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npj Systems Biology and Applications
2024 Oct 17

AndreaLGardner,Tyler...
Computational identification of surface markers for isolating distinct subpopulations from heterogeneous cancer cell populations.
npj Systems Biology and Applications
肿瘤内异质性降低了治疗效果,并使我们对肿瘤进展的理解变得复杂,迫切需要了解肿瘤内异质性肿瘤细胞亚群的功能,但体外研究这些过程的系统是有限的。单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 揭示了一些癌细胞系包含不同的亚群。在这里,我们提出了 clusterCleaver,一个计算包,它使用统计距离度量来识别 scRNA-seq 中转录组亚群最大独特的候选表面标记,可用于 FACS 分离。使用 clusterCleaver,ESAM 和 BST2/tetherin 经实验验证为表面标记,可分别识别和分离 MDA-MB-231 和 MDA-MB-436 细胞内的主要转录组亚群。 clusterCleaver 是一种计算效率高且经过实验验证的工作流程,用于识别表面标记,从而跟踪和分离细胞系内转录组不同的亚群。该工具为在明确的体外系统中研究共存的癌细胞亚群铺平了道路。© 2024。作者。
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Tissue Engineering Part B-Reviews
2024 Sep 27

HaojieZhang,YaxinWei...
Emerging Diabetes Therapies: Regenerating Pancreatic β Cells.
Tissue Engineering Part B-Reviews
糖尿病 (DM) 的发病率逐年稳步上升,截至 2021 年,糖尿病患者数量已达 5.37 亿。恢复减少的 β 细胞量或受损的胰岛功能对于治疗 DM,尤其是 1 型 DM 至关重要。然而,主要产生胰岛素的胰岛β细胞的再生能力受到严重限制,并且仅在年幼的啮齿动物或儿童中观察到自然再生。因此,迫切需要开发先进的治疗方法,可以再生内源性β细胞或用干细胞(SC)衍生的或工程化的β样细胞替代它们。目前治疗胰岛素依赖型糖尿病的策略主要包括促进内源性β细胞的自我复制、诱导SC分化、将非β细胞重编程为β样细胞以及通过细胞干预生成胰腺样类器官。在这篇综述中,我们讨论了这些方法的当前最新技术,描述了相关的挑战,提出了潜在的解决方案,并强调了优化 β 细胞或胰岛移植和相关临床试验的持续努力。这些有效的细胞疗法将产生用于移植的功能性β细胞的可持续来源,并为未来的糖尿病治疗奠定坚实的基础。
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CHEST
2024 Sep 27

ChristopherRGilbert,...
Acquisition and Handling of Endobronchial Ultrasound Transbronchial Needle Samples - An American College of Chest Physicians Clinical Practice Guideline.
CHEST
支气管内超声引导经支气管抽吸(EBUS-TBNA)已成为肺癌初始诊断和分期的标准。以前的指南一般侧重于 EBUS-TBNA 的“何时”和“如何”;然而,在采集期间和采集后处理和处理样本以帮助优化辅助研究的诊断率和组织完整性方面几乎没有可用的指导。本文件审查了有关 EBUS-TBNA 标本处理和处理的现有文献。采用严格的方法来提供值得信赖的循证指南和专家小组报告。小组成员利用 PICO(群体、干预、比较和结果)格式提出了关键的临床问题,解决了 EBUS-TBNA 标本处理中的特定主题。 MEDLINE(通过 PubMed)和 Cochrane 图书馆进行了系统检索,以识别相关文献,并辅以手动检索。使用文件评估工具对参考文献进行筛选,以评估纳入研究的质量,提取有意义的数据,并对支持每项推荐或建议的证据水平进行分级。我们对与以下相关的 9 个 PICO 问题的文献进行了系统回顾和批判性分析:处理和处理 EBUS-TBNA 标本得出了九项基于证据的陈述。处理和处理 EBUS-TBNA 标本的证据强度各不相同,但在某些方面是令人满意的,可以指导临床医生处理标本处理的某些方面。需要对样本处理和加工的许多方面进行更多研究,以帮助完善我们的知识库。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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CHEST
2024 Oct 08

Bo-GuenKim,Hyunseung...
The growth of screening-detected pure ground-glass nodules after 10 years of stability.
CHEST
目前尚不确定低剂量计算机断层扫描 (LDCT) 检测到的纯磨玻璃结节 (pGGN) 应随访多长时间。需要进一步进行更长随访期的研究来确定 pGGN 的最佳随访时间。pGGN 中增大的结节在 10 年内保持稳定的百分比是多少?这是一项源自检测到 pGGN 受试者的回顾性队列研究1997 年至 2006 年间的 LDCT 扫描,其自然病程于 2013 年报告。我们重新分析了 2022 年 7 月之前的所有随访数据。研究对象遵循我们的机构指南,直到他们不再是最终治疗的候选者。 pGGN 的生长定义为整个结节直径增加 2 毫米或更多,或结节内出现新的实性部分。总共对 89 名具有 135 个 pGGN 的患者进行了中位随访 193 个月。在 135 个 pGGN 中,23 个 (17.0%) 尺寸增大,首次检测到尺寸变化的中位时间为 71 个月。在 23 个生长的 pGGN 中,有 122 个是在第一次 LDCT 中检测到的,13 个是在后续 CT 扫描中新检测到的。 5 年内观察到大小增加的有 8 个结节 (34.8%),5 至 10 年内观察到的大小增加有 12 个结节 (52.2%),10 年后观察到的大小有 3 个结节 (13.0%)。 15个结节经手术组织学证实为腺癌。在稳定10年的76个pGGN中,有3个(3.9%)尺寸增加。在保持稳定10年的pGGN中,3.9%最终增长,表明一些pGGN即使在长期稳定后仍能生长。我们建议 pGGN 可能需要跟踪 10 年以上才能确认增长。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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CHEST
2024 Oct

MohammedJamjoom,AmrA...
A 78-Year-Old Man With Shortness of Breath After Radioembolization of the Liver.
CHEST
一名 78 岁男性,有胃胃肠道间质瘤 (GIST) 病史,并已转移至肝脏,在肝转移病灶放射性栓塞治疗后 1 周开始出现进行性呼吸短促、干咳和主观发热。 10 年前,他首次诊断出患有胃肠道间质瘤,并接受了手术切除。然而,最近他的肝脏病变活检被证明是转移性胃肠道间质瘤病变。他表示,在放射栓塞手术前,他没有任何呼吸道症状,并否认有肺部疾病史。他的病史还包括 2002 年冠状动脉旁路移植术后的冠状动脉疾病、射血分数降低的心力衰竭以及放置起搏器后的房室传导阻滞。诊断出肝转移后,他提前 6 个月开始接受伊马替尼治疗,随后接受了钇 90 (Y-90) 微球放射性栓塞治疗。版权所有 © 2024 美国胸科医师学会。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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CHEST
2024 Oct

JemMarieGolbin,Alber...
A Case of Labile BP in a Patient With Oropharyngeal Carcinoma.
CHEST
一名71岁男性,有复发性扁桃体鳞状细胞癌病史,因口咽出血入院。他接受了高剂量放射治疗以达到治愈目的。住院第 4 天,他表现出因气道粘液塞导致缺氧,并被送往内科 ICU。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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CHEST
2024 Oct

EricMerrell,LouisAre...
A 63-Year-Old Presents With Acute Fatigue, Dyspnea, and Hypoxia.
CHEST
一名没有明显病史的 63 岁女性因 3 天疲劳和劳力呼吸困难病史被送往紧急护理中心。经检查,她的室内空气氧饱和度低于 80 度,并被转移到最近的医院进行进一步评估。最初的胸片显示双侧广泛的间质混浊,有利于中下肺。一般的感染性检查并未发现任何问题。她的症状被认为是非典型细菌或病毒感染所致。她出院回家,通过鼻插管补充氧气,流量为 2 升/分钟;指示完成 7 天的抗生素疗程;并给予严格的退货预防措施。六天后,尽管完成了规定的抗生素疗程,但她还是因呼吸困难恶化而返回急诊室。她被收入院接受进一步评估。她于 2000 年代初从印度北部移民。在印度,烹饪是在明火上进行的。他们的家位于一个家禽养殖场。她从来不抽烟。她了解典型癌症筛查的最新情况。她没有养宠物,并否认自搬到美国后进一步接触鸟类。她的职业经历包括制造业,但她否认大量接触灰尘或金属刨花。版权所有 © 2024 美国胸科医师学会。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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CHEMICO-BIOLOGICAL INTERACTIONS
2024 Nov 01

ShuoWang,JingjingChe...
Structure optimization, synthesis and bioactivity evaluation of novel BCR-ABL tyrosine kinase inhibitor targeting T315I mutation.
CHEMICO-BIOLOGICAL INTERACTIONS
慢性粒细胞白血病(CML)是由BCR-ABL融合蛋白引起的恶性血液肿瘤,该融合蛋白与ATP结合发挥酪氨酸酶活性并持续激活下游磷酸化途径。以伊马替尼为代表的酪氨酸激酶抑制剂(TKI)是临床治疗CML的关键药物。而靶点突变导致严重的耐药问题,尤其是T315I突变仍然是一个尚未解决的挑战,尽管第三代TKI Ponatinib对T315I突变疗效良好,但心脏毒性限制了其临床应用。尽管如此,帕纳替尼的结构优化仍然是克服突变带来的耐药性的潜在策略。在此,我们展示了一系列新型BCR-ABL/T315I酪氨酸激酶抑制剂,这些抑制剂是通过使用我们团队之前报道的BCR-ABL/T315I抑制剂ZINC21710815作为先导化合物进行虚拟筛选,并针对T315I先导化合物进行结构优化而获得的。突变,以及通过活性评估和机制研究筛选两种新化合物,W4和W8。 W4和W8对BaF3/T315I具有更好的细胞死亡诱导作用和特殊选择性,值得进一步深入研究,以获得更理想的抗CML药物作为先导化合物。Copyright © 2024。Published by Elsevier B.V.
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CHEMICO-BIOLOGICAL INTERACTIONS
2024 Nov 01

ChuanChen,RuixuanXu,...
Lanostane triterpenoids from Ganoderma calidophilum exhibit potent anti-tumor activity by inhibiting PTP1B.
CHEMICO-BIOLOGICAL INTERACTIONS
赤芝(Ganoderma calidophilum)代表了灵芝属中的一个独特品种,被土著黎族用作预防和治疗癌症的药物。然而,G. calidophilum 在抗肿瘤治疗中的精确生物活性和作用在很大程度上仍未得到解决。已从 G. calidophilum 中分离出几种羊毛甾烷三萜类化合物。酶活性分析表明,四种羊毛甾烷三萜类化合物表现出 PTP1B 抑制活性,对 SHP2、SHP1、PTPN5、PTPRA、STEP 和 TCPTP 的抑制最小。分子对接分析表明这些化合物主要与 PTP1B 的底物识别和进入区域结合。进一步分析表明,其中灵芝醛A(GAA)是一种选择性、非竞争性的PTP1B抑制剂。 GAA 以剂量依赖性方式抑制 C33A 和 MDA-MB-231 细胞的增殖、集落形成和迁移。 GAA 具有以细胞类型特异性方式诱导细胞凋亡的能力,无论是依赖于半胱天冬酶还是不依赖于半胱天冬酶。 PTP1B siRNA 显着降低 GAA 的细胞毒性作用,而 PTP1B 的过表达显着增加 GAA 处理后的细胞生长。这些发现证实 PTP1B 是 GAA 的功能靶点。 GAA作用机制的研究表明,它可以通过抑制PTP1B来抑制AKT的激活,同时激活p38,从而促进细胞死亡。基于羊毛甾醇三萜骨架开发特异性PTP1B抑制剂是可能的。 G. calidophilum 有潜力被开发成功能性食品或药物,以预防和治疗癌症。版权所有 © 2024 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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CHEMICO-BIOLOGICAL INTERACTIONS
2024 Nov 01

YanyanYang,NingningT...
PP2 suppresses proliferation and migration of C6 Glioma and MDA-MB-231 cells by targeting both fibroblast growth factor receptor 1 and Src.
CHEMICO-BIOLOGICAL INTERACTIONS
成纤维细胞生长因子(FGF)参与神经胶质瘤(最常见的脑肿瘤类型)和乳腺肿瘤的进展。在本研究中,我们旨在评估抑制剂 PP2 对神经胶质瘤和乳腺肿瘤细胞增殖和迁移的影响,并表征这些过程中涉及的分子机制。通过增殖、迁移和侵袭测定以及细胞凋亡分析来检查 PP2 对 C6 胶质瘤和 MDA-MB-231 细胞致瘤潜力的抑制作用。通过免疫印迹、免疫沉淀、磷蛋白测定、细胞热位移测定 (CETSA) 和分子对接模型研究了 PP2 抗神经胶质瘤活性背后的分子机制。 PP2 通过 FGF2 抑制 C6 神经胶质瘤和 MDA-MB-231 细胞的增殖和迁移。此外,PP2直接阻断FGF受体1(FGFR1)和Src的酶活性,随后影响核因子-κB和激活蛋白-1信号通路。 CETSA分析和对接模型表明FGFR2的TK1结构域(Val 492和Glu 486)可能是PP2的结合位点。因此,总的来说,我们的研究结果表明,PP2 通过靶向 FGFR1 和 Src 介导抗肿瘤作用,并可能作为治疗性抑制剂用于治疗神经胶质瘤。版权所有 © 2024 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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