高级别（HGOC）和低级别卵巢癌（LGOC）是两种不同的恶性肿瘤，具有不同的生物学特征、治疗模式和预期寿命。然而，生活质量（QOL）、睡眠和抑郁症状的差异尚未按等级进行检查，也没有与这些症状相关的炎症特征。我们的目标是通过 OC 等级来表征 QOL 和生物标志物。参与者包括 HGOC (N = 578) 或 LGOC (N = 85) 患者。参与者在初次手术或新辅助化疗前完成了心理社会因素的基线评估，并贡献了唾液中的皮质醇和血液中的白介素 6 (IL-6) 定量。术中收集样本以量化肿瘤皮质醇。一般线性模型用于按年级检查生物和心理变量的差异。在基线时，LGOC 患者报告较少的抑郁症 (p = 0.018) 和睡眠障碍 (p = 0.014)，但抑郁情绪没有显着差异 (p = 0.11) ) 或 QOL (p = 0.51) 与 HGOC 患者相比，调整年龄和疾病阶段。与 HGOC 相比，LGOC 中的肿瘤皮质醇水平有较低的趋势 (p = 0.078)。诊断一年后，我们发现生活质量和疲劳显着改善，植物性抑郁和 IL-6 水平下降，无论级别如何。我们首次描述了 LGOC 患者的心理社会经历。尽管 LGOC 患者的疾病预后较好，但其出现情绪障碍的可能性与 HGOC 患者一样。肿瘤皮质醇存在分级差异的趋势。我们的研究结果强调需要解决低度和高度卵巢恶性肿瘤患者的健康问题。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。

组学技术和人工智能 (AI) 方法的进步正在推动我们在肝病学的个性化诊断、预后和治疗策略方面取得进展。这篇综述全面概述了用于分析肝脏疾病组学数据的人工智能方法的现状。我们概述了各种肝脏疾病的不同组学水平的患病率，并对研究中使用的人工智能方法进行了分类。具体来说，我们强调转录组和基因组分析的主导地位，以及蛋白质组和甲基化组等其他水平的相对稀疏的探索，这代表了新见解的未开发潜力。癌症基因组图谱和国际癌症基因组联盟等公开数据库计划为肝细胞癌诊断和治疗的进步铺平了道路。然而，对于其他肝脏疾病来说，大型组学数据集的可用性仍然有限。此外，应用复杂的人工智能方法来处理多组学数据集的复杂性需要大量数据来训练和验证模型，并且在临床实用性上实现无偏差结果方面面临挑战。讨论了解决数据缺乏和利用机会的策略。鉴于慢性肝病在全球造成的巨大负担，必须建立多中心合作来生成大规模组学数据，以进行早期疾病识别和干预。探索先进的人工智能方法对于最大限度地发挥这些数据集的潜力并改进早期检测和个性化治疗策略也是必要的。© 作者（或其雇主）2024。在 CC BY-NC 下允许重复使用。禁止商业再利用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。

STAT3是乳腺癌癌基因的转录激活因子，这表明它可能是乳腺癌的潜在治疗靶点。因此，本研究通过具有患者特异性原代细胞（PSPC）的新型临床前平台，探讨了STAT3信号通路抑制剂C188-9在乳腺癌治疗中的潜在应用。PSPC是从获得的乳腺癌样本中分离出来的通过来自 15 名患者捐赠者的活检或手术，并得到他们的充分认可。 PSPCs用C188-9或其他化疗剂处理，然后用细胞活力测定进行分析。 Western blot法和实时定量PCR检测相应PSPCs STAT3信号通路的表达和活性。正常（实验）浓度的C188-9处理对PSPCs增殖具有有效的抑制作用。同时，与一些其他传统化疗药物相比，长时间使用低（临床相关）浓度的 C188-9 治疗会降低 PSPC 的细胞活力。此外，C188-9 降低了部分而非所有患者样本的 PSPC 中 pSTAT3 的表达水平。 C188-9 的治疗通过抑制 STAT3 至 C-myc 信号通路来降低乳腺癌样本的细胞活力。在这项研究中，我们测试了一种低临床相关浓度的新药 C188-9，以及几种传统药物。化疗药物。十五名患者捐献者中有十名的 PSPC 对 C188-9 敏感，而一些传统化疗药物却失败了。这一发现表明，C188-9 只能对这 10 名 PSPC 患者捐赠者产生治疗效果，表明未来 PSPC 的个性化利用。© 2024。作者。

幼稚 CD4 T 细胞及其分化的对应物在肿瘤免疫微环境中发挥着重要的调节作用，但它们对肺腺癌 (LUAD) 的影响尚未完全了解。我们利用孟德尔随机化来评估幼稚 CD4 T 细胞与 LUAD 之间的因果关系。我们采用改进的单样本基因集富集分析 (ssGSEA) 算法和癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库，确定了初始 CD4 T 细胞的浸润水平及其分化亚型，并研究了它们与临床特征的相关性。通过Mantel试验和京都基因与基因组百科全书（KEGG）数据库富集分析确定了T辅助细胞的潜在调控途径。孟德尔随机化分析揭示了幼稚CD4 T细胞对LUAD的抑制作用（错误发现率 < 0.05），这是使用 TCGA 数据库的观察实验证实了这一点。具体而言，2 型辅助 T 细胞在总体生存、无病生存和无进展生存方面表现出对 LUAD 的促进作用 (p<0.05)。此外，调节性 T 细胞在疾病特异性存活方面对 LUAD 表现出保护作用 (p<<0.01)。同时，我们探索了幼稚 CD4 T 细胞分化亚型对 LUAD 的总体影响，揭示了中性粒细胞脱颗粒、MAPK 家族信号通路以及血小板激活、信号传导和聚集等途径的上调。幼稚 CD4 T 细胞及其分化的对应物发挥着至关重要的作用在肿瘤免疫微环境中发挥调节作用，证明其作用具有双向性。因此，阐明其机制并开发新型细胞分化诱导剂将有利于抗癌治疗。© 2024。作者。

外泌体通过复杂的信号网络介导涉及多种生物分子的细胞间串扰。近年来，外泌体及其非编码RNA货物在几种癌症类型的发生和进展中的关键作用明显显现。特别是，肿瘤块及其微环境通过细胞通讯共同进化，其中这些纳米级细胞外囊泡是最相关的参与者之一。有关这些通讯所涉及的细胞和分子机制的知识将为新型基于外泌体的治疗性 RNA 递送以及创新的预后/诊断工具铺平道路。尽管外泌体具有宝贵的治疗潜力和临床相关性，但由于此类癌症的稀有性和高度异质性，其对肉瘤的作用的报道还很模糊。在这里，我们剖析了科学文献，以揭示外泌体非编码 RNA 作为肉瘤亚型细胞间通讯介质的多方面作用。© 2024。作者。

B细胞是肿瘤微环境中的适应性免疫细胞，在肿瘤的发生发展和转移中发挥着重要作用。然而，免疫 B 细胞相关基因的遗传变异在非小细胞肺癌 (NSCLC) 患者生存中的作用仍不清楚。在本研究中，我们首先评估了来自前列腺癌、肺癌、结直肠癌和卵巢癌 (PLCO) 癌症筛查的 1,185 名患者的发现数据集中的 220 个免疫 B 细胞相关基因中的 10,776 个单核苷酸多态性 (SNP) 与 NSCLC 生存之间的关联审判。我们在多变量 Cox 比例风险回归分析中发现 369 个 SNP 与 NSCLC 的总生存率 (OS) 显着相关（P ≤ 0.05，贝叶斯错误发现概率 ≤ 0.80），其中 18 个 SNP 在另一个包含 984 名患者的独立基因分型数据集中得到了验证来自哈佛肺癌易感性 (HLCS) 研究。然后，我们进行连锁不平衡 (LD) 分析，然后使用多变量 Cox 回归模型进行逐步分析。最后，两个独立的 SNP，肌醇多磷酸 5-磷酸酶 D (INPP5D) rs13385922 C>T 和外泌体成分 3 (EXOSC3) rs3208406 A>G，仍然与 NSCLC OS 显着相关，组合风险比 (HR) 为 1.14 (95%)置信区间 = 1.06-1.23，P = 2.41×10-4) 和 1.20 (95% 置信区间 = 1.14-1.28，P = 3.41×10-9)。此外，PLCO 数据集中，具有这两个 SNP 不利基因型组合的 NSCLC 患者与较差的 OS（P 趋势 = 0.0002）和疾病特异性生存（DSS，P 趋势 < 0.0001）相关。表达数量性状位点（eQTL）分析表明，INPP5D rs6782875 T等位基因与正常肺组织和全血样本中INPP5D mRNA表达水平升高显着相关，而EXOSC3 rs3208406 G等位基因与正常肺组织和全血样本中EXOSC3 mRNA表达水平升高显着相关。肺组织。我们的数据表明，这些免疫 B 细胞相关基因的遗传变异可能通过影响基因表达来预测 NSCLC 的生存。版权所有 © 2024 Lu、Liu、Wang、Tang、Luo、Du、Christiani 和 Wei。

微血管侵犯（MVI）是肝细胞癌（HCC）的关键病理标志，与不良预后、早期复发和转移进展密切相关。然而，控制其发生和发展的精确机制基础仍然难以捉摸。在这项研究中，我们从 TCGA 和 HCCDB 存储库下载了批量 RNA-seq 数据，从 GEO 数据库下载了单细胞 RNA-seq 数据，以及从中信银行数据库。利用 Scissor 算法，我们描绘了与预后相关的细胞亚群，并辨别了一种独特的 MVI 相关恶性细胞亚型。通过伪时间分析和细胞间通讯审查对这些恶性细胞亚群进行了全面的探索。此外，我们设计了一个基于 MVI 相关基因的预后模型，在 TCGA 训练集上采用了 10 种机器学习算法集成的 101 种算法组合。采用C指数、校准曲线和决策曲线分析（DCA）对内部测试集和外部验证集进行严格评估。伪时间分析表明，恶性细胞与MVI呈正相关，主要集中在早中期分化阶段，与不良预后相关。重要的是，这些细胞在 MYC 通路中表现出显着富集，并通过 MIF 信号通路参与与不同细胞类型的广泛相互作用。通过空间转录组学数据的验证证实了恶性细胞与 MVI 表型的关联。我们设计的预后模型表现出卓越的敏感性和特异性，超越了大多数先前发布的模型的性能。校准曲线和DCA强调了该模型的临床实用性。通过综合多转录组学分析，我们描绘了MVI相关的恶性细胞并阐明了它们的生物学功能。这项研究为治疗 HCC 提供了新颖的见解，构建的预后模型为临床决策提供了宝贵的支持。版权所有 © 2024 Huang、Wu、Yu、Xu、Chen、Huo 和 Li。

尽管我们对 1 型单纯疱疹病毒 (HSV-1) 生物学的了解已大大增强，但制定消除潜伏感染个体中的 HSV-1 的治疗策略仍然是一个公共卫生问题。目前用于治疗 HSV-1 并发症的抗病毒药物不具有特异性，并且不能解决潜伏感染。我们最近开发了一种基于 CRISPR-Cas9 的基因编辑平台，专门针对 HSV-1 基因组。在这项研究中，我们进一步使用 2D Vero 细胞培养物和 3D 人类诱导多能干细胞衍生的脑类器官 (CO) 模型来评估我们针对病毒 ICP0 或 ICP27 基因的编辑构建体的有效性。我们发现，在 Vero 细胞中用 AAV2-CRISPR-Cas9 载体靶向 ICP0 或 ICP27 基因可显着抑制 HSV-1 复制。此外，我们用 HSV-1 有效地感染了 CO，表征了病毒复制动力学，并建立了病毒潜伏期模型。最后，我们发现靶向 ICP0 或 ICP27 的 AAV2-CRISPR-Cas9 载体显着减少了潜伏感染 HSV-1 的 CO 中的病毒反弹。总之，我们的结果表明 HSV-1 的 CRISPR-Cas9 基因编辑是消除潜伏病毒库并治疗 HSV-1 相关并发症的有效治疗方法。© 2024 作者。

前列腺癌 (PC) 是最常诊断出的癌症，也是男性癌症相关死亡的第二大原因。从广泛的治疗方法中可以明显看出，它是异质的。大多数 PC 患者最初对雄激素剥夺疗法有反应；然而，大多数病例要么是激素敏感型前列腺癌，要么是去势抵抗型前列腺癌。目前的治疗方案遵循 PC 的演变，这是一个不断进步的过程，涉及广泛的基因组改变的组合。这些基因组改变要么是遗传性种系突变，例如 BRCA2 突变，要么是仅针对肿瘤细胞（体细胞）的突变。肿瘤特异性基因组谱包括基因组结构重排、典型雄激素反应基因和许多其他特定基因，例如 TMPRSS2-ERG 融合、SPOP/FOXA1、TP53/RB1/PTEN 和 BRCA2。新证据表明信号通路的参与，包括 PI3K、WNT/β-catenin、SRC 和 IL-6/STAT，这些信号通路已被证明可促进 PC 中上皮间质转化癌干细胞样特征/干细胞性和神经内分泌分化。在过去的十年中，我们对基因型-表型关系的理解得到了显着增强。 PC 与典型遗传改变和信号通路激活基因相关的遗传背景使人们对分子亚型和疾病格局有了更深入的了解，从而使针对不同基因型和表型的个体疗法发挥更灵活的作用。版权所有 © 2024 作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版

人类 T 细胞淋巴瘤 (TCL) 的组织病理学分类具有独特的突变基因分型，表明不同的淋巴瘤发生。假设在具有不同 TCL 表型的狗中也观察到类似的概念。本研究旨在鉴定先前报道的人类和狗在犬 TCL 和无效细胞淋巴瘤 (NCL) 中的单核苷酸多态性 (SNP)，并设计基于多重聚合酶链式反应从每个变体中提取出相容的寡核苷酸。从 68 个肿瘤样本（62 个 TCL 和 6 个 NCL）和 5 个 TCL 狗的血沉棕黄层样本中提取基因组 DNA。使用 MassARRAY 对 21 个基因的 44 个 SNP 中的四种 TCL 亚型和 NCL 进行了分析。在所有 TCL 亚型和 NCL 中观察到的 SNP 的最大发生率是 SATB1 c.1259A > C、KIT c.1275A > G、SEL1L c.2040  200C > G和TP53分别为c.1024C > T。一些 SNP 位置与 NCL 具有统计学显着相关性，包括 MYC p.S75F (p = 0.0003)、TP53 p.I149N (p = 0.030)、PDCD1 p.F37LX (p = 0.012) 和 POT1 p.R583* (p = 0.012)。每个 TCL 组织学亚型和 NCL 可能包含独特的突变基因谱，这可能在淋巴瘤基因风险因素中发挥作用，并可能有助于为每个犬类患者选择治疗靶点药物。版权所有 © 2024 Sirivisoot，Kasantikul， Techangamsuwan 和 Rungsipipat。