研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Experimental Hematology & Oncology
2024 Aug 15
ValentinaD'Atri,Guil...
Assessment of chemical stability of monoclonal antibody and antibody drug conjugate administered by pressurized intraperitoneal aerosol chemotherapy.
Experimental Hematology & Oncology
加压腹膜内气溶胶化疗(PIPAC)是腹膜癌患者的一种新治疗方法。到目前为止,大多数已发表的研究都调查了通过 PIPAC 施用已确定的细胞抑制剂。本研究旨在评估 PIPAC 对两种突破性抗癌药物的效果,特别是抗 PD1 派姆单抗和抗 HER2 抗体药物偶联物 (ADC) - 曲妥珠单抗-deruxtecan。我们使用密封容器系统的实验装置,模拟腹腔并使用与临床使用相同的特征,对 PIPAC 给药前后临床相关浓度的派姆单抗和曲妥珠单抗-deruxtecan 样本进行了系统分析。我们利用一系列色谱和光谱技术来探索药物一级、二级和三级结构的潜在变化,重点关注雾化产生的翻译后修饰。我们的研究结果表明 PIPAC 并未损害所测试生物药品的完整性。通过尺寸排阻色谱 (SEC) 评估,两种药物的尺寸变异保持不变。反相液相色谱 (RPLC) 和疏水相互作用色谱 (HIC) 显示 PIPAC 治疗前后疏水性变异、平均药物抗体比 (DAR) 或 DAR 分布没有显着差异。圆二色性(CD)光谱证实二级和三级结构得以保留。虽然派姆单抗在 PIPAC 后显示电荷变体没有变化,但曲妥珠单抗-deruxtecan 在单克隆抗体本身的电荷变体数量上表现出不可忽略的变化,而有效负载保持不变。这种转变可能与 PIPAC 和这些实验中使用的 CapnoPen® 装置(由镍和铬制成)的金属成分有关。 总之,我们的结果表明 PIPAC 不会改变派姆单抗和曲妥珠单抗-deruxtecan 的结构,为未来的临床试验铺平道路。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2024 Jul 25
ZhengweiLi,LipengWan...
HHOMR: a hybrid high-order moment residual model for miRNA-disease association prediction.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
大量研究表明 microRNA (miRNA) 对于疾病的预测、诊断和表征至关重要。然而,通过传统的生物学实验来识别 miRNA 与疾病的关联既昂贵又耗时。为了进一步探索这些关联,我们提出了一种基于混合高阶矩与元素级注意机制(HHOMR)相结合的模型。该模型创新地将混合高阶统计信息与结构和群落信息融合在一起。具体来说,我们首先根据 miRNA 与疾病之间的现有关联构建了一个异质图。 HHOMR 采用结构融合层来捕获结构级嵌入,并利用混合高阶矩编码器层来增强特征。然后使用元素级注意机制来自适应地集成这些混合时刻的特征。最后,利用多层感知器来计算 miRNA 与疾病之间的关联分数。通过 HMDD v2.0 的五倍交叉验证,我们实现了 93.28% 的平均 AUC。与四种最先进的模型相比,HHOMR 表现出了优越的性能。此外,还进行了食管肿瘤、淋巴瘤和前列腺肿瘤这三种疾病的病例研究。在具有高疾病关联评分的前 50 个 miRNA 中,dbDEMC 和 miR2Disease 数据库分别确认了 46、47 和 45 个与这些疾病相关的 miRNA。我们的结果表明,HHOMR 不仅优于现有模型,而且在预测 miRNA-疾病关联方面显示出巨大潜力。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。
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BRITISH JOURNAL OF CANCER
2024 Aug 22
EsbenPackness,Olafur...
Infections and their prognostic significance before diagnosis of chronic lymphocytic leukemia, non-Hodgkin lymphoma, or multiple myeloma.
BRITISH JOURNAL OF CANCER
免疫缺陷是 B 细胞恶性肿瘤的共同特征。感染的风险及其诊断后的预后意义已得到很好的表征,但相反,人们对这些领域的诊断前感染知之甚少。在匹配的病例对照分析中,使用丹麦全国登记册,我们评估了慢性淋巴细胞白血病的诊断前感染率。白血病 (CLL)、弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL)、多发性骨髓瘤 (MM)、滤泡性淋巴瘤 (FL)、边缘区淋巴瘤 (MZL) 和淋巴浆细胞淋巴瘤 (LPL)。然后使用临床登记数据的生存分析来确定诊断前一年的感染对总体生存的影响。为了为尽可能多的患者提供结果,抗菌药物处方被用作感染的替代指标。全国登记册和临床登记册分别包括 30,389 名患者(累计 213,649 张抗菌处方)和 18,560 名患者(累计 107,268 张处方)。恶性肿瘤诊断前 15 年,感染的相对风险增加,并且在诊断前一年显着增加。诊断前一年内使用两种以上抗菌药物与显着缩短总生存期相关,与已知的预后因素无关。患有 B 细胞源性恶性肿瘤的患者在诊断前几年就表现出明显的免疫缺陷,因此不同的疾病亚型表现出重叠和不同的趋势诊断前的感染风险。此外,诊断前一年内的多次感染与所有检查的恶性肿瘤的总生存期较短独立相关。© 2024。作者。
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BRITISH JOURNAL OF CANCER
2024 Aug 22
ZhengyanYang,PaiZhan...
DRD4 promotes chemo-resistance and cancer stem cell-like phenotypes by mediating the activation of the Akt/β-catenin signaling axis in liver cancer.
BRITISH JOURNAL OF CANCER
肝癌干细胞(LCSC)显着影响肝癌的化疗耐药性和复发。已知多巴胺受体 D4 (DRD4) 会增强胶质母细胞瘤中的癌症干细胞 (CSC) 表型,并与一些非中枢神经系统肿瘤的不良预后相关;为了研究DRD4在LCSCs和非LCSCs中的基因和蛋白表达谱,我们利用转录组测序和Western blotting分析。采用生物信息学分析和免疫组化评估DRD4表达水平与肝癌患者病理特征的相关性。使用药理学或基因编辑技术探索 DRD4 对 LCSC 表型和信号通路的影响。此外,使用蛋白质印迹和免疫荧光检查了 DRD4 对 β-连环蛋白的蛋白表达和细胞内定位的影响。DRD4 表达在 LCSC 中显着升高,并且与肝癌的短生存期相关。 DRD4的表达和活性与HCC的耐药性、自我更新和致瘤性呈正相关。从机制上讲,DRD4通过激活PI3K/Akt/GSK-3β途径稳定β-catenin并促进其进入细胞核,从而增强LCSC表型。抑制DRD4表达和激活为根除LCSC和缓解化疗耐药提供了一种有前途的靶向治疗。 © 2024。作者获得施普林格自然有限公司的独家许可。
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Brain Structure & Function
2024 Aug 22
TeestaMukherjee,Shra...
Development of a CNN for Adult Brain Tumour Characterisation: Implications and Future Directions for Transfer Learning.
Brain Structure & Function
脑肿瘤是儿童中最常见的实体瘤,尽管与成人相比发病率较低。然而,它们固有的异质性、儿科患者的伦理考虑以及长期随访的困难使得收集大量同质数据集进行分析具有挑战性。本研究的重点是使用成人 BraTS 2020 数据集开发用于脑肿瘤表征的卷积神经网络 (CNN)。我们建议在未来的研究中,通过利用迁移学习(TL),将知识从在广泛的成人脑肿瘤数据集上预先训练的模型转移到较小的队列数据集(例如,儿童脑肿瘤)。这种方法旨在从预先训练的模型中提取相关特征,解决带注释的儿科数据集的有限可用性,并增强儿童肿瘤的表征。讨论了这种方法在儿科神经肿瘤学中的含义和潜在应用。
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Brain Structure & Function
2024 Aug 22
MobinYasini,DennisRa...
Enhancing Clinical Practice: Creating Dynamic Medical Content in Electronic Medical Records.
Brain Structure & Function
电子病历 (EMR) 的集成彻底改变了医疗保健,但通常仍保留纸质结构的局限性。这项研究提出了一个框架,用于开发专门适应临床背景(包括医学专业和疾病)的动态医学内容。根据这种动态环境定制内容可以带来多种好处,包括改善对相关信息的访问、简化工作流程以及可能改善患者治疗效果。我们应用我们的框架来开发神经外科内容,重点关注脑肿瘤。该方法涉及定义医学专业、概述用户旅程以及迭代开发评估表、仪表板和订单集等工件。标准化术语确保一致性和互操作性。我们的结果证明了满足用户需求和临床相关性的内容的成功开发。虽然最初的实施侧重于神经外科,但探索可扩展性和人工智能集成为进一步发展提供了有希望的途径。未来的研究可以定量评估该方法对用户满意度和患者治疗结果的影响。
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Brain Structure & Function
2024 Aug 22
DanielHieber,NicoHai...
Comparing nnU-Net and deepflash2 for Histopathological Tumor Segmentation.
Brain Structure & Function
机器学习 (ML) 已经发展成为计算机科学家专用的专业技术。除了一般的易用性之外,自动化管道还允许用最少的计算机科学知识来训练复杂的机器学习模型。近年来,自动化机器学习 (AutoML) 框架已成为专业机器学习模型的有力竞争对手,甚至能够在特定任务上超越后者。此外,这种成功不仅限于简单的任务,还包括复杂的任务,例如组织病理学组织中的肿瘤分割,这是一项非常耗时的任务,需要医疗专业人员多年的专业知识。在医学图像分割方面,领先的 AutoML 框架是 nnU-Net 和 deepflash2。在这项工作中,我们开始在组织病理学图像分割领域比较这两个框架。事实证明,这个用例特别具有挑战性,因为肿瘤和健康组织通常无法通过硬边界清晰地区分,而是通过异质过渡来区分。使用来自 56 名胶质母细胞瘤患者的 103 张完整幻灯片图像的数据集进行评估。培训和评估在带有消费类硬件的笔记本电脑上运行,确定框架是否适合临床场景而不是研究实验室的高性能场景。
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Brain Structure & Function
2024 Aug 22
GlebDanilov,Alexande...
Reproducibility of Radiomic Features in Glial Brain Tumors.
Brain Structure & Function
在我们最近的研究中,我们有效地证明了利用标准化感兴趣体积(VOI)、放射组学和机器学习将神经胶质瘤的磁共振图像(MRI)分为四种组织学类型的可行性。本研究旨在确定当 VOI 位置发生变化时我们的方法的可重复性。当在不同的 VOI 中采用相同的特征选择方法时,我们能够证明 ML 结果的高再现性。然而,对于所研究的样本量 (n = 85),无法确保不同 VOI 之间放射组学特征及其集合的再现性。在评估神经胶质瘤的放射组学研究时,应考虑放射组学特征的有限再现性。
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ARCHIVOS DE BRONCONEUMOLOGIA
2024 Jul 27
MeiXie,XuwenLin,Xiny...
Tertiary Lymphoid Structure in Tumor Microenvironment and Immunotherapy of Lung Cancer.
ARCHIVOS DE BRONCONEUMOLOGIA
免疫检查点抑制剂开启了肺癌治疗的时代。然而,个体患者之间免疫治疗的疗效存在显着差异。三级淋巴结构(TLS)是病理条件下出现的异位淋巴细胞聚集,是抗肿瘤免疫的主要作用位点。据报道,肿瘤微环境 (TME) 中 TLS 的存在与肺癌患者良好的临床预后和免疫治疗的良好反应有关。深入了解 TLS 及其在 TME 中的动态变化已成为优化肺癌免疫治疗策略的一个有吸引力的焦点。本文对TLS的组成、形成、作用机制、检测方法等进行全面综述,并总结TLS在肺癌免疫治疗中的作用。最后,还讨论了 TLS 的诱导,这可能为肺癌治疗提供更有效的治疗策略。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier España 出版,S.L.U.版权所有。
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BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
2024 Aug 22
QinghuaGong,Jingjing...
A sandwich-type photoelectrochemical biosensor based on anthocyanin-sensitized ZnO/P5FIn heterojunction for the sensitive detection of CYFRA21-1.
BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
。开发了一种基于 ZnO/聚(5-甲酰基吲哚)(P5FIn)/花青素异质结构的夹心型光电化学 (PEC) 免疫传感器,以实现肿瘤标志物 CYFRA21-1 的灵敏无背景检测。具有良好光伏性能的ZnO与窄带隙P5FIn结合形成p-n型异质结。这种结构减少了电子空穴对复合,从而增强了复合材料的光电流响应。花青素是一种环境友好的天然化合物,具有优异的抗氧化、氧化还原性能和显着的电化学活性。经过花青素敏化后,复合材料对可见光的吸收和利用增强,进一步提高了材料的PEC发光效率。此外,氮化硼量子点 (BN QD) 通过聚多巴胺 (PDA) 与 Ab2 结合作为二抗标记物,增强了其灵敏度。该生物传感器的线性检测范围为 0.001-100 ng mL-1,检测限 (LOD) 为 0.00033 ng mL-1。此外,该生物传感器表现出出色的选择性、重现性和稳定性,以及在分析实际人血清样本方面的成功结果。该方法为肿瘤标志物检测提供了一种可行的方法。© 2024。作者获得 Springer-Verlag GmbH Austria(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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