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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Nov 13

ChiakiIwamura,Hideta...
Microbial ligand-independent regulation of lymphopoiesis by NOD1.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
已知造血系统中祖细胞的异常分化会严重影响宿主的免疫反应。在此,我们证明 NOD1(细菌肽聚糖的胞质先天传感器)也在小鼠造血细胞中发挥作用,作为淋巴祖细胞的生成和分化以及外周 T 淋巴细胞稳态的主要调节因子。我们进一步表明,NOD1 通过促进造血细胞因子下游的 STAT5 信号传导来介导这些功能。在稳态下,NOD1 的缺失导致成熟 T、B 和自然杀伤细胞数量适度但显着减少。在全身性原生动物感染期间,这种缺陷显着增强,导致宿主死亡。功能性 NOD1 的缺乏还会损害 T 细胞依赖性抗肿瘤免疫,同时预防结肠炎。这些发现表明,除了作为细菌配体受体的经典作用外,NOD1 通过与主要宿主细胞因子信号通路相互作用,在调节适应性免疫方面发挥着重要作用。© 2023。这是美国政府的作品,不受版权保护在美国;外国版权保护可能适用。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Nov 12

KentaTakeuchi,Shunsu...
Incorporation of human iPSC-derived stromal cells creates a pancreatic cancer organoid with heterogeneous cancer-associated fibroblasts.
Stem Cell Research & Therapy
胰腺导管腺癌(PDAC)的侵袭性受到肿瘤微环境(TME)的影响。在这项研究中,为了体外概括 PDAC TME,我们将源自患者的 PDAC 细胞与源自人类诱导多能干细胞 (hiPSC) 的间充质和血管内皮细胞共培养,以在空气-液体中创建融合的胰腺癌类器官 (FPCO)界面。 FPCO 被进一步诱导类似于 PDAC 组织的两个不同方面。静止的 FPCO 具有耐药性,可能是因为 TME 由丰富的细胞外基质蛋白组成,这些蛋白是由 hiPSC 衍生的各种类型的癌症相关成纤维细胞 (CAF) 分泌的。增殖性 FPCO 在抗癌药物治疗后可以重新增殖,这表明这种类型的 FPCO 将有助于研究 PDAC 复发。因此,我们生成了 PDAC 类器官,它概括了 PDAC 组织的异质性,是筛选抗癌药物的潜在平台。版权所有 © 2023 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Nov 11

CAMcAnespie,PChaudha...
Response of cancer stem cells and human skin fibroblasts to picosecond-scale electron irradiation at 1010 -1011 Gy/s.
Stem Cell Research & Therapy
这项研究旨在首次证明用皮秒级电子束单次爆发提供的戈伊级剂量照射生物细胞的可能性,从而产生前所未有的 1010 - 1011 Gy/s 的剂量率。癌症干细胞和人类皮肤成纤维细胞受到激光驱动源的 MeV 级电子束照射。每个脉冲的剂量高达 3 Gy,具有高空间均匀性(方差系数 3-6%),时间尺度在 10 - 20 ps 范围内。在照射过程中对剂量进行了表征,发现与蒙特卡罗模拟一致。使用克隆形成测定和 53BP1 病灶形成研究了两种细胞系的细胞存活和 DNA 双链断裂修复动力学,并将结果与剂量率为 的参考 X 射线进行了比较0.49 Gy/min。高达 3 Gy 的两种细胞系的克隆形成测定结果均符合线性二次模型,其中人体皮肤的 α=(0.68±0.08) Gy-1 和 β=(0.01±0.01) Gy-2对于成纤维细胞,对于癌症干细胞,α=(0.51±0.14)Gy-1和β=(0.01±0.01)Gy-2。与 0.49 Gy/min 的照射相比,我们的实验结果表明,尽管观察到 α 参数显着增加,但高达 3 Gy 的剂量的细胞存活率没有统计学上的显着差异,这可能暗示更复杂的损伤。焦点测量显示 1011 Gy/s 和 0.49 Gy/min 的照射之间没有显着差异。这项研究证明了使用皮秒级激光产生的电子束和 1010-1011 Gy/s 超高剂量率进行放射生物学研究的可能性。初步结果表明,在统计不确定性范围内,α 参数显着增加,可能表明更高密度的电离轨道会引起更复杂的损伤。版权所有 © 2023。由 Elsevier Inc. 出版。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Nov 11

HosseinPoursadegh,Mo...
Magnetic nanocomposite through coating mannose-functionalized metal-organic framework with biopolymeric pectin hydrogel beads: A potential targeted anticancer oral delivery system.
Stem Cell Research & Therapy
这项研究设计了磁性纳米复合水凝胶珠,用于潜在的靶向抗癌口服给药系统。为此,在 Fe3O4 纳米粒子存在下,通过对苯二甲酸 (TPA) 和 (Fe(NO3)3·9H2O) 处理,通过原位方法合成了 Fe3O4/MIL-88(Fe) (FM) 纳米杂化物。然后用甘露糖作为抗癌受体对它们进行修饰,以实现靶向药物输送系统。加载甲氨蝶呤 (MTX) 后,在氯化钙交联剂存在下,将它们涂上 pH 敏感的果胶水凝胶珠,以便可以通过消化系统的酸性环境将纳米混合物转移到肠道。不同分析技术的结果表明材料被正确合成、涂覆和负载。设计的磁性纳米复合水凝胶珠表现出pH敏感性溶胀和药物释放速率,保护MTX免受胃酸性环境的影响。 MTT测试显示对结肠癌HT29细胞系具有良好的细胞毒性。值得注意的是,负载 MTX 的 FM 纳米杂化物与甘露糖 (MTX-MFM) 的功能化将其抗癌特性提高了约 20%。结果表明,所制备的新型磁性纳米复合水凝胶珠具有作为靶向抗癌口服给药系统的良好潜力。版权所有 © 2023 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Nov 10

CuicuiLiu,ZhijunXiao...
Multi-cohort validation study of a four-gene signature for risk stratification and treatment response prediction in hepatocellular carcinoma.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
肝细胞癌 (HCC) 复杂的分子景观对通过临床基因检测实现精确的风险分层提出了重大挑战。目前,缺乏可靠的基因特征可以帮助临床医生为 HCC 患者做出临床决策。我们从公共数据库中的 20 个独立队列中获得了 HCC 患者的基因表达谱。基因签名是通过采用两种机器学习算法开发的。除了在公共队列中使用高通量数据验证签名之外,我们还通过 RT-PCR 方法在 64 个 HCC 病例中验证了签名。我们比较了不同亚组之间的基因组、转录组和蛋白质组特征。我们还将我们的特征与已发表的 130 个基因特征进行了比较。我们开发了一种新型四基因特征,命名为 HCC4,它显示了预测 1300 多名 HCC 患者生存结果的巨大潜力。 HCC4 还具有预测复发和肿瘤体积倍增时间、评估经导管动脉化疗栓塞和免疫治疗反应以及 HCC 无创检测的潜力。 HCC4高评分组显示TP53、RB1和TSC1/2基因突变频率较高,细胞周期、糖酵解和缺氧信号通路活性增加,癌症干性评分较高,脂质代谢活性较低。在 7 个 HCC 队列中,与之前发布的 130 个特征相比,HCC4 在预测总生存期方面表现出更高的平均 C 指数。药物筛选表明,HCC4 评分高的患者对针对 AURKA、TUBB、JMJD6 和 KIFC1 的药物更敏感。我们的研究结果表明,HCC4 是改善风险分层和识别最有可能从 TACE 治疗中受益的 HCC 患者的强大工具、免疫疗法和其他实验疗法。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd。保留所有权利。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Nov 14

YawenWang,JiadaiXu,P...
Zanubrutinib-lenalidomide-rituximab (ZR2) in unfit diffuse large B-cell lymphoma: efficient and tolerant.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
本研究的目的是检查 zanubrutinib、rituximab 和 lenalidomide (ZR2) 在不健康的弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 患者中的有效性和安全性。还评估了 ZR2 方案的血栓或出血风险,尤其是同时服用抗血小板药物时。我们回顾性审查了 2019 年 12 月至 2022 年 2 月期间在两个医疗中心接受 ZR2 方案治疗的不合格新诊断 (ND) 和难治性或复发 (R/R) DLBCL 患者。分析了生存率(OS)、出血不良事件(AE)和血栓形成事件。此外,我们还研究了 zanubrutinib 单独使用或与来那度胺联合使用对体外和体内血小板功能的影响。共有 30 名接受 ZR2 方案的不适合患者(13 名 ND DLBCL 和 17 名 R/R DLBCL 患者)参加了该研究(中位年龄:69.5 岁)。 ND DLBCL 和 R/R DLBCL 的最终 ORR 分别为 77.0% 和 50.1%。中位随访时间为 16.6 个月。随访期间未达到中位 PFS 和 OS。 4 例患者发生皮下出血 AE,3 例患者出现严重出血事件,2 例患者观察到血栓事件。 ZR2 方案在体外和体内功能测试中抑制血小板功能(聚集、凝块回缩、扩散和激活),尤其是对胶原蛋白的反应。 ZR2 对于不适合的 DLBCL 患者来说是一种有效的治疗选择,并且具有良好的耐受性。值得注意的是,该方案抑制血小板功能。对于接受该方案治疗的患者,应谨慎使用抗血小板药物。© 2023。作者获得 Springer-Verlag GmbH 德国(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Nov 13

ItskeFraterman,Irene...
Association between pretreatment emotional distress and neoadjuvant immune checkpoint blockade response in melanoma.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
对于 IIIB-D 期黑色素瘤的治疗,新辅助免疫检查点阻断 (ICB) 的效果优于辅助 ICB,但潜在的反应生物标志物,如干扰素-γ (IFNγ) 特征和肿瘤突变负荷 (TMB) 还不够。临床前研究表明,情绪困扰 (ED) 可通过 β-肾上腺素能或糖皮质激素信号传导对抗肿瘤免疫反应产生负面影响。我们进行了事后分析,评估 PRADO 2 期试验 (NCT02977052) 中 IIIB-D 期黑色素瘤患者治疗前 ED 与新辅助 ICB 治疗后临床反应之间的关联。欧洲癌症研究与治疗组织的情绪功能量表用于识别 ED 患者 (n = 28) 与非 ED 患者 (n = 60)。调整 IFNγ 特征和 TMB 后,治疗前 ED 与主要病理反应降低(46% 对比 65%,调整后比值比 0.20,P = 0.038)显着相关,2 年无复发生存率降低(74% 对比 91%,调整后比值比 0.20,P = 0.038)。调整 IFNγ 特征后,风险比 3.81,P = 0.034),并且 2 年无远处转移生存率降低(78% 与 95%,调整后的风险比 4.33,P = 0.040)。对基线患者样本的 RNA 测序分析无法确定与这些结果减少相关的明确的 β-肾上腺素能或糖皮质激素驱动机制。治疗前 ED 可能是与黑色素瘤新辅助 ICB 后临床反应相关的一个标志物,值得进一步研究。 ClinicalTrials.gov 注册:NCT02977052 .© 2023。作者获得 Springer Nature America, Inc. 的独家许可。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Nov 13

JohnWilfredTMalabana...
Enhancing Physicochemical Properties and Biocompatibility of Hollow Porous Iron Oxide Nanoparticles through Polymer-Based Surface Modifications.
Epigenetics & Chromatin
在这项研究中,我们合成了使用聚合物(特别是壳聚糖(Chi)、聚乙二醇(PEG)和藻酸盐(Alg))进行表面修饰的中空多孔氧化铁纳米粒子(HPIONP),以提高胶体稳定性和生物相容性。对于胶体稳定性,Alg 包被的 HPIONP 保持尺寸稳定性长达 24 小时,仅增加 18%,而 Chi、PEG 和未包被的 HPIONP 则表现出更大的尺寸增加,范围为 64% 至 140%。通过评估聚合物涂层 HPIONP 的细胞活力、遗传毒性和血液相容性来评估其生物相容性。在 6.25 至 100 μg/mL 的测试浓度范围内,未包被和聚合物包被的 HPIONP 对三种正常细胞系(RAW264.7、3T3-L1 和 MCF10A)均表现出最小的细胞毒性,在最高浓度下细胞活力超过 80%。值得注意的是,根据微核测定,聚合物涂层的 HPIONP 表现出非遗传毒性,并显示出血液相容性,小鼠血液中仅出现 2-3% 的溶血,而未涂层的 HPIONP 则表现出 4-5% 的溶血。此外,我们评估了在固定磁场中暴露 2 小时后 HPIONP 对 MDA-MB-231 乳腺癌细胞的细胞毒性,结果显示,使用未涂层和聚合物涂层的 HPIONP 处理时,细胞死亡率最高分别为 38% 和 29%分别为 100 μg/mL。这种现象归因于铁催化 Fenton 和 Haber-Weiss 反应,导致活性氧 (ROS) 依赖性细胞死亡 (r ≥ 0.98)。总之,与未包被的 HPIONP 相比,水热合成和随后用聚合物进行的 HPIONP 表面修饰显示出改善的胶体稳定性、非遗传毒性和血液相容性,同时保持对正常细胞和癌细胞的细胞毒性水平非常相似。这项研究为进一步探索聚合物涂层铺平了道路,以提高磁性纳米粒子在输送抗癌药物方面的整体性能和安全性。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Nov 13

XiaobingGu,MingdongW...
TE-TSS: an integrated data resource of human and mouse transposable element (TE)-derived transcription start site (TSS).
Epigenetics & Chromatin
转座元件(TE)在基因组中含量丰富,是关键的调控元件。一些 TE 充当表观遗传调控启动子,这些 TE 衍生的转录起始位点 (TSS) 在调控与特定功能(例如癌症和胚胎发生)相关的基因方面发挥着至关重要的作用。然而,缺乏一个可系统地收集 TE 衍生的 TSS 数据的可访问数据库是当前的研究空白。为了解决这个问题,我们建立了 TE-TSS,这是人类和小鼠 TE 衍生的 TSS 的集成数据资源 (http:////xozhanglab.com//TETSS)。 TE-TSS 编译了 2681 个 RNA 测序数据集,涵盖各种组织、细胞系和发育阶段。从这些中,我们鉴定了 5768 个人类 TE 衍生的 TSS 和 2797 个小鼠 TE 衍生的 TSS,其中分别有 47% 和 38% 经过实验验证。 TE-TSS 能够全面探索 TSS 在不同样本中的使用情况,提供对组织特异性基因表达模式和转录调控元件的见解。此外,TE-TSS 比较了 15 个哺乳动物物种中 TE 衍生的 TSS 区域,增强了我们对其进化和功能方面的理解。 TE-TSS 的建立有助于进一步研究 TE 在塑造转录组景观中的作用,并为理解它们参与不同的生物过程提供宝贵的资源。© 作者 2023。由牛津大学出版社代表 Nucleic Acids 出版研究。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Nov 13

TaoGao,YinanZheng,Br...
Epigenetic Aging is Associated with Measures of Midlife Muscle Volume and Attenuation in CARDIA Study.
Epigenetics & Chromatin
GrimAge 加速 (GAA) 是一种代表生理衰老的表观遗传标记,与包括癌症和心血管疾病在内的年龄相关疾病相关。然而,GAA 与肌肉质量和功能之间的关联尚不清楚。我们在考试年 (Y) 15 (2000-01) 估计了来自年轻人冠状动脉风险发展 (CARDIA) 研究的 1118 名黑人和白人参与者的 GAA 测量值和 20 (2005-06)。在第 25 年(2010-11)访视时使用 CT 扫描测量腹部肌肉成分。我们使用多元回归模型来检查 GAA 估计值与肌肉成像测量值的关联。在 CARDIA 研究中,GAA 每升高一年,肌间脂肪组织平均升高 1.1% (95% CI 0.6%, 1.5%) [IMAT] ] 腹部肌肉的体积。 GAA 每增加一年,与平均 -0.089 亨斯菲尔德单位 (HU) (95% CI -0.146, -0.032) 较低的瘦肌肉衰减和平均 -0.049 HU (95% CI -0.092, -0.007) 较低的 IMAT 相关腹部肌肉的衰减。分层分析表明,GAA 与女性中较高的腹部肌肉 IMAT 体积相关性更强,并且仅与白人参与者的较低瘦肌肉衰减显着相关。在中年人群中,较高的 GAA 与较高的腹部肌肉 IMAT 体积和较低的瘦肌肉衰减相关。 © 作者 2023。由牛津大学出版社代表美国老年学协会出版。版权所有。如需权限,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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