尽管使用基于 CHOP 的化疗方案可在大多数犬多中心高级别 B 细胞淋巴瘤 (mhBCL) 病例中诱导缓解，但有些病例在第一个诱导方案期间出现早期复发。在这项研究中，我们检查了化疗前犬 mhBCL 的基因表达谱，并研究了它们与第一个完整的基于 CHOP 的方案期间早期复发的关系。本研究纳入了 25 例 mhBCL 病例，采用基于 CHOP 的方案作为首次诱导化疗。 16 例完成第一个完整的基于 CHOP 的方案而没有复发（S 组），9 例在化疗期间出现复发（R 组）。对肿瘤淋巴结样本进行 RNA 测序。通过比较S组和R组之间的基因表达谱来提取差异表达基因（DEG），并通过RT-qPCR验证这些基因表达水平的差异。提取的179个DEG包括与趋化因子CC基序配体、T细胞受体信号通路、PD-L1表达和PD-1检查点通路相关的基因。我们关注趋化因子CC基序配体，证实CCL4在R组中显着下调（P=0.039）。我们还关注了与T细胞信号通路相关的基因，证实R组中CD3E（P=0.039）、ITK（P=0.023）和LAT（P=0.023）基因显着上调。目前的结果表明，肿瘤细胞的变化以及肿瘤细胞与免疫细胞之间的相互作用都与诱导首次缓解的化疗效果相关。

粘膜黑色素瘤是一种罕见的恶性肿瘤；然而，据报道，亚洲人粘膜黑色素瘤的发病率高于白种人。鼻窦粘膜黑色素瘤（SNMM）是一种侵袭性恶性肿瘤，由于远处转移，预后较差。 BRAF抑制剂和MEK抑制剂的全身治疗是具有BRAF V600突变的皮肤黑色素瘤患者的护理标准之一。然而，尚未建立针对粘膜黑色素瘤患者的分子靶向治疗。由于其频率较低，相对较少的研究描述了与粘膜黑色素瘤相关的基因突变。此外，据我们所知，日本患者的基因突变尚未见报道。因此，在本研究中，我们评估了SNMM患者的遗传和临床病理特征。基于靶向二代测序，对从SNMM患者获得的总共18份组织样本进行基因突变分析，以探讨肿瘤发生的驱动因素和/或用于预测 SNMM 临床结果的候选基因。我们还对发现 CTNNB1 突变的患者进行了免疫组织化学检查。18 名患者中有 8 名 (44%) 患有基因突变。最常见的突变是 NRAS（6/18，33%），其次是 CTNNB1（2/18，11%）和 BRAF（1/18，5.6%）。一名患者同时患有 NRAS 和 CTNNB1 突变。有和没有基因突变的患者的临床结果没有显着差异。 NRAS 突变与相对较高的 T 分类和较差的生存率相关，但差异并不显着。在两个具有 CTNNB1 突变的肿瘤中均检测到 β-连环蛋白的核转位。 BRAF突变的氨基酸变化为外显子15中的K601R。在目前的研究中，未检测到BRAF V600突变。基因突变与临床结果没有显着相关性。然而，NRAS 突变可能是预后预测因子，CTNNB1 突变可能是免疫检查抑制剂的治疗效应因子。需要进行更大规模的前瞻性研究来阐明 SNMM 患者基因突变的临床重要性。版权所有 © 2023。由 Elsevier B.V. 出版。

鉴于其高发病率和死亡率，肺癌是中国的一个重大公共卫生问题。最近提出环状RNA（circRNA）参与肿瘤的发生和进展。然而，它们在肺腺癌（LUAD）发病机制、肿瘤微环境（TME）中的特殊作用以及潜在的分子机制仍不清楚。利用高通量测序分析了7对人类中的circRNA表达谱LUAD 组织。 shRNA 用于敲低 YAP1 和 FGB 基因。通过 RNA 测序和 RT-qPCR 对 circ_16601 在 LUAD 细胞中的调节作用进行分类。体外和体内研究了circ_16601对肺癌进展的影响。与邻近正常肺组织相比，circ_16601在LUAD组织中显着升高，其高表达与LUAD患者不良预后呈正相关。此外，circ_16601 过表达可促进 LUAD 细胞体外增殖，并增加小鼠体内异种移植组织的生长； circ_16601 还可以招募成纤维细胞成为癌症相关成纤维细胞。从机制上讲，circ_16601可以直接与miR-5580-5p结合，防止其降解FGB mRNA并增强其稳定性。随后，circ_16601 以 YAP1 依赖性方式促进 Hippo 通路的激活，导致 LUAD 进展。我们的研究结果为了解 circ_16601 在 LUAD 进展中的调节作用提供了宝贵的见解，并强调了其作为 LUAD 诊断和治疗靶点的潜力。总的来说，这项研究为改善这种毁灭性疾病患者的预后和生活质量提供了理论支持。© 2023。作者。

为了确定与接受新辅助放化疗 (NCRT) 的局部晚期直肠癌 (LARC) 患者的治疗反应和预后相关的基因。在我们的队列中，检查并生成了 NCRT 前 64 个肿瘤活检样本的基因表达谱。进行加权基因共表达网络分析来识别基因模块。外部验证数据集包括 GSE3493、GSE119409 和 GSE133057。使用免疫组织化学（IHC）评估候选基因的表达。 TIMER 用于评估免疫浸润。我们使用我们的数据和外部验证数据集确定并验证了预测 CCT5 和 ELF1 治疗反应的能力。 GSE133057 数据集中候选基因的生存差异趋势与我们的队列相似。高水平的 CCT5 和 ELF1 表达与 NCRT 耐药和不良预后相关。此外，还通过 IHC 方法评估了 117 例 LARC 患者样本中 CCT5 和 ELF1 的表达。基于 IHC 结果和 Cox 分析，构建了 CCT5 和 ELF1 的风险评分模型并表现良好。风险评分是 LARC 患者无进展生存期和总生存期的独立预后因素，然后用于构建列线图模型。使用基因集富集分析探讨了 CCT5 和 ELF1 的潜在机制。潜在的途径包括细胞凋亡、细胞周期和其他过程。 CCT5和ELF1表达与免疫细胞浸润显着相关。CCT5和ELF1被确定为LARC患者治疗反应和预后的生物标志物。风险评分模型和列线图有助于预测接受 NCRT 的 LARC 患者的治疗反应和生存结果。© 2023。作者。

药物-基因相互作用数据库（DGIdb，https://dgidb.org）是一个可公开访问的资源，聚合基因或基因产物、药物和药物-基因相互作用记录，以推动临床医生和研究人员的假设生成和发现。 DGIdb 5.0 是最新版本，包括大量的架构和功能更新，以支持集成到临床和药物发现流程中。 DGIdb 服务架构已分为单独的客户端和服务器应用程序，从而为应用程序编程接口 (API) 和 Web 界面的用户提供一致的数据访问。新界面是用 ReactJS 开发的，包括动态可视化和用户界面元素显示的一致性。添加了 GraphQL API 以支持对所有药物、基因、注释和相关数据的可定制查询。更新的文档为用户提供了这些新功能的示例查询和详细使用说明。此外，还添加了六个源，并且更新了许多现有源。新添加的来源包括 ChemIDplus、HemOnc、NCIt（美国国家癌症研究所同义词库）、Drugs@FDA、HGNC（HUGO 基因命名委员会）和 RxNorm。这些新来源已被纳入 DGIdb，以提供额外的记录并增强治疗药物监管批准状态的注释。在导入过程中，药物和基因分组的方法已被扩展并开发为独立的模块化标准化器。这些来源和分组方法的更新改进了 DGIdb 中 FAIR（可查找性、可访问性、互操作性和可重用性）数据表示。© 作者 2023。由牛津大学出版社代表 Nucleic Acids Research 出版。

基于 RNA 测序的 RNA 剪接变异的量化可以揭示组织和疾病特异性剪接模式。为了研究此类剪接变异，我们引入了 MAJIQlopedia，这是一本剪接变异百科全书，包含 86 个人体组织和 41 个癌症数据集。 MAJIQlopedia 报告了正常组织中总共 486 175 个选择性剪​​接点和癌症中 338 317 个选择性剪​​接点的注释和未注释剪接事件。该数据库可从 https://majiq.biociphers.org/majiqlopedia/ 获取，包括一个用户友好的界面，提供所有组织或癌症类型中每个连接点的连接使用量化的图形表示。为了证明 MAJIQlopedia 的案例使用，我们回顾了基因 WT1、MAPT 和 BIN1 的剪接变异，这些基因都具有已知的组织或癌症特异性剪接变异。我们还使用 MAJIQlopedia 来强调正常组织中 FDX1 和 MEGF9 的新剪接变异，并且我们发现了 RPS6KA6 中仅发生在两种癌症类型中的新外显子包含事件。用户可以下载数据库、请求向网络工具添加数据，或安装 MAJIQlopedia 服务器来集成专有数据。 MAJIQlopedia 可以作为研究人员的参考数据库，帮助他们了解感兴趣的基因中存在哪些剪接变异，以及了解组织或癌症特异性剪接亚型的使用。© 作者 2023。由牛津大学出版社出版代表核酸研究。

食管内镜粘膜下剥离术 (ESD) 期间的穿孔通常是由电损伤引起的。然而，在某些情况下，由于肠肌肉组织节段性缺失（SAIM）而发生穿孔，而没有医源性肌肉损伤。我们调查了食管 ESD 期间 SAIM 的发生率和临床病程。我们对 2013 年至 2019 年在日本 10 个中心进行的食管 ESD 进行了回顾性评价。1708 名患者中，有 5 名（0.29%）因食管癌接受了 ESD 并患有 SAIM。中位肌肉缺损尺寸为 20 毫米。所有病灶均被切除，未停药。切除后，三名患者使用 Endoloop 进行闭合。 4 名患者患有纵隔气肿。所有患者均接受保守治疗。SAIM 是一种非常罕见的疾病，通常仅在 ESD 期间诊断。进行食管 ESD 的医生应该了解 SAIM。当检测到 SAIM 时，应修改 ESD 技术以防止全层穿孔。版权所有 © 2023 美国胃肠内窥镜协会。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。

盆腔淋巴结切除术 (PLND) 与根治性膀胱切除术 (RC) 一起为膀胱癌患者提供重要的诊断和治疗价值。随着新辅助化疗的出现和支持标准 PLND 的前瞻性数据，关于最佳 PLND 范围和患者选择仍然存在争议。尽管 25% 的患者在 RC 时淋巴结 (LN) 呈阳性，但近 40% 的患者可能没有接受足够的 PLND。我们假设 PLND 仍然是膀胱癌治疗的一个重要方面。为了阐明淋巴结产量的预后重要性，我们对接受 RC 的异质群体 (pTanyNx/0M0) 患者进行了回顾性调查。根据监测、流行病学和最终结果 (SEER) 计划，我们确定了 pTanyNx/0M0 膀胱癌患者从 2004 年到 2015 年进行 RC。Kaplan Meier 曲线和 Cox 比例风险模型评估了癌症特异性生存。以 PLND 作为主要协变量对患者进行分析。然后，生存分析根据 LN 产量（作为连续变量和分类变量（≤10、11-20、21-30 和 >30））和 T 分期对接受 PLND 的患者进行分层。最终队列包括 pTanyNx/0M0 膀胱尿路上皮患者癌症（n=12,096）；中位随访时间为 39（IQR：17-77）个月。 81.45% 的患者进行了 PLND，中位 LN 产量为 14（IQR：7-23）。最常见的是，患者患有 T2 疾病（44.68%）。在控制年龄和 T 分期后，与未接受 PLND 的患者相比，接受 PLND 的患者 CSS 有所改善（HR=0.56，[95% CI：0.51-0.62]）。当按 LN 产量对患者进行分组时，生存率以“剂量依赖性”方式改善（>30 LN：HR=0.76，[95% CI：0.66-0.87]）。我们在将患者分为非肌层浸润性膀胱癌 (NMIBC) 和肌层浸润性膀胱癌 (MIBC) 时注意到了类似的结果。在当代 pTanyNx/0M0 膀胱癌患者的大型系列研究中，我们发现 PLND 具有显着的肿瘤学益处。较高的 LN 产量与非肌肉侵袭性和肌肉侵袭性疾病中 CSS 的改善相关。我们的数据支持即使在非肌肉侵袭性疾病中也存在隐匿性微转移的可能性。此外，鉴于辅助免疫治疗的最新进展，我们的结果强调了足够的淋巴结产量对于准确分期和最佳治疗的重要性。版权所有 © 2023 Elsevier Inc. 保留所有权利。

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PPGL）是分泌儿茶酚胺的罕见肿瘤，起源于肾上腺髓质或肾上腺外交感神经节。这些肿瘤分泌肾上腺素和去甲肾上腺素，但副神经节瘤通常只产生去甲肾上腺素，因为缺乏苯乙醇胺 N-甲基转移酶 (PNMT) 表达。复合副神经节瘤是由多种类型的神经母细胞组成的复杂肿瘤，极为罕见。我们介绍了一名 46 岁女性的病例，她的儿茶酚胺谱不典型，她在术前被诊断为嗜铬细胞瘤。然而术后病理显示，患者患有肾上腺外副神经节瘤并伴有神经节神经瘤，从而诊断为复合肿瘤。有趣的是，PNMT 在副神经节瘤和神经节神经瘤中都有表达。此外，我们回顾了报道的复合性副神经节瘤，并将其与复合性嗜铬细胞瘤的临床特征进行了比较。我们还讨论了复合性副神经节瘤病因学的各个方面以及 PNMT 在肿瘤中表达的机制。

使用移植后环磷酰胺 (PTCy)、他克莫司 (TAC) 和吗替麦考酚酯 (MMF) 预防移植物抗宿主病 (GVHD) 用于同种异体单倍体供体 (haplo) 造血细胞移植 (HCT)，其结果与匹配的非相关供体相当移植。莫菲特癌症中心的一项 II 期研究用西罗莫司 (SIRO) 代替 TAC，报告了 II-IV 级急性 GVHD 的发生率相当。尽管比较数据有限，但在这种情况下，许多中心已根据首选副作用情况用 SIRO 代替 TAC。本研究的目的是比较 haplo HCT 与 PTCy/SIRO/MMF 与 PTCy/TAC/MMF 的结果。我们回顾性比较了 PTCy/SIRO/MMF 与 PTCy/TAC/MMF 的单倍体 HCT 结局。包括 2014 年至 2019 年间在莫菲特癌症中心或希望之城国家医疗中心接受单倍体供体 T 细胞充满外周血干细胞移植 HCT 治疗血液恶性肿瘤的所有连续患者。总共包括 423 名患者，其中 84 名（20 名） %）收到了 SIRO，339（80%）收到了 TAC。所有患者的中位年龄为 54 岁（范围为 18 至 78 岁），整个研究队列的中位随访时间为 30 个月。 SIRO组≥60岁的患者比例较高（58% vs 34%，P=<.01），并且各组在诊断类型、预处理方案和巨细胞病毒血清状态方面也存在差异。第 100 天的 II-IV 级急性 GVHD 发生率（45% 对比 47%，P=.6）或术后 2 年的慢性 GVHD 发生率（47% 对比 54%，P=.79）没有显着差异。血细胞CT。在多变量分析中，TAC 在第 30 天的中性粒细胞植入明显更好（OR = 0.30，CI 0.1 至 0.83，P = 0.02），中位植入时间为 17 天，而 SIRO 为 18 天，但血小板植入与 SIRO 相似。两组。另外，在多变量分析中，GVHD 预防类型对急性或慢性 GVHD、非复发死亡率、复发、无 GVHD 无复发生存期、无病生存期或外周血单倍体 HCT 后的总生存期没有显着影响。这些结果表明 SIRO与 TAC 结合 PTCy/MMF 预防 GVHD 相比，它是一种可比的替代方案，尽管外周血单倍体 HCT 后植入延迟，但总体临床结果相似。虽然 TAC 仍然是护理标准，但可以根据这些药物的副作用情况并考虑 HCT 中患者的医疗合并症来替代 SIRO。版权所有 © 2023。由 Elsevier Inc. 出版。