研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY
2023 Nov 10
TanweiYuan,DominicEd...
CpG-biomarkers in tumor tissue and prediction models for the survival of colorectal cancer: a systematic review and external validation study.
CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY
该研究旨在确定基于 CpG 甲基化的结直肠癌 (CRC) 预后的预后生物标志物和预测模型,并在大型外部队列中对其进行验证。我们进行了系统性搜索,分析了 28 项研究中的 298 个独特的 CpG 和 12 个基于 CpG 的预后模型。调整临床变量后,48 个 CpG 和 5 个预后模型被证实与生存相关。然而,模型的辨别能力不足,受试者工作特征曲线下面积在0.53至0.62之间。校准准确性大多较差,并且没有观察到超出传统临床变量的显着附加预后价值。所有预后模型也被评为具有高偏倚风险。虽然一小部分 CpG 显示出潜在的临床实用性和普遍性,但基于 CpG 的预后模型表现不佳且缺乏临床相关性。版权所有 © 2023。由 Elsevier B.V. 出版。
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BIOLOGICAL PROCEDURES ONLINE
2023 Nov 13
BinLuo,ZujunQue,Xiny...
Identification of exosome protein panels as predictive biomarkers for non-small cell lung cancer.
BIOLOGICAL PROCEDURES ONLINE
非小细胞肺癌(NSCLC)仍然是全球癌症相关死亡的主要原因,这主要是由于其转移倾向。诊断为局部原发癌的患者比转移癌患者的生存率更高。因此,必须发现用于早期检测 NSCLC 和及时预测肿瘤转移的生物标志物,以改善患者的预后。在这里,我们利用综合方法来分离和表征 NSCLC 患者以及健康个体的血浆外泌体。然后,我们进行了蛋白质组学分析和平行反应监测,以识别和验证血浆外泌体中排名最高的蛋白质。我们的研究表明,转移的 NSCLC 患者的外泌体中的蛋白质组与健康个体的蛋白质组明显不同。前者比后者具有更大的直径和更低的外泌体浓度。此外,在 1220 个已鉴定的外泌体蛋白中,我们鉴定了两个不同的生物标志物组。第一个生物标志物组(FGB、FGG 和 VWF)显示出早期 NSCLC 诊断的潜力,并证明与 NSCLC 患者的生存时间直接相关。第二组生物标志物(CFHR5、C9 和 MBL2)成为评估 NSCLC 转移的潜在生物标志物,其中单独的 CFHR5 与 NSCLC 患者的总体生存率显着相关。这些发现强调了血浆外泌体生物标志物用于早期 NSCLC 诊断的潜力和转移预测。值得注意的是,CFHR5 是 NSCLC 患者有希望的预后指标。外泌体生物标志物的临床应用为增强 NSCLC 的治疗提供了潜力。© 2023。作者。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Nov 11
ArunaSJaiswal,Arijit...
TATDN2 resolution of R-loops is required for survival of BRCA1-mutant cancer cells.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
BRCA1 缺陷细胞的 IRE1 RNase 增加,可降解多种 microRNA。其中一种 miR-4638-5p 的重建表达导致 BRCA1 缺陷的癌细胞产生合成致死性。我们发现 miR-4638-5p 抑制 TATDN2 的表达,TATDN2 是 TATD 核酸酶家族中一个尚未被充分表征的成员。我们发现人类 TATDN2 对双链发夹 RNA 结构具有 RNA 3' 核酸外切酶和核酸内切酶活性。鉴于 TATDN2 对发夹 RNA 的切割,以及 BRCA1 缺陷细胞难以解析 R 环,我们测试了 TATDN2 是否可以解析 R 环。使用体外生化重建测定,我们发现 TATDN2 与 R 环结合,并以 Mg2 依赖性方式降解 RNA 链,但不降解体外多种形式 R 环的 DNA。 Alphafold-2 预测氨基酸 E593 和 E705 的突变会螯合必需的 Mg2+ 阳离子,从而完全消除了这种 R 环解析活性。耗尽 TATDN2 会增加细胞 R 环、DNA 损伤和染色体不稳定。 TATDN2 缺失导致 R 环增加的情况下复制叉进展不良。值得注意的是,我们发现 TATDN2 对于 BRCA1 缺陷型癌细胞的生存至关重要,但对于同源 BRCA1 丰富的癌细胞来说则不然。因此,我们提出 TATDN2 是治疗 BRCA1 缺陷型癌症的新靶点。© 作者 2023。由牛津大学出版社代表 Nucleic Acids Research 出版。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Nov 13
EiichiSasaki,Hoshino...
Expression of CD5 in salivary gland tumors: an ancillary marker for carcinoma showing thymus-like differentiation (CASTLE) of the major salivary gland.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
最近,已经发现了发生在主要唾液腺中的胸腺样分化(CASTLE)癌病例。为了评估 CD5 免疫组织化学在区分唾液腺 CASTLE 与其他类型唾液腺肿瘤中的诊断价值,我们评估了 109 个唾液腺肿瘤中的 CD5 表达,涵盖 23 种不同的组织学类型,包括唾液腺 CASTLE。此外,我们回顾了之前报道的 10 例唾液 CASTLE 病例。大多数唾液CASTLE病例(10/11,91%)显示出强烈的CD5表达。相比之下,108 个非唾液腺 CASTLE 肿瘤中的 104 个 (96%) CD5 呈阴性,而其余 4 个肿瘤 (3.7%)(所有这些肿瘤在组织学上均为 Warthin 肿瘤)显示 CD5 局灶性阳性,强度为弱至中度。总之,本研究的结果支持 CD5 免疫组织化学可用于区分唾液腺 CASTLE 与其他组织学类型的唾液腺肿瘤。该肿瘤中异常的 CD5 表达可能与肿瘤微环境有关。© 2023。作者获得 Springer-Verlag GmbH 德国(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Nov 13
MAdelitaVizcaino,And...
Pseudoendocrine sarcoma: clinicopathologic, molecular, and epigenetic features of one case.
Epigenetics & Chromatin
假内分泌肉瘤(PES)是最近描述的一种肿瘤,通常发生在椎旁软组织中。在组织学上,PES 类似于分化良好的神经内分泌肿瘤,但缺乏上皮/神经内分泌标志物的表达,并且大多数显示异常的核 β-连环蛋白阳性。我们描述了一种 PES 的临床病理学和分子特征以及 DNA 甲基化谱。一名 52 岁男性切除的椎旁软组织肿块显示神经内分泌样肿瘤,角蛋白和突触素呈阴性,并显示弥漫性核 β-连环蛋白表达。靶向 NGS 证实了 CTNNB1 (p.S37C) 突变。全基因组甲基化分析显示与中枢神经系统肿瘤(版本 11b6 和 12b6)或肉瘤分类器(校准分数≤0.3)中的任何甲基化类别都不匹配,但与最近报道的 PES 聚类在一起,其中也进行了甲基化分析。手术后 18 个月内,他一直保持无病状态,随后又进行了放化疗。随着对更多病例的检查,我们的研究结果表明 PES 可能具有独特的甲基化分析特征。© 2023。作者获得 Springer-Verlag GmbH 德国(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Nov 10
YuanyuanChen,ZhengSo...
Liuwei Wuling Tablet relieves the inflammatory transformation of hepatocellular carcinoma by inhibiting the PI3K/AKT/NF-κB signalling pathway.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
六味五灵片(LWWL)是经中国国家药品监督管理局(NMPA)批准的中成药。临床上,它用于治疗肝细胞癌(HCC)之前的一系列肝脏疾病,包括肝炎、肝纤维化和肝硬化。 LWWL被认为可以抑制HCC的炎症转化,这可能对HCC的预防和治疗产生积极影响。然而,其确切的作用机制仍不清楚。为了研究LWWL如何有效治疗HCC并验证该过程中涉及的通路,建立二乙基亚硝胺(DEN)诱导的HCC体内模型来研究LWWL的作用关于 HCC 的发展。分析大鼠血清的天冬氨酸转氨酶(AST)、丙氨酸转氨酶(ALT)、碱性磷酸酶(ALP)和γ-谷氨酰转肽酶(GGT)。大鼠肝组织用苏木精和伊红(H
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Nov 07
ARRao,VNoronha,ARama...
Correlation of the Geriatric Assessment with Overall Survival in Older Patients with Cancer.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
全球指南建议所有接受化疗的老年癌症患者应接受老年评估。然而,老年评估的利用往往受到其时间密集性的限制,这限制了其在资源有限和需求高的环境中的采用。缺乏证据将老年评估结果与印度次大陆的生存率联系起来。因此,本研究的目的是评估老年评估对印度老年癌症患者生存的影响,并确定与这些老年癌症患者生存相关的因素。这是一项观察性研究,在老年肿瘤诊所进行塔塔纪念医院(印度孟买)。纳入了接受老年评估的 60 岁及以上癌症患者。我们评估了非肿瘤老年领域的功能和跌倒、营养、合并症、认知、心理学、社会支持和药物治疗。在两个或多个领域表现出损伤的患者被归类为虚弱。2018 年 6 月至 2022 年 1 月期间,我们招募了 897 名患者。中位年龄为 69 岁(四分位间距 65-73)岁。常见的恶性肿瘤为肺癌(40.5%)、食道癌(31.9%)和泌尿生殖系统(12.1%); 54.6%患有转移性疾病。根据老年评估结果,767 名(85.4%)患者身体虚弱。健康患者的估计中位总生存期为 24.3(95% 置信区间 18.2-未达到)个月,而体弱患者的估计中位总生存期为 11.2(10.1-12.8)个月(风险比 0.54;95% 置信区间 0.41-0.72,P < 0.001 )。在调整年龄、性别、原发肿瘤和转移状态后,总生存率的这种差异仍然显着(风险比 0.56;95% 置信区间 0.41-0.74,P < 0.001)。在体能状态为 0 或 1 的患者 (n = 454) 中,365 名 (80.4%) 身体虚弱;健康状态 0-1 组的中位总生存期为 33.0 个月(95% 置信区间 24.31-未达到),而体弱患者的中位总生存期为 14.4 个月(95% 置信区间 12.25-18.73)(风险比 0.50; 95% 置信区间 0.34-0.74,P = 0.001)。在多变量分析中,预测生存的老年评估领域是功能(风险比 0.68;95% 置信区间 0.52-0.88;P = 0.003)、营养(风险比 0.64;95% 置信区间 0.48-0.85,P = 0.002)和认知(风险比 0.67;95% 置信区间 0.49-0.91,P = 0.011)。老年评估是印度老年癌症患者生存的有力预后工具。即使在被认为最适合的患者群体(即表现状态 0 和 1)中,老年评估也具有预后意义。我们的研究再次强调了老年评估对于计划进行癌症定向治疗的所有老年患者的至关重要性。版权所有 © 2023 . 爱思唯尔有限公司出版
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Nov 12
MagdaAAkl,NoraAElMah...
Design, spectral, molecular modeling, antimitotic, analytical and mechanism studies of phenyl isothiocyanate Girard's T derived metal complexes.
Cellular & Molecular Immunology
配体N-{[(苯基氨基)硫代甲基]肼基羰基甲基}三甲基氯化铵(PTHAC)由异硫氰酸苯酯和Girard-T(三甲基铵乙酰肼)以摩尔比(1:1)回流制备。合成并纯化了NiCl2·6H2O、CuCl2·2H2O和Co(CH3COO)2·6H2O的金属配合物。使用元素分析、磁矩、光谱(IR、UV-Vis)等多种仪器性能对 PTHAC 及其 Cu(II)、Co(II) 和 Ni(II) 金属配合物 (1-3) 进行了表征、 1H NMR、质量)和热分析(TGA 和 DTG)。元素分析、磁矩、光谱(IR、UV-Vis、1H NMR、质量)和热分析(TGA 和 DTA)的结果提供了以下结构:产生的配体及其(1-3)络合物。根据光谱结果,PTHAC 作为 O、N 和 S 三齿供体,与铜 (II)、钴 (II) 和镍 (II) 离子形成具有八面体几何形状的单核配合物。所有原子性质,包括键长、键角、HOMO、LUMO、偶极矩和电荷,均已确定。 PTHAC 和产生的 (1-3) 复合物针对乳腺癌细胞的细胞毒活性已被研究并与分子模型相关。与游离配体 CoII-L 和 NiII-L 相比,CuII-L 复合物更有效地抑制乳腺癌细胞生长。此外,PTHAC 配体还成功应用于使用油酸表面活性剂 (HOL) 通过浮选和分光光度法测定多种天然水、经过认证的矿石和药物样品中 Co(II) 的分离。在 pH 6.5 时,PTHAC 与 Co(II) 反应生成深绿色 (1:1) Co(II):PTHAC 复合物,使用油酸 (HOL) 表面活性剂可显着漂浮该复合物。影响分离程序的不同实验变量,例如对 pH、Co(II) 浓度、HOL、PTHAC、温度等进行了研究。 Co(II) 的线性范围为 (0.1-7.0) mgL-1。在水层和浮渣层中,有色络合物的摩尔吸光系数分别为 0.14 × 104 和 0.16 × 105Lmol-1 cm-1。 LOD 为 0.04 mgL-1,与 3.7 × 10-3 µg cm-2 的 Sandell 灵敏度相关,预富集因子为 200,RSD% (n = 5) 小于 4.2%。此外,还研究了PTHAC与Cu(II)、Co(II)和Ni(II)的配位过程以及使用HOL表面活性剂浮选PTHAC-Co(II)络合物过程中涉及的机理。阐明。© 2023。作者。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Nov 12
JieSu,YahuiLiu,JingZ...
CDC-NET: a cell detection and confirmation network of bone marrow aspirate images for the aided diagnosis of AML.
Cellular & Molecular Immunology
病理学中的标准化形态学评估通常是定性的。基于形态学对骨髓穿刺图像中的有核细胞进行分类和定性分析对于急性肌样白血病(AML)、急性淋巴细胞白血病(ALL)和骨髓增生异常综合征(MDS)等的诊断至关重要。 - 由于骨髓抽吸图像的复杂性,准确识别有核细胞并计算细胞百分比非常耗时且困难。本文提出了一种骨髓穿刺图像的深度学习分析模型,称为细胞检测和确认网络(CDC-NET),通过提高细胞检测和识别的准确性来辅助诊断AML。具体来说,我们以骨髓穿刺图像中的有核细胞为检测对象来建立模型。由于不同类别的一些细胞具有相似的形态,分类错误是不可避免的。我们设计了一个确认网络,其中多个经过训练的分类器充当病理学家,通过投票方法确认细胞类别。为了证明所提出方法的有效性,对临床微观数据集进行了实验。 CDC-NET的召回率和精度分别为78.54%和91.74%,我们的方法的漏检率低于其他流行方法。实验结果表明,所提出的模型具有用于抽吸涂片病理分析和 AML 辅助诊断的潜力。© 2023。国际医学与生物工程联合会。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Nov 11
ZhenXu,ChristofferFl...
Uridine-cytidine kinase 2 potentiates the mutagenic influence of the antiviral β-d-N4-hydroxycytidine.
Cellular & Molecular Immunology
Molnupiravir (EIDD-2801) 是一种抗病毒药物,已获批用于治疗严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV2) 感染。用莫努匹拉韦活性形式 β-d-N4-羟基胞苷(NHC 或 EIDD-1931)处理细菌或细胞系会诱导 DNA 突变。然而,这些结果与药物注册期间进行的体内遗传毒性研究形成鲜明对比。使用 CRISPR 筛选,我们发现失活嘧啶补救途径成分尿苷胞苷激酶 2 (Uck2) 可使细胞对 NHC 更具耐受性。短期暴露于 NHC 会增加小鼠骨髓细胞系的突变率,其中大多数突变是 T:A 到 C:G 的转变。 Uck2 失活会损害 NHC 的诱变活性,而 Uck2 的过度表达会增强诱变作用。 UCK2 在许多癌症和细胞系中表达上调。我们的结果表明,核糖核苷代谢的差异导致了在癌细胞系和原发组织中观察到的 NHC 的可变致突变性。© 作者 2023。由牛津大学出版社代表 Nucleic Acids Research 出版。
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