研究动态
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Nov 10
ShixinZhao,YongkangZ...
System analysis based on the pyroptosis-related genes identifes GSDMD as a novel therapy target for skin cutaneous melanoma.
GENES & DEVELOPMENT
皮肤黑色素瘤(SKCM)是最具侵袭性的皮肤癌,占皮肤相关癌症死亡率的 75% 以上。作为一种新发现的程序性细胞死亡,焦亡已被发现与肿瘤进展密切相关。然而,SKCM 中焦亡的预后意义仍然难以捉摸。从癌症基因组图谱 (TCGA) 和基因型组织表达 (GTEx) 数据库中获得了总共 469 个 SKCM 样本和 812 个正常样本。首先,鉴定了正常样本和SKCM样本之间差异表达的细胞焦亡相关基因(PRG)。其次,我们建立了基于单变量 Cox 和 LASSO Cox 回归分析的预后模型,该模型在 GSE65904 的测试队列中得到了验证。第三,使用列线图来预测 SKCM 患者的生存概率。 R 包“pRRophetic”用于识别低风险组和高风险组之间的药物敏感性。使用“immuneeconv”R 包评估肿瘤免疫浸润。最后,探讨了 GSDMD 和 SB525334 在 A375 和 A2058 细胞中的功能。基于单变量 Cox 和 LASSO 回归分析,我们建立了一个预后模型,确定了 8 个 PRG(AIM2、CASP3、GSDMA、GSDMC、GSDMD、IL18、NLRP3 和NOD2),这在测试队列中得到了验证。根据风险评分中位数将 SKCM 患者分为低风险组和高风险组。 Kaplan-Meier 生存分析显示,高危患者的总生存期短于低危患者。此外,时间依赖性 ROC 曲线验证了风险模型预测 SKCM 预后的准确性。更重要的是,鉴定出4种小分子化合物(SB525334、SR8278、吉西他滨、AT13387),它们可能是不同风险组患者的潜在药物。最后,GSDMD 的过表达和 SB525334 治疗抑制 SKCM 细胞的增殖、迁移和侵袭。在本研究中,我们构建了基于 PRG 的预后模型,并将 GSDMD 确定为潜在的治疗靶点,这为 SKCM 治疗提供了新的见解。© 2023。作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Nov 10
JifeiWang,WangjieJia...
Exosome-derived miR-182-5p promoted cholangiocarcinoma progression and vasculogenesis by regulating ADK/SEMA5a/PI3K pathway.
GENES & DEVELOPMENT
越来越多的证据表明 miRNA 调节参与肿瘤发生和恶性表型的关键基因的表达。本项目旨在探讨miR-182-5p在胆管癌进展中的作用及机制。通过分析TCGA和GEO数据库,结合组织表达水平,确定miR-182-5p是其中之一。最有价值的研究 miRNA。 miR-182-5p 与下游靶基因之间的功能和关系均通过体外和体内实验验证。采用甲基化特异性PCR和亚硫酸氢盐测序检测下游基因启动子甲基化水平变化。我们发现miR-182-5p可以被胆管癌分泌的外泌体摄取。此外,外泌体衍生的miR-182-5p通过靶向ADK/SEMA5a促进血管内皮细胞增殖和迁移并诱导血管生成。随后,PI3K/AKT/mTOR 信号通路被激活,最终引起对吉西他滨和顺铂的耐药。我们的研究结果表明 miR-182-5p/ADK/SEMA5a 轴可能作为胆管癌的潜在治疗靶点。© 2023 John Wiley
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Nov 09
YanZhang,YunGao,Feng...
Long noncoding RNA NRAV in the 12q24.31 risk locus drives gastric cancer development through glucose metabolism reprogramming.
GENES & DEVELOPMENT
长非编码 RNA (lncRNA) 是介导癌症风险的重要候选者。在这里,我们的目的是确定单核苷酸多态性(SNP)诱导的lncRNA的风险,并研究它们在胃癌(GC)发展中的作用。通过整合GC组织中lncRNA的差异表达分析和正常胃组织和GC组织中的表达数量性状位点(eQTL)分析,以及基于GC全基因组关联研究(GWAS)和独立验证研究的遗传关联分析,我们确定了四个与 GC 风险一致相关的 lncRNA 相关 SNP,包括 SNHG7 (OR = 1.16, 95%CI: 1.09 - 1.23)、NRAV (OR = 1.11, 95%CI: 1.05 - 1.17)、LINC01082 (OR = 1.16) ,95%CI:1.08 - 1.22)和 FENDRR(OR = 1.16,95%CI:1.07 - 1.25)。我们进一步发现 12q24.31 处的功能性 SNP rs6489786 增加远端增强子处 MEOX1 或 MEOX2 的结合,并导致 NRAV 上调。功能测定表明,NRAV 加速 GC 细胞增殖,同时抑制 GC 细胞凋亡。从机制上讲,NRAV 通过电子传递链降低关键亚基基因的表达,从而驱动葡萄糖代谢从有氧呼吸重编程为糖酵解。这些发现表明,调节 lncRNA 表达是促进 GC 发展的风险相关变异的关键机制。© 作者 2023。由牛津大学出版社出版。版权所有。如需权限,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Nov 11
MargaretMEmmet,Yuchi...
Patient decisions regarding cancer gene panel testing: An exploratory study.
GENES & DEVELOPMENT
这项研究检查了癌症遗传咨询诊所患者选择特定多基因面板测试的相关因素。我们对 2019 年在马萨诸塞州总医院癌症风险评估中心 (CCRA) 接受测试前遗传咨询的患者及其遗传咨询师进行了调查,以评估人口和临床特征、患者担忧和咨询结果。最终,228 名符合条件的参与者完成了调查,其中 85.1% 的人同意进行基因检测。在选择测试的人中,56.2% 选择了可用的最大的组合类型,即包含可作用和不可作用基因的泛癌组合。白人患者比非白人患者更有可能进行检测。在测试人员中,提供的测试选项数量、参与者的教育程度、年龄和 NCCN 指南状态与患者在四个面板选项之间的选择相关。一些患者的担忧,包括结果对未来癌症筛查和家庭动态的影响,也与测试选择有关。其他几个参与者特征,包括收入、癌症诊断和家庭结构,似乎并不能预测测试选择。我们的结果证实了患者对大型基因组的偏好,并确定了患者特征、关注点和测试选择之间有限的关联。然而,我们注意到,大量参与者没有选择最常选择的测试,并且测试选择很难根据临床和人口统计因素进行预测。我们的结果还进一步证明了癌症基因检测中存在的差异。研究的局限性不允许我们的研究结果推广到所有癌症遗传咨询患者。需要进一步的研究来检验患者在癌症环境中如何以及为何在多种基因测试选项之间进行选择。这项研究是第一个检查患者在全方位多基因组选项之间选择的研究之一。© 2023 国家遗传咨询师协会。
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EUROPEAN RADIOLOGY
2023 Nov 11
AnastasiaKALKwee,Bar...
Bronchiectasis is associated with lower lung function in lung cancer screening participants.
EUROPEAN RADIOLOGY
支气管扩张是胸部计算机断层扫描 (CT) 中常见的偶然发现,但其与肺癌筛查的相关性尚不完全清楚。我们调查了患有或不患有慢性阻塞性肺病 (COPD) 的肺癌筛查参与者中支气管扩张与呼吸道症状、肺功能和肺气肿之间的关联。我们纳入了来自荷兰-比利时肺癌筛查试验 (NELSON) 的 3260 名(戒烟者)吸烟者)。胸部放射科医生对支气管扩张进行评分。通过独立 t 检验和多变量回归检查与肺功能(FEV1% 预测值、FEV1/FVC)、呼吸道疾病(咳嗽、呼吸困难、喘息、粘液分泌过多)和 CT 量化肺气肿(第 15 个百分位)的关系。存在于 5.4% (n = 175/3260)。患有和不患有 COPD 的受试者之间的患病率没有差异(68/1121 [5.9%] 与 109/2139 [5.1%];p = .368)。患有支气管扩张的 COPD 受试者的 FEV1% 预测值较低(76.2% vs. 85.0%;p < .001),FEV1/FVC 较低(0.58 vs. 0.62;p< .001),且肺气肿较多(- 938 HU vs. - 930 HU;p = .001)比没有支气管扩张的 COPD 受试者高。在 COPD 受试者中,支气管扩张与较低的 FEV1% 预测 (B =  - 7.7; CI [- 12.3, - 3.3])、较低的 FEV1/FVC (B =  - 2.5; CI [- 4.3, - 0.8]) 独立相关,更多咳嗽(OR 2.4;CI [1.3,4.3])、更多粘液分泌过多(OR 1.8;CI [1.0,3.1])和更多呼吸困难(OR 2.3;CI [1.3,3.9])。在没有 COPD 的患者中 (n = 2139),支气管扩张与更多的咳嗽、粘液分泌过多和喘息相关,但与肺功能恶化无关。我们的肺癌筛查参与者中有 5.4% 存在支气管扩张,并且与更多的呼吸道症状和喘息相关。 ,慢性阻塞性肺病患者,肺功能较低,肺气肿较多。在肺癌筛查人群中,支气管扩张的患病率为5.4%,严重程度主要为轻度。除非同时存在轻度慢性阻塞性肺病,否则这一发现几乎没有临床意义。在这些受试者中,支气管扩张与肺功能降低、更多呼吸道症状和更多肺气肿有关。• 5.4% 的肺癌筛查参与者中发现支气管扩张,其中包括患有或不患有轻度慢性阻塞性肺病的(前)吸烟者。 • 在患有轻度慢性阻塞性肺病的患者中,支气管扩张与肺功能降低、更多呼吸道症状和更多肺气肿相关。 • 轻度支气管扩张的偶然发现与肺癌筛查人群的相关性不大,除非同时存在慢性阻塞性肺病。© 2023。作者获得欧洲放射学会的独家许可。
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DRUG DISCOVERY TODAY
2023 Nov 08
FarhanMazahir,Rajeev...
Bioinspired theranostic quantum dots: paving the road to a new paradigm for cancer diagnosis and therapeutics.
DRUG DISCOVERY TODAY
尽管进行了广泛的研究,但大多数类型的癌症仍然缺乏完全治愈的方法。基于纳米技术的载体,如脂质体、纳米粒子(NP)、树枝状聚合物、纳米乳剂和其他纳米载体,可以靶向癌细胞,但它们在体内的命运是不可预测的。仿生量子点 (BQD) 具有增强的水溶性、极低的毒性、生物相容性、易于生物功能化和选择性癌症靶向性。鉴于其光致发光、高纵向弛豫值、激光照射时的光热效应、产生单线态氧以及用于气体治疗的 H2S,BQD 是优异的癌症治疗诊断剂。在这篇综述中,我们重点介绍了 BQD 的治疗诊断应用以及与之相关的现有挑战。版权所有 © 2023。由 Elsevier Ltd 出版。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Nov 10
DianeDuroux,Christia...
Graph-based multi-modality integration for prediction of cancer subtype and severity.
Disease Models & Mechanisms
治疗前的个性化癌症筛查为提高诊断准确性和治疗结果铺平了道路。大多数方法仅限于单一数据类型,并且不考虑特征之间的相互作用,而忽略了多模态和系统生物学可以提供的补充见解。在这个项目中,我们演示了使用图论通过单个网络进行数据集成,其中节点和边是特定于个体的。我们展示了早期、中期和晚期基于图形的 RNA-Seq 数据和组织病理学全幻灯片图像融合的结果,用于预测癌症亚型和严重程度。开发的方法如下:(1)我们创建单独的网络; (2)我们从这些图中计算个体之间的相似度; (3)我们在相似度矩阵上训练我们的模型; (4)我们使用宏F1分数来评估性能。管道元素的优缺点是在公开的现实数据集上进行评估的。我们发现基于图的方法可以比不研究交互的方法提高性能。此外,与基于单个数据的模型相比,合并多个数据源通常可以改善分类,尤其是通过中间融合。所提出的工作流程可以轻松适应其他疾病环境,以加速和增强个性化医疗保健。© 2023。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Nov 10
ZijianChen,PanyunWu,...
The association of statin therapy and cancer: a meta-analysis.
Disease Models & Mechanisms
他汀类药物通常用于降低胆固醇,并已被证明对动脉粥样硬化性心血管疾病具有显着益处。然而,他汀类药物治疗是否会降低癌症风险仍存在争议。在这项研究中,我们通过对随机对照试验进行全面的荟萃分析,研究了他汀类药物治疗对癌症发病率和死亡率的影响。通过 Cochrane、Embase、Medline 和 PubMed 进行系统检索,以查找符合条件的随机对照试验相关数据他汀类药物治疗和肿瘤学。我们的主要终点是癌症发病率和死亡率。本研究使用了固定效应模型。该荟萃分析包括三十五项随机对照研究。 28 项纳入的研究报告了癌症发病率,18 项研究报告了癌症死亡率。汇总结果表明,与安慰剂相比,他汀类药物并未降低癌症发病率[OR = 0.99,95% CI (0.95,1.03)]。此外,他汀类药物并未降低癌症死亡率[OR = 0.99,95% CI (0.91,1.07)]。这项研究还进行了一些亚组分析,结果显示他汀类药物对泌尿生殖癌和乳腺癌等癌症亚型没有影响。他汀类药物的类型以及他汀类药物的长期治疗均对癌症发病率和死亡率没有影响。通过综合分析,我们发现他汀类药物治疗在保护心血管系统的同时并不能降低癌症发病率或死亡率。Prospero CRD42022377871.© 2023。作者。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Oct 31
DimitraPAnastasiadou...
An emerging paradigm of CXCL12 involvement in the metastatic cascade.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
趋化因子 CXCL12,也称为基质细胞衍生因子 1 (SDF1),已成为驱动癌症进展的复杂分子网络中的关键调节因子。作为肿瘤微环境的影响因素,CXCL12发挥着多方面的作用,超越了其作为诱导侵袭和转移的趋化因子的传统作用。事实上,CXCL12 已被赋予与上皮间质转化、癌细胞干性、血管生成和免疫抑制相关的功能,所有这些目前都被视为有助于其他癌症标志中的“转移级联”的特殊生物程序。它与其同源受体 CXCR4 相互作用,引发一系列事件,不仅塑造肿瘤细胞的转移潜力,而且定义了支持转移定植的次级器官内的生态位。鉴于 CXCL12 在转移级联中的深远影响,了解其机制基础对于有针对性地消除转移过程中的限速步骤至关重要。本综述旨在全面概述有关 CXCL12 在癌症转移中的作用的当前知识,特别是其分子相互作用,使其作为治疗靶点的潜力合理化。版权所有 © 2023 作者。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Nov 11
Yan-YunShu,Li-LinHu,...
Rifaximin Prevents Intestinal Barrier Dysfunction and Alleviates Liver Injury in MCT-induced HSOS Mice.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
利福昔明是肝脏和肠道疾病治疗策略的有效组成部分。然而,利福昔明治疗肝窦阻塞综合征(HSOS)的疗效尚未探讨。本研究旨在探讨利福昔明治疗HSOS的疗效及机制。通过野百合碱(MCT,800 mg/kg)建立小鼠HSOS模型,并部分HSOS小鼠灌胃给予利福昔明。然后,根据肝脏病理结果、肝脏促炎细胞因子、丙氨酸转氨酶和天冬氨酸转氨酶水平评估利福昔明在 HSOS 中的疗效。使用Ussing小室评估肠道通透性,通过蛋白质印迹和实时聚合酶链反应测量紧密连接(TJ)蛋白以评估肠道屏障完整性。然后,通过酶联免疫吸附测定法评估血清促炎细胞因子水平。随后进行体外实验,确定利福昔明与TJ蛋白的关系。利福昔明有效减轻MCT诱导的HSOS肝损伤,抑制肝脏促炎细胞因子的表达,降低血清肿瘤坏死因子-α和白细胞介素的水平-6。此外,利福昔明降低肠道通透性,改善肠道屏障完整性,促进TJ蛋白表达。结果表明,MCT诱导的HSOS中肠道屏障完整性被破坏。利福昔明对 MCT 诱导的 HSOS 的显着缓解可能与通过调节 TJ 蛋白表达来修复肠道屏障完整性有关。© 2023。华中科技大学。
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