组织中的 Neuropilin 2 (NRP2) 表达是侵袭性前列腺癌的独立预后因素。由于 NRP2 通路激活被认为部分是通过继发性耐药发生的，因此诊断时收集的初始组织活检标本中 NRP2 的量化在识别发病和死亡风险最高的患者方面可能作用有限。鉴于转移组织只是偶尔获得用于分析，因此需要开发指示 NRP2 通路激活的血浆生物标志物，以潜在地告知前列腺癌预后。因此，我们研究了 NRP2 或血管内皮生长因子 C (VEGF-C)（一种已知的 NRP2 可溶性配体）的血浆水平是否可以预测前列腺癌。我们假设血浆 NRP2 和 VEGF-C 与更晚期的疾病或复发性疾病有关。通过酶联免疫分析对取自机会性生物库中 145 名前列腺癌患者的血浆样本中的 NRP2 和 VEGF-C 水平进行定量。这些患者要么（1）新诊断（N = 28），（2）缓解期（N = 56），或（3）疾病复发（N = 61）。来自 15 名没有已知恶性肿瘤的成年男性的血浆样本作为比较队列。进行统计分析以调查血浆 NRP2/VEGF-C 与患者结果的关系，调整年龄、种族、前列腺特异性抗原 (PSA)、格里森评分和诊断时的肿瘤分期。NRP2 和 VEGF-C 水平均未受到影响。与非癌症对照相比，癌症患者存在显着差异。我们观察到血浆 NRP2 与疾病严重程度之间没有明确的关联。血浆 VEGF-C 增加与疾病缓解显着相关，并与 I/II 期和中危格里森评分相关。 NRP2 和 VEGF-C 均与 PSA 水平无关。尽管组织 NRP2 表达与严重疾病相关，但血浆 NRP2 并未观察到这一点。血浆 NRP2 水平与疾病严重程度或复发无关。 VEGF-C 在缓解期和病情较轻的患者中最高。需要进一步的研究来确定评估肿瘤 NRP2 状态的非侵入性方法。© 2023 作者。 《前列腺》由 Wiley periodicals LLC 出版。

可以从癌症患者的血液和/或尿液中分离游离 DNA (cfDNA) 并进行测序。传统的短读长测序缺乏可部署性和速度，并且可能对短 cfDNA 片段产生偏差。在这里，我们证明，通过牛津纳米孔技术 (ONT) 测序，我们可以实现从液体活检中获取基因组和片段组数据。可以在样品采集后 24 小时内确定拷贝数畸变和 cfDNA 片段模式。从肺癌患者血浆和膀胱癌患者尿液计算出的肿瘤衍生cfDNA分数与通过相同样本的短读长测序计算出的肿瘤分数高度相关（R = 0.98）。血浆和尿液中转录起始位点附近的 cfDNA 大小谱、片段化模式、片段末端组成和核小体谱显示出典型的 cfDNA 特征。此外，使用 ONT 测序在血浆和尿液中回收了高比例的肿瘤来源的长 cfDNA 片段 (>300bp)。 ONT 测序是一种经济高效、快速且可部署的方法，用于从液体活检中获取基因组和片段组结果，从而可以分析以前未充分研究的 cfDNA 群体。© 2023 作者。根据 CC BY 4.0 许可证条款发布。

多药耐药性 1 (MDR1) 转运蛋白限制乳腺癌 (BC) 治疗中使用的化疗药物（紫杉醇、蒽环类药物）在细胞内的积累。除了肿瘤细胞外，MDR1 还在免疫细胞亚群上表达，并赋予化疗耐药性。在人类 T 细胞中，大多数 CD8 T 细胞和 CD4 T 辅助 (Th) 细胞亚群都表达 MDR1。在这里，我们探讨了 MDR1 在 CD4 T 细胞上的表达、功能和调节，并研究了该群体在 BC 中对新辅助化疗 (NAC) 的反应中的作用。通过流式细胞术检测 BC 患者。通过流式细胞术和 RNA 测序 (RNA-seq)，这些特征被扩展到来自未经治疗的乳腺肿瘤的 CD4 Th 细胞。我们进行了体外极化测定，以破译 MDR1 对 CD4 Th 细胞的调节。我们在体外评估了化疗药物对 MDR1 CD4 Th 细胞的影响。我们在两个独立的 BC 队列以及 NAC 前后 BC 肿瘤活检的公共 RNA-seq 数据集中分析了 NAC 治疗对血液和肿瘤中 MDR1 CD4 Th 细胞的影响及其与治疗效果的关联。最后，我们对接受 NAC 治疗的患者的血液 CD4 记忆 T 细胞进行了单细胞 (sc) RNAseq，并将其与 scRNAseq 公共数据集相结合。MDR1 CD4 Th 细胞在 Th1.17 多功能细胞中高度富集，但也在 Th17 细胞中富集，在血液和未经治疗的乳腺肿瘤组织中。从机制上讲，在体外 Th17 或 Th1.17 极化过程中，肿瘤生长因子 (TGF)-β1 是 MDR1 诱导所必需的。在 NAC 治疗的患者中，紫杉醇体外和体内治疗后，MDR1 表达赋予 Th1.17 和 Th17 细胞选择性优势。 scRNAseq 证明 MDR1 与肿瘤 Th1.17 和具有细胞毒性细胞特征的 Th 相关。血液和肿瘤中 MDR1 CD4 Th1.17 和 Th17 细胞的富集与病理反应呈正相关。 NAC 耐药患者缺乏 Th1.17 和 Th17 的早期调节，因此主张将其用作化疗方案调整的生物标志物。MDR1 有利于 NAC 后血液和肿瘤中 Th1.17 和 Th17 的富集，这与临床反应相关。 © 作者（或其雇主）2023。根据 CC BY-NC 允许重复使用。不得商业再利用。请参阅权利和权限。由英国医学杂志出版。

胰腺导管腺癌（PDAC）是最致命的癌症之一。尽管免疫检查点阻断在一系列人类癌症中成功应用，但 PDAC 的免疫治疗仍然不成功。 PDAC 的特点是促纤维增生、缺氧和高度免疫抑制的肿瘤微环境 (TME)，其中通常缺乏 T 细胞浸润（免疫荒漠），或者 T 细胞远离肿瘤岛（免疫排除）。将 TME 转化为免疫炎症状态，允许 T 细胞浸润，可以提高 PDAC 免疫治疗的成功率。在这项研究中，我们使用 KPC3 皮下 PDAC 小鼠模型来研究肿瘤源性唾液酸在塑造 PDAC 中的作用。肿瘤免疫景观。唾液酸缺陷型 KPC3 系是通过基因敲除 CMAS（胞苷单磷酸 N-乙酰神经氨酸合成酶）酶而产生的，CMAS 酶是合成含唾液酸聚糖的关键酶。通过使用抗程序性细胞死亡蛋白 1 (PD-1) 和激动性 CD40 治疗来评估唾液酸缺乏对免疫治疗疗效的影响。KPC3 肿瘤中唾液酸的缺乏导致 CD4 和 CD8 T 细胞数量增加TME，并降低 T 细胞群中 CD4 调节性 T 细胞 (Treg) 的频率。重要的是，CD8 T 细胞能够浸润唾液酸缺陷肿瘤中的肿瘤岛。免疫环境的这些有利改变使唾液酸缺乏的肿瘤对免疫疗法敏感，而免疫疗法对表达唾液酸的 KPC3 肿瘤无效。此外，人类胰腺癌中唾液酸化相关基因的高表达与 CD8 T 细胞浸润减少、Treg 细胞增加以及较差的生存概率相关。我们的结果表明，肿瘤来源的唾液酸介导 PDAC 内的 T 细胞排斥TME，从而损害免疫疗法的功效。靶向唾液酸是增强 T 细胞浸润并改善 PDAC 免疫治疗结果的潜在策略。© 作者（或其雇主）2023。CC BY-NC 允许重复使用。不得商业再利用。请参阅权利和权限。由英国医学杂志出版。

BRD7 被确定为鼻咽癌 (NPC) 的肿瘤抑制因子。环状RNA（CircRNA）作为癌基因或抑癌基因参与鼻咽癌的发生和发展。然而，源自 BRD7 的环状 RNA 形式在 NPC 中的功能和机制尚不清楚。在本研究中，我们首先发现circBRD7是一种源自BRD7的新型circRNA，可抑制鼻咽癌细胞的增殖、迁移、侵袭，以及体内异种移植肿瘤的生长和转移。机制上，circBRD7通过增强其宿主基因BRD7启动子区组蛋白3赖氨酸27乙酰化（H3K27ac）的富集来促进BRD7的转录激活和表达，BRD7促进circBRD7的形成。因此，circBRD7与BRD7形成正反馈环，抑制NPC的发生和进展。此外，BRD7表达的恢复挽救了circBRD7对鼻咽癌恶性进展的抑制作用。此外，circBRD7在鼻咽癌组织中呈低表达，与BRD7表达量呈正相关，与鼻咽癌患者的临床分期呈负相关。综上所述，circBRD7 通过与其宿主基因 BRD7 形成正反馈环来减弱鼻咽癌的肿瘤生长和转移，而靶向 circBRD7/BRD7 轴是鼻咽癌临床诊断和治疗的一种有前途的策略。© 2023 作者。约翰·威利出版的《癌症科学》

在异质细胞群中，单个细胞的行为可能不同，对环境的反应也不同。这种细胞多样性可以通过测量 DNA 甲基化模式来评估。具有可变甲基化模式的基因座可提供细胞异质性的信息，并可作为疾病和发育进程的生物标志物。细胞间的甲基化异质性可以通过单细胞甲基化组或混合细胞的计算技术来评估。然而，这些精确估计甲基化异质性的方法的可行性和性能需要进一步评估。在这里，我们提出了采用最初来自生物多样性的数学框架的基于模型的方法，来估计全基因组DNA甲基化异质性。我们通过特征比较评估了我们的模型和现有方法的性能，并在合成数据集和真实数据上进行了测试。总的来说，我们的方法比其他方法具有优势，因为它们与实际异质性具有更好的相关性。我们还证明甲基化异质性提供了与传统甲基化水平不同的额外一层生物信息。在案例研究中，我们表明，CG 和非 CG 甲基化中甲基化异质性的不同特征可以预测拟南芥基因组元件之间的调节作用。这为植物表观基因组学开辟了新的方向。最后，我们证明我们的评分可能能够识别人类癌症样本中的位点作为早期癌症检测的假定生物标志物。我们将生物多样性的数学框架采用三种基于模型的方法来分析全基因组 DNA 甲基化异质性以监测细胞异质性。我们的方法，即 MeH，已使用现有方法进行实施和评估，并向研究界开放。© 2023。作者。

肝细胞癌（HCC）是全球健康问题之一。乙型肝炎病毒（HBV）是肝癌的主要原因之一。 HCC 患者临床结果不佳归因于一小群被称为癌症干细胞 (CSC) 的癌细胞。在这项工作中，我们研究了使用 tazemetostat (Taz) 抑制 zeste 同源物 2 (EZH2) 增强子的效果，zeste 同源物 2 是一种已知在 CSC 中过度表达的组蛋白甲基转移酶。在 HCC 细胞系 (HEPG2) 和乙型肝炎病毒转染的 HEPG2 (HBV/HEPG2) 细胞中评估了 Taz 的作用。 MTT 测定显示，用 0.5、1、4 或 6 μM Taz 处理 48 小时后，HEPG2 细胞活力显着下降。 HEPG2 和 HBV/HEPG2 细胞与 0.5 或 1 μM Taz 孵育 48 小时，然后收集细胞和上清液，使用酶对 EZH2、CD13、上皮细胞粘附分子 (EpCAM) 和 β-catenin 进行蛋白表达分析连锁免疫吸附测定（ELISA）。 Taz 对 HEPG2 和 HBV/HEPG2 细胞中的 EZH2、CD13 和 β-catenin 显示出显着的剂量依赖性抑制作用。此外，EpCAM 蛋白水平在 HBV/HEPG2 中显着降低，但在单独的 HEPG2 细胞系中则没有。我们的结果表明，Taz 抑制 EZH2 会导致 β-catenin 信号传导下调，并最终降低 CD13 和 EpCAM 的表达，这是 CSC 的特征。目前的研究表明，Taz 可能是治疗 HCC（包括 HBV 诱导的 HCC）的一种有前途的治疗方法，可与放疗/化疗联合使用以靶向 CSC 并预防肿瘤复发。© 2023。作者。

T细胞淋巴母细胞淋巴瘤（T-LBL）是一种高度侵袭性的非霍奇金淋巴瘤，预后较差。 P21 激活激酶 (PAK) 是基于基因表达的分类器的一个组成部分，可以预测 T-LBL 的预后。然而，PAK 在 T-LBL 进展和生存中的作用仍知之甚少。在此，我们发现与人 T 淋巴细胞系相比，PAK1 在 T-LBL 细胞系（Jurkat、SUP-T1 和 CCRF-CEM）中的表达显着较高。此外，32 例复发 T-LBL 患者的 PAK2 mRNA 水平显着高于 37 例未复发的患者 (P = .012)。 PAK1 和 PAK2 高表达的 T-LBL 患者的中位 RFS 明显短于 PAK1 和 PAK2 低表达的患者（PAK1，P = .028；PAK2，P = .027；PAK1/2，P = .032）。 PAK 抑制剂 PF3758309 (PF) 和 FRAX597 可以通过阻断 G1/S 细胞周期相变来抑制 T-LBL 细胞的增殖。此外，PF可以增强体内外对阿霉素的化疗敏感性。从机制上来说，通过蛋白质印迹和RNA测序，我们发现PF可以抑制T-LBL细胞系中PAK1/2的磷酸化并下调cyclin D1、NF-κB和细胞粘附信号通路的表达。这些发现表明PAK可能与T-LBL复发有关，并进一步发现PAK抑制剂可以抑制多柔比星处理的T-LBL细胞的增殖并增强其化疗敏感性。总的来说，我们目前的研究强调了 T-LBL 治疗中抑制 PAK 的潜在治疗效果。版权所有 © 2023 作者。由威科健康公司代表中华医学会 (CMA) 和中国医学科学院血液学研究所发布

前列腺癌仍然是全球男性癌症相关死亡的最常见原因之一。前列腺癌进展为致命性转移性疾病是由多种因素介导的。前列腺微生物群及其代谢物在转移、去势抵抗性前列腺癌（CRPC）治疗抵抗和肿瘤复发中的作用尚未得到充分研究。微生物区系的表征可以为治疗耐药性的出现、新型有效靶向疗法的鉴定以及前列腺癌进展过程中生物标志物的开发中的功能意义提供新的机制见解。肿瘤微环境（TME）及其组成部分与前列腺微生物群同时作用，促进前列腺癌的发生和进展至转移。在本文中，我们讨论了越来越多的证据，表明微生物群对 TME 表型景观的功能贡献及其对前列腺癌治疗靶向和复发性疾病的影响。AJCEU 版权所有 © 2023。

目的：失巢凋亡是一种发生在正常上皮和内皮细胞中的程序性细胞死亡。然而，失巢凋亡调节因子（ANR）在膀胱癌（BLCA）中的具体作用仍不清楚。因此，本研究的目的是寻找能够识别 BLCA 不同水平失巢凋亡抵抗的亚组，并构建失巢凋亡评分系统来评估预后。方法：通过从公共数据集中获取 ANR，识别具有不同程度失巢凋亡抵抗力的 BLCA 亚群，并确定风险。结果：ANR 影响 BLCA 的发生和预后，可以通过建立风险模型进行预测。结论：失巢凋亡评分系统和失巢凋亡相关风险概况可能有助于为 BLCA 患者制定更有效和个性化的治疗策略。