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Disease Models & Mechanisms
2023 Nov 08

YakinthiChrisochoido...
Crosstalk with lung fibroblasts shapes the growth and therapeutic response of mesothelioma cells.
Disease Models & Mechanisms
间皮瘤是一种侵袭性间皮层癌症,与广泛的纤维化反应相关。后者很大程度上是由癌症相关成纤维细胞介导的,其介导肿瘤进展和不良预后。然而,人们对这种疾病中癌细胞和成纤维细胞之间的串扰大多缺乏了解。在这里,利用患者来源的间皮瘤细胞系和肺成纤维细胞的共培养,我们证明成纤维细胞活化是一种自我繁殖的过程,产生纤维化细胞外基质(ECM)并引发间皮瘤细胞的耐药性。在对间皮瘤细胞/成纤维细胞信号串扰进行表征后,我们发现 FDA 批准的几种靶向疗法在 ECM 嵌入的共培养球体模型中比标准护理顺铂/培美曲塞更有效。特别是,SRC 家族激酶抑制剂 Saracatinib 在间皮瘤基因工程小鼠模型中将总体生存期延长至远远超出护理标准。简而言之,我们为合理设计针对间皮瘤/成纤维细胞通讯的新型治疗策略以治疗间皮瘤患者奠定了基础。© 2023。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Nov 08

WanqiLai,MeixiaKuang...
Skin cancer diagnosis (SCD) using Artificial Neural Network (ANN) and Improved Gray Wolf Optimization (IGWO).
Disease Models & Mechanisms
皮肤癌(SC)是最危险的癌症类型之一,如果不及时治疗,可能会威胁患者的生命。通过早期诊断这种疾病,可以更有效地使用治疗方法并预防疾病的进展。机器学习 (ML) 技术可用作 SCD 的有用且高效的工具。到目前为止,已经提出了多种基于ML技术的自动SCD方法;然而,该研究领域仍然需要应用最优且高效的模型来提高SCD的准确性。因此,在本文中,提出了一种结合优化技术和人工神经网络 (ANN) 的 SCD 方法。该方法包括四个步骤:预处理、分割、特征提取和分类。使用 Kohonen 神经网络执行用于识别病变区域的图像分割,其中使用贪婪搜索算法 (GSA) 增强识别的感兴趣区域 (ROI)。所提出的方法使用卷积神经网络(CNN)从 ROI 中提取特征。此外,为了对特征进行分类,使用了人工神经网络,并通过改进的灰狼优化(IGWO)算法来调整神经元的数量和权重向量。该方法利用概率模型来提高GWO算法的收敛速度。根据评估结果,利用IGWO模型优化ANN的结构和权向量,可以有效提高诊断准确率至少5%。实施该方法并与之前的方法进行性能比较的结果也表明,该方法可以在 ISIC-2016 和 ISIC-2017 数据库中诊断 SC,平均准确率分别为 97.09 和 95.17%;与其他方法相比,准确率至少提高了 0.5%。© 2023。作者。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Nov 08

MariaZachou,PagonaFl...
The role of anti-diabetic drugs in NAFLD. Have we found the Holy Grail? A narrative review.
DIABETES & METABOLISM
非酒精性脂肪肝病 (NAFLD) 已成为肝病的主要原因,影响着全球 30% 的人口。 NAFLD 在肥胖个体和 2 型糖尿病 (T2DM) 患者中的患病率特别高。 NAFLD 的范围从简单的肝脏脂肪沉积到坏死性炎症和纤维化(非酒精性脂肪性肝炎 (NASH))、NASH 肝硬化和/或肝细胞癌。胰岛素抵抗在 NAFLD 发病机制中起着关键作用,此外还有脂肪细胞失调、线粒体功能障碍、遗传因素和肠道微生物群的变化。由于胰岛素抵抗也是 T2DM 的主要诱发因素,因此使用抗糖尿病药物来治疗 NAFLD 似乎是合理的。在这篇综述中,我们提供了一些最广泛使用的抗糖尿病药物的 NAFLD 相关作用机制,即二甲双胍、吡格列酮、钠-葡萄糖转运蛋白 2 抑制剂 (SGLT2i)、胰高血糖素样肽 1 受体类似物 (GLP1 RA) 和二肽基肽酶 4 抑制剂 (DPP4i),并提供有关其在患有以下疾病的患者中使用的可用数据NAFLD,伴或不伴 T2DM。二甲双胍和 DPP4i 都显示出相当矛盾的结果,而吡格列酮似乎对 NASH 患者有益,因此是唯一被所有主要肝脏协会批准用于治疗伴有显着肝纤维化的 NASH 的药物。另一方面,SGLT2i 和 GLP1 RA 似乎对 NAFLD 患者有益,显示出显着的结果,其中 SGLT2i 在迄今为止唯一的头对头研究中被证明更有效。 在 NAFLD 合并糖尿病患者中,吡格列酮、GLP1 RA 和 SGLT2i 似乎是合理的治疗选择。在将这些药物推荐给非糖尿病患者之前,需要进行更大规模的研究。© 2023。作者。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Nov 08

AntoniettaGigante,Gi...
CHA2DS2-VASc score as a predictor of clinical outcomes in hospitalized patients with and without chronic kidney disease.
DIABETES & METABOLISM
高 CHA2DS2-VASc 评分(充血性心力衰竭、高血压、年龄 > 75 岁、糖尿病、既往中风或短暂性脑缺血发作或血栓栓塞、血管疾病、年龄 65-74 岁和性别类别)与不同环境中的不良临床结果相关。本研究的目的是评估 CHA2DS2-VASc 评分和 R2CHA2DS2-VASc 评分(包括肾功能损害)与内科病房住院患者的院内死亡率和住院时间长度之间的关联。我们连续招募了 983 名患者在内科病房住院 3 年的患者。 R2CHA2DS2-VASc 评分的计算方法是,根据 K-DOQI 定义,是否存在慢性肾病 (CKD),在 CHA2DS2-VASc 上加 2 分。主要结局是全因死亡率和住院时间 > 10 天的综合结果。 CKD 3-5 期患者的 CHA2DS2-VASc 与 1-2 期相比有所增加 (p< 0.001)。 47.3% 的住院患者出现复合结局。根据传染病和癌症的存在进行调整的多变量线性逻辑回归分析,以及复合结果的发生显示,CHA2DS2-VASc 和 R2CHA2DS2 的调整 OR 分别为 1.349 (95% CI 1.248-1.462) 和 1.254 (95% CI 1.179-1.336) -分别为 VASc 分数。 CHA2DS2-VASc 和 R2CHA2DS2-VASc 评分与综合结果之间的关联没有发现差异(AUC 0.631 vs 0.630),此外,将住院期间是否存在传染病以及阳性癌症病史添加到模型中会增加 AUC (0.667 和 0.663)。无论是否存在 CKD,CHA2DS2-VASc 评分越高,与内科病房住院患者的住院时间和死亡率增加相关。© 2023。作者。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023

JunjunHuang,KeRen,Li...
Coptisine attenuates sepsis lung injury by suppressing LPS-induced lung epithelial cell inflammation and apoptosis.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
本研究旨在探讨黄连碱在急性肺损伤(ALI)中的作用及机制。采用脂多糖(LPS)刺激小鼠肺上皮12(MLE-12)细胞,构建体外肺损伤模型,研究黄连碱的作用。脓毒症引起的 ALI。通过细胞计数试剂盒 8 测定评估 MLE-12 细胞的活力。通过酶联免疫吸附血清学测定测定肿瘤坏死因子-α (TNF-α)、白细胞介素 6 (IL-6) 和 IL-1β 的细胞因子释放。通过逆转录定量聚合酶链反应检测TNF-α、IL-6和IL-1β mRNA的相对表达水平。通过Annexin V/碘化丙啶染色测定MLE-12细胞的细胞凋亡,并通过流式细胞仪进行分析。 Western blot分析观察凋亡相关蛋白Bax和Cleaved Caspase-3的表达。通过Western blot检测B细胞抑制剂α(IκBα)中的磷酸化p65、p65、磷酸化核因子κ轻链多肽基因增强子(IκBα)和IκBα,发现核因子κB(NF-κB)信号通路被激活。印迹分析。黄连碱处理可以显着恢复LPS刺激引起的MLE-12细胞活力下降。黄连碱治疗显着抑制TNF-α、IL-6和IL-1β的释放。黄连碱处理可抑制LPS诱导的MLE-12细胞凋亡,并抑制Bax和cleaved Caspase-3的表达水平。黄连碱联合LPS刺激,显着降低了磷酸-IκBα的蛋白水平,增加了IκBα的水平,并降低了磷酸-p65-p65的比率。这些结果表明,黄连碱通过抑制肺上皮细胞炎症和凋亡来减轻脓毒症肺损伤。 NF-κB 通路。因此,黄连碱可能具有治疗脓毒症引起的 ALI 的潜力。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Nov 03

OishiMukherjee,Sudes...
Natural Plant Products Mediated Prevention of Cancer Facilitated through Immune Suppression of Treg Cells.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
癌症是导致死亡的主要原因之一,已经测试并使用了多种方法来找出最佳治疗方法。除了靶向治疗外,免疫疗法已被证明通过控制某些免疫细胞是有效的。传统的癌症治疗会遇到不良副作用的后果,这一直是治疗的一个主要问题;因此,人们向天然存在的免疫调节剂迈进,以开发更安全的治疗方法。调节性 T 细胞 (Treg) 是负责肿瘤生长的主要免疫细胞之一。为了维持免疫稳态,Treg 抑制对自身和非自身抗原的异常免疫反应。转录因子 FoxP3 负责其谱系规范,并参与 IL10、IL35 和 TGFb 等免疫抑制细胞因子的产生。这有助于癌细胞增殖,而不受 CD8 T 细胞、树突状细胞、单核细胞/巨噬细胞、B 细胞和自然杀伤细胞等不同免疫细胞的限制。因此,针对 Tregs 提供不受阻碍的免疫监视已被证明是癌症免疫治疗的突破。这篇综述主要关注一些常见的天然免疫调节剂,这些免疫调节剂源自植物产品,这些产品已成为免疫治疗剂,以及它们抑制 Tregs 的一些能力,可作为治疗癌症的有效方法。版权所有 © Bentham Science Publishers;如有任何疑问,请发送电子邮件至 epub@benthamscience.net。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Nov 08

DaniaZhivaki,EmilyAG...
mRNAs encoding self-DNA reactive cGAS enhance the immunogenicity of lipid nanoparticle vaccines.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
脂质纳米颗粒 (LNP) 封装的 mRNA 已成为刺激免疫力的有效疫苗接种工具。该技术最常见的应用是将编码抗原蛋白的 mRNA 递送至树突状细胞 (DC),然后刺激抗原特异性淋巴细胞反应。目前尚不清楚,除了抗原呈递之外,是否可以通过 mRNA 编码的蛋白质诱导疫苗功效所需的其他免疫刺激 DC 活性。在此,我们报告了编码环状 GMP-AMP 合酶 (cGAS) 的自身 DNA 反应变体的 mRNA,称为 cGASΔN。 cGASΔN 在结合线粒体内 DNA 后产生环状二核苷酸 cGAMP。 cGAMP 与蛋白质 STING 结合,激活先天免疫反应,刺激 T 细胞。我们发现,当通过 LNP 递送至 DC 时,mRNA 编码的 cGASΔN 诱导小鼠和人类 DC 的趋化因子受体、T 细胞共刺激分子、主要组织相容性复合体蛋白、促炎细胞因子和 I 型干扰素的上调。这些活性超过了通过 LNP 传递的 mRNA 编码抗原的免疫刺激活性。用抗原-LNP 和 cGASΔN-LNP 联合免疫小鼠,导致抗原特异性产生 IFNγ 的 T 细胞大量产生。这些 T 细胞反应是持久的,并通过淋巴管、血液和肺部循环。单独使用抗原 LNP 进行免疫(类似于临床中使用的免疫接种)会刺激微弱且短暂的 T 细胞反应。与单独使用抗原 LNP 免疫相比,与 cGASΔN-LNP 共同注射时,抗体对抗原 LNP 的反应偏向 I 型同种型。这些发现确立了酶 cGASΔN 作为催化佐剂,这可能有助于增强核酸疫苗的免疫原性。重要性 核酸疫苗有望预防感染和治疗癌症。该技术最常见的用途是在 mRNA 上编码抗原蛋白,然后通过脂质纳米颗粒 (LNP) 制剂将其递送至细胞。在这项研究中,我们发现 LNP 中的 mRNA 也可以编码免疫刺激蛋白。我们发现 cGAS 酶的活性突变体(称为 cGASΔN)在 LNP 封装的 mRNA 疫苗中充当催化佐剂。通过 LNP 与抗原 mRNA-LNP 结合递送 cGASΔN mRNA,可产生持久的抗原特异性 IFNγ 产生 T 细胞,其效率超过了类似于目前临床使用的抗原 LNP 的效率。该策略不会损害 B 细胞反应;相反,它诱导了 Th1 偏向的抗体同种型。这项工作揭示了使用 mRNA 编码的催化佐剂的新疫苗设计策略,该策略可能是产生免疫疗法的 CD8 T 细胞和 B 细胞反应的理想选择。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Nov 08

ShuzhaoChen,LimeiZha...
A Comprehensive Analysis of NRP1 in Malignancies Provide Therapeutic Implication for Treating Cancer Patients Infected with SARS-CoV-2.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
COVID-19(2019 冠状病毒病)由 SARS-CoV-2(严重急性呼吸综合征冠状病毒-2)引起,可导致肺炎、细胞因子风暴和淋巴细胞减少。由于免疫抑制,癌症患者更容易感染 SARS-CoV-2 和严重的 COVID-19。最近的研究表明,NRP1(神经毡蛋白 1)可能作为 SARS-CoV-2 进入宿主细胞的新型介质。由于尚未对泛癌中NRP1的特征进行系统评价,因此我们对泛癌患者中的NRP1进行了全面分析。使用生物信息学方法,我们旨在系统地检查泛癌组织和健康组织中的 NRP1 表达谱。我们发现肺癌和泌尿生殖系统癌症比其他癌症患者的 NRP-1 表达相对较高,表明这些患者可能更容易感染 SARS-CoV-2。我们的分析进一步表明,感染 SARS-CoV-2 的 Vero E6 细胞、全血、肺类器官、睾丸组织和肺泡球中 NRP1 表达下调。值得注意的是,NRP1 与大多数癌症患者的免疫细胞浸润、免疫检查点基因和免疫相关基因相关。这些研究结果表明,在患有特定类型癌症(尤其是肺癌和泌尿生殖系统癌症)的患者中,NRP1 的高表达会增加对 SARS-CoV-2 感染的易感性,并增加细胞因子风暴造成损害的风险。总体而言,NRP1 似乎在调节许多肿瘤类型的免疫特性和代谢中发挥着关键作用。 NRP1 抗原的特异性抑制剂(pegaptanib、EG00229 或 MNRP1685A)与其他抗 SARS-CoV-2 策略相结合可能有助于治疗 SARS-CoV-2 感染后患有肺癌和泌尿生殖系统癌症的患者。© 2023。作者),获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 的一部分)的独家许可。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Nov 07

SomayehHashemiSheikh...
Meta-analysis of microarray data to determine gene indicators involved in the cisplatin resistance in ovarian cancer.
Stem Cell Research & Therapy
导致卵巢癌顺铂耐药的显着错误表达基因指标尚未完全了解。似乎有几个调控基因和信号通路与化疗耐药表型的出现有关。这里,采用荟萃分析方法来评估参与一线化疗(顺铂)后复发的失调基因。 ,从 GEO 存储库中收集了 6 个卵巢癌库。分别使用 R 中的 SVA 和 ggplot2 软件包进行批量效应消除和质量评估以及箱线图和 PCA。使用 LIMMA R 软件包中的线性回归模型将顺铂耐药和敏感的卵巢癌组与具有显着表达变化的基因进行比较。 DEG 的显着性阈值为 adj p 值 < .05 和 - 1 > logFC > 1。总共鉴定出 261 个基因在顺铂耐药组和顺铂敏感组中具有显着差异表达水平。在前10个上调和下调基因中,PITX2、SNCA和EPHA7(上调)以及TMEM98(下调)是PI3K/AKT信号通路的间接上游调节因子,对化疗耐药的发展做出了巨大贡献通过促进细胞增殖、存活和细胞周期进程以及抑制细胞凋亡来治疗癌症。此外,对DEG的全面评估显示,不仅膜离子通道KCa1.1、Kv4和CACNB4失调,影响细胞兴奋性、增殖和凋亡,而且细胞粘附蛋白COL4A6、EPHA3和CD9也失调,影响正常细胞的附着。细胞 ECM 和细胞凋亡,为逆转顺铂耐药性提供了良好的选择。我们的结果预测并表明 PI3K/AKT 信号通路、离子通道和细胞粘附蛋白的上游调节因子在卵巢癌顺铂耐药性发展中发挥重要作用。© 2023作者。由 Wiley periodicals LLC 出版的癌症报告。
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Stem Cell Research & Therapy
2023

YaseswiniNeelamraju,...
Depletion of tet2 results in age-dependent changes in DNA methylation and gene expression in a zebrafish model of myelodysplastic syndrome.
Stem Cell Research & Therapy
骨髓增生异常综合征 (MDS) 是一组异质性克隆性造血疾病,其特征是无效造血、血细胞减少和发育不良。编码 10-11 易位 2 (tet2) 的基因是一种双加氧酶,催化 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 转化为 5-羟甲基胞嘧啶,是 MDS 和其他骨髓恶性肿瘤中反复突变的肿瘤抑制基因。此前,我们报道了一种稳定的斑马鱼系,其 tet2 基因具有功能丧失突变。 tet2m/m突变斑马鱼出现MDS前状态,伴有肾骨髓发育不良,但到11月龄时循环血细胞计数正常,并伴有贫血,这意味着到24月龄时MDS发病。在当前的研究中,我们从 4 月龄和 15 月龄的成年 tet2m/m 和 tet2wt/wt 鱼的肾骨髓中收集祖细胞,并进行增强型还原代表性亚硫酸氢盐测序 (ERRBS) 和批量 RNA 测序,以测量 DNA 甲基化和基因表达的变化与野生型相比,在 4 月龄的 tet2m/m HSPC 中观察到基因启动子区域和 CpG 岛的 DNA 甲基化全面增加。此外,SUZ12 和多梳抑制复合物 2 (PRC2) 中涉及的金属反应元件结合转录因子 2 (MTF2) 靶标的高甲基化基因显着富集。然而,在 4 至 15 个月大时,我们观察到 tet2m/m HSPC 中 DNA 甲基化出现了矛盾的整体下降。基因表达分析发现,与野生型相比,4 月龄的 tet2m/m HSPC 中与 mTORC1 信号传导以及干扰素 γ 和 α 反应相关的基因上调。 4 月龄时,tet2 突变鱼的 HSPC 中下调的基因在细胞周期调节、血红素代谢和白细胞介素 2 (IL2)/信号转导子和转录激活子 5 (STAT5) 信号传导方面富集,可能与自我更新增强有关tet2 功能丧失的 HSPC 中的克隆优势。最后,总体增加的启动子甲基化与基因表达之间存在总体负相关。
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