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HUMAN MOLECULAR GENETICS
2023 Oct 31

ErinRBurnight,BeauJF...
Demonstration of the pathogenicity of a common non-exomic mutation in ABCA4 using iPSC-derived retinal organoids and retrospective clinical data.
HUMAN MOLECULAR GENETICS
ABCA4 突变是孟德尔视网膜疾病的最常见原因。该基因的临床评估具有挑战性,因为其极端的等位基因多样性、大部分非外显子突变以及广泛的相关疾病。我们使用患者来源的视网膜类器官以及来自一大群 ABCA4 相关视网膜疾病患者的 DNA 样本和临床数据来研究 ABCA4 变异 (IVS30 1321 A > G) 的致病性,该变异在 2% 的患者中杂合发生。欧洲人。我们发现这种变异会导致感光细胞中的基因错误剪接,从而导致生成的蛋白质包含 36 个不正确的氨基酸,然后过早停止。我们还调查了 10 名含有该突变的复合基因型患者的表型。他们首次视力丧失的中位年龄为 39 岁,属于 ABCA4 疾病患者中病情最轻的五分之一。我们得出的结论是,IVS30 1321 A > G 变体在足够宽松的遗传背景下与足够有害的相反等位基因配对时会导致疾病。© 作者 2023。由牛津大学出版社出版。版权所有。如需权限,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Nov 14

ThomasSPostler,AnqiW...
A pan-cancer analysis implicates human NKIRAS1 as a tumor-suppressor gene.
GENES & DEVELOPMENT
转录因子 NF-κB 家族和小 GTP 酶 Ras 家族是驱动肿瘤发生和癌变的增殖信号传导的重要介质。 κB-Ras 蛋白先前已被证明可通过独立机制抑制 NF-κB 和 Ras 激活,这表明它们作为肿瘤抑制因子,与人类癌症具有潜在广泛的相关性。在这项研究中,我们使用了两种小鼠模型来建立 κB-Ras 蛋白与肿瘤发生的相关性。此外,我们还利用泛癌生物信息学分析来探索 κB-Ras 蛋白在人类癌症中的作用。令人惊讶的是,我们发现编码 κB-Ras 1 (NKIRAS1) 和 κB-Ras 2 (NKIRAS2) 的基因在具有致癌 Ras 突变的肿瘤样本中很少下调。人类 NKIRAS1 表达的降低与至少四种癌症类型的预后较差有关,并与肿瘤发生相关的基因网络有关。我们的研究结果提供了直接证据,证明不携带致癌 RAS 突变的人类肿瘤中 NKIRAS1 的缺失与较差的临床结果相关。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Nov 01

YangeYu,ZhaoyanZhu,M...
Effect of Pseudostellaria heterophylla polysaccharide on the growth and liver metabolism of chicks.
GENES & DEVELOPMENT
本研究通过饲喂雏鸡日粮,探讨太子参多糖(PHP)对雏鸡生长发育及肝脏代谢的影响。选取 7 日龄固始公鸡 400 只,随机分为 4 组,分别标记为 A、B、C、D。A 组饲喂基础日粮,B、C、D 组分别饲喂 100 mg、200 mg 和 200 mg。每公斤基础饮食分别含有 400 毫克 PHP。 14、21、28、35日龄时,每组随机抽取5只雏鸡采集样本进行指标检测。结果表明,与A组相比,14、21、28天平均日采食量(ADFI)和料重比(F/G)显着降低(P < 0.05),显着增加。 21天、28天平均日增重(ADG)显着升高(P < 0.05),总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、胰岛素(INS)、甲状腺素(T3)、生长激素(GH)水平显着升高14 d、28 d(P < 0.05),C组28 d葡萄糖(GLU)、总胆固醇(TC)、胰高血糖素(GC)、甘油三酯(TG)水平显着降低(P < 0.05)。 14 d、21 d TP、ALB 水平显着升高(P < 0.05),35 d TP 水平显着升高(P < 0.05),28 d GH 水平显着升高(P < 0.05), B组和D组28天时GLU、GC水平降低(P < 0.05),14天、21天F/G显着降低(P < 0.05)。根据上述结果,选取A、C组雏鸡28 d时的肝脏进行转录组测序。测序结果显示,显着差异表达基因(SDEG)在生长发育、氧化磷酸化、PPAR信号通路和脂质代谢通路等方面富集。这些结果表明,日粮中添加200 mg/kg PHP可促进雏鸡的生长发育、脂质代谢和能量代谢,抑制炎症和肿瘤的发生,改善肝脏功能。©作者2023 . 由牛津大学出版社代表美国动物科学学会出版。版权所有。如需权限,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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EXPERT REVIEW OF MOLECULAR DIAGNOSTICS
2023 Nov 06

TimKortlever,Willemi...
Cross-sectional risk models using quantitative fecal hemoglobin in colorectal cancer screening: a systematic review.
EXPERT REVIEW OF MOLECULAR DIAGNOSTICS
粪便免疫化学检测 (FIT) 是结直肠癌 (CRC) 筛查的核心工具。为了改善结肠镜检查个体的选择,已经开发了将 FIT 与其他 CRC 风险因素相结合的风险模型。本系统综述旨在概述当前基于 FIT 的无创 CRC 筛查风险模型,以促进未来的实施。我们对将定量粪便血红蛋白与临床数据或无创生物标志物相结合的风险模型进行了系统文献检索,旨在用于CRC筛查。使用 PROBAST 工具评估偏倚风险。其中包括 29 篇出版物报告的 20 个风险模型。总体偏倚风险很高。在将风险模型与 FIT 进行比较的研究中,11/12 (92%) 风险模型的 c 统计量显着高于仅 FIT。 16/20 风险模型 (80%) 尚未经过外部验证,迄今为止仅实施了一种模型。基于 FIT 的风险模型有可能提高 CRC 筛查的产量。不幸的是,所有纳入的出版物都存在很高的偏倚风险,并且大多数风险模型尚未经过外部验证。利用风险模型改进结直肠癌筛查的前景应该鼓励对现有筛查项目进行更严格的评估。
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EUROPEAN RADIOLOGY
2023 Nov 06

FilippoCrimì,GiulioC...
Nodal staging with MRI after neoadjuvant chemo-radiotherapy for locally advanced rectal cancer: a fast and reliable method.
EUROPEAN RADIOLOGY
对于局部晚期直肠癌 (LARC) 患者,新辅助放化疗 (nCRT) 后淋巴结状态阴性可能会考虑保留直肠方案,而不是完全直肠系膜切除;然而,目前的 MRI 淋巴结分期标准的准确性并不理想。本研究的目的是比较 LARC 患者 nCRT 后不同 MRI 维度标准对淋巴结分期的诊断准确性。 回顾性纳入 LARC nCRT 后接受 MRI 并随后进行手术的患者,并将其分为训练组和验证组。分别有 100 名和 39 名患者。根据欧洲胃肠放射学会共识指南(即 ESGAR 方法),由两名放射科医生独立评估最大直肠系膜淋巴结的短轴、长轴和头尾轴以及体积和淋巴结状态。在培训队列中评估读者间的一致性。组织病理学是参考标准。计算 ROC 曲线和最佳截止值,并与 McNemar 检验进行比较。研究人群包括 139 名患者(中位年龄 62 岁 [IQR 55-72],94 名男性)。长轴 (κ = 0.81)、体积 (κ = 0.85) 和 ESGAR 方法 (κ = 0.88) 的读者间一致性较高,而短轴 (κ = 0.11) 的读者间一致性较低。长轴、体积和 ESGAR 方法在训练(分别为 71%、74% 和 65%)和验证(分别为 83%、78% 和 75%)中的准确度相似 (p > 0.05) )队列。最大淋巴结长轴和体积测量的准确性不低于LARC nCRT后淋巴结分期的ESGAR方法。在直肠癌MRI再分期中,最大直肠系膜淋巴结长轴或体积的测量术前放化疗后的淋巴结分期是 ESGAR 淋巴结分期标准的更快、更可靠的替代方案。• 目前局部晚期直肠癌放化疗后淋巴结分期的 MRI 标准准确性欠佳且耗时。 • MRI 测量最大直肠系膜淋巴结的长轴或体积显示,对于评估局部晚期直肠癌的局部区域淋巴结状态具有良好的准确性。 • 放化疗后对最大直肠系膜淋巴结的长轴和体积进行 MRI 测量可能是 ESGAR 淋巴结分期标准的更快、更可靠的替代方案。© 2023。作者获得欧洲放射学会的独家许可。
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EUROPEAN RADIOLOGY
2023 Nov 06

MishalMendiratta-Lal...
Ethiodized oil as an imaging biomarker after conventional transarterial chemoembolization.
EUROPEAN RADIOLOGY
利用碘化油作为化疗载体的传统经动脉化疗栓塞术(cTACE)已成为中期肝细胞癌(HCC)的标准治疗方法,并已被采用作为肝移植的桥接和降期治疗。由碘化油和化疗溶液组成的油包水乳剂保留在肿瘤脉管系统中,从而导致高组织药物浓度和低全身化疗剂量。治疗后成像中肿瘤内碘化油的密度和分布模式可预测肿瘤坏死的程度和治疗反应的持续时间。本综述描述了碘化油的多种作用,特别是其作为肿瘤对 cTACE 反应的生物标志物的作用。临床相关性:随着局部治疗方案(包括联合疗法的使用)日益复杂,治疗反应评估变得具有挑战性;碘化油沉积模式可以作为预测治疗反应的成像生物标志物,并可能预测治疗后的预后。要点: • 由于治疗后影像学表现各异,肝细胞癌局部治疗后的治疗反应评估充满了多重挑战。 • 乙碘化油的独特之处在于其射线不透性可以作为成像生物标志物来帮助预测治疗反应。 • 乙硫碘油的沉积模式已成为一种检测未充分治疗的肿瘤部分的机制,并且可以作为增强的辅助手段,以改善接受乙硫碘油动脉内栓塞治疗的患者的治疗。© 2023。作者( s)。
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EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION
2023 Nov 06

SanazBarzegar,SaeedP...
Zinc finger proteins and ATP-binding cassette transporter-dependent multidrug resistance.
EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION
多药耐药性(MDR)仍然是癌症治疗中的一个重大挑战,导致临床结果不佳。 ATP 结合盒 (ABC) 转运蛋白的失调已被确定为 MDR 的关键因素。锌指蛋白(ZNP)是转录的关键调节因子,并已成为癌症耐药性的潜在贡献者。弥合 ZNP 和 MDR 之间的知识差距对于了解癌症治疗异质性的来源至关重要。这篇综述试图阐明不同的 ZNP 如何调节 ABC 基因的转录调控,从而导致对癌症治疗的抵抗。该搜索是使用 PubMed、Google Scholar、EMBASE 和 Web of Science 进行的。除了 ABC 阻滞剂外,转录特征还受到调节ZNP 预计将在逆转 ABC 介导的 MDR 和预测抗癌治疗的疗效方面发挥作用。在 ZNP 诱导的上皮间质转化中,SNAIL、SLUG 和 Zebs 已被确定为通过激活 ATM、NFκB 和 PI3K/Akt 途径促进 MDR 的重要因素,使代谢暴露于潜在的 ZNP-MDR 相互作用。此外,还发现核受体(例如 VDR、ER 和 PXR)可以调节某些 ABC 调节。其他 C2H2 型锌指,包括 Kruppel 样因子、Gli 和 Sp 也有可能导致 MDR。除了回顾 ZNP 失调对恶性肿瘤中 ABC 相关化疗耐药性影响的证据外,还讨论了 ZNP 功能的重要标志物强调基因与基因以及微环境与基因相互作用对 MDR 前景的临床影响。对 ZNP 衍生生物标志物的未来研究对于解决癌症治疗的异质性至关重要。© 2023 Stichting 欧洲临床研究学会期刊基金会。约翰·威利出版
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Disease Models & Mechanisms
2023 Nov 06

CelineIMahieu,Andrew...
ORAOV1, CCND1, and MIR548K are the driver oncogenes of the 11q13 amplicon in squamous cell carcinoma.
Disease Models & Mechanisms
11q13 扩增是人类癌症中的常见事件,尤其是鳞状细胞癌 (SCC)。尽管几乎总是跨越 10 个基因,但尚不清楚扩增子的哪些遗传成分是 SCC 的关键驱动事件。计算、体外、离体和体内模型的组合利用 Cas9-RNP 电穿孔进行有效的原代人角质形成细胞基因组编辑,确定 ORAOV1、CCND1 和 MIR548K 是头颈 SCC 中扩增子的关键驱动因素。 CCND1 扩增以独立于 CDK4/6/RB1 的方式驱动细胞周期,并可能赋予 RRM2 一种新的依赖性。 MIR548K 有助于上皮-间质转化。最后,我们将 ORAOV1 确定为一种癌基因,可能通过其调节活性氧的能力发挥作用。因此,11q13 扩增子通过至少三个独立的遗传元件驱动 SCC,并为这种病态和致命疾病提供了治疗靶点。意义:这项工作展示了针对鳞状细胞癌(最常见和最致命的人类癌症之一)中最常见扩增的机制的新机制和方法。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Nov 01

IlYun,Sung-InJang,Eu...
Changes in the Place of Death of Patients With Cancer After the Introduction of Insurance-Covered, Home-Based Hospice Care in Korea.
Disease Models & Mechanisms
尽管为了改善晚期癌症患者及其护理人员的生活质量而将临终关怀纳入健康保险范围,但很少有研究评估该政策涵盖家庭临终关怀服务的效果。在韩国引入保险覆盖的家庭临终关怀服务后,癌症患者的死亡地点发生了变化。这项队列研究使用了2018年2月1日至2021年12月31日的数据,数据来自死亡原因统计韩国统计局每年发布的数据库,其中包含该国所有死亡的信息。死于癌症(一种符合临终关怀资格的代表性疾病)的个体被分配到病例组,而死于痴呆(一种不符合临终关怀资格的疾病)的个体被分配到对照组。研究人群共有 218,522 人。由于韩国健康保险院于 2020 年 9 月 1 日开始承保家庭临终关怀服务,最后随访日期为 2021 年 12 月 31 日,因此随访期干预前和干预后分别为31个月和16个月(干预前:2018年2月1日至2020年8月31日;干预后:2020年9月1日至2021年12月31日)。根据是否是该人自己的家而定的二进制变量。应用分段回归的比较中断时间序列模型来分析时间趋势及其结果变化。在符合分析条件的 218522 例死亡中(平均 [SD] 死亡年龄,78.6 [8.8] 岁;130435 名男性 [ 59.7%]),207459 例因癌症,11063 例因痴呆症。引入家庭临终关怀后,癌症患者的家庭死亡率比痴呆患者高 24.5%(估计为 1.245 [95% CI,1.030-1.504];P = .02)。干预后,生活在农村地区的癌症死亡和痴呆死亡之间的水平变化差异更为明显(估计为 1.320 [95% CI,1.118-1.558];P = .001)。此外,较高的教育水平与家庭临终关怀带来的即时效应大小差异较大相关(低教育水平:估计,1.205 [95% CI,1.025-1.416];P = .02;中等教育水平水平:估计,1.307 [95% CI,0.987-1.730],P = .06;高教育水平:估计,1.716 [95% CI,0.932-3.159];P = .08)。在韩国保险强制要求以家庭为基础的临终关怀之后,癌症患者的死亡地点在干预后癌症患者在家中死亡的可能性增加了。这一发现表明需要扩大家庭临终关怀的范围,以尊重绝症患者的自主权并提高他们的死亡质量。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Oct 23

ShipraTaneja,Michael...
Predictors of disease recurrence in high-risk non-metastatic renal cell carcinoma patient's post-surgical resection: A single-center, retrospective study.
Disease Models & Mechanisms
大约 20-40% 接受局部疾病治疗的肾癌患者会出现术后复发。存在多种预后模型来帮助临床医生确定远处复发的风险,但这些模型的标准和终点各不相同。我们的目的是检查复发率和临床病理因素作为高危肾细胞癌 (RCC) 患者复发的预测因素。我们对 2000 年 1 月至 2015 年 12 月期间接受肾切除术的 T3 RCC 患者进行了单中心回顾性图表审查. 登记辅助治疗临床试验的患者和随访时间少于三年的患者被排除在外。采用 Kaplan-Meier 生存分析以及单变量和多变量 Cox 回归来确定疾病复发率和预测因素。纳入了 88 名 pT3 RCC 患者,其中 39 名患者出现复发,中位时间为 23.5 个月(范围 1.6-127.5)。 9 名患者在 58 个月后出现疾病复发。 Kaplan-Meier 对数秩检验发现,手术切缘阴性且 Fuhrman 核分级较低的患者具有更高的无复发生存率。单变量 Cox 回归显示手术切缘阳性、高 Fuhrman 核分级和大肿瘤尺寸是重要的预测因素。在多变量 Cox 回归模型中,高 Fuhrman 核分级和阳性手术切缘是复发的显着预测因素。44% 的 T3 期患者出现疾病复发。高福尔曼核分级和阳性手术切缘与复发时间相关。医生应使用预后模型来促进有关疾病复发的对话,并在建议的五年随访期后继续监测高风险患者。我们建议对 pT3 切除患者进行术后长达 10 年的监测。
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