TGFB1 编码 TGF-β1，这是一种有效的细胞因子，调节包括免疫反应在内的多种细胞过程。 TGF-β1 在癌症中发挥着背景依赖性作用，并且越来越多地被认为是增强免疫治疗反应的治疗靶点。我们全面评估了 TGFB1 的表达及其在血液恶性肿瘤中的临床和生物学效应。首先使用来自 GTEx、CCLE 和 TCGA 数据库的数据探索 TGFB1 表达。使用 Hemap 和我们的 In Silico 精选数据集分析了 TGFB1 在血液恶性肿瘤中的表达和临床意义。我们还分析了 Hemap 中 TGFB1 与免疫评分和免疫细胞浸润之间的关系。我们使用 TIDE 和真实世界免疫治疗数据集进一步评估了 TGFB1 在预测免疫治疗反应中的价值。 TGFB1 在正常组织和癌症类型中均显示出血液组织特异性表达模式。 TGFB1 表达在血癌中广泛失调，通常与不良预后相关。 TGFB1 表达与不同血癌类型中不同的 TME 特性相关。此外，TGFB1 表达被发现是预测免疫治疗反应的有用标记。我们的结果表明 TGFB1 在血液恶性肿瘤中广泛失调。 TGFB1 可能以癌症类型特异性的方式调节免疫微环境，可用于开发免疫治疗新靶向药物。© 2023。作者。

流行病学研究表明，患有神经发育障碍 (NDD) 的个体更容易患上某些类型的癌症。然而值得注意的是，病例统计数据可能会受到患有 NDD（例如智力障碍、自闭症和精神分裂症）个体癌症的晚期发现的影响，这可能会导致数字出现偏差。至于 NDD 相关突变，在大多数情况下，它们是种系突变，而癌症突变是零星的，在生命中出现。然而，体细胞嵌合可能会刺激 NDD，并且与癌症相关的突变可能是种系突变。 NDD 和癌症具有相同的蛋白质、途径和突变。在这里，我们询问（i）它们到底有哪些共同特征，以及（ii）尽管它们有共同点，但它们在临床结果上有何不同。为了解决这些问题，我们采用了统计框架，然后进行网络分析。我们对突变、重建的疾病特异性网络、通路、转录组水平以及自闭症谱系障碍 (ASD) 和癌症的概况进行了彻底的探索，指出信号强度是关键因素：强信号传导促进癌症中的细胞增殖，而较弱的信号传导强度是关键因素。中）信号传导影响 ASD 的分化。因此，我们认为决定临床结果的是信号强度，而不是激活突变。© 2023。作者。

酰胺质子转移（APT）成像已被提议作为评估肿瘤代谢的技术。然而，APT 成像与包括正电子发射断层扫描 (PET) 在内的其他定量模式之间的关系尚未得到详细研究。本研究旨在评估 APT 成像在确定恶性胶质瘤代谢状态方面的临床实用性，并将结果与​​ 11C-蛋氨酸 (Met)-PET 进行比较。本研究分析了 20 名连续接受治疗的恶性胶质瘤患者的 APT 成像数据。 2022年1月和2023年7月。患者接受了肿瘤切除术，并研究了肿瘤活性与APT信号强度之间的相关性。我们还比较了灶周肿瘤浸润区域相同区域的 11C-Met-PET 和 APT 成像。所有 20 例病例均获得了清晰的诊断性 APT 图像。胶质母细胞瘤 (GBM)、IDH 野生型组的平均 APT 强度 (APTmean) 显着高于其他胶质瘤组 (6.0±4.7%；p<0.001) (27.2±12.8%)。最佳区分 GBM 和其他恶性神经胶质瘤的 APTmean 截止值为 12.8%，敏感性为 100%，特异性为 83.3%。这些 APTmean 值与 11C-Met-PET 分析得出的肿瘤与对侧正常脑组织的比率大致匹配 (r = 0.66)。 T1加权成像中钆非造影区也观察到APT信号，似乎反映了周围肿瘤浸润区域。APT成像可用于评估肿瘤浸润区域，类似于11C-Met-PET。 APT 成像显示患者的侵袭性较低，有助于肿瘤切除的术前计划，有助于最大限度地切除肿瘤，包括肿瘤侵袭区域。© 2023。作者获得 Springer-Verlag GmbH 德国（Springer Nature 旗下公司）的独家许可。

大数据是跨各个领域构建现实世界深度学习系统的基石。在医学和医疗保健领域，单个临床站点缺乏足够的数据，因此需要多个站点的参与。不幸的是，对数据安全和隐私的担忧阻碍了跨站点的数据共享和重用。现有的多站点临床学习方法在很大程度上取决于网络防火墙和系统实施的安全性。为了解决这个问题，我们提出了中继学习，这是一种安全的深度学习框架，可以将临床数据与外部入侵者物理隔离，同时仍然利用多站点大数据的优势。我们展示了接力学习在不同疾病和解剖结构的三个医疗任务中的功效，包括视网膜眼底结构分割、纵隔肿瘤诊断和大脑中线定位。我们通过多站点验证和外部验证将接力学习的性能与替代解决方案进行比较来评估接力学习。合并来自 21 个医疗主机（包括 7 个外部主机）的总共 41,038 个分布不均匀的医学图像，我们观察到中继学习在所有三项任务中的性能显着提高。具体来说，它在视网膜眼底分割、纵隔肿瘤诊断和脑中线定位方面分别实现了 44.4%、24.2% 和 36.7% 的平均性能提升。值得注意的是，接力学习在外部测试集上的表现甚至优于集中学习。同时，Relay Learning在本地保留数据主权，无需跨站点网络连接。我们预计接力学习将彻底改变临床多站点协作并重塑未来的医疗保健格局。© 2023。作者。

本研究旨在探讨葡萄膜炎专家对单基因葡萄膜炎 (mU) 的认识、知识和诊断/治疗实践。这是一项探索性横断面调查研究。来自自身炎症性疾病联盟 (AIDA) 网络和国际葡萄膜炎研究组 (IUSG) 的葡萄膜炎专家进行了一项匿名、半结构化的电子调查。我们纳入了回答≥50%的受访者。77名参与者将他们的mU知识评为熟练（3.9%）、足够（15.6%）、足够（16.9%）或差（63.6%）。当被问及他们想到的第一个 mU 基因时，60.4% 的人提到了 NOD2，3.9% 的人提到了 NLRP3 或 MEFV，49.4% 的人给出了错误的答案或没有答案。临床场景的成功率从 15.6% 到 55.8% 不等，多学科团队的眼科医生的成功率更高 (p<0.01)。 41.6% 的医生对疑似 mU 进行了基因检测。分子技术的可用性没有因地理位置的不同而显着差异（p > 0.05）。与私人保险相比，公共医疗保健系统确保患者获得更高比例的处方测试（p<0.00）。在缓解病情抗风湿药物（DMARD）方面，葡萄膜炎专家最熟悉的是肿瘤坏死因子-α抑制剂。超说明书治疗程序的困难是 mU 患者处方 DMARD 的主要障碍，并且与白细胞介素 1 (p < 0.01) 和白细胞介素 6 (p < 0.01) 抑制剂的获得/处方药物比率成反比。调查确定了患者护理方面的熟练领域、差距和有针对性的改进机会。综合输出可以为循证指南提供信息，为临床医生提供标准化方法，并推动 AIDA 网络-IUSG 统一努力，以推进科学知识和临床实践。© 2023。作者。

由于检测和治疗方面的挑战，转移性脑癌的预后较差。血脑屏障 (BBB) 是导致预后不良的原因之一，它严重限制了治疗药物向颅内肿瘤的转运。在原发性乳腺癌脑转移的发展过程中，血脑屏障发生改变，被称为“血肿瘤屏障”(BTB)。更好地了解不同癌症类型和阶段的 BBB 和 BTB 之间的差异可能有助于确定新的治疗靶点。在这里，我们利用组织工程微血管模型，其中包含诱导多能干细胞（iPSC）衍生的脑微血管内皮样细胞（iBMEC），并被具有脑向性的人乳腺癌转移癌球体包围。我们直接比较 BBB 和 BTB 体外微血管，以揭示血管周围癌症生长过程中发生的物理和化学相互作用。我们确定癌细胞的血管共选择动态、血管变性模式，并量化抗体转运的内皮屏障。此外，我们利用大量 RNA 测序、微血管灌注液 ELISA 和相关功能测定，探测癌细胞存在时的早期脑内皮变化。我们发现转移性 BTB 内的免疫细胞粘附和内皮周转率升高，并且巨噬细胞对 BTB 身份具有独特的影响。我们的模型提供了一种新颖的三维系统来研究 BTB 内发生的癌症-血管-免疫相互作用和药物输送的机制。© 2023。作者。

针对具有遗传性癌症倾向的个体的个性化监测、预防和癌症治疗选择取决于种系基因检测的结果。基因组技术的改进，例如 RNA 测序的可用性，可以通过提高种系检测的准确性和产量来增加对有资格进行个性化干预的个体的识别。评估配对 DNA 和 RNA 检测与致病种系检测的累积关联遗传变异和不确定意义变异的解析 (VUS)。2019 年 3 月至 2020 年 4 月，对在单一诊断实验室接受遗传性癌症指征种系检测的个体进行了配对 DNA 和 RNA 测序。人口统计特征、临床数据和检测结果在收到样本时进行整理，并随着时间的推移评估变体分类的变化。数据分析于2020年5月至2023年6月进行。主要结果是诊断率提高、VUS率降低、变异类型的总体结果、RNA证据与变异分类的关联以及对癌症风险管理的相应预测效果。总共纳入了 43524 名个体（测试时的中位年龄 [范围]，54 [2-101] 岁；37373 名女性个体 [85.7%]，6224 名男性个体 [14.3%]，以及 2 名性别未知的个体 [< 0.1%]），进行了 43599 次测试。共有 2197 名（5.0%）德系犹太人，1539 名（3.5%）亚裔，3077 名（7.1%）黑人，2437 名（5.6%）西班牙裔，27793 名（63.7%）白人，2049 名（4.7%） ）是其他种族，其中 4507 人（10.3%）的种族和民族未知。 549 人 (1.3%) 的变异分类受到影响。 97 名个体进行了具有医学意义的升级，其中 70 名个体的变异从 VUS 重新分类为致病性/可能致病性 (P/LP)，27 名个体具有新的深部内含子 P/LP 变异，而使用 DNA 无法检测到该变异单独测序。 545 个 P/LP 剪接变异中共有 93 个 (17.1%) 依​​赖于 RNA 证据进行分类，439 个现有剪接 VUS 中的 312 个 (71.1%) 通过 RNA 证据解决。值得注意的是，与白人相比，亚洲人、黑人和西班牙裔人的阳性率上升 (3.1%) 和 VUS 率下降 (-3.9%) 更高（1.6%；P = .02；和 -2.5%； P < .001)。这项诊断研究的结果表明，同时进行 RNA 测序和 DNA 测序的能力通过改进新变异的检测和现有变异的分类，代表了种系基因检测的重要进步。这扩大了对具有遗传性癌症倾向的个体的识别，并增加了个性化治疗和监测的机会。

TP63 等主转录因子建立超级增强子 (SE) 来驱动癌细胞中的核心转录网络，但细胞核内 SE 的时空调节仍然未知。核孔复合体 (NPC) 可能将 SE 束缚在 RNA 输出率最大的核孔上。在这里，我们报告 NUP153（NPC 的一个组成部分）将 SE 锚定到 NPC 上，并通过最大化 mRNA 输出来增强 TP63 表达。这种锚定是通过 NUP153 的本质无序区域 (IDR) 和共激活剂 BRD4 之间的蛋白质-蛋白质相互作用介导的。 NUP153 的沉默可将 SE 排除在核外周之外，降低 TP63 的表达，损害细胞生长，并诱导鳞状细胞癌的表皮分化。总体而言，这项工作揭示了 NUP153 IDR 在 SE 定位调节中的关键作用，从而为表观基因组和空间水平上的新基因调控层提供了见解。版权所有 © 2023 作者。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。

选择性剪接 (AS) 在转录组多样性中发挥着至关重要的作用，是癌症的一个标志，它深刻影响前列腺癌 (PCa) 的发生和进展，前列腺癌是男性中普遍存在且可能限制生命的癌症。越来越多的证据强调了 AS 失调与 PCa 的发病和进展之间的关联。然而，仍然缺乏在事件水平上对 AS 概况进行全面综合的分析，利用多个高通量队列的数据并评估 PCa 进展的预后，需要进行彻底的探索。我们在 ZWINT 中发现了一个差异表达的保留内含子事件三个不同的队列，包括我们之前分析的基于原始阵列的数据集和两个 RNA 测序 (RNA-seq) 数据集。随后对这些 RNA-seq 数据集的深入分析揭示了 141 个改变的事件，其中 21 个事件证明与患者的生化无复发生存 (BCRFS) 显着相关。我们制定了基于 AS 事件的预后特征，捕获了基因 CYP4F12、NFATC4、PIGO、CYP3A5、ALS2CL 和 FXYD3 中的六个关键事件。这一特征有效地将诊断为 PCa 的高风险患者与低风险患者区分开来，这些患者的 BCRFS 较短。值得注意的是，在预测 5 年 BCRFS 方面，该签名的预测能力超过了传统的临床病理学标记，在内部和外部验证集中都表现出了强大的性能。最后，我们构建了一个新颖的列线图，将患者的格里森评分与病理肿瘤分期相结合，证明 BCRFS 的预后得到了改善。PCa 的临床进展预测仍然难以捉摸。这项研究揭示了与 BCRFS 相关的新颖剪接事件，增强了现有的预后工具，从而有可能完善临床决策。© 2023。作者。

背景 一名 82 岁女性因急性发热性疾病和肠系膜脂膜炎就诊，并发展为生化无菌性脑膜炎（脑脊液细胞增多，无可识别病原体）。调查确定她的疾病可能是由柳氮磺吡啶引起的迟发性超敏反应。柳氮磺吡啶诱发的无菌性脑膜炎是一种罕见疾病，由于最初的非特异性疾病症状，需要排除更常见的“危险信号”病因，例如感染和恶性肿瘤，因此通常在患者入院晚期才诊断出来。病例报告 一名 82 岁女性，有反复尿路感染和血清阴性关节炎病史，有 3 天的疲劳、头痛、呼吸困难和倦怠病史。入院时，由于发热和心动过速，她被认为是不明原因败血症。脑计算机断层扫描（CT）显示没有急性颅内异常。此外，胸部、腹部和骨盆的 CT 未显示任何脓毒症来源或恶性肿瘤特征。通过血清学和脑脊液检测排除感染性病因后，诊断为柳氮磺吡啶诱发的无菌性脑膜炎（SIAM）。然后患者开始静脉注射类固醇，导致立即退热和症状缓解。结论 SIAM 仍然是一个诊断挑战，因为患者表现出非特异性体征和症状，如发热、头痛和疲倦。这些患者需要从病史、体格检查、生化检测和放射成像开始进行全面的调查。该病例说明，对于患有发热性疾病的风湿病患者，需要高度怀疑药物引起的过敏反应，并且已确信排除了感染性病因。在 SIAM 中立即开始静脉注射类固醇可显着恢复和缓解症状。