肺鳞状细胞癌（LUSC）的分子亚型已在基因组、转录组和蛋白质组水平上进行。然而，基于组织代谢组学的LUSC分层仍然缺乏。将高分辨率成像质谱与共识聚类相结合，在 330 名 LUSC 患者中鉴定出了具有不同代谢模式的四种肿瘤特异性亚型和四种基质特异性亚型。第一个肿瘤亚型 T1 与 DNA 损伤和免疫学特征（包括 CD3、CD8 和 PD-L1）呈负相关。相同的特征与肿瘤亚型T2呈正相关。 T4 肿瘤亚型与 PD-L1 高表达相关。与T1和T4亚型相比，T3亚型患者的预后改善，T3是UICC分期的独立预后因素。同样，基质亚型与不同的免疫学特征和代谢途径相关。基质亚型 S4 的预后优于 S2。随后，基于接受新辅助治疗的独立 LUSC 队列的分析表明，S2 基质亚型与化疗耐药相关。通过基于组织的空间代谢组学确定的临床相关患者亚型是对现有分子分类系统的有价值的补充。亚型之间的代谢差异及其与免疫学特征的关联可能有助于改善个性化治疗。© 2023。作者。

源自两个基因的嵌合转录本 (CT) 产生的分子和功能多样性有助于肿瘤细胞的存活。目前还存在一些差距。本研究是对癌症基因组图谱 (TCGA) (https://portal.gdc.cancer.gov) 中 160 个卵巢癌样本的 RNA 测序数据集中确定的 CT 谱进行的系统研究。结构注释揭示了伴侣基因的染色体定位、差异剪接和调节非翻译区域的包含所带来的复杂性。表型特异性关联的识别进一步解决了转化过程中动态调节的间充质特征。在进化背景上，蛋白质编码 CT 被认为是高度保守的，而非编码 CT 可能是最近才进化的。我们还意识到，目前假定结构改变或邻近基因通读生成 CT 的前提在亲本基因在基因组上距离较远的情况下是无效的。在解决这一缺陷时，我们确定了 3D 空间中特定时空排列介导的基因邻近度对于生成 CT 的重要性。所有这些特征共同表明，通过平行或与本地调控网络串扰形成嵌合体来增加细胞中分子多样性的非随机机制。© 2023 作者。

衰老相关分泌表型（SASP）与肝内胆管癌（ICC）的发生和进展密切相关。然而，其与 ICC 干性的关系仍不清楚。在该研究中，使用一类线性回归（OCLR）和单样本基因集富集分析（ssGSEA）算法计算ICC的干性指数。使用 ICC 的 Pearson 相关分析，总共鉴定了 14 个衰老相关干性基因 (SRSG)。随后，使用 ICC 共识聚类建立了 SRSG 相关分类。不同类型的 ICC 表现出不同的预后、免疫、代谢和致癌特征。此外，我们使用主成分分析 (PCA) 构建了 ICC 风险评分模型。风险评分与干性、免疫浸润、代谢和致癌特征呈正相关，但与 ICC 的预后呈负相关。高风险评分的患者可能对免疫治疗反应良好。此外，我们采用 3D 纤维蛋白凝胶来选择具有干性特征的肿瘤再生细胞 (TRC)。我们发现属于 14 个 SRSG 的 HELLS 在 ICC-TRC 中表达上调。沉默 HELLS 显着减少了 ICC-TRC 中的集落大小，抑制了迁移和侵袭，并减弱了 SASP。总之，我们为 ICC 提供了一种新颖的分类和风险评分，并揭示了 CSLC 可以获得活跃 SASP 的分子机制。© 2023 由 Elsevier B.V. 代表计算和结构生物技术研究网络出版。

合成致死（SL）对是同时丧失功能导致细胞死亡的基因对，而单独任一基因的破坏性突变不会影响细胞的存活。这使得 SL 对成为精准癌症治疗的有吸引力的靶点，因为靶向 SL 对的未受损基因可以选择性地杀死已经含有受损基因的癌细胞。由于寻找真正的 SL 对的难度，特别是在特定细胞类型上，当前的计算方法只能提供有限的见解，因为忽略了细胞上下文依赖性和 SL 对的机制理解的关键方面。因此，SL 目标的识别仍然依赖于昂贵且耗时的实验方法。在这项工作中，我们将细胞系特异性多组学数据应用于专门设计的深度学习模型来预测细胞系特异性 SL 对。通过将多种类型的细胞特异性组学数据与自我关注模块结合起来，我们将基因关系表示为图表。我们的方法以细胞特异性的方式实现了 SL 对的预测，并展示了促进发现癌症治疗的细胞特异性 SL 靶点的潜力，为揭示癌症生物学中 SL 起源的机制提供了工具。我们方法的代码和数据可以在 https://github.com/promethiume/SLwise 找到。© 2023 作者。

纤维肉瘤起源于成纤维细胞，是一种可在所有性别和年龄组中出现的恶性肿瘤。融合基因在人类癌症中尤其普遍，特别是在纤维肉瘤亚型中，它们在肿瘤发生中发挥着巨大的驱动力。许多融合基因是引发这种疾病的致病机制的基础。此外，融合基因类型谱与纤维肉瘤的表型表达之间存在密切关联，使得融合基因不仅可以作为纤维肉瘤有希望的诊断指标，而且可以作为其亚分类的关键基础。同时，越来越多的融合基因编码的嵌合蛋白已被证实可以作为治疗纤维肉瘤的特异性靶标，从而显着提高患者的预后。该综述全面阐述了纤维肉瘤中融合基因形成的机制、融合基因的谱系、检测纤维肉瘤内融合基因的方法以及纤维肉瘤域内融合基因驱动的靶向治疗干预的前景。版权所有 © 2023 Tang, Hu 、文和敏。

背景：内质网（ER）应激在结直肠腺癌（COAD）中发挥促凋亡作用。本研究旨在开发一种新型的 COAD ER 应激相关预后风险模型，并为对免疫检查点抑制剂治疗具有不同风险评分反应的 COAD 队列提供支持。方法：TCGA-COAD 和 GSE39582 纳入本前瞻性研究。进行单变量和多变量 Cox 分析以确定预后 ER 应激相关基因 (ERSG)。因此，评估了不同风险组的免疫浸润情况和免疫治疗反应。最后，使用逆转录定量聚合酶链反应验证了 10 个正常组织样本和 10 个 COAD 组织样本中预后基因的表达。结果：选择八个预后基因在 TCGA-COAD 队列的训练集中建立基于 ERSG 的特征。使用 TCGA-COAD 和 GSE39582 队列的测试集证实了这一点的准确性。基因集变异分析表明，高低风险群体的差异功能与免疫相关途径有关。与此相对应，CD36、TIMP1和PTGIS与不同风险组之间比例不同的19种免疫细胞显着相关，例如中央记忆CD4T细胞和中央记忆CD8T细胞。此外，风险评分被认为可以有效预测免疫治疗的临床反应，并且免疫治疗反应与 COAD 个体的风险评分显着负相关。此外，免疫检查点抑制剂治疗在高危组中效果较差，高危组中PD-L1的表达水平以及肿瘤免疫功能障碍和排除评分显着升高。最后，实验结果表明临床样本中预后基因的表达趋势与公共数据库的结果一致。结论：我们的研究建立了一个新的风险特征来预测COAD患者的预后，为COAD的临床治疗提供理论支持。

目前尚不清楚停止对老年男性进行前列腺癌 (PCa) 筛查的最佳时机，并且仍存在争议。 为了评估之前接受过基于前列腺特异性抗原 (PSA) 筛查的老年男性的前列腺癌特异性死亡率 (PCSM)，以确定那些可能从持续筛查中受益的人。共有 7052 名男性参加了欧洲前列腺癌筛查随机研究鹿特丹部分的筛查部门，在接受前列腺癌筛查后最后一次筛查时年龄为 70-74 岁最多包括三轮筛查但未诊断出 PCa。评估了 85 岁之前 PCSM 的累积发病率。此外，还进行了竞争风险回归来评估 PCSM 的潜在预测因素。中位随访时间为 16 年。到 85 岁，所有男性中 PCSM 的累积发病率为 0.54%（95% 置信区间 [CI]：0.40-0.70），PSA <2 ng/的男性为 0.11%（95% CI：0.05-0.27） ml，PSA 2-3 ng/ml 的男性为 0.85%（95% CI：0.47-1.5），PSA ≥ 6.5 ng/ml 且既往无良性活检的男性为 6.8%（95% CI：3.1-15） 。 PSA（亚分布风险比 [sHR]：2.0；95% CI：1.7-2.3）、既往良性前列腺活检（sHR：0.41；95% CI：0.23-0.72）和高血压（sHR：0.48；95% CI：0.25） -0.91) 与 PCSM 显着相关。70-74 岁的男性，如果之前接受过基于 PSA 的筛查，但没有得到 PCa 诊断，那么到 85 岁时死于 PCa 的风险非常低。这些数据表明，对于 PSA <3.0 ng/ml 或既往进行过良性前列腺活检的男性，可以停止筛查。如果预期寿命超过 10 岁，PSA 水平较高且之前未进行活检的人可能会考虑继续筛查。这项研究表明，参加前列腺癌筛查试验的男性，如果没有被诊断出患有前列腺癌，死于前列腺癌的风险非常低74 岁之前罹患前列腺癌。版权所有 © 2023 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。

皮肤鳞状细胞癌（CSCC）是最常见的皮肤恶性肿瘤之一，主要发生于老年人群。 CSCC 是人类第二常见的非黑色素瘤皮肤恶性肿瘤。皮肤鳞状细胞癌的发生与环境因素密切相关。微塑料作为一种新污染物，目前正在深入研究其潜在的健康影响。然而，微塑料对皮肤癌的影响尚不清楚，这是一个需要解决的重要科学问题。为此，本研究利用两种皮肤鳞状细胞癌细胞系（SCL-1和A431）研究微塑料对皮肤癌的影响，细胞行为实验表明微塑料内化到皮肤鳞状细胞癌中细胞系以时间和剂量依赖性方式。进一步的实验通过MTT、流式细胞仪、激光共聚焦显微镜、Western blotting等实验技术表明微塑料促进了皮肤癌细胞的增殖。机理研究表明，微塑料可以导致皮肤癌细胞中线粒体ROS增加，进而引起线粒体膜电位的变化，从而打开mPTP，进而导致mt-DNA从线粒体释放到细胞质中，从而激活NLRP3最终导致皮肤癌细胞增殖。我们进一步在正常皮肤细胞模型中评估了微塑料对 HaCaT 细胞的影响，结果表明微塑料通过 NLRP3 介导的炎症和烧焦死亡对正常皮肤细胞造成损伤。目前的研究表明，微塑料作为一种新污染物，可能会促进肿瘤细胞增殖，同时对正常皮肤造成损害。版权所有 © 2023 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。

一些多形性胶质母细胞瘤 (GBM) 的特征是存在宝石细胞 (GC)，这是一种反应性星形胶质细胞的独特表型。某些GC可以被识别为肿瘤细胞，但这些细胞也被发现与中枢神经系统非肿瘤病变中的糖尿病有关。我们的目的是寻找新诊断 GBM 患者的胰岛素抵抗代谢特征与 GC 存在之间的相关性。回顾性提取组织学确诊的 GBM 患者的医疗记录，了解不同的全身代谢变量。对 GBM、患有和不患有 GC 的糖尿病患者进行了基于统计的比较。糖尿病控制不佳（即血红蛋白A1C ⩾ 8.0）的患者也对两组进行了比较。我们的研究共纳入了220例新诊断的GBM患者。 58 名（26.3%）患者入院时有 2 型糖尿病（DM2）病史。 GC-GBM 组的 DM2 控制不良率几乎是非 GC GBM 组的两倍（18.75% vs 9.5%；P = .130）。在 DM2 队列中，GC-GBM 亚组与胰岛素抵抗相关的人口和代谢特征显着相关，例如男性占主导地位（89% vs 50%，P = .073）和病态肥胖（体重⩾85 kg：OR 6.16；P = .0019，平均BMI：34.1±11.42 vs 28.7±5.44；有和没有GC组的P = .034，分别）。在控制不佳的 DM2 组中，GC-GBM 患者在诊断前没有使用胰岛素，而非 GC GBM 患者中这一比例为 61.1%（OR = 0.04，P = .045）。 与显着相关的全身代谢因素胰岛素抵抗（DM2、病态肥胖、男性）与 GBM 的独特组织学表型相关，其特征是存在 GC。这一特征在未使用合成胰岛素的控制不佳的 DM2 GBM 患者中尤为突出。这一新发现可能会增加关于星形胶质细胞和与高级别神经胶质瘤相关的星形胶质细胞中葡萄糖代谢的相关性的不断增长的数据。在 GBM 患者中，患者代谢状态、肿瘤组织学表型、肿瘤分子变化、抗糖尿病药物的使用以及这些因素对生存的影响之间的相关性值得进一步研究。© 作者 2023。

全球精神障碍患病率正在上升，对个人（尤其是糖尿病患者）的护理质量和治疗结果产生不利影响。本研究调查了生产年龄的糖尿病患者（年龄 30-59 岁）精神障碍危险因素的关联），考虑社会人口特征和共存疾病。考虑的危险因素包括社会人口因素（例如居住地、年龄、性别、婚姻状况、教育和职业）和共存疾病（例如高血压、心脏病、中风、肾衰竭、风湿病、哮喘和癌症）。这项横断面研究利用了 2018 年印度尼西亚国家健康调查 (Riskesdas) 的数据。研究人群包括年龄在 30 岁至 59 岁之间、患有糖尿病并已完成包含 20 个问题的自我报告问卷 (SRQ-20) 的受访者。排除不完整的 SRQ-20 数据后，样本包括 8,917 名受访者。使用逻辑回归分析数据。大约 18.29% 的糖尿病患者表现出精神障碍的症状。在调整年龄、性别、教育水平、职业、婚姻状况和居住地等社会人口统计学因素后，患有高血压、心脏病、风湿性疾病、哮喘或癌症等共存疾病的糖尿病患者的患病率更高。与单纯糖尿病患者相比，发生精神障碍的风险更高（调整后的比值比，6.67；95%置信区间，4.481-9.928；p<0.001）。有合并症的糖尿病患者发生精神障碍的风险升高，强调了解决精神障碍的重要性。糖尿病管理中的健康问题，特别是患有并发疾病的患者。