研究动态
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Frontiers in Pharmacology
2023
JunrenChen,KexinZhon...
Astragalin: a food-origin flavonoid with therapeutic effect for multiple diseases.
Frontiers in Pharmacology
天然存在的类黄酮长期以来一直被用作开发新药的基本模板和功能性食品的关键成分。黄芪甲苷 (AG) 是一种天然黄酮类化合物,可以从多种常见的食用植物中分离出来,例如绿茶、桑树和菟丝子的种子。值得注意的是,AG具有广泛的药理活性,对多种疾病具有治疗作用,涵盖癌症、骨关节炎、骨质疏松、溃疡性结肠炎、乳腺炎、肥胖、糖尿病、糖尿病并发症、缺血/再灌注损伤、神经病变、呼吸系统疾病等。疾病、生殖系统疾病。本文综述了AG的天然来源和药代动力学,系统总结了AG治疗多种疾病的药理活性和潜在机制,以期推动AG作为功能食品的发展,为其在疾病治疗中的临床应用提供参考。 .版权所有 © 2023 陈、钟、秦、静、刘、李和彭。
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CURRENT OPINION IN CELL BIOLOGY
2023 Oct 31
CédricZeltz,MarionKu...
Novel roles for cooperating collagen receptor families in fibrotic niches.
CURRENT OPINION IN CELL BIOLOGY
最近的数据表明,整合素和非整合素胶原蛋白受体在纤维化特异性微环境(即纤维化生态位)中合作。在某些肿瘤类型中,DDR1可以调节与III型胶原蛋白的相互作用,从而调节休眠和转移,而在其他肿瘤类型中,DDR1可以脱落并用于重组胶原蛋白。肿瘤细胞上表达的 DDR1,与癌症相关成纤维细胞上表达的 DDR2 和 α11β1 整合素一起,可以增加肿瘤组织的硬度。整合素 α1β1 和 α2β1 存在于免疫细胞上,它们与免疫抑制胶原蛋白受体 LAIR-1 一起可以介导与肿瘤内胶原蛋白的结合。总之,胶原蛋白结合整合素与 DDR 一起可以创建纤维状胶原蛋白生态位,作为陷阱阻止免疫细胞运输到肿瘤细胞团中。胶原蛋白通过 LAIR-1 与免疫细胞结合进而导致 CD8 T 细胞耗竭。需要对这些复杂的相互作用进行持续研究,以成功地进行新的基于基质的治疗干预。在当前的综述中,我们将总结有关胶原蛋白受体的最新数据,特别关注它们在肿瘤纤维化中的潜在作用,并强调它们在肿瘤纤维化生态位中的协作作用。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Oct 18
AnjaliDhall,SumeetPa...
Risk assessment of cancer patients based on HLA-I alleles, neobinders and expression of cytokines.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
癌症免疫疗法的进步在治疗癌症方面显示出显着的效果。为了设计有效的免疫疗法,根据患者的基因组图谱了解患者的免疫反应非常重要。然而,要做到这一点的分析需要熟练掌握生物信息学方法。快速发展的测序技术和统计方法给那些想要寻找不同癌症的生物标志物但不具备详细的编码或工具知识的科学家造成了障碍。在这里,我们提供基于网络的资源,使没有生物信息学专业知识的科学家能够获得不同水平的不同癌症类型的预后生物标志物。我们计算了 8346 名癌症患者的 20 种癌症类型的预后生物标志物。这些生物标志物的计算基于 i) 352 种 I 类人类白细胞抗原,ii) 660959 种肿瘤特异性 HLA1 新结合剂,以及 iii) 153 种细胞因子的表达谱。据观察,癌症患者的生存风险取决于某些类型的 HLA-I 等位基因的存在;例如,HLA-A*03:01的肝癌患者风险较低。我们的分析表明 HLA-I 等位基因的新结合物与某些类型癌症患者的总生存期具有高度相关性。例如,HLA-B*07:02 结合物与肺鳞状细胞癌的生存相关性为 0.49,与肾嫌色细胞患者的生存相关性为 -0.77。此外,我们根据细胞因子表达计算了预后生物标志物。少数细胞因子的较高表达有利于膀胱尿路上皮癌的生存,例如 IL-2,而 IL-5R 对于肾嫌色细胞患者的生存不利。 CancerHLA-I 维护原始和分析数据,可供公众免费访问 (https://webs.iiitd.edu.in/raghava/cancerhla1/)。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd。保留所有权利。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Oct 24
XiaorenWang,XudongCu...
Deciphering essential druggable genes reveals potential immune-inflammatory axis in hepatocellular carcinoma.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
肝细胞癌(HCC)是一种死亡率高、患者预后差的恶性肿瘤。其发病机制是一个多因素、多步骤的复杂过程。然而,其病因和确切的分子机制尚不完全清楚。在这里,我们基于RNA测序数据构建了一个特异性表达网络。整合基因和 miRNA 表达谱以及临床证据来检测肝细胞癌生存模块。最后,我们试图通过整合药物敏感性分析和免疫浸润分析来识别潜在的关键生物标志物和药物靶点。共检测到42个肝细胞癌的预后模块。预后模块显着富含已知的癌症相关分子,并且已发现预后模块中 12.93% 的分子是小分子药物的靶标。此外,我们发现 42 个必需基因中有 38 个(90.48%)与 7 种免疫细胞类型中至少一种的比例相关。我们整合了临床预后信息、RNA 测序数据和药物活性数据来探索免疫细胞类型的风险模块肝细胞癌。通过药物敏感性分析和免疫浸润分析,我们评估了模块中的hub基因作为肝细胞癌潜在生物标志物和药物靶点的价值。该协议为解析肝细胞癌的分子机制和理论基础提供了新的见解。版权所有 © 2023。由 Elsevier Ltd 出版。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Oct 25
JieGao,YongxianFeng,...
Identification of Key DNA methylation sites related to differentially expressed genes in Lung squamous cell carcinoma.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
DNA某些CpG位点甲基化水平的变化与肺鳞状细胞癌(LUSC)的发生密切相关。但其具体调控机制尚不清楚。因此,有必要系统地识别和分析那些DNA甲基化水平与LUSC上调和下调基因差异表达密切相关的关键CpG位点。由于DNA甲基化位点分散在基因组的不同区域,为了研究基因表达水平与DNA甲基化之间的相关性,我们将基因分为6个不重叠的功能区域,并提出了两步相关分析方法来识别差异DNA甲基化位点和匹配的差异表达基因。结果,我们获得了分散在27个基因中的39个关键CpG位点。通过对LUSC-正常样本对的比较分析,我们发现这些位点和基因可以准确地将LUSC样本和正常样本聚类。最后,我们使用这些位点和基因来区分 LUSC 和正常样本。结果表明它们可以作为识别 LUSC 的有效生物标志物。此外,所提出的两步相关分析方法还可以扩展到其他癌症和疾病生物标志物的鉴定。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Nov 03
AvaBachari,NazimNass...
Rationalizing a prospective coupling effect of cannabinoids with the current pharmacotherapy for melanoma treatment.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
黑色素瘤是主要致命的癌症之一,但从治疗的角度来看,我们对其复发和对当前药物疗法的耐药性的控制微乎其微。内源性大麻素系统(ECS)最近被认为是一种多方面的稳态调节剂,影响包括皮肤在内的不同生物区室的各种生理过程。本综述概述了黑色素瘤的病理生理学、当前用于治疗的药物疗法以及与不同药理学方法相关的挑战。此外,它还强调了大麻素作为黑色素瘤补充疗法的效用,通过恢复慢性皮肤病期间下调的免疫调节途径和升高的炎症细胞因子之间的平衡,作为治疗这种免疫原性肿瘤的建议关键方法之一。本文分类为:癌症 > 分子和细胞生理学。© 2023 作者。 WIREs 疾病机制由 Wiley periodicals LLC 出版。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Nov 03
StevenMJohnson,James...
Comprehensive genomic profiling reveals molecular subsets of ASXL1-mutated myeloid neoplasms.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
迄今为止,尚未对 ASXL1 突变骨髓疾病患者进行大规模基因组分析。我们回顾了 6043 名成年人的全面基因组分析结果,以通过 ASXL1 突变状态来表征临床病理特征和共突变模式。 ASXL1 突变发生在 1414 名患者 (23%) 中。突变共现测试显示 ASXL1 和 9 个基因(SRSF2、U2AF1、RUNX1、SETBP1、EZH2、STAG2、CUX1、CSF3R、CBL)的突变之间存在很强的共现性(p< 0.01)。对具有这些共突变的患者的进一步分析产生了一些新的发现。共突变模式支持 ASXL1/SF3B1 共突变可能在生物学上不同于 ASXL1/非 SF3B1 剪接体共突变。在 AML 中,ASXL1/SRSF2 共突变患者经常携带 STAG2 突变 (42%),这取决于 ASXL1 和 SRSF2 突变的存在 (p<0.05)。 STAG2 和 SETBP1 突变也只出现在 ASXL1/SRSF2 共突变患者中,并且与不同的慢性骨髓表型相关。我们的研究结果支持某些多突变基因型可能与 ASXL1 突变骨髓疾病具有生物学相关性。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Dec
NanTang,WeilunWen,Zh...
HELQ as a DNA helicase: Its novel role in normal cell function and tumorigenesis (Review).
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
解旋酶 POLQ 样(HELQ 或 Hel308)是一种高度保守的 3'‑5' 超家族 II DNA 解旋酶,有助于多种 DNA 过程,包括 DNA 修复、解旋和链退火。 HELQ 缺陷在生殖细胞稳定性中发挥着关键作用,因此会导致生育能力低下。此外,在多种肿瘤中观察到HELQ的异常表达,并且许多分子通路,包括核苷酸切除修复、检查点激酶1-DNA修复蛋白RAD51同源物1和ATM/ATR通路,已被证明参与参与HELQ。在本综述中,描述了 HELQ 的结构和特征,以及它在 DNA 加工中的主要功能。还描述了肿瘤发生过程中涉及 HELQ 的分子机制。据推测,HELQ 生物学值得研究,并且其在调节各种 DNA 过程和参与肿瘤发生中的关键作用具有临床相关性。
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
2023 Nov
ÁngelaBella,LeireArr...
Intraperitoneal administration of a modified vaccinia virus Ankara confers single-chain interleukin-12 expression to the omentum and achieves immune-mediated efficacy against peritoneal carcinomatosis.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer
腹膜癌病是癌症的晚期阶段,其中疾病已扩散至腹膜腔。为了恢复该位置被肿瘤细胞破坏的抗肿瘤免疫,我们评估了经改造的安卡拉牛痘病毒 (MVA) 的腹腔给药,该病毒经过改造可表达单链白细胞介素 12 (scIL-12),以增强抗肿瘤免疫反应。MVA 编码 scIL-12 (MVA.scIL-12)根据腹膜内肿瘤细胞植入的腹膜癌病模型进行评估。在静脉内、肿瘤内或腹膜内施用病毒载体后,评估了 CD8 介导的免疫反应、阐明的抗肿瘤功效和安全性。通过 ELISpot(酶联免疫吸附点)、RNA 测序、流式细胞术、活体显微镜检查以及用单克隆抗体去除淋巴细胞亚群来测量免疫反应。通过体重随访和血液检测评估安全性。使用编码荧光素酶的报告 MVA 通过生物发光分析评估静脉内或腹膜内给药的组织向性。腹膜内或局部区域给药(但不是其他给药途径)导致有效的免疫反应,其特征是肿瘤特异性 CD8 T 淋巴细胞水平增加,能够产生干扰素-γ和肿瘤坏死因子-α。抗肿瘤免疫反应不仅可以在腹膜腔中检测到,而且可以在全身检测到。作为腹膜内治疗的结果,编码scIL-12的MVA.scIL-12的单次施用完全根除植入腹膜腔中的MC38肿瘤,并且还保护治愈的小鼠免受随后的皮下再次攻击。使用 MVA 编码荧光素酶的生物发光成像显示,腹膜内给药将转基因靶向大网膜。大网膜被认为是腹膜腔免疫保护的关键组织。腹膜内给药的安全性也优于静脉内给药,因为当载体局部递送至腹膜腔时,未观察到体重减轻或血液学毒性。编码 scIL-12 的 MVA 载体的腹膜内给药靶向大网膜,即大网膜。腹膜癌病通常开始的组织。 MVA.scIL-12 诱导有效的肿瘤特异性免疫反应,通常会导致播散到腹膜腔的实验性肿瘤的根除。© 作者(或其雇主)2023。CC BY 允许重复使用-NC。不得商业再利用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
2023 Nov
YanLuo,BarathShreede...
Th17-inducing dendritic cell vaccines stimulate effective CD4 T cell-dependent antitumor immunity in ovarian cancer that overcomes resistance to immune checkpoint blockade.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer
卵巢癌 (OC) 是一种对女性高度致命的癌症,5 年总生存率为 48%。先前的研究将肿瘤微环境中 IL-17 和 Th17 T 细胞的存在与 OC 患者生存率的提高联系起来。为了确定 Th17 诱导疫苗对 OC 是否有治疗效果,我们创建了 Th17 诱导树突状细胞 (DC) (Th17-DC) 疫苗接种的小鼠模型,该模型是通过刺激 IL-15 同时阻断骨髓来源 DC 中的 p38 MAPK 产生的,随后进行抗原脉冲。将ID8肿瘤细胞腹膜内注射到小鼠体内。小鼠单独接受 Th17-DC 或传统 DC (cDC) 疫苗治疗,或联合免疫检查点阻断 (ICB) 治疗。使用多种实验策略检查全身免疫、肿瘤相关免疫、肿瘤大小和存活。与 cDC 疫苗相比,Th17-DC 疫苗增加了肿瘤微环境中的 Th17 T 细胞,重塑了骨髓微环境,并提高了小鼠存活率。 ICB 对 OC 的疗效有限,但诱导 Th17 的 DC 疫苗接种使其对抗 PD-1 ICB 敏感,通过克服 IL-10 介导的耐药性,实现持久的无进展生存。 Th17-DC 疫苗的功效,无论是单独使用还是与 ICB 联合使用,都是由 CD4 T 细胞介导的,而不是 CD8 T 细胞。这些发现强调在 OC 治疗中使用生物学相关的免疫调节剂(如 Th17-DC 疫苗)来重塑肿瘤微环境并增强临床效果对 ICB 治疗的反应。© 作者(或其雇主)2023。根据 CC BY-NC 允许重复使用。不得商业再利用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。
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