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Epigenetics & Chromatin
2023

ArnaudJannin,Anne-Fr...
Metabolism of pancreatic neuroendocrine tumors: what can omics tell us?
Epigenetics & Chromatin
细胞代谢的重编程现在是肿瘤发生的标志。近年来,胰腺神经内分泌肿瘤(pNET)的研究主要集中在遗传和表观遗传修饰以及相关信号通路上,但很少有研究致力于表征这些肿瘤的代谢特征。在这篇综述中,我们通过分析文献中可用的转录组学和代谢组学数据,彻底研究了 pNET 中的代谢途径。我们从所有公开可用的基因集富集(GSE43797、GSE73338 和 GSE117851)中检索并下载了基因表达谱,以比较差异基于阶段和 MEN1 突变状态的表达基因。此外,我们对 NET 中的代谢组学数据进行了系统回顾。通过结合转录组学和代谢组学方法,我们发现与没有 pNET 的对照相比,pNET 中的独特代谢。我们的分析表明,一碳、谷胱甘肽和多胺代谢、脂肪酸生物合成和支链氨基酸分解代谢存在失调,这些代谢提供了三羧酸循环。这些靶标与 pNET 细胞增殖和转移有关,也可能产生预后影响。在分析有或没有转移、有或没有 MEN1 突变的患者资料时,由于现有研究中发表的临床数据稀缺,我们只观察到一些差异。因此,现在需要进一步的研究来验证我们的数据并研究这些潜在靶标作为生物标志物或治疗解决方案,特别关注 pNET。版权所有 © 2023 Jannin、Dessein、Do Cao、Vantyghem、Chevalier、Van Seuningen、Jonckheere 和 Coppin。
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Epigenetics & Chromatin
2023

MinGao,YongwenLi,Pei...
Exploring the therapeutic potential of targeting polycomb repressive complex 2 in lung cancer.
Epigenetics & Chromatin
肺癌(LC)的发病机制是一个多方面的过程,受多种因素影响。除了基因突变和环境影响之外,越来越多的证据表明表观遗传机制在 LC 的发生和进展中发挥着重要作用。 Polycomb 抑制复合物 2 (PRC2) 由 EZH1/2、SUZ12 和 EED 组成,是一种表观遗传沉默子,控制靶基因的表达,对多细胞生物体的细胞身份至关重要。 PRC2 的异常表达已被证明可通过多种途径促进 LC 的进展。尽管靶向抑制 EZH2 已被证明具有延缓 LC 进展和提高化疗敏感性的潜力,但 PRC2 酶抑制剂在 LC 中的有效性有限,因此有必要更全面地了解 PRC2 的作用。本文综述了PRC2的核心亚基及其相互作用,并概述了PRC2在癌症中异常表达的机制及其在肿瘤免疫中的作用。我们还总结了 PRC2 在调节 LC 细胞中上皮间质转化、侵袭性转移、细胞凋亡、细胞周期调节、自噬和 PRC2 介导的 LC 化疗药物耐药等生物学行为中的重要作用。最后,我们探讨了针对 PRC2 的药物研究和评估的最新突破,以及这些药物治疗多种人类癌症疗效的临床研究的最新结果。版权所有 © 2023 高,李,曹,刘、陈、康。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Oct 27

DanielJMcGrail,YangL...
Widespread BRCA1/2-independent homologous recombination defects are caused by alterations in RNA-binding proteins.
Epigenetics & Chromatin
同源重组 DNA 修复 (HRD) 的缺陷既容易导致癌症发展,也会产生治疗漏洞,因此确定导致 HRD 的遗传事件范围至关重要。然而,我们发现 BRCA1/2 和其他典型 HR 基因的突变仅识别出 10%-20% 的显示 HRD 基因组证据的肿瘤。使用基于网络的方法,我们发现超过一半的导致 HRD 的推定基因起源于经典 DNA 损伤反应基因之外,其中特别富集 RNA 结合蛋白 (RBP) 编码基因。这些假定的 HRD 驱动因素经过实验验证,在独立队列中进行交叉验证,并在与癌症相关的全基因组关联研究位点中丰富。机制研究表明,一些 RBP 被招募到 DNA 损伤位点以促进修复,而其他 RBP 则控制典型 HR 基因的表达。总体而言,这项研究极大地扩展了 HRD 的已知驱动因素,对基础生物学、基因筛查和治疗分层具有影响。版权所有 © 2023 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Nov 01

ZhiChen,ChangLiu,Tao...
Resveratrol affects ccRCC cell senescence and macrophage polarization by regulating the stability of CCNB1 by RBM15.
Epigenetics & Chromatin
目的:本研究旨在探讨白藜芦醇对透明细胞肾细胞癌的治疗作用。材料
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Sep

PadminiSreedhara,Vin...
T-cell Lymphoblastic Lymphoma Presenting as a Pituitary Mass.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
原发性垂体 T 淋巴细胞淋巴瘤是一种罕见的临床实体。一名 45 岁女性因头痛、左眼视力模糊、复视、眼肌麻痹和上睑下垂就诊。大脑磁共振成像显示鞍区肿块很可能与垂体大腺瘤一致。实验室评估发现继发性甲状腺功能减退症、继发性肾上腺皮质功能不全和高催乳素血症。通过经蝶切除术切除肿块,随后的免疫表型分析显示 T 细胞淋巴母细胞淋巴瘤。二次检查证实淋巴瘤局限于中枢神经系统。切除后,患者的头痛有所改善,但她出现持续性视力缺陷以及第 III、IV 和 VI 脑神经麻痹。化疗方案包括大剂量甲氨蝶呤,随后环磷酰胺、硫酸长春新碱、盐酸阿霉素(阿霉素)、地塞米松(环磷酰胺、美司钠、硫酸长春新碱、盐酸阿霉素、地塞米松)和甲氨蝶呤/阿糖胞苷交替循环。自从接受化疗以来,麻木、眼睑下垂、左眼眶压力和头痛都有所改善。该病例仅代表第八例 T 细胞原发性垂体淋巴瘤,也是接受诊断的最年轻的患者。© 作者 2023。由牛津大学出版社代表内分泌学会出版。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023

KeiferKurtz,LauraEib...
Engineering CAR-T cells for radiohapten capture in imaging and radioimmunotherapy applications.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
理由:CAR-T 细胞的体内动力学仍不完全清楚。迫切需要新的方法来非侵入性地纵向监测转移细胞的生物分布、功能、增殖和体内持久性,并在治疗失败的情况下提高其细胞毒性效力。方法:在这里,我们工程化了 CD19 CAR-T 细胞(“Thor”细胞)来表达膜结合的 scFv huC825,它以皮摩尔亲和力结合 DOTA 半抗原,适合用成像或治疗性放射性核素进行标记。我们评估了其在 PET 连续跟踪研究和 α-放射性核素递送中的多功能实用性,以增强淋巴瘤模型中使用 Thor 细胞体内次优过继细胞转移的抗肿瘤杀伤功效。结果:我们表明,该报告基因/探针平台能够使用具有极高对比度的 PET/CT 成像对全身输注的 Thor 细胞进行重复、灵敏和特异性的评估。 PET 的摄取在细胞和功能水平上与 Thor 细胞相关。此外,我们报告了Thor细胞能够优先在肿瘤部位积累细胞毒性α发射放射性核素,从而提高治疗效力。结论:Thor 细胞是一种新的治疗诊断剂,可以为过继性 T 细胞疗法的更好、更安全的临床方案以及加速开发策略提供重要信息。© 作者。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Nov 01

XiaomeiILiu,RubyLeon...
Physiologically-based pharmacokinetic modeling of nilotinib for drug-drug interactions, pediatric patients, and pregnancy and lactation.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
尼罗替尼是第二代 BCR-ABL 酪氨酸激酶抑制剂,用于治疗成人和儿童患者的费城染色体阳性慢性粒细胞白血病。尼罗替尼在特定人群(如妊娠期和哺乳期人群)中的药代动力学(PK)仍知之甚少。因此,本研究的目标是开发一种基于生理学的药代动力学 (PBPK) 模型,以预测虚拟药物相互作用 (DDI) 研究以及儿童、孕妇和哺乳期人群中的尼洛替尼 PK。尼洛替尼 PBPK 模型是在 PK-Sim® 中构建的,PK-Sim® 是免费开源软件开放系统药理学 (OSP) 的一部分。用于验证尼罗替尼模型的观察到的临床数据来自文献。该模型合理地预测了成人人群中尼洛替尼的浓度、成人人群中尼洛替尼与利福平或酮康唑之间的 DDI,以及儿童、孕妇和哺乳期人群中的 PK,尽管在后两个人群中血浆浓度被略微低估。成人模型的预测 PK 参数与观察到的 PK 参数之比,AUC 为 0.71-1.11,Cmax 为 0.55-0.95。对于 DDI,预测的 AUCR 和 CmaxR 符合 Guest 标准。目前的研究证明了使用 PBPK 模型来了解成人和特殊人群(例如儿科、孕妇和哺乳期个体)之间 PK 差异的机制基础的效用,表明该技术可以潜在地告知或优化特定人群的给药条件。本文受版权保护。保留所有权利。本文受版权保护。版权所有。
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CLINICAL MICROBIOLOGY REVIEWS
2023 Nov 01

MuneyoshiKimura,Saga...
MicroRNAs in infectious diseases: potential diagnostic biomarkers and therapeutic targets.
CLINICAL MICROBIOLOGY REVIEWS
摘要MicroRNA (miRNA) 是保守的、短的非编码RNA,在基因表达的转录后调控中发挥着至关重要的作用。它们与癌症以及神经、心血管和自身免疫疾病的发病机制有关。最近的几项研究表明,miRNA 在调节免疫细胞的分化、成熟和激活方面发挥着关键作用,从而影响宿主对感染的免疫反应。感染引起的 miRNA 上调或下调会影响负责免疫反应的基因的蛋白质表达,并可以确定疾病进展的风险。最近,miRNA 已被探索作为各种传染病的诊断生物标志物和治疗靶点。这篇综述总结了我们目前从临床角度对 miRNA 在病毒、真菌、细菌和寄生虫感染中的作用的理解,包括关键的功能机制及其作为生物标志物和治疗靶点的潜在用途的影响。
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npj Systems Biology and Applications
2023 Oct 31

MustafaOzen,CarlosFL...
Data-driven structural analysis of small cell lung cancer transcription factor network suggests potential subtype regulators and transition pathways.
npj Systems Biology and Applications
小细胞肺癌(SCLC)是一种侵袭性疾病,由于其转录亚型和亚型转变的混合,治疗起来具有挑战性。转录因子 (TF) 网络一直是通过系统方法识别 SCLC 亚型调节因子的研究焦点。然而,它们的结构可以提供有关亚型驱动因素和转变的线索,但几乎没有被研究过。在这里,我们使用图论概念分析 SCLC TF 网络的结构,并确定其负责复杂信号处理的结构上重要的组件(称为集线器)。我们首先分析无偏网络结构,然后将 RNA-seq 数据整合为分配给每个相互作用的权重,证明网络的中心是不同 SCLC 亚型的调节者。数据驱动的分析强调 MYC 作为中心,这与最近的报告一致。此外,我们假设连接功能不同的中心的路径可能控制亚型转换,并通过对候选路径的网络模拟来测试该假设并观察亚型转换。总体而言,复杂网络的结构分析可以识别其功能上重要的组件和驱动网络动态的路径。此类分析可以是生成假设的第一步,并可以指导发现目标路径,其扰动可能会改变网络动态表型。© 2023。作者。
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JOURNAL OF NANOBIOTECHNOLOGY
2023 Oct 31

YuhanFu,JialinSun,Ya...
Glucose oxidase and metal catalysts combined tumor synergistic therapy: mechanism, advance and nanodelivery system.
JOURNAL OF NANOBIOTECHNOLOGY
癌症一直对人类健康构成重大威胁,由于传统疗法的局限性,促使人们对新的治疗策略进行广泛的研究。饥饿疗法(ST)通过针对癌细胞增殖的主要能源葡萄糖而引起了相当大的关注。葡萄糖氧化酶 (GOx) 是一种促进葡萄糖消耗的催化剂,已成为 ST 的关键治疗剂。然而,单独使用单一 ST 很难完全抑制肿瘤生长,因此需要开发协同治疗方法。金属催化剂具有类似酶的功能,可以作为载体,能够与GOx结合,实现多种肿瘤治疗。然而,确保酶活性在正常组织中保留并在肿瘤内特异性激活是一个严峻的挑战。纳米递送系统通过提高治疗剂的稳定性和实现控制释放来提供增强治疗效果的潜力。本综述主要关注GOx与金属催化剂联合协同肿瘤治疗机制的最新进展。此外,它还讨论了为不同载体类别的协同治疗而设计的各种纳米颗粒(NP)结构。最后,本综述总结了基于 GOx-金属催化剂的纳米颗粒 (G-M),并深入探讨了与 G-M 治疗、输送设计和氧气 (O2) 供应相关的挑战。© 2023。作者。
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