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Stem Cell Research & Therapy
2023 Oct 30

ClaudiaBruedigam,Amy...
Imetelstat-mediated alterations in fatty acid metabolism to induce ferroptosis as a therapeutic strategy for acute myeloid leukemia.
Stem Cell Research & Therapy
端粒酶能够在大多数癌症中实现复制永生,包括急性髓系白血病 (AML)。 Imetelstat 是一种一流的端粒酶抑制剂,对骨髓纤维化和骨髓增生异常综合征具有临床疗效。在这里,我们开发了 AML 患者来源的异种移植资源,并结合功能遗传学进行综合基因组学、转录组学和脂质组学分析,以确定 imetelstat 疗效的关键介质。在一项针对患者来源的异种移植物的随机 II 期临床前试验中,imetelstat 有效减轻了 AML 负担,并优先针对包含突变 NRAS 和氧化应激相关基因表达特征的亚组。无偏见的全基因组 CRISPR/Cas9 编辑将铁死亡调节因子确定为 imetelstat 功效的关键调节因子。伊美司他促进含多不饱和脂肪酸磷脂的形成,导致脂质过氧化和氧化应激水平过高。铁死亡的药理学抑制会降低伊美司他的疗效。我们利用这些机制见解来开发优化的治疗策略,使用氧化应激诱导化疗使患者样本对 imetelstat 敏感,从而使 AML 的疾病得到实质性控制。© 2023。作者。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Oct 30

ZhiyongZhang,Lingnan...
PVA enema ameliorates DSS-induced acute colitis in mice.
Stem Cell Research & Therapy
溃疡性结肠炎(UC)代表一种临床上具有挑战性的疾病,其特征在于结肠上皮粘膜的持续损伤作为主要病理特征。聚乙烯醇(PVA)溶液主要由胶水组成,是一种可生物降解的聚合物材料,已在医疗领域得到应用。本研究致力于探讨 PVA 水溶液在改善小鼠 UC 方面的治疗潜力。通过在饮食中添加 2.5% DSS 6 天,在 48 只 C57BL/6 小鼠中诱导 UC。用不同浓度的 PVA(0.1 mg/ml PVA、0.3 mg/ml PVA、1 mg/ml PVA、3 mg/ml PVA、10 mg/ml PVA)灌肠处理小鼠(n = 6)。评估疾病活动指数(DAI)和组织学评分的炎症程度。此外,还培养了小鼠结肠类器官,用于评估 PVA 对体外扩张的影响。PVA 水溶液(1 mg/ml 和 3 mg/ml)能够减轻小鼠的 DAI。到第 6 天,1 mg/ml PVA 组的 DAI 显着降低了 3/5 倍 (p = 0.02)。组织病理学评分有所改善,同时肠粘膜组织中炎症因子的水平降低。此外,已证实 PVA 可以在体外促进结肠类器官的扩张。 总之,我们的研究结果表明,PVA 有可能改善患有 DSS 诱导结肠炎的小鼠受试者中与结肠炎相关的症状,主要是通过其促进肠道干细胞扩增。这项研究可能为溃疡性结肠炎的临床治疗提供新的候选者。© 2023。作者。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Oct 30

HakimBouamar,LarryEs...
mTOR inhibition abrogates human mammary stem cells and early breast cancer progression markers.
Stem Cell Research & Therapy
乳腺生理学的特点是含有成体干/祖细胞,这些细胞在女性的整个生殖寿命中积极地修改乳腺组织。尽管乳腺干/祖细胞在乳腺发育、生理维持和繁殖中都很重要,但乳腺干/祖细胞在乳腺肿瘤发生中的确切作用尚未在人类或动物模型中得到充分阐明。调节女性成体干/祖细胞的意义不仅可以使人们更好地了解它们的功能,而且可以预防乳腺癌,这使我们能够评估雷帕霉素在降低乳腺干/祖细胞活性和恶性进展标志物方面的功效.我们通过流式细胞术分析了大量人类乳腺组织的基底细胞和管腔细胞组成,并通过球体形成测定分析了其干细胞和祖细胞功能,与年龄和绝经状态相关的临床研究(NCT02642094)涉及低- mTOR 抑制剂西罗莫司的剂量(2 毫克/天)和短期(5-7 天)治疗。通过免疫组织化学定量分析来测量活检和手术乳腺样本中生物标志物的表达。西罗莫司治疗显着消除了乳腺干细胞活性,特别是在绝经后患者中。它不影响管腔祖细胞的频率,但降低了它们的自我更新能力。虽然西罗莫司对基底细胞群没有影响,但它减少了管腔细胞群,特别是绝经后患者。它还显着减少了与乳腺癌从原位导管癌发展为浸润性乳腺癌相关的预后生物标志物,包括 p16INK4A、COX-2 和 Ki67,以及与衰老相关的秘书表型标志物,从而可能起到预防早期乳腺癌的作用总体而言,这些发现表明 mTOR 信号转导与乳腺干细胞和祖细胞活性以及癌症进展之间存在联系。试验注册 本研究涉及一项临床试验,注册号为 ClinicalTrials.gov,注册号为 NCT02642094,注册日期为 2015 年 12 月 30 日。© 2023。作者。
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Stem Cell Research & Therapy
2023

ChenglongPan,AnqiXu,...
Research progress of Claudin-low breast cancer.
Stem Cell Research & Therapy
Claudin 低乳腺癌 (CLBC) 是 2007 年在分子水平上发现的乳腺癌亚组。Claudin 是构成紧密连接的主要蛋白质之一,在抗炎和抗肿瘤反应以及维持水和电解质平衡。紧密连接蛋白表达的减少会导致紧密连接结构的破坏和下游信号通路的激活,从而导致肿瘤的形成。 Claudin-low乳腺癌的起源仍存在争议。 Claudin 低乳腺癌的特点是 Claudin3、4、7、E-cadherin 和 HER2 低表达,Vimentin、Snai 1/2、Twist 1/2、Zeb 1/2 和 ALDH1 高表达,以及干细胞特征。 Claudin-low乳腺癌临床发病多在绝经年龄,组织学分级较高。这种乳腺癌亚型比其他亚型更容易扩散到淋巴结。克劳丁低乳腺癌常常伴有侵袭性增加和预后不良。根据临床回顾性分析,claudin-low乳腺癌可以实现低病理完全缓解。目前,虽然已经确定了claudin-low乳腺癌的多个治疗靶点,但有效的治疗仍处于基础研究阶段,尚未设计动物研究或临床试验。本文广泛讨论了 CLBC 的起源、分子生物学特征、病理特征、治疗和预后。这将有助于全面了解 CLBC,并为乳腺癌个体化治疗奠定基础。版权所有 © 2023 Pan、Xu、Ma、Yao、Zhao、Wang 和 Chen。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Oct 31

MdSohel
Comprehensive exploration of Biochanin A as an oncotherapeutics potential in the treatment of multivarious cancers with molecular insights.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
癌症被认为是死亡的主要原因。癌症死亡率的上升以及现有化疗药物的副作用、疗效差和成本高等现有局限性增加了对更有效和替代癌症治疗的需求。这篇综述简要概述了生物鸡蛋白 A (BCA) 及其对各种癌症的潜力,并详细介绍了抗癌机制。根据我们的审查,包括计算机模拟、体外、临床前和临床试验在内的许多研究已经测试来评估 BCA 的功效。该化合物可有效对抗 15 种癌症,包括乳腺癌、宫颈癌、结直肠癌、胃癌、胶质母细胞瘤、肝癌、肺癌、黑色素瘤、口腔癌、骨肉瘤、卵巢癌、胰腺癌、咽癌、前列腺癌和脐静脉癌。该化合物的一般抗癌活性是通过多种分子过程介导的,包括细胞凋亡、细胞增殖、转移和血管生成、信号传导、酶途径和其他机制的调节。针对治疗和致癌蛋白以及不同的途径,构成了抗癌作用的分子机制。许多信号网络及其组件,例如 EFGR、PI3K/Akt/mTOR、MAPK、MMP-2、MMP-9、PARP、Caspase-3/8/9、Bax、Bcl2、PDL-1、NF-κB、TNF -α、IL-6、JAK、STAT3、VEGFR、VEGF、c-MY、细胞周期蛋白 B1、D1、E1 和 CDK、Snail 和 E-钙粘蛋白可在癌细胞中受 BCA 调节。 BCA 的这种抗癌特性可能是其正确的结构化学的结果。使用基于 BCA 的疗法作为纳米载体来递送化疗药物有可能非常有效。这种天然化合物与其他天然化合物和标准药物(包括索拉非尼、5-氟尿嘧啶、替莫唑胺、阿霉素、芹菜素和染料木黄酮)具有协同作用。此外,正确使用这种化合物可以通过多种机制逆转多药耐药性。 BCA具有更好的药物相似性和药代动力学特性,并且对人体无毒(眼、肝、肾、皮肤、心脏)。由于 BCA 具有广泛的抗癌机制、协同效应和良好的药代动力学特性,在标准药物上市之前,BCA 可以用作补充食品。© 2023 John Wiley
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Oct 30

ChiLiu,JieShi,Zhengy...
RP11-495P10.1 promotes HCC cell proliferation by regulating reprogramming of glucose metabolism and acetylation of the NR4A3 promoter via the PDK1/PDH axis.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
过去几十年来,肝细胞癌(HCC)的发病率和相关死亡有所增加。然而,HCC 发病机制的分子机制尚不完全清楚。长链非编码RNA(lncRNA)RP11-495P10.1已被证明与前列腺癌的进展密切相关,但其在HCC中的作用和具体机制仍不清楚。在这里,我们发现 RP11-495P10.1 在 HCC 组织和细胞中高表达,并有助于 HCC 细胞的增殖。此外,这项研究表明,RP11-495P10.1通过负向调节核受体亚家族4组a成员3(NR4A3)的表达来影响HCC的增殖。糖代谢重编程是肿瘤细胞的主要特征之一。在本研究中,我们发现RP11-495P10.1通过改变丙酮酸脱氢酶激酶1(PDK1)和丙酮酸脱氢酶(PDH)的表达来调节糖代谢重编程,从而促进HCC细胞的增殖。此外,敲低 RP11-495P10.1 通过促进 PDH 活性和乙酰辅酶 A 的产生来增加 NR4A3 启动子中 H3K27Ac 的富集,从而导致 NR4A3 转录增加。总之,RP11-495P10.1通过PDK1/PDH轴调节葡萄糖代谢的重编程和NR4A3启动子的乙酰化来促进HCC细胞增殖,这为HCC的诊断和治疗提供了一种以lncRNA为导向的治疗策略。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Oct 30

JuanDu,TianyiHuang,Z...
Biological function and clinical application prospect of tsRNAs in digestive system biology and pathology.
Epigenetics & Chromatin
tsRNA 是源自 tRNA 的小非编码 RNA,在多种生理活动中发挥重要作用,如 RNA 沉默、核糖体生物发生、逆转录转座和表观遗传,以及参与细胞分化、增殖和凋亡。 tsRNA相关异常通过影响细胞周期和特定信号分子,对多种人类疾病(包括恶性肿瘤)的发生、发展和进展产生重大影响。本文介绍了tsRNA的起源和分类,总结了tsRNA在消化系统疾病中的调节机制和生理功能以及功能失调的影响,重点关注了tsRNA作为诊断和预后生物标志物的临床前景。视频摘要。© 2023。作者。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Oct

LingWang,DingkaiXu
Regulation of long noncoding RNAs in the pathogenesis and clinical implications of pituitary adenomas.
Epigenetics & Chromatin
垂体腺瘤(PA)是一种发生在蝶鞍的肿瘤,是最常见的颅内肿瘤之一。它属于一种源自垂体细胞单克隆的腺瘤。 PA 在所有颅内肿瘤中排名第三,仅次于神经胶质瘤和脑膜瘤。尸检时的平均患病率约为 15%,放射学检查时的平均患病率约为 22.5%。大多数 PA 是良性、非侵袭性腺瘤,可以通过手术切除或通过药物控制。然而,其中约 35% 的肿瘤侵犯了附近的解剖结构,无法完全切除。 0.1%~0.2%的PA病例最终发展为垂体癌。此外,由于占位效应和垂体激素分泌紊乱,PA 可能导致严重的发病。因此,迫切需要阐明PA的病理机制,提高诊断的准确性,并开发靶向治疗。尽管目前对PA发病机制的了解仍然有限,但PA的表观遗传调控已越来越受到关注。已知长非编码 RNA (lncRNA) 可在转录后调节基因表达,并在各种肿瘤的发生、进展或抑制中发挥重要作用。越来越多的证据表明,lncRNA 失调与 PA 发展之间存在密切关系。这篇综述重点介绍了 lncRNA 在 PA 发病机制中研究的最新进展,以及它们作为 PA 患者的诊断/预后生物标志物或治疗靶点的潜力。© 2023 作者。约翰·威利出版的《免疫、炎症和疾病》
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Epigenetics & Chromatin
2023 Oct 19

BoramLee,JunseokPark...
Pan-cancer analysis reveals multifaceted roles of retrotransposon-fusion RNAs.
Epigenetics & Chromatin
转座子衍生的转录本在 RNA 序列中含量丰富,但它们的结构和功能,特别是来自未注释或体细胞获得的转座子的融合转录本,仍然尚未得到充分研究。在这里,我们开发了一种新的生物信息学工具来检测 RNA 测序数据中的转座子融合转录本,并对 34 种癌症类型的 10,257 个癌症样本以及 3,088 个正常组织样本进行了泛癌分析。我们鉴定了 52,277 个癌症特异性融合,每个癌症有约 30 个事件,以及转座子内易形成融合的热点位点。内含子转座子的外显子化是最常见的基因融合,而体细胞 L1 插入构成癌症特异性融合的一小部分。来源 L1 和 HERV(而非 Alus)在融合形成后在癌症中显示出 DNA 甲基化降低。总体而言,癌症特异性 L1 融合富含肿瘤抑制基因,而 Alu 融合富含癌基因,包括预测患者生存的 EZH2 中反复出现的 Alu 融合。我们还证明转座子衍生肽触发 CD8 T 细胞激活的程度与 EBV 病毒相当。我们的研究结果揭示了不同家族的转座子融合背后不同的表观遗传和致瘤机制,并强调转座子作为新的治疗靶点和有效新抗原的来源。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Oct 18

GerryAShipman,Reinni...
Systematic perturbations of SETD2, NSD1, NSD2, NSD3 and ASH1L reveals their distinct contributions to H3K36 methylation.
Epigenetics & Chromatin
组蛋白 3 赖氨酸 36 (H3K36me) 的甲基化已成为基因表达忠实调控的重要表观遗传成分。尽管它在发育、疾病和癌症中很重要,但分子因子如何共同塑造 H3K36me 景观尚不清楚。我们使用小鼠间充质干细胞模型来扰乱 H3K36me 沉积机制并推断五个最重要参与者的活动:SETD2、 NSD1、NSD2、NSD3 和 ASH1L。我们发现 H3K36me2 是三种甲基化状态中最丰富的,并且主要由 NSD1 沉积在基因间区域,部分由 NSD2 沉积在基因间区域。相比之下,H3K36me1/3 在外显子内最为丰富,并且与基因表达呈正相关。我们证明,虽然 SETD2 沉积了大部分 H3K36me3,但它也在转录基因内沉积了 H3K36me2。此外,SETD2 的缺失会导致外显子 H3K36me1 的增加,这表明其他 H3K36 甲基转移酶 (K36MT) 的主要基因体在转录前具有较低的甲基化状态。通过还原方法,我们揭示了 NSD3 和 ASH1L 催化的 H3K36me2 的分布模式。 NSD1/2 建立了广泛的基因间 H3K36me2 结构域,而 NSD3 将 H3K36me2 峰沉积在活性启动子和增强子上。同时,ASH1L 的活性仅限于发育相关基因的调控元件,我们的分析表明 PBX2 是一种潜在的招募因子。在基因内,SETD2 沉积 H3K36me2/3,而其他 K36MT 能够独立沉积 H3K36me1/2 SETD2 活动。对于 H3K36me1/2 的沉积,我们发现了 K36MT 活性的层次结构,其中 NSD1>NSD2>NSD3>ASH1L。虽然 NSD1 和 NSD2 负责 H3K36me2 的大部分全基因组传播,但 NSD3 和 ASH1L 的活性仅限于主动调控元件。
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