研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Oct 30
MichaelPTobin,Charlo...
Differences in cell shape, motility, and growth reflect chromosomal number variations that can be visualized with live-cell ChReporters.
GENES & DEVELOPMENT
肿瘤和培养细胞中的染色体数量经常发生动态变化,这使治疗以及理解基因型-机械型关系变得复杂。在这里,我们使用活细胞“ChReporter”方法来识别具有单条染色体丢失的细胞,以更好地了解细胞形状、运动和生长的差异。我们关注标准肺癌细胞系,并首先显示保留 ChReporter 的克隆群体在细胞和核形态以及运动性方面表现出巨大差异。表型指标遵循简单的规则,包括随速度变化的迁移持久性,并且从药物反应、成像和单细胞 RNA 测序中可以明显看出细胞骨架的差异。然而,机械型-基因型关系被证明是复杂的,激发了对丢失或保留 5 号染色体 ChReporter 的克隆进行比较。当丢失时,无荧光细胞显示 5 号染色体基因的低表达,包括调节 MT 和增殖的关键肿瘤抑制因子 APC。集落紧凑,细胞核圆形,细胞增殖更多,药物结果暗示 APC,患者生存数据表明肺和其他肿瘤类型之间的关联。因此,使用 ChReporters 对基因型进行视觉识别可以帮助阐明机械类型和机械进化。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Oct 30
ZhishanChen,Weiqiang...
A large-scale microRNA transcriptome-wide association study identifies two susceptibility microRNAs, miR-1307-5p and miR-192-3p, for colorectal cancer risk.
Disease Models & Mechanisms
全转录组关联研究 (TWAS) 已经确定了许多结直肠癌 (CRC) 风险的假定易感基因。然而,易感性 miRNA(基因表达的关键失调因子)仍未得到探索。我们对 313 名 CRC 东亚患者的 DNA 样本进行了基因分型,并在远离肿瘤的正常结肠组织中进行了小 RNA 测序,以建立预测 miRNA 表达的遗传模型。我们应用这些模型和全基因组关联研究 (GWAS) 的数据(包括 23 942 例东亚血统病例和 217 267 例对照)来研究预测的 miRNA 表达与 CRC 风险的关联。分别通过促进和抑制 miRNA 表达进行扰动实验,并在 SW480 和 HCT116 细胞中进行进一步的体外测定。在 Bonferroni 校正阈值 P < 4.5 × 10-4 下,我们鉴定了两个假定的易感性 miRNA,miR-1307-5p 和 miR-192-3p,位于距 GWAS 识别的任何风险变异超过 500 kb 的区域。 CRC。我们观察到,miR-1307-5p 的高预测表达与 CRC 风险增加相关,而 miR-192-3p 的低预测表达与 CRC 风险增加相关。我们的实验结果进一步提供了强有力的证据,表明 miR-1307-5p 和 miR-192-3p 分别在促进和抑制 CRC 细胞增殖、迁移和侵袭方面发挥调节作用,这在SW480 和 HCT116 细胞。我们的研究为 CRC 发展的生物学机制提供了更多见解。© 作者 2023。由牛津大学出版社出版。版权所有。如需权限,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Oct 30
SamuelTSavitz,Sheale...
Evaluation of the Predictive Value of Routinely Collected Health-Related Social Needs Measures.
DIABETES & METABOLISM
目的是评估定期收集的患者报告的健康相关社会需求 (HRSN) 指标对于预测利用率和健康结果的价值。作者确定了梅奥诊所患有癌症、糖尿病或心力衰竭的患者。 HRSN 测量值作为 2019 年 6 月至 12 月患者报告筛查的一部分收集,并于 2020 年确定结果(住院、30 天再入院和死亡)。对于每种结果和疾病组合,使用 4 种模型:梯度增强机(GBM)、随机森林(RF)、广义线性模型(GLM)和弹性网络(EN)。其他预测因素包括临床因素、人口统计数据和基于地区的 HRSN 措施——地区剥夺指数 (ADI) 和农村地区。使用或不使用常规收集的 HRSN 测量值作为曲线下面积 (AUC) 的变化来评估模型的预测性能。还评估了变量的重要性。 AUC 的差异是混合的。 3 种癌症死亡模型(GBM:0.0421、RF:0.0496、EN:0.0428)、3 种住院模型(GBM:0.0372、RF:0.0640、EN:0.0441)和 1 种死亡模型(RF:0.0754)有显着改善)用于糖尿病,1 个再入院模型(GBM:0.1817),以及 3 个心力衰竭死亡模型(GBM:0.0333,RF:0.0519,GLM:0.0489)。年龄、ADI 和 Charlson 合并症指数在变量重要性方面排名前 3 位,并且始终比常规收集的 HRSN 指标更重要。添加常规收集的 HRSN 测量结果对模型的预测性能产生了不同程度的改善。这些发现表明,现有因素和 ADI 对于这些情况下的预测更为重要。需要做更多的工作来确定能够持续提高模型性能的预测变量。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Oct 30
AmberFGallanis,Laure...
Costs of Cancer Prevention: Physical and Psychosocial Sequelae of Risk-Reducing Total Gastrectomy.
DIABETES & METABOLISM
由于种系基因检测的可用性不断增加,实体瘤癌症预防的降低风险手术是一个紧迫的临床课题。我们研究了降低风险的全胃切除术 (RRTG) 的短期和长期结果,以及其对遗传性弥漫性胃癌综合征患者的健康相关生活质量 (QOL) 的鲜为人知的影响。接受 RRTG 作为一部分的个体对遗传性胃癌的单机构自然史研究进行了检查。评估了临床病理学细节、急性和慢性手术发病率以及健康相关的生活质量。使用经过验证的问卷来确定 QOL 评分和心理社会精神治疗指标。2017 年 10 月至 2021 年 12 月期间,有 126 名患者因致病性或可能致病性种系 CDH1 变异而接受了 RRTG。大多数患者(87.3%;110 /126) 患有 pT1aN0 胃癌,最终病理学具有印戒细胞特征。急性(<30 天)术后主要发病率较低(5.6%;7/126),并且几乎所有患者(98.4%)在全胃切除术后体重减轻。胃切除术后 2 年,94% (64/68) 的患者表现出至少一种慢性并发症(即胆汁反流、吞咽困难和微量营养素缺乏)。职业改变(23.5%)、离婚(3%)和酒精依赖(1.5%)是一些患者因全胃切除术而改变生活的后果。在中位随访时间为 24 个月的患者中,生活质量评分在胃切除术后 1 个月时下降,并在 6-12 个月时恢复到基线。RRTG 与改变生活的不良事件相关,在为 CDH1 变异患者提供咨询时应讨论这些不良事件。胃癌的预防。判断癌症预防手术的风险不仅应该根据如果不治疗则因疾病死亡的可能性来判断,还应该根据器官切除的实际后果来判断。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Oct 30
YaniZhou,DanLiu,Huir...
FGL1 Promotes Tumor Immune Escape in Stomach Adenocarcinoma via the Notch Signaling Pathway.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
免疫逃逸是胃腺癌(STAD)免疫治疗失败的主要原因。本研究试图揭示FGL1影响STAD的潜在机制。通过生物信息学分析FGL1的表达、FGL1影响的信号通路以及FGL1与免疫细胞浸润的关系。采用实时定量PCR(qRT-PCR)、细胞计数试剂盒8测定、集落形成测定、流式细胞术和Transwell测定分别分析FGL1表达、细胞活力、细胞增殖、细胞凋亡和细胞侵袭。采用酶联免疫吸附法、乳酸脱氢酶法、qRT-PCR 和 Western blot 分别揭示 STAD 细胞和 CD8 T 细胞共培养后促炎细胞因子的表达、细胞毒性以及 Notch 信号相关基因的 mRNA 和蛋白表达。细胞。进行裸鼠实验验证上述结果。 FGL1在STAD中高表达,可激活Notch信号通路,且与CD8 T细胞浸润呈负相关。细胞实验证实FGL1的高表达有利于STAD细胞的增殖并阻碍其凋亡。在 STAD 和 CD8 T 细胞共培养系统中,FGL1 的敲低可促进促炎因子的表达和 CD8 T 细胞的细胞毒性。敲低FGL1可以抑制Notch信号通路相关基因的表达,Notch抑制剂的添加证明FGL1通过Notch信号通路促进免疫逃逸。本研究探讨FGL1对STAD免疫逃逸的影响,证明FGL1通过激活Notch信号通路抑制CD8 T细胞活化,从而促进STAD肿瘤免疫逃逸,为STAD患者的免疫治疗提供新的潜在诊断标志物和治疗靶点.© 2023。作者获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 的一部分)的独家许可。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Oct 30
ZahraAzarifar,Razieh...
In vitro co-delivery of 5-fluorouracil and all-trans retinoic acid by PEGylated liposomes for colorectal cancer treatment.
Stem Cell Research & Therapy
由于耐药性的发展,单靶点抑制剂在癌症治疗中尚未取得成功。然而,能够同时抑制多个靶标的治疗剂在诱导癌细胞凋亡和克服癌细胞耐药性方面显示出令人鼓舞的结果。在这里,我们设计了一种复合脂质体纳米载体,共同负载 5-氟尿嘧啶 (5-FU) 和全反式视黄酸 (ATRA),以评估组合药物在结直肠癌 (CRC) 中的抗癌功效。通过薄膜水合技术合成了磷脂/胆固醇/DSPE-PEG (2000) 载体,用于 ATRA 和 5-FU 的共同递送。表征后,通过集落形成和 MTT 法研究了 5-FU 和 ATRA 共载脂质体纳米载体在增殖、上皮间质转化 (EMT)、凋亡和癌症干细胞 (CSC) 中的作用,RT- qPCR和Annexin V/PI试剂盒。脂质体(LPs)的平均粒径为 < 150 nm,粒径分布均匀。药物释放分析表明,ATRA 和 5-FU 可以同时从 LP 中以缓释方式释放。验证了LPs负载的ATRA和5-FU的协同抑制作用,组合指数为0.43。双药 LP 显示出最高的细胞毒性、增强的细胞增殖抑制、增加的凋亡潜力、减少的 CSC 以及减弱的 EMT 相关生物标志物。此外,双药 LP 比其他脂质体制剂更能降低 β-catenin 基因表达。这些研究结果表明,使用 LP 实现 ATRA 和 5-FU 的协同作用是提高 5-FU 对 CRC 细胞治疗效果的有效方法.© 2023。作者获得 Springer Nature B.V. 的独家许可。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Oct 30
SaidehHemati,Ashrafa...
Schizophyllan promotes osteogenic differentiation of human adipose tissue-derived mesenchymal stem cells in vitro.
Stem Cell Research & Therapy
生物活性多糖是高效预防骨病的一种有前景的方法。裂褶多糖(SPG)是一种从真菌中提取的多糖,具有抗癌、抗肿瘤和抗炎作用。在本研究中,首次通过体外测定评估了在 SPG 上生长的人脂肪组织源性间充质干细胞 (hADMSC) 的细胞增殖、成骨标志物、矿物质沉积和成骨基因表达。使用MTT测定和吖啶橙染色进行测量。使用碱性磷酸酶 (ALP) 活性测试、细胞钙含量测定和矿化基质染色来评估 hADMSC 的分化。为此,通过实时 RT-PCR 在两周内使用茜素红 S、von Kossa 染色以及骨特异性标记物(包括 ALP、Runx2 和骨连接蛋白)的表达。根据结果​​,确定10μg/ml浓度的SPG作为分化研究的最佳剂量。体外成骨分化试验结果表明,与体外对照组相比,SPG增强了分化hADMSCs在分化过程中的成骨标志物和矿化作用,并上调了骨特异性基因的表达。结果表明,SPG可以作为有效的应用未来成骨分化的因素。当前的研究提供了对基于 hADMSC 的治疗的见解,并为患有骨缺陷和损伤的个体引入了有前景的治疗材料。© 2023。作者获得 Springer Nature B.V. 的独家许可。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Oct 30
YangGong,BinKong,Wei...
USP38 regulates inflammatory cardiac remodeling after myocardial infarction.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
炎症反应和随后的心室重塑是心肌梗死(MI)后导致室性心律失常(VA)的关键因素。泛素特异性蛋白酶 38 (USP38) 是 USP 家族的一员,但 USP38 对 MI 后心律失常底物生成的影响仍不清楚。本研究旨在确定 USP38 在 MI 后 VA 中的作用及其潜在机制。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Oct
ZhaohuiLiu,RunhuaLin...
Early oesophageal carcinoma with a defect of the oesophageal muscularis propria: a rare case report.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
我们在此报告一例在内镜粘膜下剥离术中发现的早期食管癌合并食管固有肌层缺损的罕见病例。外科医生在内窥镜切除过程中没有损伤固有肌层;然而,我们观察到纵隔腔以及后来发生的皮下气肿。因此,该患者被认为患有固有肌层缺陷。迄今为止,该现象尚未见文献报道。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Oct 30
MohammedSFawzy,Abdel...
The relationship between DNA methyltransferase 3B (DNMT3B) and miR 124-3pa expressions in bladder cancer tissues.
Epigenetics & Chromatin
膀胱癌是影响泌尿道的最常见恶性肿瘤。遗传改变与膀胱癌的发展密切相关。 MicroRNA (miRNA) 是一种小型非编码单链 RNA 分子,与膀胱癌有关。 miR-124-3pa 在各种类型的人类恶性肿瘤中表现出表达改变。 DNA 甲基转移酶 3B (DNMT3B) 负责 DNA 从头甲基化,这是致癌作用中的基本表观遗传过程。本工作旨在研究膀胱癌组织中DNMT3B和miR 124-3pa的表达情况,探讨其在疾病诊断和预后中的意义。本病例对照研究纳入了106例原发性尿路上皮患者的组织样本。膀胱癌。将组织分成两部分。第一部分立即冷冻并保存在 - 80°C 下,用于提取总 RNA,随后检测 miR 124-3pa 和 DNMT3B 表达。另一部分保存在福尔马林溶液中进行组织病理学检查。癌组织和正常组织中miRNA-124-3pa和DNMT3B的表达量均具有高度统计学差异(P<0.001)。此外,miRNA-124-3pa 和 DNMT3B 表达之间存在高度统计学显着的强负相关(r=-0.750,P < 0.001)。 miR-124-3pa和DNMT3B的综合表现表明,≥3.3的截止点可以作为膀胱癌存在的预测因子,敏感性为98.1%,特异性为80%。miR-124-3pa和DNMT3B可以可用作膀胱癌存在的预测因子。© 2023。作者获得 Springer Nature B.V. 的独家许可。
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