Cortex Periplocae (CP) 的活性成分在许多癌症中发挥抗肿瘤特性。然而，人们对它们对神经胶质瘤的影响或相关的潜在机制知之甚少。该研究调查了CP治疗神经胶质瘤的潜在机制。用CP的乙醇提取物处理U251和TG905细胞。使用细胞计数试剂盒-8 (CCK-8) 和集落形成测定检测细胞增殖。应用流式细胞术分析来探索细胞周期停滞和细胞凋亡的诱导。 Western blot检测细胞周期和凋亡相关蛋白的表达水平。采用网络药理学方法预测 CP 活性成分对神经胶质瘤作用的潜在机制。然后，使用基于相对和绝对定量的同量异位标签（iTRAQ）的定量蛋白质组学分析来验证差异表达的蛋白质和通路，以揭示潜在的机制。此外，为了确定 iTRAQ 结果，使用平行反应监测 (PRM) 选择 6 种候选蛋白进行定量。CP 提取物抑制 U251 和 TG905 细胞的增殖并诱导细胞周期停滞和凋亡。 CP有16种活性化合物。 CP的抗肿瘤机制可能与细胞凋亡通路、p53信号通路、PI3K-AKT通路或癌症通路中的转录失调有关。六种蛋白（HSP90AB1、TOP2A、ATP1A1、TGFβ1、ATP1B1 和 TYMS）被确定为调节胶质瘤 CP 的关键因子。我们的研究利用集成网络药理学和基于 iTRAQ 的定量蛋白质组学揭示了 CP 治疗胶质瘤的潜在机制技术。

共济失调毛细血管扩张和 Rad3 相关蛋白 (ATR) 是 DNA 损伤反应的关键组成部分，也是癌症治疗的潜在靶点。评估了 ATR 抑制剂 BAY 1895344 在分化型甲状腺癌 (DTC) 治疗中的应用。 BAY 1895344 以剂量依赖性方式抑制四种 DTC 细胞系（TPC1、K1、FTC-133 和 FTC-238）的细胞活力。 BAY 1895344 处理将 DTC 细胞阻滞在 G2/M 期，增加 caspase-3 活性，并引起细胞凋亡。 BAY 1895344 与索拉非尼或乐伐替尼联合在四种 DTC 细胞系中主要显示出协同作用。 BAY 1895344 与达拉非尼加曲美替尼的组合在携带 BRAFV600E 的 K1 细胞中显示出协同作用。 BAY 1895344 单一疗法可延缓异种移植模型中 K1 和 FTC-133 肿瘤的生长。在 K1 异种移植模型中，BAY 1895344 加乐伐替尼和 BAY 1895344 与达拉非尼加曲美替尼的组合比任何单一疗法更有效。在接受单一疗法或联合疗法治疗的动物中没有出现明显的毒性。我们的研究结果为 BAY 1895344 治疗 DTC 的临床试验的开展提供了理论基础。

癌症治疗费用的上涨甚至对全民健康覆盖的地区构成了挑战。有必要评估癌症患者当前的医疗保健利用趋势，以指导公共卫生政策、资源分配和制定明智的医疗保健目标。我们分析了癌症患者在四个领域的医疗保健利用的最新趋势：药物、放射治疗（ RT）、手术和诊断程序 - 使用从 2014 年至 2019 年间韩国一家三级医院的电子病历中提取的临床数据库。计算复合调整增长率 (CAGR) 以捕获研究期间的年增长率。确定了 74,285 名癌症患者，其中分别有 40.3% (29,962)、14.2% (10,577)、31.1% (23,066) 和 92.6% (68,849) 的患者接受过至少一种抗癌药物、RT、手术和诊断程序，在此期间。我们观察到靶向免疫肿瘤药物的使用增加了 1.7 倍（从 6.8% 增加到 11.6%），调强放疗 (IMRT) 的使用增加了 21 倍（从 2014 年的 3.0% 增加到 65.7%）期间。相比之下，我们观察到接受手术治疗的患者比例持续下降，从2014年的12.2%下降到2019年的10.9%。这种下降在结肠癌（从28.5%下降到24.2%）和肝癌患者中尤其明显。从 4.1% 降至 2.9%）。从 2014 年到 2019 年，靶向免疫肿瘤药物和调强放射治疗 (IMRT) 的使用显着增加，但手术数量却有所下降。虽然有针对性的免疫肿瘤药物和 IMRT 可能会带来有希望的结果，但它们的财务影响和过度使用的可能性需要仔细监督和长期成本效益研究。© 2023 作者。约翰·威利出版的癌症医学

放射治疗（RT）因其无创性和广泛的适应性而在肿瘤治疗中发挥着重要作用。近年来，人们发现放射治疗可以诱导抗肿瘤免疫反应，引起了科学家和临床医生的广泛关注。在这篇综述中，我们重点介绍了纳米生物材料在放射治疗激活免疫治疗中应用的最新进展。我们首先讨论不同放射增敏纳米生物材料与免疫检查点抑制剂的组合，以增强肿瘤免疫反应并提高放疗疗效。随后，引入了各种纳米生物材料支持的肿瘤氧合策略，以缓解缺氧的肿瘤环境并放大免疫调节作用。在纳米疫苗和佐剂的帮助下，放射治疗可以刷新宿主的免疫系统。此外，电离辐射响应纳米生物材料可提高先天免疫介导的抗肿瘤免疫力。最后，我们总结了免疫调节纳米生物材料的快速发展，并讨论了肿瘤放射免疫治疗纳米生物材料发展的关键挑战。了解纳米生物材料辅助放射免疫治疗将最大限度地发挥临床放射治疗和免疫治疗的益处，并促进新的联合治疗方式的开发。© 2023。作者。

背景：口腔鳞状细胞癌（OSCC）是全世界最常见的癌症类型之一。尽管之前已经观察到 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 和 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 的整体丢失，但 OSCC 中 5mC 和 5hmC 的全基因组、单碱基分辨率和同步作图仍未实现。同样，5mC 和 5hmC 如何共同导致 OSCC 基因表达异常的机制在很大程度上尚未被探索。使用并行全基因组亚硫酸氢盐测序 (WGBS) 和全基因组氧化亚硫酸氢盐测序 (oxWGBS)，我们在配对的原代 OSCC 样本及其正常邻近组织 (NAT) 中以单核苷酸分辨率表征了 5mC 和 5hmC 谱。我们还使用多组学分析分析了 5mC 和 5hmC 修饰对 OSCC 差异基因表达的影响。结果：在 OSCC 样本中观察到各个基因组区域的 5mC 和 5hmC 总体降低。在 OSCC 启动子区域，共鉴定出 6,921 个差异甲基化区域和 1,024 个差异羟甲基化区域。有趣的是，与5mC和5hmC的双向修饰相比，启动子处5mC和5hmC的单向修饰与基因表达的更大变化相关。此外，启动子处带有 5mC 和 5hmC 单向修饰的基因富含信号通路，如细胞增殖、细胞分化和受体酪氨酸激酶通路，这些通路对于肿瘤发生至关重要。最后，带有 5mC 和 5hmC 启动子单向修饰的前 20 个基因的分组表达特征往往与头颈鳞状细胞癌某些亚型的临床结果相关。结论：使用平行 WGBS 和 oxWGBS 分析，我们观察到 OSCC 中各个基因组区域的 5mC 和 5hmC 修饰总体减少。启动子处 5mC 和 5hmC 的单向修饰与 OSCC 组织中基因表达的增强变化相关。此外，这种在启动子处带有 5mC 和 5hmC 单向修饰的差异表达基因可能与 OSCC 的结果具有临床相关性。版权所有 © 2023 赵、朱、龚、马、熊、苏、万和王。

目的：雌激素受体乳腺癌（BC）的特点是雌激素受体的表达。它是女性中最常见的癌症，全球发病率为 226 万例。本研究的目的是确定雌激素受体阳性和三阴性 BC 样本之间的差异表达基因和亚型转换。方法：从 ArrayExpress 收集数据，然后从 HISAT2 进行预处理和后续映射。通过StringTie进行Read定量，然后使用R包ballgown进行差异表达分析。使用Enrichr进行功能富集分析，然后根据ScType标记数据库筛选免疫基因。还使用 IsoformSwitchAnalyzeR 软件包进行异构体开关分析。结果：共鉴定出9,771个差异表达基因，其中上调表达基因86个，下调表达基因117个。六个基因被鉴定为主要与雌激素受体阳性 BC 相关，同时发现了一组新的十个基因，这些基因以前在雌激素受体阳性 BC 中未曾报道过。此外，还确定了免疫系统相关基因中的选择性剪接和随后的亚型使用。结论：本研究确定了癌细胞中免疫系统相关基因中亚型的差异使用，表明由于 CXCR 趋化因子受体结合、铁离子结合和细胞因子活性的失调而导致免疫抑制。版权所有 © 2023 Khan、Hanif、Alsakhen、Jabbar 、沙姆赫、阿尔萨伊阿里、阿尔迈马迪、阿尔加姆迪、沙库里、阿尔法拉吉、阿尔穆塔里、侯赛因·伊萨·穆罕默德、阿布齐德、雷赫曼和胡瓦梅尔。

单细胞测序 (SCS) 技术正在改变我们对细胞成分、功能和跨生物体相互作用的理解，因为它具有避免大量样本的基因型和表型异质性产生的噪音的固有优势。通过直接、单独测量数千至数百万个单细胞的多种分子特征，SCS 技术可以表征多种细胞类型，并揭示基因调控网络的机制、转录动态和蛋白质组分析的功能状态。在此背景下，我们对SCS技术进行了系统研究，包括scDNA、scRNA、scATAC、scCITE和scSNARE方法的基本概念、操作步骤和应用，重点关注SCS独特的临床优势，特别是在癌症治疗中。我们探索了具有挑战性但关键的领域，例如循环肿瘤细胞（CTC）、谱系追踪、肿瘤异质性、耐药性和肿瘤免疫治疗。尽管在管理和分析 SCS 产生的大量数据方面存在挑战，但这项技术有望揭示癌症研究的新视野。本综述旨在强调 SCS 在癌症研究中的关键作用，并促进单细胞技术在癌症治疗中的应用。版权所有 © 2023 Chen、Jiang、Du、Yang、Pan、Li 和 Cui。

简介：RNA序列分析可以有效地用于识别异常剪接，考虑到肿瘤抑制基因的功能丧失机制，它们是足够的靶标。桑格测序是RNA序列分析最简单的方法；然而，由于其对无义介导的 mRNA 衰减 (NMD) 的敏感性不足，建议使用具有 NMD 抑制作用的培养样本，这阻碍了其广泛采用。方法：回顾性分析未进行 NMD 抑制的外周血 RNA 的 Sanger 测序结果，对抑癌基因的潜在剪接变异进行检测。对于转录本中未发现变化的阴性病例，通过查阅最新文献来评估 NMD 引起假阴性的可能性。结果：回顾了各种肿瘤抑制基因的十一种潜在剪接变体。根据桑格 RNA 测序确定的无效效应，有 6 种变异被分类为致病性或可能致病性。由于确定了框内变化或两个等位基因的正常表达，四个变体仍然是意义不确定的变体。在回顾了最近的一项研究后，一个变体的结果被怀疑是由 NMD 引起的假阴性，该研究报告了相同的变体对受影响的转录本造成了无效作用。结论：虽然根据规范规则，大多数病例中发现的 RNA 变化预计会经历 NMD，但大多数病例 (10/11) 可以通过 Sanger RNA 测序进行解释，而无需 NMD 抑制，因为尽管 NMD 效率很高，但由于 NMD 效率不完全或等位基因特异性表达.版权所有 © 2023 Ha、Jang、Kim 和 Kim。

【摘要】：背景:子宫内膜异位症是一种常见的慢性妇科疾病,对女性健康造成显着的负面影响。 Wilms 肿瘤 1 相关蛋白 (WTAP) 是 N6-甲基腺苷修饰 RNA 甲基转移酶复合物的重要组成部分，在多种人类疾病中发挥着关键作用。然而，WTAP 基因的单核苷酸多态性 (SNP) 是否会导致子宫内膜异位症风险仍有待研究。方法：我们使用 Agena Bioscience MassArray iPLEX 平台对 473 名卵巢子宫内膜异位症患者和 459 名对照参与者的三种 WTAP 多态性进行了基因分型。利用逻辑回归模型评估 WTAP SNP 与卵巢子宫内膜异位症风险之间的关联。结果：在单基因座分析中，我们发现 rs1853259 G 变异基因型显着增加，而 rs7766006 T 变异基因型显着降低与卵巢子宫内膜异位症风险的关联。联合分析表明，具有两种不利基因型的个体比具有零风险基因型的个体表现出显着更高的卵巢子宫内膜异位症风险（调整后OR = 1.71 [1.23-2.37]，p = 0.001）。在分层分析中，rs1853259 AG/GG和rs7766006 GG基因型的风险效应在年龄≤30岁、妊娠≤1、产次≤1、rASRM I期的亚组中明显，而rs7766006 GG基因型与更差的风险相关（ rASRM II III IV 期患者的调整后 OR = 1.64 [1.08-2.48]，p = 0.021）。单倍型分析表明，具有GGG单倍型的个体比野生型AGG单倍型携带者患卵巢子宫内膜异位症的风险更高。此外，误报概率和贝叶斯错误发现概率分析验证了显着结果的可靠性。数量表达性状位点分析显示rs1853259和rs7766006与WTAP的表达水平相关。结论：我们的研究结果表明，WTAP 多态性与中国女性卵巢子宫内膜异位症的易感性相关。版权所有 © 2023 Wan、Ye、Chen、Xiong、OuYang、Wu、He、Duan、Jie、Zhang 和 Hua。

三阴性乳腺癌（TNBC）是临床上具有侵袭性的乳腺癌亚型。核心转录调节电路 (CRC) 由自动调节转录因子 (TF) 及其增强子组成，它们主导基因表达程序并控制细胞命运。然而，TNBC 对 CRC 的了解有限。在此，我们系统地表征了乳腺癌中激活的超级增强子 (SE) 并研究了 14 个 CRC。我们发现CRC可能广泛参与DNA构象变化、代谢过程和影响基因表达重编程的信号反应。此外，这些 CRC TF 能够与桥接增强子-启动子环的伙伴 TF 协调。值得注意的是，CRC TF 和伙伴对对乳腺癌分子亚型（尤其是 TNBC）表现出显着的特异性。 USF1、SOX4 和 MYBL2 被确定为 TNBC 特异性 CRC TF。我们进一步证明 USF1 是 TNBC 免疫表型相关的 TF。我们发现增强子驱动的 CRC 重新布线与癌症免疫和死亡率相关，这将有助于表观遗传抗癌治疗策略的发展。版权所有 © 2023 Shi、Zhong、Dong、Hu 和 Li。