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GENES & DEVELOPMENT
2024 Aug 21

JiwonKoh,JinyongKim,...
Harnessing Institutionally Developed Clinical Targeted Sequencing to Improve Patient Survival in Breast Cancer: A Seven-Year Experience.
GENES & DEVELOPMENT
考虑到亚洲乳腺癌(BC)患者的高疾病负担和独特特征,有必要全面了解该人群的遗传特征。通过韩国研究驱动医院项目开发了机构靶向测序平台,并将其纳入临床实践。本研究探讨了靶向下一代测序 (NGS) 的使用及其在现实世界中晚期/转移性 BC 患者中的结果。我们回顾了使用定制测序平台 - FiRST Cancer Panel 对 BC 患者进行 NGS 测试的结果。 FCP) - 七年多了。我们系统地描述了 FCP 在精确诊断、个性化治疗策略和阐明疾病发病机制方面的临床转化。对 522 名 BC 患者的 548 个样本进行了 NGS 测试。 97.6% 的测试样本至少含有一种致病性改变。常见的改变包括TP53(56.2%)、PIK3CA(31.2%)、GATA3(13.8%)、BRCA2(10.2%)突变,以及CCND1(10.8%)、FGF19(10.0%)和ERBB2(9.5%)扩增)。 ERBB2 扩增的 NGS 分析与 HER2 免疫组织化学和原位杂交密切相关。 RNA 组分析发现了潜在的可操作和预后融合基因。 FCP 有效筛选了潜在的种系致病/可能致病突变。 10.3% 的 BC 患者接受了 NGS 指导下的匹配治疗,带来了显着的总生存优势 (p=0.022),特别是对于转移性 BC。 临床NGS提供了多方面的好处,加深了我们对疾病的了解,提高了诊断精度,并为靶向治疗铺平了道路。 FCP 的具体优势凸显了多基因检测对 BC 的重要性,特别是对于转移性疾病。
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EMBO Molecular Medicine
2024 Aug 20

XinxingLi,TaoLiu,Ant...
Ultra-sensitive molecular residual disease detection through whole genome sequencing with single-read error correction.
EMBO Molecular Medicine
虽然游离 DNA (cfDNA) 的全基因组测序 (WGS) 对于分子残留疾病 (MRD) 的检测具有巨大前景,但其性能受到 WGS 错误率的限制。这里我们介绍AccuScan,一种高效的cfDNA WGS技术,可实现单读长级别的全基因组纠错,实现4.2×10-7的错误率,比以读长为中心的去噪低约两个数量级方法。 AccuScan 在 MRD 中的应用证明了分析灵敏度低至 10-6 循环变异等位基因频率,样本水平特异性为 99%。 AccuScan 在预测结直肠癌复发方面表现出 90% 的标志性敏感性(术后 6 周内)和 100% 的特异性。使用手术后一周内收集的样本,它还显示出对食道癌的 67% 敏感性和 100% 特异性。当 AccuScan 用于监测黑色素瘤患者的免疫治疗时,循环肿瘤 DNA (ctDNA) 水平和动态特征与临床结果一致。总体而言,AccuScan 为 MRD 检测提供了高度准确的 WGS 解决方案,支持百万分之一范围内的 ctDNA 检测,无需大量样本输入或个性化试剂。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 20

AttaponRattanasupar,...
Impact of pre-sarcopenia on outcomes of transarterial chemoembolization in unresectable hepatocellular carcinoma.
Disease Models & Mechanisms
肌少症对肝细胞癌 (HCC) 结局的影响已有充分记录,但肌少症前期的影响仍不清楚。本研究探讨了肌少症前期对接受经动脉化疗栓塞 (TACE) 的不可切除 HCC 患者的肿瘤反应和生存的影响。我们使用 SliceOmatic 软件回顾性评估了接受 TACE 治疗的不可切除 HCC 患者的肌肉体积。肌少症前期由日本肝病学会标准定义(男性:42 cm2/m2;女性:38 cm2/m2)。比较肌少症前期组和非肌少症前期组,并使用 Cox 比例风险模型来确定影响生存的变量。使用血清甲胎蛋白 (AFP) 水平(诊断截止值为 200 ng/mL)按肿瘤负荷分层进行亚组分析。在 100 名患者中,39 名患有肌少症前期。前肌少症的存在与肿瘤完全缓解的实现无关。肌少症前期组(18 个月)的中位总生存期 (OS) 显着低于非肌少症前期组(30 个月;对数秩 P = 0.039)。对 77 名 AFP< 200 ng/mL 的患者进行的亚组分析显示,肌少症前期组的 OS 特别差(16 个月与 34 个月;对数秩 P< 0.001)。多变量分析发现 AFP 增加(调整后的风险比 [HR] 每增加 10 个单位 1.142;P < 0.001),终末期肝病模型评分更高(调整后的 HR 每增加 1.176;P< 0.001),并且预-肌少症(调整后的 HR 2.965;P < 0.001)作为较短 OS 的预测因子。肌少症前期是接受 TACE 的不可切除 HCC 患者死亡率增加的重要预测因子,尤其是 AFP< 200 ng/mL 的患者,表明其作为早期干预目标的潜力。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 20

JingwenLuo,FeiMo,Zhe...
Engineered mitochondria exert potent antitumor immunity as a cancer vaccine platform.
Disease Models & Mechanisms
优选的抗原递送模式伴随着足够的佐剂有利于疫苗效率。线粒体具有原核特征,含有多种损伤相关分子模式(DAMP),很容易被吞噬细胞摄取,同时激活先天免疫。在当前的研究中,我们建立了一个线粒体工程平台,用于生成富含抗原的线粒体作为癌症疫苗。以卵清蛋白(OVA)和酪氨酸酶相关蛋白2(TRP2)为模型抗原,合成具有线粒体定位信号肽的融合蛋白。然后使用慢病毒感染系统生产含有 OVA 或 TRP2 的线粒体疫苗。提取含有 OVA 和 TRP2 的工程线粒体(OVA-MITO 和 TRP2-MITO)并作为潜在的癌症疫苗进行评估。令人印象深刻的是,工程线粒体疫苗在小鼠肿瘤模型中用作预防性和治疗性疫苗时表现出有效的抗肿瘤作用。从机制上讲,OVA-MITO 和 TRP2-MITO 有效招募并激活树突状细胞 (DC),并诱导肿瘤特异性细胞介导的免疫。此外,线粒体疫苗对DC的激活关键涉及TLR2途径及其脂质激动剂,即源自线粒体膜的心磷脂。结果表明,工程化线粒体本身就是精心编排的载体,充满了用于抗原递送的免疫刺激物,可以更好地靶向局部树突状细胞并发挥强大的适应性细胞免疫。这项概念验证研究建立了一个通用的疫苗构建平台,其中包含带有针对癌症和其他疾病的可变抗原的工程线粒体。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 20

YanjieKong,TianlongL...
BRD4-specific PROTAC inhibits basal-like breast cancer partially through downregulating KLF5 expression.
Disease Models & Mechanisms
近年来,人们对在癌症治疗中使用蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)的兴趣有所增加。靶向溴结构域和额外末端结构域 (BET) 蛋白,尤其是含溴结构域蛋白 4 (BRD4),已显示出对基底样乳腺癌 (BLBC) 的抑制作用。然而,BRD4 PROTAC 的生物利用度受到其非选择性生物降解性和低肿瘤靶向能力的限制。我们证明,6b (BRD4 PROTAC) 通过靶向 BRD4(而非 BRD2 和 BRD3)来抑制 BLBC 细胞生长,从而实现 cereblon (CRBN) 介导的泛素化和蛋白酶体降解。化合物 6b 还抑制 Krüppel 样因子 5 (KLF5) 转录因子的表达,Krüppel 样因子 5 (KLF5) 是 BLBC 中的一种关键癌蛋白,由 BRD4 介导的超级增强子控制。此外,6b 在异种移植小鼠模型中抑制 HCC1806 肿瘤生长。 6b 和 KLF5 抑制剂的组合对 BLBC 显示出相加效应。这些结果表明,BRD4 特异性 PROTAC 可以通过下调 KLF5 有效抑制 BLBC,并且 6b 有潜力作为 BLBC 的新型治疗药物。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 20

MaliheRam,MohammadRe...
Application of artificial intelligence in chronic myeloid leukemia (CML) disease prediction and management: a scoping review.
Disease Models & Mechanisms
应对慢性粒细胞白血病 (CML) 诊断和管理的复杂性提出了重大挑战,包括需要准确预测疾病进展和治疗反应。人工智能 (AI) 提供了一种变革性方法,可以开发复杂的预测模型和个性化治疗策略,从而增强早期检测并改善治疗干预,从而获得更好的患者结果。我们进行了广泛的搜索,从 PubMed、Scopus 和 Web 中检索相关文章截至 2023 年 4 月 24 日的科学数据库。使用标准化提取表格收集数据,结果以表格和图表形式呈现,显示频率和百分比。作者遵守 PRISMA-ScR 检查表,以确保研究报告透明。在最初确定的 176 篇文章中,在删除重复项并应用纳入和排除标准后,选择了 12 篇进行我们的研究。 AI在管理CML方面的主要应用包括肿瘤诊断/分类(n = 9,75%)、预测/预后(n = 2,17%)和治疗(n = 1,8%)。对于肿瘤诊断,人工智能分为基于血涂片图像的方法(n = 5)、基于临床参数的方法(n = 2)和基于基因分析的方法(n = 2)。最常用的人工智能模型包括支持向量机(SVM)(n = 5)、极限梯度提升(XGBoost)(n = 4)以及各种神经网络方法,例如人工神经网络(ANN)(n = 3) 。此外,具有交互式自学学校的混合卷积神经网络 (HCNN-IAS) 在组织白血病数据类型方面实现了 100% 的准确度和灵敏度,而 MayGAN 在从血涂片图像诊断 CML 方面实现了 99.8% 的准确度和高性能。人工智能提供了突破性的见解和工具用于增强慢性粒细胞白血病的预测、预后和个性化治疗。集成的人工智能系统使医疗保健从业者能够进行高级分析,优化患者护理并改善 CML 管理的临床结果。© 2024。作者。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Aug 20

WaichiYamamoto,Taisu...
Suppressive effect of the anesthetic propofol on the T cell function and T cell-dependent immune responses.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
全身麻醉被认为会抑制免疫系统,并对术后感染和癌症的长期预后产生负面影响。然而,全身麻醉药引起免疫抑制的机制仍不清楚。在这项研究中,我们重点关注广泛用于全身麻醉和重症监护下镇静的异丙酚,并检查了其对 T 细胞功能和 T 细胞依赖性免疫反应的影响。我们发现异丙酚抑制 T 细胞糖酵解代谢、分化为效应 T 细胞以及效应 T 细胞产生细胞因子。在体外异丙酚存在下,CD8 T 细胞被激活并分化为效应细胞,显示出抗肿瘤活性降低。此外,丙泊酚治疗抑制了李斯特菌感染期间抗原特异性 CD8 T 细胞数量的增加。相比之下,给予丙泊酚改善了炎症性疾病小鼠模型的炎症状况,例如OVA诱导的过敏性气道炎症、半抗原诱导的接触性皮炎和实验性过敏性脑脊髓炎。这些结果表明,异丙酚可能通过抑制 T 细胞功能和 T 细胞依赖性免疫反应来降低肿瘤和感染免疫,同时通过抑制炎症改善慢性炎症性疾病的发病机制和预后。© 2024。作者。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Aug 21

DonaldDetchou,UmaruB...
Interleukin 4 and cancer resistance in glioblastoma multiforme.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
在这篇综述中,作者强调了 IL4 在减轻癌症生长的所有“标志”和对当前免疫疗法的耐药性方面的作用,为其在 GBM 中的作用提供了框架,并为未来的治疗方案提供了指导。本综述围绕 IL4 促进 GBM 中免疫抵抗的六种策略进行组织:(i) 细胞凋亡逃避,(ii) 生长信号的自给自足,(iii) 对抗生长信号不敏感,(iv) 侵袭和转移,(v) 无限的复制潜力,(vi) 持续的血管生成。© 2024。作者获得 Springer-Verlag GmbH 德国(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Aug 20

XianzheYu,YinZhang,F...
The role of microRNAs in the gastric cancer tumor microenvironment.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
胃癌(GC)是最致命的恶性肿瘤之一,其发病机制尚不清楚。由于其治疗耐药、复发率高以及缺乏可靠的早期检测技术,大多数患者预后不良。因此,识别新的肿瘤生物标志物和治疗靶点至关重要。本综述旨在通过总结 microRNA (miRNA) 调节肿瘤微环境 (TME) 的过程并强调其在 TME 中的关键作用,为提高 GC 患者的预后提供新的见解。 GC TME 内肿瘤细胞、细胞外基质、血管、癌症相关成纤维细胞和免疫细胞之间的相互作用。特别研究了非编码 RNA(称为 miRNA)在通过各种信号通路、细胞因子、生长因子和外泌体调节 TME 中的作用。 GC 中的肿瘤形成、转移和治疗受到 TME 内相互作用的显着影响。 miRNA 通过多种信号通路、细胞因子、生长因子和外泌体调节这些相互作用来调节肿瘤进展。 miRNA 的失调会影响细胞增殖、分化、血管生成、转移和治疗抵抗等关键细胞过程,从而导致 GC 的发病机制。miRNA 在 GC TME 的调节中发挥着至关重要的作用,影响肿瘤进展和患者预后。通过了解 miRNA 控制 TME 的机制,可以确定潜在的生物标志物和治疗靶点,以改善 GC 患者的预后。© 2024。作者。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Aug 19

DejunKong,ZhengluWan...
Capecitabine mitigates cardiac allograft rejection via inhibition of TYMS-Mediated Th1 differentiation in mice.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
先前的研究阐明卡培他滨 (CAP) 作为一种抗肿瘤药物,具有假定的免疫抑制作用。然而,支撑这些效应的复杂机制仍有待阐明。在本研究中,我们旨在揭示 CAP 发挥免疫抑制作用以减少同种异体移植排斥的分子途径。将男性 BALB/c 供体的心脏移植到男性 C57BL/6 受体,并用 CAP 治疗 7 天。使用一系列技术评估这些心脏移植的排斥反应,包括 H
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