阴茎鳞状细胞癌（PSCC）是一种罕见疾病，在巴西等发展中国家更为普遍，与生殖器卫生状况不佳有关，从而促进微生物的增殖。生态失调会影响局部免疫反应，增加病毒感染的风险，并可能产生炎症过程。目前对阴茎组织中微生物群的了解有限，PSCC 的细菌多样性仍然未知。在这项研究中，鉴定了与阴茎癌相关的微生物群及其在肿瘤发生和进展中的潜在作用。通过二代测序分析了19个肿瘤及其各自的非肿瘤邻近组织中的16S rRNA基因，以进行分类学分类、分析核心微生物组、扩增子序列变体 (ASV) 的丰度和多样性 (QIIME2 v.2020.2)，以及计算机功能预测 (PICRUST2，p < 0.05)。在这两种组织中，变形菌门和厚壁菌门，以及产碱菌属和梭杆菌属，最为普遍。肿瘤中梭杆菌门、弯曲杆菌门和梭杆菌门的相对丰度较高（分别为 p = 0.04、p = 0.04 和 p = 0.039）。此外，β多样性分析揭示了当仅考虑晚期肿瘤（pT2和pT3）时形成两个不同组的趋势。此外，功能分析确定了前 35 条途径，79.5% 的 PSCC 样本含有促炎微生物。我们描述了阴茎癌的第一个微生物组，揭示了丰富多样的微生物群以及与炎症相关的分类单元（变形菌门）厚壁菌门、梭杆菌属和普氏菌属，以及 Finegoldia magma 和 Pseudomonas geniculata 种）和分子途径（几丁质衍生物降解、原儿茶酸途径、肌醇代谢和蔗糖途径），这些途径也与炎症和癌变有关。此外，我们在肿瘤和非肿瘤组织中发现了特异性且丰富的 ASV。我们的数据鼓励进一步研究，以更好地了解这些微生物在阴茎癌发生中的作用，为诊断、预后和早期治疗的进展提供机会。© 2023 美国男科学会和欧洲男科学会。

非编码RNA（ncRNA）因其在肿瘤发生和进展中的重要作用而受到广泛关注，特别是在免疫治疗耐药中。肿瘤免疫治疗耐药是阻碍肿瘤治疗效果的关键因素，这在很大程度上归因于肿瘤微环境的免疫抑制特性。目前的研究表明，癌症来源的ncRNA通过多种方式参与肿瘤免疫抑制微环境（TIME）的形成。它们不仅促进癌细胞表面免疫检查点配体（例如 PD-L1、CD47、Gal-9 和 CD276）的表达，而且还增强免疫抑制细胞因子（例如 TGF-β、IL-6、 IL-10、VEGF 和趋化因子）。癌症来源的ncRNA还可以通过细胞外囊泡转移到周围的免疫相关细胞中，从而抑制CD8 T细胞和NK细胞的细胞毒性，抑制DC介导的抗原呈递，诱导TAM和CAF的免疫抑制表型转化，增强免疫抑制能力。 Tregs 和 MDSC 的免疫抑制功能。在此，我们总结了癌症来源的 ncRNA 在调节 TIME 形成中的作用，并进一步探索它们作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜在应用，这将有助于我们在未来解决 TIME 介导的免疫治疗耐药性。本文分类如下：疾病和发育中的 RNA > 疾病调节 RNA/RNAi/核糖开关中的 RNA > 调节 RNA。© 2023 Wiley periodicals LLC。

许多晚期人类癌症都存在瘤内缺氧区域，O2 梯度延伸至缺氧。缺氧诱导因子 (HIF) 在缺氧癌细胞中被激活，并驱动代谢重编程、血管化、侵袭和转移。缺氧通过诱导多能性因子 KLF4、NANOG、OCT4 和 SOX2 的表达和/或活性来诱导乳腺癌干细胞 (BCSC) 规范。最近的研究发现缺氧乳腺癌细胞中 PLXNB3、NARF 和 TERT 的 HIF-1 依赖性表达。 PLXNB3 结合并激活 MET 受体酪氨酸激酶，导致 SRC 非受体酪氨酸激酶激活，随后激活粘着斑激酶，从而促进癌细胞迁移和侵袭。 PLXNB3-MET-SRC 信号传导还会激活 STAT3，这是一种介导 NANOG 基因表达增加的转录因子。缺氧诱导的 NARF 与 OCT4 结合，并通过稳定 OCT4 与 KLF4、NANOG 和 SOX2 基因的结合以及稳定 OCT4 与 KDM6A 的相互作用来充当共激活剂，KDM6A 是一种组蛋白去甲基化酶，可消除组蛋白 H3 在赖氨酸 27 处的抑制性三甲基化，从而增加 KLF4、NANOG 和 SOX2 基因表达。除了通过这些机制增加多能因子表达外，HIF-1 还直接激活编码端粒酶的 TERT 基因的表达，端粒酶是维持端粒所需的酶，而端粒是 BCSC 无限自我更新所必需的。 HIF-1 与 TERT 基因结合并募集 NANOG，NANOG 通过促进随后募集 USP9X（一种抑制 HIF-1α 降解的去泛素酶）和 p300（一种介导 H3K27 乙酰化的组蛋白乙酰转移酶，这是转录激活。© 作者 2023。由牛津大学出版社出版。

大脑类器官（CO）源自人类在体外诱导的多能干细胞，模仿人类胎儿大脑的特征。 CO的发展很大程度上依赖于“自组织”机制，其中分化为皮质细胞的细胞自主组织成大脑皮质样组织。然而，对其形态（包括尺寸和厚度）的外在操纵仍然具有挑战性。在这项研究中，我们发现硅酸盐微纤维支架可以支持皮质神经元层的形成，并在70天内成功生成了比传统CO厚9倍的皮质神经元层。硅酸盐微纤维层中的这些皮质神经元以类似胎儿大脑的层状图案分化。虽然这些细胞特征（例如皮质神经元和神经干/祖细胞）与传统 CO 的细胞特征相似，但皮质神经元层在片状结构中大大增厚。此外，支架中的皮质神经元表现出自发的电活动。我们得出的结论是，硅酸盐微纤维支架支持 CO 皮质神经元层的形成，而不干扰自组织驱动的皮质生成。对 CO 皮质神经元层形成的外在操纵可能有助于研究人类大脑皮层的发育机制或发病机制，特别是对于再生疗法和生物工程的发展。© 作者 2023。出版者牛津大学出版社。

免疫逃避诱导多能干细胞（iPSC）衍生的肾脏类器官，被称为“隐形”类器官，有望用于临床移植。为了解决免疫排斥问题，我们研究了移植前对肾脏类器官进行基因改造的 I 类人类白细胞抗原 (HLA) 的影响。通过使用 CRISPR-Cas9，我们成功敲除 β-2-微球蛋白 (B2M)，从而产生缺乏 HLA I 类表面表达的 iPSC。在体外，B2M 敲除可保护源自这些 iPSC 的肾脏类器官免受 T 细胞排斥。为了评估体内保护作用，将未修饰的（对照）和 B2M-/- 肾类器官移植到移植了人外周血单核细胞 (PBMC) 的人源化小鼠中。证实人类 PBMC 成功植入，4 周后，我们观察到对照和 B2M-/- 类器官之间 CD4 和 CD8 T 细胞的浸润率、增殖或细胞毒性没有明显差异。两组类器官均表现出组织完整性受损，表现为肾小管炎和肾小管完整性丧失。值得注意的是，虽然 B2M-/- 类器官未能在其细胞表面表达 HLA I 类，但在对照和移植到含有人 PBMC 的小鼠体内的 B2M-/- 类器官中，预先存在 HLA II 类表达。 HLA II 类表达不仅限于抗原呈递细胞，在肾类器官的上皮细胞中也很明显，这对其移植带来了额外的免疫挑战。因此，我们得出结论，仅 B2M 敲除不足以保护 iPSC 衍生的肾类器官免受 T 细胞介导的免疫排斥。此外，我们的研究结果表明，调节 HLA II 类信号传导对于预防移植后的排斥反应是必要的。© 作者 2023。由牛津大学出版社出版。

探讨沉默蛋白磷酸酶2cm（Pp2cm）基因对金黄色葡萄球菌（S. aureus）感染巨噬细胞炎症因子表达的影响及其机制。敲低Pp2cm对炎症因子、增殖、凋亡及Toll的影响在 RAW 264.7 细胞（一种用腺病毒 (Ad) 转染的鼠巨噬细胞系）中分析了样受体 (TLR) 信号传导。将细胞分为四组，包括Ad-Ctrl组、Ad-Pp2cm组、Ad-Ctrl金黄色葡萄球菌组和Ad-Pp2cm金黄色葡萄球菌组。通过单独引入对照腺病毒(Ad-Ctrl)或靶向Pp2cm基因的腺病毒(Ad-Pp2cm)来实现细胞转染，并且通过施加或不施加金黄色葡萄球菌来诱导炎症或不存在炎症。肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、白细胞介素-1β（IL-1β）、TLR2、TLR4、Toll样受体衔接蛋白（Tirap）和骨髓分化因子88（Myd88）的表达通过real-时间荧光定量聚合酶链反应（RT-qPCR）。通过蛋白质印迹法测定PP2Cm蛋白表达。采用细胞计数试剂盒8（CCK-8）法检测细胞增殖情况，流式细胞仪检测细胞凋亡情况。与Ad-Ctrl组相比，Ad-Pp2cm组Pp2cm基因和PP2Cm蛋白表达下调，差异有统计学意义（P<0.05）。与Ad-Ctrl金黄色葡萄球菌组相比，Ad-Pp2cm金黄色葡萄球菌组巨噬细胞TNF-α和IL-1β基因水平显着升高（P<0.01）。此外，与Ad-Ctrl组相比，Ad-Pp2cm组巨噬细胞中TLR2、TLR4、Tirap和Myd88基因表达水平升高，差异有统计学意义（P<0.05）。 Ad-Ctrl组和Ad-Pp2cm组细胞凋亡和增殖差异无统计学意义。沉默Pp2cm基因促进巨噬细胞对金黄色葡萄球菌感染的炎症反应。此外，TLR通路在巨噬细胞炎症激活中发挥着重要作用。版权所有©四川大学学报（医学版）编委会。

YKL-40，也称为几丁质酶-3-like-1 (CHI3L1)，是一种人软骨糖蛋白-39，其 N 末端由酪氨酸 (Y)、赖氨酸 (K) 和亮氨酸 (L) 组成，因此名称YKL-40。本研究探讨YKL-40是否能够促进Ⅱ型肺泡上皮细胞炎症因子的表达。将A549细胞与白介素（IL）-1β（20 ng/mL）、IL-6（20 ng/mL）一起体外培养。 /mL)、肿瘤坏死因子-α (TNF-α) (20 ng/mL) 和干扰素-γ (IFN-γ) (20 ng/mL)。通过RT-qPCR测定YKL-40转录的表达。将 A549 细胞与 5、10 和 20 ng/mL 的 IL-1β 一起培养，并通过 Western blot 测定 YKL-40 蛋白的表达。将重组 YKL-40 蛋白分别以 0、100、500 和 1 000 ng/mL 培养 A549 细胞，并通过 RT-qPCR 检测 IL-6 和 IL-8 的表达水平。设计三对靶向YKL-40的小干扰RNA（si-YKL-40-1/2/3）和阴性对照（NC），分别转染A549细胞，测定YKL-40的表达量通过 RT-qPCR 和蛋白质印迹。筛选出si-YKL-40-3用于后续实验。在A549细胞中，转染si-YKL-40-3和si-NC，然后加入IL-1β(20ng/mL)进行培养。 RT-qPCR法测定YKL-40、IL-6、IL-8的表达量，QAH-INF-1试剂盒测定上清液中多种因子的表达量。RT-qPCR结果显示IL-1β与对照组相比，IL-6、TNF-α、IFN-γ不能上调 YKL-40 蛋白转录水平，差异有统计学意义（ P<0.01）。蛋白质转录水平。 Western blot结果显示，IL-1β（20 ng/mL）能够显着促进YKL-40的表达，且与对照组相比，不同浓度IL-1β处理组的差异均具有统计学意义。 （P<0.01）。在 A549 细胞中添加人重组 YKL-40 蛋白后，结果显示，炎症因子 IL-6、IL-8 的表达量显着升高，与对照组相比，差异有统计学意义（ P<0.05）。 si-YKL-40-3 转染降低 YKL-40 表达后，IL-6（ P<0.05）、IL-8（ P<0.05）等炎症因子表达较对照组降低。 YKL-40可促进Ⅱ型肺泡上皮细胞模型A549细胞系IL-6、IL-8等急性炎症因子的表达和分泌，从而加重炎症反应。靶向抑制YKL-40表达可有效抑制炎症反应。四川大学学报（医学版）编委会版权所有©。

探讨生命不同阶段体重指数（BMI）和成年期体重增加与肥胖相关乳腺癌风险生物标志物的关系，为制定乳腺癌防治政策提​​供依据。一项横断面研究是根据中国西南地区女性社区乳腺癌筛查的随访队列设计的。使用顺序抽样，从队列中招募符合条件的参与者作为研究对象。收集有关基本危险因素的信息，并测量身高、体重和血浆生物标志物水平。应用多元线性回归模型分析成年早期BMI（定义为参与者20岁时的BMI）、成年BMI（定义为入组时测量的BMI）和成年体重增加与生物标志物的关联。对数转换后将生物标志物的浓度纳入模型中。 442名参与者的平均年龄为49（45, 54）岁，成年早期和成年期的平均BMI分别为21.47（19.56, 23.11）和24.10（22.59） ，25.97）kg/m 2 ，成年期平均体重增加为6.60（2.00，11.00）kg。成年期BMI与脂联素水平呈负相关（β=-0.026，95% CI：-0.045--0.008，P=0.006），与C反应蛋白水平呈正相关（β=0.095，95% CI：0.054-0.137） ，P<0.001）和瘦素受体水平（β=0.090，95% CI：0.063-0.117，P<0.001）。未发现成年期 BMI 与抵抗素水平之间或成年期 BMI 与胰岛素样生长因子结合蛋白 3 水平之间存在关联。研究发现，成年早期的 BMI 仅与胰岛素样生长因子结合蛋白 3 水平呈负相关（β=-0.039，95% CI：-0.068--0.010，P=0.009）。对 20 岁后成年体重增加的进一步分析显示，成年期平均年体重增加与脂联素水平呈负相关，与其他 4 种生物标志物呈正相关。此外，与体重保持稳定的女性相比，成年期体重增加超过5.00 kg的女性脂联素水平显着降低（β=-0.185，95% CI：-0.320--0.049，P=0.008），而他们的胰岛素样生长因子结合蛋白-3（β=0.389，95% CI：0.183-0.594，P<0.001）和瘦素受体（β=0.245，95% CI：0.048-0.442，P=0.015）水平为成年期体重增加与肥胖相关乳腺癌风险生物标志物的变化密切相关。女性在整个成年期应保持稳定的体重，体重增加最好不超过5.00公斤。版权所有©《四川大学学报（医学版）》编辑部。

狂犬病是由狂犬病病毒（RABV）引起的一种可预防的人畜共患疾病，死亡率很高。信使RNA（mRNA）疫苗为疫苗开发和大流行防范开辟了新途径，具有强大的可扩展性，可能克服唯一获得许可的狂犬病灭活疫苗浪费时间和成本的缺点。在这里，我们设计了一种表达 RABV G 蛋白并用脂质纳米颗粒 (LNP) 和不同的核酸免疫刺激剂 (CPG 1018、CPG 2395 和 Poly I:C) 封装的 RABV mRNA 疫苗，然后评估其在小鼠中的免疫原性和保护能力。虽然用 LNP 和 CPG 1018 封装的 RABV mRNA 可以诱导更有效的体液反应，具有最高和持久的 RABV-G 特异性 IgG 滴度和病毒中和滴度，但也诱导更强的 RABV G 特异性细胞介导的免疫 (CMI) 反应，包括最高的根据小鼠流式细胞术测定，产生干扰素 γ (IFN-γ) 和肿瘤坏死因子 α (TNFα) 的 CD4 /CD8 T 细胞的比例。此外，在暴露前和暴露后攻击试验中，LNP CPG 1018 封装的 RABV G mRNA 可诱导 100% 针对 25 LD50 的 RABV 感染，通过 qRT-PCR 检测到病毒基因组减少，病毒复制抑制效果最高。这些结果表明，用 LNP 免疫刺激核酸 CPG 1018 封装的 RABV G mRNA 显示出作为安全且经济的狂犬病候选疫苗的前景。版权所有 © 2023 作者。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。

原发性肝癌具有显着的肿瘤内遗传异质性（IGH），它推动了癌症的进化并阻碍了有效的癌症治疗。 CRISPR/Cas9 诱导的小鼠肝癌模型可用于阐明 IGH 是如何形成的。然而，由于除了靶向突变之外，CRISPR/Cas9还可以在细胞中诱导染色体碎裂和染色体外DNA，我们想知道这种效应是否有助于CRISPR/Cas9诱导的小鼠肝癌中IGH的发展。基于CRISPR/Cas9的靶向体细胞多重-诱变用于靶向 34 个肿瘤抑制基因 (TSG)，以诱导小鼠原发性肝肿瘤。分析并比较单细胞克隆及其亚克隆之间、细胞增殖的不同时间点之间以及亲本克隆与小鼠皮下同种异体移植物衍生的单细胞克隆之间的肿瘤细胞靶位点突变。基因组不稳定性和染色体外环状 DNA (eccDNA) 的产生被探索为这些肝肿瘤细胞中靶位点突变振荡的潜在机制。在 30-60 天内有效诱导小鼠本土肝肿瘤后，对 CRISPR/Cas9- 的分析诱导的肿瘤和源自肿瘤结节的单细胞克隆揭示了靶位点的多重和异质突变。许多靶位点在单细胞克隆中经常表现出两种以上类型的等位基因变异，且频率不同，表明这些靶位点的拷贝数增加。在单细胞克隆及其亚克隆之间的某些靶位点，靶向 TSG 突变的类型和频率持续发生变化。在没有持续 CRISPR/Cas9 基因组编辑的情况下，即使是细胞培养物和小鼠皮下移植物中亚克隆的增殖也改变了靶向 TSG 突变的类型和频率，这表明在这些肝脏肿瘤中 IGH 的发展存在初级染色体之外的新来源。肿瘤细胞的核型分析揭示了这些细胞中的基因组不稳定性，表现为高水平的微核和染色体畸变，包括染色体片段和染色体断裂。测序分析进一步证明了这些肿瘤细胞中含有靶向 TSG 突变的 eccDNA 的生成。携带 TSG 突变的小 eccDNA 可能作为支持多重 CRISPR/Cas9 诱导的小鼠肝癌肿瘤内异质性和肿瘤进化的重要来源。© 2023。 BioMed Central有限公司，施普林格自然的一部分。