肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

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HongWang,RongXie,Fum...

Structural and biochemical insights into the interaction mechanism underlying HORMAD1 and its partner proteins.

哺乳动物 HORMA 结构域蛋白 1 (HORMAD1) 调节许多癌症中的 DNA 错配修复和同源重组 (HR) 修复。在这里，我们发现人类 HORMAD1 的结构采用自闭合构象，并显示出分子内 HORMA 结构域闭合基序相互作用模式。结构和生化数据表明，HORMAD2 和 MCM9 的肽基序与 HORMAD1 的相互作用模式与 HORMAD1 自身的闭合基序高度相似。来自 HORMAD1 不同结合伴侣的肽基序共享保守的 Ser-Glu-Pro 序列。此外，结构比较揭示了含有 HORMA 的蛋白质之间 HORMA 肽基序相互作用模式的多样性。最后，基于细胞的检测表明，这种 HORMA 闭合基序相互作用模式有助于 DNA 错配修复，并且是 HORMAD1 依赖性 HR 修复所必需的。总之，我们的结果为含 HORMA 结构域的蛋白质家族的共同主题和功能可塑性提供了结构和生化见解，并揭示了 HORMAD1 的通用调节机制。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd。保留所有权利。

STATISTICAL METHODS IN MEDICAL RESEARCH

Fatima-ZahraJaouimaa...

Penalized variable selection in multi-parameter regression survival modeling.

STATISTICAL METHODS IN MEDICAL RESEARCH

标准生存模型（例如比例风险模型）包含与风险规模相对应的单个回归组件。相反，我们考虑所谓的“多参数回归”方法，其中协变量同时通过多个分布参数（例如尺度和形状参数）进入模型。这种方法之前已被证明可以以相对较低的模型复杂性实现灵活性。然而，除了逐步类型选择方法之外，变量选择方法在多参数回归生存建模设置中还不够发达。因此，我们提出使用以下惩罚的惩罚多参数回归估计程序：最小绝对收缩和选择算子、平滑剪切绝对偏差以及自适应最小绝对收缩和选择算子。我们使用广泛的模拟研究和对肺癌观察研究数据的应用来比较这些程序；威布尔多参数回归模型自始至终用作运行示例。

STATISTICAL METHODS IN MEDICAL RESEARCH

RahulGhosal,MarcosMa...

Functional proportional hazards mixture cure model with applications in cancer mortality in NHANES and post ICU recovery.

STATISTICAL METHODS IN MEDICAL RESEARCH

我们开发了一个函数比例风险混合治愈模型，其中在基线处测量了标量和函数协变量。混合治愈模型可用于研究具有特定感兴趣事件的治愈分数的人群，并扩展到功能数据。我们采用期望最大化算法并开发了一种基于半参数惩罚样条的方法来估计发生率和延迟部分的动态函数系数。所提出的方法计算效率高，同时通过粗糙度惩罚将平滑度纳入估计的函数系数中。仿真研究表明该方法在准确估计模型参数和基线生存函数方面具有令人满意的性能。最后，该模型的临床潜力在两个真实数据示例中得到证明，这些示例将丰富的高维生物医学信号作为在基线测量的功能协变量，并构成在当代医疗情况下应用治愈生存模型的新领域。我们特别分析了 (i) 2003-2006 年国家健康和营养检查调查中的每分钟体力活动数据，以研究基线体力活动的昼夜模式与 2019 年所有癌症死亡率之间的关联，同时调整其他生物因素因素； (ii) 重症监护病房收集的疾病严重程度的日常功能测量对重症监护病房后康复和死亡事件的影响。我们的研究结果为日常身体活动模式与癌症死亡率之间的关联提供了新的流行病学见解。 R 中提供了软件实现和所提出的估计方法的说明。

STATISTICS IN MEDICINE

WendaZhang,ZichenMa,...

Genome-wide search algorithms for identifying dynamic gene co-expression via Bayesian variable selection.

STATISTICS IN MEDICINE

高通量技术产生的大量基因表达数据为系统地研究基因间相互作用提供了令人兴奋的机会。生物系统中基因与基因的相互作用受到严格调控，并且通常是高度动态的。这种相互作用可以在各种内部细胞信号或外部刺激下灵活变化。先前的研究已经开发出统计方法来检查基因-基因相互作用的这些动态变化。然而，由于典型的基因组数据集中需要考虑大量可能的基因组合，因此密集计算是探索基因间相互作用的常见挑战。另一方面，通常只有一小部分基因组合表现出动态共表达变化。为了解决这个问题，我们提出了基于尖峰和平板先验的贝叶斯变量选择方法。所提出的算法通过专注于识别搜索空间中有希望的基因组合的子集来降低计算强度。我们还采用贝叶斯多重假设检验程序来识别强动态基因共表达变化。进行模拟研究以将所提出的方法与现有的穷举搜索启发法进行比较。我们使用癌症基因组图谱乳腺癌 BRCA-US 项目的 RNA 测序数据集展示了我们提出的研究基因共表达模式与总体生存率之间关联的方法的实施情况。© 2023 作者。约翰·威利出版的《医学统计》

STATISTICS IN MEDICINE

An-MingTang,ChengPen...

Semiparametric normal transformation joint model of multivariate longitudinal and bivariate time-to-event data.

STATISTICS IN MEDICINE

近年来，纵向和生存数据联合模型（JMLS）被广泛用于研究临床试验中纵向数据和生存数据之间的关系。但是，现有的研究主要集中在独立生存数据。在许多临床试验中，生存数据可能是双变量相关的。为此，本文提出了一种新的 JMLS，可容纳多变量纵向和双变量相关的时间事件数据。非参数边际生存风险函数转换为二元正态随机变量。采用贝叶斯惩罚样条来近似未知的基线危险函数。将 Metropolis-Hastings 算法合并到 Gibbs 采样器中，我们开发了一种贝叶斯自适应 Lasso 方法来同时估计参数和基线危险函数，并在所考虑的 JMLS 中选择重要的预测变量。使用模拟研究和国际乳腺癌研究组的示例来说明所提出的方法。© 2023 John Wiley

STATISTICS IN MEDICINE

QingyanXiang,RonaldJ...

The survival-incorporated median vs the median in the survivors or in the always-survivors: What are we measuring? and Why?

STATISTICS IN MEDICINE

许多临床研究根据生存率和其他连续/顺序临床结果（例如生活质量评分）来评估治疗的益处。在这些研究中，当受试者在随访评估之前死亡时，临床结果变得不确定并因死亡而被缩短。将结果视为因死亡而“缺失”或“审查”可能会误导治疗效果评估。我们表明，如果我们使用幸存者或永远幸存者的中位数作为估计值来总结临床结果，我们可以得出结论，生存概率和良好临床结果之间存在权衡，即使在概率和良好临床结果之间存在权衡的情况下也是如此。一种治疗的生存率和任何良好临床结果的可能性都更好。因此，我们主张不要总是将死亡视为临床结果缺失的一种机制，而应将其作为结果衡量的一部分。为了说明生存状态，我们将生存合并中位数描述为死亡情况下结果的替代汇总衡量标准。生存合并中位数是一个阈值，50% 的人口存活且结果高于该阈值。通过概念性示例和前列腺癌治疗研究的应用，我们表明，生存合并中位数提供了一种简单而有用的汇总测量方法，可为临床实践提供信息。© 2023 John Wiley

STATISTICS IN MEDICINE

LiLiu,WenSu,XingqiuZ...

Semiparametric estimation and testing for panel count data with informative interval-censored failure event.

STATISTICS IN MEDICINE

面板计数数据和区间删失数据是事件史研究中经常出现的两种不完整数据。几乎所有现有的统计方法都是为单独分析而开发的。在本文中，我们研究了一种更一般的情况，即循环事件过程和区间删失故障事件同时发生。为了直观、清晰地解释循环电流过程与故障事件之间的关系，我们通过完全未指定的链接函数提出了故障时间相关的平均模型。为了克服非参数成分和参数回归系数混合带来的挑战，我们开发了一个两阶段的基于条件预期似然的估计程序。我们建立了所提出的两阶段估计器的一致性、收敛速度和渐近正态性。此外，我们构建了一类双样本检验来比较不同组的平均函数。所提出的方法通过广泛的模拟研究进行了评估，并用激发本研究的皮肤癌数据进行了说明。© 2023 John Wiley

SEMINARS IN THROMBOSIS AND HEMOSTASIS

SalahElsherif,AliZid...

ABO Blood Group and the Risk of Thrombosis in Cancer Patients: A Mini-Review.

SEMINARS IN THROMBOSIS AND HEMOSTASIS

癌症相关血栓（CT），特别是静脉血栓栓塞（VTE），是一种常见现象，多种因素导致血栓形成风险存在很大差异。多项研究已经检验了 ABO 血型与 CT 风险之间的关联，非 O 型血与血栓形成风险增加相关；然而，这些研究报告的结果各不相同，并具有公认的局限性。众所周知，ABO 血型与止血有关，通过冯维勒布兰德因子 (VWF) 介导。在这篇叙述性综述中，我们旨在总结有关 ABO 血型在 VTE 中的作用的当前知识，特别关注 VWF 和其他危险因素对 VTE 发生的作用。我们从文献中找到了 ABO 血型对确定健康人群 VTE 风险的影响的证据，但只有少数研究在癌症患者中检验了这种影响。此外，关于 ABO 对不同癌症类型影响的研究缺乏严谨性，特别是在其他风险因素方面。总体而言，大多数研究表明，非 O 型血癌症患者的 VTE 风险增加与 VWF 水平增加有很强的相关性。在一些研究中这种关联性较弱。在对各种癌症中 ABO 或 ABO-VWF 介导的高凝状态和 VTE 风险得出可靠结论之前，还需要进一步研究。这些研究将有助于确定 ABO 分型是否可以作为附加生物标志物，以改善癌症患者的 VTE 风险评估模型。Thieme。版权所有。

SEMINARS IN THROMBOSIS AND HEMOSTASIS

TuaGyldenholm,Anne-M...

Thrombin Generation Markers as Predictors of Cancer-Associated Venous Thromboembolism: A Systematic Review.

SEMINARS IN THROMBOSIS AND HEMOSTASIS

静脉血栓栓塞（VTE）是癌症患者发病和死亡的主要原因。人们不断寻找能够预测癌症相关 VTE 的生物标志物。其中，凝血酶生成标记物提供了一个可能的选择。本系统综述检查了三种广泛使用的凝血酶生成生物标志物：凝血酶原片段 1.2 (F1.2)、凝血酶-抗凝血酶复合物 (TAT) 和离体凝血酶生成，预测实体和血液成人癌症患者 VTE 的能力。相关研究已在 PubMed 和 Embase 数据库中确定，且审查符合系统审查和荟萃分析指南的首选报告项目。每项研究均使用国家心肺血液研究所的质量评估工具进行评估。审查方案发布在 PROSPERO 上，标识符为 CRD42022362339。综述中总共纳入了 24 篇论文：11 篇报告了 F1.2 的数据，9 篇报告了 TAT 数据，12 篇报告了离体凝血酶生成数据。纳入研究的质量评级从良好（n = 13）、一般（n = 8）到差（n = 3）不等，具有高度异质性。然而，F1.2、TAT 复合物和离体凝血酶生成均被发现与 VTE 的发生有关。这种关联对于 F1.2 最为明显。此外，F1.2的确定能够提高几个既定风险评估分数的精确度。总之，发现患有 VTE 的癌症患者中凝血酶生成标记物升高，特别是 F1.2 被发现是癌症相关 VTE 的有希望的预测因子。Thieme。版权所有。

SEMINARS IN THROMBOSIS AND HEMOSTASIS

Platelet Contributions to the (Pre)metastatic Tumor Microenvironment.

SEMINARS IN THROMBOSIS AND HEMOSTASIS

除了在血栓形成和止血中的常规作用外，血小板长期以来还与非止血病理学相关，包括肿瘤细胞转移。此后的大量机制研究表明，血小板与血管内肿瘤细胞的直接结合促进了转移的关键标志，包括循环中的存活和肿瘤细胞在继发部位的停滞。然而，血小板还与构成原发性肿瘤和转移性肿瘤内的基质和免疫区室的非恶性细胞相互作用。这篇综述首先将简要介绍血小板对转移性疾病的贡献，然后讨论血小板在创造可能支持肿瘤细胞成功转移的微环境中所发挥的新作用。Thieme。版权所有。