研究动态
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NEURO-ONCOLOGY
2023 Oct 20
ZirongHuo,ZhaohuiWan...
Single-cell transcriptomes reveal the heterogeneity and microenvironment of vestibular schwannoma.
NEURO-ONCOLOGY
前庭神经鞘瘤(VS)是桥小脑角和内耳道最常见的良性肿瘤。阐明 VS 的异质细胞成分可以深入了解其各种生长模式。使用单细胞 RNA 测序来分析 7 个 VS 样本和 2 个正常神经的转录组。采用多重免疫荧光来验证数据集结果。对 5 个正常神经和 44 个 VS 样本进行批量 RNA 测序,以生成 VS 生长的预测模型。总共 83,611 个细胞被注释为 14 种不同的细胞类型。我们发现了不同 VS 肿瘤的异质性。具有 VEGFA 生物标志物的雪旺细胞亚群通过 mRNA 分解代谢和肽生物合成与 VS 快速生长显着相关。正常神经中的巨噬细胞大部分为M2表型,而缓慢生长和快速生长的VS之间M1和M2巨噬细胞的比例没有显着差异。 VS 中成纤维细胞和血管细胞的正常空间分布被破坏。与正常神经相比,VS 中雪旺细胞和血管细胞之间的通讯增强。三个细胞簇与 VS 的快速生长显着相关,并且可以细化体 RNA 中的生长分类。我们的研究结果为单细胞水平的 VS 微环境提供了新的见解。它可以增强我们对 VS 不同临床表型的理解,并有助于预测生长特征。分子亚型应纳入治疗考虑因素中。© 作者 2023。由牛津大学出版社代表神经肿瘤学会出版。版权所有。如需权限,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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NEURO-ONCOLOGY
2023 Oct 19
JungOhLee,SungSooAhn...
Added Prognostic Value of 3D Deep Learning-Derived Features from Preoperative MRI for Adult-type Diffuse Gliomas.
NEURO-ONCOLOGY
使用三维 (3D) 卷积神经网络 (CNN) 研究全脑 MRI 空间特征对成人型弥漫性神经胶质瘤的预后价值。在一项回顾性多中心研究中,从五个数据集中招募了 1,925 名弥漫性神经胶质瘤患者:SNUH (n=708)、UPenn (n=425)、UCSF (n=500)、TCGA (n=160) 和 Severance (n=132)。 SNUH 和 Severance 数据集作为外部测试集。对比前和对比后 3D T1 加权、T2 加权和 T2-FLAIR 图像被处理为多通道 3D 图像。训练 3D 适应的 SE-ResNeXt 模型来预测总体生存率。使用 Cox 回归评估基于深度学习的预后指数 (DPI)、空间特征衍生的定量评分和已建立的预后标记的预后价值。使用一致性指数(C 指数)和 Brier 评分(BS)进行模型评估。仅 MRI 中位 DPI 生存预测模型的 C 指数分别为 0.709 和 0.677(BS=0.142 和 0.215),生存差异(p < SNUH 和 Severance 数据集分别为(0.001 和 p = 0.002;对数秩检验)。多变量 Cox 分析显示 DPI 是一个重要的预后因素,独立于临床和分子遗传变量:SNUH 和 Severance 数据集的风险比分别=0.032 和 0.036(p < 0.001 和 p=0.004)。多模态预测模型比仅使用临床和分子遗传变量的模型获得了更高的 C 指数:0.783 与 0.774,p = 0.001,SNUH; 0.766 vs. 0.748,p = 0.023,Severance。使用全脑 MRI 的 3D-CNN 模型得出的全局形态特征对于弥漫性胶质瘤具有独立的预后价值。结合临床、分子遗传学和影像数据可产生最佳性能。© 作者 2023。由牛津大学出版社代表神经肿瘤学会出版。版权所有。如需权限,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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Nature Reviews Endocrinology
2023 Oct 02
NishaSThomas,Rebecca...
Diabetes mellitus in breast cancer survivors: metabolic effects of endocrine therapy.
Nature Reviews Endocrinology
乳腺癌是世界上最常见的侵袭性恶性肿瘤,当今有数百万幸存者。 2 型糖尿病 (T2DM) 也是一种全球流行的疾病,也是广泛研究的乳腺癌危险因素。大多数乳腺肿瘤表达雌激素受体,并采用旨在破坏雌激素依赖性信号传导的全身疗法进行治疗。自六年前靶向内分泌治疗出现以来,乳腺癌的死亡率稳步下降。然而,在过去十年中,据报道乳腺癌治疗后患 T2DM 的风险升高,特别是对于接受内分泌治疗的患者。在这篇综述中,我们重点介绍内分泌治疗历史上的关键事件,从他莫昔芬的开发开始。我们还总结了已报道的不良代谢影响的顺序,包括血脂异常、肝脂肪变性和糖耐量受损。我们讨论了根据流行病学数据确定乳腺癌治疗在 T2DM 发展中因果作用的局限性,并描述了信息丰富的临床前研究,这些研究表明内分泌治疗可能通过复杂机制驱动 T2DM 风险和进展。我们还强调了内分泌治疗的挽救生命的益处,并强调需要更好的 T2DM 风险预测生物标志物以及针对不断增长的乳腺癌幸存者群体的预防策略。© 2023。Springer Nature Limited。
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NATURE REVIEWS MOLECULAR CELL BIOLOGY
2023 Oct 04
Jin-SooKim,JiaChen
Base editing of organellar DNA with programmable deaminases.
NATURE REVIEWS MOLECULAR CELL BIOLOGY
线粒体和叶绿体是包含自己基因组的细胞器,分别编码用于 ATP 生成和二氧化碳固定的关键基因。线粒体 DNA 突变可导致多种遗传性疾病,也与衰老和与年龄相关的疾病(包括癌症)有关。细胞器 DNA 的靶向编辑应该有助于研究细胞器基因和开发新的治疗方法,但由于活细胞中缺乏有效的工具而受到阻碍。最近,开发了无 CRISPR、仅蛋白质的碱基编辑器,例如双链 DNA 脱氨酶毒素 A 衍生的胞嘧啶碱基编辑器 (DdCBE) 和腺嘌呤碱基编辑器 (ABE),可以在人类细胞中进行靶向细胞器 DNA 编辑线条、动物和植物。在这篇综述中,我们介绍了为体外细胞器 DNA 碱基编辑而开发的可编程脱氨酶,并讨论了动物中的线粒体 DNA 编辑和植物中的质体基因组(质体组)编辑。我们还讨论了这些工具的精度和效率限制,并提出了治疗、农业和环境应用的改进方案。© 2023。Springer Nature Limited。
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Nature Reviews Urology
2023 Sep 27
RichardCZieren,Patri...
Diagnostic liquid biopsy biomarkers in renal cell cancer.
Nature Reviews Urology
肾细胞癌(RCC)的临床表现正在转向偶然和早期检测,这给 RCC 诊断带来了新的挑战。随着新的诊断生物标志物的开发来区分良性和恶性小肾肿块(SRM),过度治疗可能会减少。与组织活检不同,液体活检是从患者的血液或尿液中获得的,因此是微创的,适合纵向监测。用于 RCC 诊断的最有希望的液体活检生物标志物类型是循环肿瘤细胞、细胞外囊泡 (EV) 和游离 DNA。循环肿瘤细胞检测具有最高的特异性,且处理时间和成本较低。然而,生物学特性和低灵敏度限制了这些标记物在 SRM 诊断中的使用。游离 DNA 可能会补充大体积肾细胞癌的诊断,但在 SRM 中的临床应用潜力有限。 EVs具有最高的生物丰度和识别小量疾病的最高灵敏度;此外,这些标记物的分子特征使 EV 适用于多种分析应用。因此,目前,EV 检测在 RCC 诊断应用(包括 SRM 的识别)方面具有最大的潜力。所有这些液体生物标志物在临床实践中都具有潜力,有待验证研究。还需要实施生物标志物来改善 RCC 亚型的表征。最后,诊断生物标志物可能会扩展到预后或预测应用。© 2023。Springer Nature Limited。
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Nature Reviews Urology
2023 Oct 17
DanielaPerotti,Richa...
Hallmark discoveries in the biology of Wilms tumour.
Nature Reviews Urology
近 50 年前,阿尔弗雷德·克努森 (Alfred Knudson) 提出了肿瘤发展的“两次打击”模型,由此引发了对肾母细胞瘤的现代研究。从那时起,世界各地研究人员的努力极大地扩展了我们对肾母细胞瘤生物学的了解,包括遗传学方面的重大进展 - 从克隆第一个肾母细胞瘤基因到揭示该肿瘤遗传图谱的高通量研究。这些发现增进了对肾母细胞瘤胚胎起源、家族发生和相关综合征的了解。人们已经做出了许多努力来寻找肾母细胞瘤的预后生物标志物并将其应用于临床,其结果通常是有利的,但对一些受影响个体的治疗仍然具有挑战性。生物标志物的肿瘤内异质性也带来了挑战。此外,肾母细胞瘤的临床前模型,从细胞系到类器官培养物,已经不断发展。尽管取得了这些成就,仍有许多工作有待发现:对肾母细胞瘤复发和双侧肾母细胞瘤的多重起源的进一步分子理解是正在积极研究领域的两个例子。国际合作,特别是当需要大型肿瘤系列以获得可靠数据时,将有助于回答一些尚未解决的问题。© 2023。施普林格自然有限公司。
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NATURE REVIEWS MICROBIOLOGY
2023 Oct 04
MaxwellTWhite,Cynthi...
The microbial landscape of colorectal cancer.
NATURE REVIEWS MICROBIOLOGY
结直肠癌(CRC)是全球发病率和死亡率的重要来源,迫切需要改进预防和治疗策略。随着我们对结直肠癌了解的加深,越来越明显的是,肠道微生物群由数万亿与结肠直接接触的微生物组成,在结直肠癌的发生和进展中发挥着重要作用。了解个体微生物和复杂微生物群落在结直肠癌发病机制中所起的作用及其伴随机制,将有助于产生新的结直肠癌预防和治疗干预措施。在这篇综述中,我们讨论了有关 CRC 肠道微生物群整体扰动的最新证据、特定微生物与 CRC 的关联、微生物潜在驱动 CRC 发展的潜在机制以及复杂微生物群落在 CRC 发病机制中的作用。尽管近年来我们对微生物群与结直肠癌之间关系的了解有所提高,但我们的研究结果凸显了当前研究中存在的巨大空白,需要填补这些空白才能将这些知识用于造福患者。© 2023。Springer Nature Limited。
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NATURE REVIEWS IMMUNOLOGY
2023 Oct 02
PeterDKatsikis,KenJI...
Challenges in developing personalized neoantigen cancer vaccines.
NATURE REVIEWS IMMUNOLOGY
癌症免疫疗法最近的成功凸显了利用免疫系统治疗癌症的好处。疫苗在促进病原体免疫力方面有着悠久的历史,因此,针对癌症新抗原的疫苗一直被认为是指导和放大针对肿瘤的免疫反应,同时保护健康组织的工具。近年来,广泛的临床前研究和一百多项临床试验测试了新抗原发现和疫苗配方的不同策略。然而,尽管人们对新抗原疫苗充满热情,但大多数临床试验仍然无法证明明确的功效。在这篇综述中,我们重点关注与疫苗设计和肿瘤环境有关的关键障碍,这些障碍仍有待克服,以释放新抗原疫苗在癌症治疗中的真正潜力。© 2023。Springer Nature Limited。
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NATURE REVIEWS IMMUNOLOGY
2023 Oct 04
CarmenFiuza-Luces,Pe...
The effect of physical exercise on anticancer immunity.
NATURE REVIEWS IMMUNOLOGY
定期的体育活动与较低的癌症发病率和死亡率以及较低的肿瘤复发率相关。流行病学证据得到动物模型临床前研究的支持,表明定期锻炼可以延缓癌症的进展,包括高度侵袭性恶性肿瘤。尽管运动抗肿瘤作用的机制仍有待确定,但癌症免疫监视的改善可能很重要,因为运动会刺激不同的免疫细胞亚型渗透肿瘤。还有证据表明,运动后收集的血液中的免疫细胞可以用作癌症的过继细胞疗法。在本视角中,我们讨论了肌肉活动对于维持健康的免疫系统的重要性,并讨论了单次运动(即“急性”运动)和“常规”运动(即重复运动)的效果抗癌免疫,包括肿瘤浸润。我们还讨论了这一新兴研究领域的假设机制和临床意义。© 2023。施普林格自然有限公司。
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NATURE REVIEWS IMMUNOLOGY
2023 Oct 13
YutingMa,GuidoKroeme...
The cancer-immune dialogue in the context of stress.
NATURE REVIEWS IMMUNOLOGY
尽管几乎没有直接证据支持压力影响癌症发病率,但正如人类流行病学分析和小鼠模型所示,它确实影响肿瘤的演变、传播和治疗结果。生理和心理应激源的经历和反应可以引发神经和内分泌的改变,从而影响肿瘤微环境中的恶性(干)细胞、基质细胞和免疫细胞,以及肿瘤大环境中的全身因素。重要的是,压力引起的神经内分泌变化可以调节免疫反应,这一点已逐渐被发现。许多应激相关免疫调节分子(SAIM)可以通过与免疫细胞上相应的受体结合来重塑自然或治疗诱导的抗肿瘤反应。此外,压力可引起全身或局部代谢重编程并改变胃肠道微生物群的组成,从而间接调节抗肿瘤免疫。在这里,我们探索了将压力与癌症免疫对话中的扰动联系起来的复杂回路及其对癌症治疗方法的影响。© 2023。Springer Nature Limited。
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