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Journal of Translational Medicine
2023 Sep 22

TaoLiu,Meng-QiFan,Xi...
Activation of CTNNB1 by deubiquitinase UCHL3-mediated stabilization facilitates bladder cancer progression.
Journal of Translational Medicine
The catenin beta 1 gene (CTNNB1) plays a crucial role in the malignant progression of various cancers. Recent studies have suggested that CTNNB1 hyperactivation is closely related to the occurrence and development of bladder cancer (BCa). As a member of the deubiquitinating enzyme (DUB) family, ubiquitin C-terminal hydrolase L3 (UCHL3) is abnormally expressed in various cancers. In this study, we discovered that UCHL3 is a novel oncogene in bladder cancer, suggesting it is a promising target against bladder cancer.
我们利用CRISPR-Cas9技术构建了稳定过表达或敲除UCHL3的细胞系。利用Western blotting确定了UCHL3的成功过表达或敲除。然后,我们进行了CCK-8、克隆形成、软琼脂和Transwell迁移实验,以确定UCHL3基因对细胞表型的影响。我们使用UCHL3缺陷的T24细胞(通过CRISPR-Cas9介导的基因组编辑建立)进行了RNA-seq。我们通过热图和基因集富集分析(GSEA)分析了野生型和UCHL3缺陷的T24细胞系中WNT信号通路基因表达的差异。然后,我们使用双荧光报告基因检测验证了UCHL3对Wnt信号通路的影响。接下来,我们使用Western blotting、共免疫沉淀和免疫荧光实验分析了相关机制。我们还进行了裸鼠肿瘤形成实验。此外,我们建立了条件性UCHL3敲除小鼠和膀胱癌模型小鼠以进行研究。
我们发现UCHL3的过表达促进了膀胱癌细胞的增殖、侵袭和迁移,而膀胱癌细胞中UCHL3的减少延缓了体外和体内的肿瘤发生。UCHL3与Wnt信号通路密切相关并引发了Wnt信号通路的激活,表明其功能取决于其去泛素化活性。值得注意的是,UCHL3缺陷小鼠对膀胱肿瘤发生的敏感性较低。此外,UCHL3在膀胱癌细胞中高度表达,与晚期病理指标相关。
总之,我们发现UCHL3在膀胱癌中存在扩增,并在体外增强肿瘤细胞的增殖和迁移,在体内促进膀胱肿瘤的发生和发展。此外,我们揭示了UCHL3稳定CTNNB1表达,进而激活致癌性的Wnt信号通路。因此,我们的研究结果强烈提示UCHL3是膀胱癌的有希望的治疗靶点。© 2023. BioMed Central有限公司,属于Springer Nature的一部分。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 22

RamyaRamaswami,Takan...
Transcriptional landscape of Kaposi sarcoma tumors identifies unique immunologic signatures and key determinants of angiogenesis.
GENES & DEVELOPMENT
Kaposi肉瘤(KS)是由Kaposi肉瘤疱疹病毒(KSHV)引起的多中心肿瘤,在全球范围内导致HIV感染者的患病率和死亡率上升。KS通常涉及皮肤,但在严重病例中也可能发生在胃肠道(GI)。我们使用RNA测序来比较来自19个参与者的44对样本的皮肤和GI KS病变的细胞和KSHV基因表达特征。对KS病变的KSHV表达分析确定了病毒基因组的转录活跃区域。一个重要的病毒裂解基因ORF75的转录物在91%的KS病变中被检测到。宿主基因分析鉴定了在皮肤KS和GI KS病变中与正常组织相比独特的370个差异表达基因(DEGs)和58个差异表达基因。与正常皮肤相比,白细胞介素(IL)-6和IL-10基因表达在皮肤病变中较高,但在GI KS病变中并未发现。在皮肤和GI KS组织中,有26个细胞基因差异表达:包括编码血管生成受体的Fms相关酪氨酸激酶4(FLT4)和分泌性糖蛋白的Stanniocalcin 1(STC1)。使用原代淋巴管内皮细胞(LECs)进行的功能研究进一步调查了FLT4和STC1。在这些模型中,LECs的KSHV感染导致了管状形成的增加,而STC1或FLT4的沉默则导致了管状形成的受损。此项KS组织的转录谱研究为这种独特的病毒驱动肿瘤的特征和发病机制提供了新见解。© 2023. BioMed Central Ltd., Springer Nature的一部分。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 22

RyoKutsuna,TohruMiyo...
Siderophore-producing Pantoea ferrattrahens sp. nov. isolated from a clinical specimen and Pantoea ferramans sp. nov. isolated from soil at the bottom of a pond.
GENES & DEVELOPMENT
从胰腺癌脓毒症患者(PAGU 2156T菌株)和塘底土壤(PAGU 2198T菌株)中分离出两种革兰阴性厌氧培养菌。这两种菌株在铬铬天蓝S琼脂培养基平板上形成菌落周围的光晕,表明它们产生铁载体。基于16S rRNA基因,两种分离菌株被归类为假单胞菌属。通过使用多态分类法,将这两种分离菌株与已有物种区分开来。通过使用gyrB、rpoB、atpD和infB四个基因进行的系统发育分析显示,PAGU 2156T株菌与CBasp.P. Cypripedii LMG 2657T(89.9%)或CBasp.P. Septica LMG 5345T(95.7%)密切相关。与此同时, PAGU 2198T株菌与CBasp.P. Rodasii DSM 26611T(93.6%)和CBasp.P. Rwandensis DSM 105076T(93.3%)形成了单一支系。通过对草稿基因组组装获得的平均核苷酸同一性值显示,PAGU 2156T株菌与密切相关物种之间的同一性值≤90.2%,而PAGU 2198T株菌与密切相关物种之间的同一性值≤81.5%。基于各种表型、生化特性和与相关物种相比的整细胞脂肪酸组分,得出结论,应将每个菌株归类为假单胞菌属的新物种。在本文中,建议将PAGU 2156T株(=NBRC 115930T = CCUG 76757T)命名为 Pantoea ferrattrahens sp. nov.,将PAGU 2198T株(=NBRC 114265T = CCUG 75151T)命名为 Pantoea ferramans sp. nov.。 ©2023 The Societies and John Wiley & Sons Australia, Ltd.
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Disease Models & Mechanisms
2023 Oct

DenaTreiderAlavi,Heg...
Effect of a one-year personalized intensive dietary intervention on body composition in colorectal cancer patients: Results from a randomized controlled trial.
Disease Models & Mechanisms
变化的身体组成可能影响结直肠癌(CRC)患者癌症复发、继发癌症和其他慢性疾病的风险。对于身体组成的变化,如低肌肉量或高脂肪量的干预措施是饮食和体力活动。然而,有关单独饮食干预对如何影响身体组成的证据有限。本研究旨在调查6个月和12个月以挪威食品为基础的饮食指南为重点的饮食干预对结直肠癌I-III期术后患者体重和身体组成的影响。本研究纳入了CRC-NORDIET研究手术后2-9个月的随机对照试验的参与者。干预组接受密集的饮食干预,而对照组进行了类似的测量,但没有饮食干预。使用Lunar iDXA测量了身体组成,并使用线性混合模型进行了分析。总共纳入了383名参与者,其中干预组192名,对照组191名。经过6个月,干预组的平均体重增长较对照组低0.7千克(p = 0.020),脂肪质量增长较对照组低0.6千克(p = 0.019),但在12个月时没有差异。此外,干预组的脂肪质量增加较对照组在6个月时低了0.5个百分点(p = 0.012),在12个月时低了0.7个百分点(p = 0.011)。在6个月时,与对照组相比,干预组腹部脂肪组织的增长较低63克(p = 0.031)。在任何时间点上,脂肪无水组织或皮下脂肪组织没有差异。干预组在6个月(p = 0.025)和12个月(p = 0.021)时的脂肪质量与脂肪无水组织比例的增长较低。饮食干预减少了总体体重和脂肪质量的增长,而未改变脂肪无水组织。尽管个别变化很小,但饮食干预可能导致整体上更有利的身体组成特征。这些发现表明,饮食干预可能是预防结直肠癌幸存者体重和脂肪质量增长的治疗策略的一部分。版权所有 © 2023 作者(们)。由 Elsevier Ltd. 发布。版权所有。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Sep 22

ShigemitsuHorie,SeiN...
Preoperative prognostic model for localized and locally advanced renal cell carcinoma: Michinoku Japan Urological Cancer Study Group.
Disease Models & Mechanisms
经实证验证的适用于局部和局部晚期肾细胞癌(LLRCC)的新修饰国际转移性肾细胞癌数据集联合模型(mIMDC)是一种术前预后模型。本研究旨在验证该mIMDC模型,并在LLRCC中构建一个新模型。我们建立了一个数据库(Michinoku日本泌尿系统癌症研究小组数据库),其中包括79例临床诊断为LLRCC(cT3b/c/4NanyM0)并接受根治性肾切除术的患者,时间为2007年12月至2018年5月。通过单变量和多变量分析,在该数据库中回顾性分析了无病生存(DFS)和总生存(OS),根据这些结果构建了一个新的预后模型,并使用新的和mIMDC模型的c-index估计了模型的拟合能力。DFS和OS的独立不良预后因素包括以下因素:≥1个东方合作组织肿瘤学小组工作能力状态、2.0mg/dL的C-反应蛋白和白细胞计数的上限超过正常值。有利(无因素),中等(一个因素)和不良风险组(两个或三个因素)的中位DFS分别为76.1、14.3和4.0个月(P<0.001)。有利、中等和不良风险组的3年OS分别为92%、44%和0%(P<0.001)。新的和mIMDC模型的DFS c指数分别为0.67和0.60(P=0.060),OS c指数分别为0.74和0.63(P=0.012)。LLRCC中的新术前预后模型可用于患者护理和临床试验。
©2023. 本文作者授予日本临床肿瘤学协会独家许可。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Sep 22

RileyPBohan,AndreaNR...
Impact of Biopsy Attempts, Race, and Access on Time to Initiation of Treatment for Pancreatic Cancer.
Disease Models & Mechanisms
对于手术候选者来说,对疑似胰腺癌(PDAC)进行活检是有帮助的,但并非始终必要。活检对治疗选择产生影响,因为新辅助疗法目前要求组织学诊断,但对于外科切除手术来说并非必须。我们探讨了通过内窥镜超声(EUS)活检获取组织诊断对可切除和边缘可切除PDAC患者治疗时间的影响。对最终证实患有PDAC的手术患者进行了回顾性研究(2011-2021)。收集了里程碑日期(疑似癌症、活检、外科手术或新辅助治疗)。使用Mann-Whitney-Wilcoxon检验、Pearson卡方检验、Fisher精确检验、线性回归和Cox比例风险模型进行数据分析。在131例可切除和58例边缘可切除患者中,边缘可切除组进行了更多的活检(1.2次与0.7次,p < 0.0001),更有可能在三级保健中心进行活检(67.2% vs 30.5%,p < 0.0001),且趋向于治疗时间较长(49 vs 44天,p = 0.070)。在黑人种群(29天,p = 0.0002)和医疗保险为医疗保险为Medicare(22天,p = 0.038)且未在三级保健中心进行活检的患者中,治疗时间显著增加(10天,p = 0.039)。在调整了协变量后,额外活检明显延迟了治疗时间(1次活检:21天,p = 0.0001;2次活检:44天,p < 0.0001;3次活检:68天,p < 0.0001)。EUS活检显著影响疑似PDAC与治疗之间的时间。这可能受到临床实践日益偏向新辅助疗法(需要经活检证实的疾病)的影响。治疗时间还可能受到接受三级保健中心服务的能力和种族差异的影响。© 2022年。肠道外科学会(The Society for Surgery of the Alimentary Tract)。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Sep 22

ManWu,ShunLi,YiqianL...
Associations between the inflammatory potential of diets with adherence to plant-based dietary patterns and the risk of new-onset cardiometabolic diseases in Chinese adults: findings from a nation-wide prospective cohort study.
DIABETES & METABOLISM
目的:目前关于饮食炎症指数(DII)反映的饮食炎症潜力与心脑血管代谢性疾病(CMD)的关联仍缺乏确凿证据。本研究旨在探究DII与植物性膳食模式遵循度以及新发CMD(包括中风、2型糖尿病(T2DM)和心肌梗死(MI))风险之间的关联。方法:本次研究纳入中国健康与营养调查的成年人(N = 14,652)(1997-2015)。膳食摄入数据采用连续3天24小时膳食回顾和食物称重法进行采集。DII采用成熟且经验证的方法进行计算。CMD采用经验证的自报问卷进行识别。统计分析采用Cox比例风险回归模型。结果:在平均10年的随访中,共发现404例新发中风,1051例新发T2DM和280例新发MI。较低的PDI、hPDI、ERD、WISH和PHDI得分以及较高的uPDI得分与较高的DII得分相关(所有P趋势<0.0001)。以较高DII得分反映的炎性饮食与中风(Q5 vs. Q1:HR = 1.90;95% CI:1.26-2.88;P趋势= 0.0006)、T2DM(Q5 vs. Q1:HR = 2.08;95% CI:1.61-2.69;P趋势<0.0001)和MI(Q5 vs. Q1:HR = 1.70;95% CI:1.04-2.76;P趋势= 0.0114)的风险升高在整个队列中均得到肯定的关联。性别和BMI显著影响DII与T2DM风险的关联,性别显著影响DII与MI风险的关联。结论:对健康可持续的植物性膳食模式的遵循度较低,对不健康的植物性膳食模式的遵循度较高,与较高的DII得分相关。利用DII,我们在中国成年人(基线时无CMD和癌症)中报告了炎性饮食与中风、T2DM和MI新发风险增加之间的长期关联。这些发现为DII与心脑血管代谢性健康的关联提供了证据,并为当前文献的发展提供了有关DII是否应纳入膳食指南并作为改善饮食质量和预防CMD在中国人群中的一种有效工具的慎重评估。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Sep 20

AshiMannan,SoniaDhim...
Pharmacological modulation of Sonic Hedgehog signaling pathways in Angiogenesis: A mechanistic perspective.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
Sonic hedgehog (SHh)信号通路是一个至关重要的工作网络,可以在多细胞胚胎生长和形态建立等发育过程中调节关键事件。SHh通路调控的紊乱可能导致严重后果,包括先天性残疾、干细胞更新、组织再生以及癌症/肿瘤生长等。当SHh结合到Patch (Ptc)-介导的Smoothened (Smo) (Ptc-smo)受体复合物上时,SHh信号的激活就开始了,随后启动下游信号传导。本综述研究了SHh通路药理调控对通过经典和非经典途径影响血管生成的情况。经典途径血管生成包括激活血管生成细胞因子,如成纤维细胞生长因子(FGF)、血管内皮生长因子(VEGF)、胎盘生长因子(PGF)、肝细胞生长因子(HGF)、血小板源性生长因子(PDGF)、基质细胞源性因子1α、转化生长因子-β1(TGF-β1)和血管生成素(Ang-1和Ang-2),从而促进血管生成过程。非经典途径包括间接激活特定通路,如iNOS/Netrin-1/PKC、RhoA/Rock、ERK/MAPK、PI3K/Akt、Wnt/β-连环蛋白、Notch信号通路等。本综述将更好地阐明SHh在介导血管生成中的机制,有助于抑制特定癌症和肿瘤生长。版权所有 © 2023. Elsevier Inc.出版。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Dec

NamrataGautam,Lukasz...
Themis controls T cell activation, effector functions, and metabolism of peripheral CD8+ T cells.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
Themis在调节胸腺细胞在T细胞发育过程中的阳性选择方面起着重要作用,但它在外周T细胞中的作用尚不明确。在这里,我们使用依赖他莫昔芬的急性Themis缺失小鼠模型来研究T细胞的激活及其后果。我们发现,增殖、包括抗肿瘤杀伤在内的效应功能以及能量代谢的上调都受到严重影响。这项研究揭示了外周适应Themis缺失现象,通过证明Themis急性缺失后的直接TCR诱导缺陷,在外周T细胞慢性缺乏Themis的dLck-Cre缺失模型中并不明显。我们比较了采用慢性与急性依赖他莫昔芬介导的Themis缺失以及(慢性的)dLck-Cre缺失模型的长期外周适应。我们发现,在慢性依赖他莫昔芬介导的Themis缺失中,T细胞受体(TCR)和细胞因子信号通路的基因表达谱发生了调节。该谱与(慢性的)dLck-Cre缺失模型相重叠。因此,我们发现外周适应会对TCR和细胞因子信号模块产生改变。我们的数据凸显了Themis在CD8+ T细胞激活中的重要性。© 2023 Gautam等人。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Sep 23

LiHe,LanLiu,DanXu,Yi...
Deficiency of N6-Methyladenosine Demethylase ALKBH5 Alleviates Ultraviolet B Radiation-Induced Chronic Actinic Dermatitis via Regulating Pyroptosis.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
热凋亡是一种炎症性程序化细胞死亡(PGD),据报道与N6-甲基腺苷(m6A)修饰有关。本研究旨在调查m6A去甲基化酶AlkB同源物5(ALKBH5)在慢性光化性皮炎(CAD)进程中热凋亡的机制。运用定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)评估CAD和正常样本之间的m6A相关基因变化。将人角质形成细胞(HaCaT细胞)暴露于紫外线B(UVB;10,20和30 mJ/cm2),随后评估细胞增殖、细胞凋亡、炎症细胞因子(白介素(IL)-1β、IL-18和肿瘤坏死因子(TNF-α))、热凋亡相关蛋白(气孔美凋亡蛋白(GSDMD),半胱氨酸酶-1(Caspase-1)和半胱氨酸酶-4(Caspase-4))。将靶向ALKBH5的小干扰RNA(siRNA)转染入HaCaT细胞,评估si-ALKBH5对CAD的影响。通过暴露紫外线B(每天250 mJ/cm2)诱导CAD小鼠模型,以确认ALKBH5在CAD中的作用。CAD患者中ALKBH5表达增加。紫外线B也促进了ALKBH5的表达,增加了细胞凋亡,并诱导了炎症因子(IL-1β、IL-18和TNF-α)的释放以及热凋亡相关蛋白(GSDMD,Caspase-1和Caspase-4)。沉默ALKBH5抑制了细胞凋亡,并抑制了紫外线B诱导的热凋亡和炎症反应。同时,沉默ALKBH5减轻了CAD小鼠紫外线B诱导的皮肤损伤,伴随炎症细胞因子和热凋亡相关蛋白表达的减少。本研究有助于进一步了解ALKBH5在CAD诱导的热凋亡中的作用机制,并为CAD的研究与管理提供了新的思路。© 2023. 作者(们)独家授权给施普林格科技传媒有限责任公司,施普林格自然出版集团的一部分。
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