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Parasites & Vectors
2023 Sep 22

KatharinaRöltgen,Sco...
Antibody and B Cell Responses to SARS-CoV-2 Infection and Vaccination: The End of the Beginning.
Parasites & Vectors
随着过去几年中COVID-19 疫情的发展,人类免疫系统、快速突变和选择的SARS-CoV-2病毒变异以及有效的疫苗之间的相互作用,使个体免疫学历史的景观变得复杂。本文回顾了一些关键发现,包括抗体和B细胞介导的免疫,对高度突变的欧米克戎变异体的反应;免疫印记和连续的病毒抗原变异接触对抗体和B细胞记忆的其他影响;继发淋巴组织和粘膜组织以及非中和抗体介导的免疫;易受重症疾病影响的人群(如癌症、免疫缺陷和其他合并症)以及表现出对重症疾病明显抵抗力的人群(如许多非洲人群)的反应;以及抗体参与感染后急性继发症或长期COVID的证据。尽管疫情的初始阶段已经结束,但人类群体仍将面临由这种不可预测病毒带来的挑战。《病理学:疾病机制年度综述文集》第19卷的预计在线最终发布日期为2024年1月。请参阅http://www.annualreviews.org/page/journal/pubdates 获取修订后的估计日期。
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2023 Sep 22

OleksiiSemeniuk,Vict...
Monte Carlo investigation of dose distribution of uniformly and non-uniformly loaded standard and notched eye plaques.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
为了研究非均匀荷载和切割斑块对眼斑块剂量分布的影响,我们使用EGSnrc蒙特卡洛(MC)模拟在水和解剖学上代表性的眼球模型中研究眼斑块剂量分布。我们按照TG43规范进行模拟,并与完全考虑种子间和不均匀性效应的MC模拟进行比较。对于标准斑块配置,水中均匀和非均匀荷载的斑块剂量分布几乎没有区别。对于标准斑块,与TG43计算相比,平行于斑块的平面的MC计算剂量分布由于在斑块的边缘处被模达屏蔽而变窄。在斑块后面的剂量经过完全衰减。对于切割斑块,结果相似,切割平面上的衰减沿着切割处平面是不对称的。累积剂量体积直方图显示,与TG43计算相比,计算得到的MC剂量对于肿瘤和眼部结构均有显著减少。对于切割斑块,由于包围视神经的模达,MC剂量大大减弱,使视神经D95%从14 Gy降至0.2 Gy,与TG43计算相比。肿瘤D95%分别为89.2 Gy和79.95 Gy,对应于TG43和MC计算。TG43计算高估了靶区和风险器官的绝对剂量和横向剂量分布。对于非均匀荷载的斑块来说,与均匀荷载的斑块沿中心轴线进行剂量匹配足以提供可比较的覆盖率,可在眼科肿瘤繁忙中心进行临床使用。© 2023 The Authors. Journal of Applied Clinical Medical Physics published by Wiley Periodicals, LLC on behalf of The American Association of Physicists in Medicine.
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INTERNATIONAL JOURNAL OF EPIDEMIOLOGY
2023 Sep 20

AndreaGini,MurielleC...
A new method of estimating prevalence of childhood cancer survivors (POCCS): example of the 20-year prevalence in The Netherlands.
INTERNATIONAL JOURNAL OF EPIDEMIOLOGY
估计儿童癌症幸存者的数量对于癌症控制非常重要,包括临床指导方针。为了在数据共享限制的情况下比较不同国家的估计结果,我们提出了一种使用聚合数据计算有限持续期癌症幸存者患病率 (POCCS) 的新方法。我们开发了一个马尔可夫模型,模拟了人口中每个日历年和出生队列中个体在以下健康状态中的比例: 健康、新被诊断为癌症、患有癌症幸存和死亡。健康状态之间的转换通过使用来自荷兰癌症注册处的年龄-性别特异性发病率、荷兰癌症注册处的条件1年净存活率 (1989-2011) 以及来自人类死亡数据库的年度性别和年龄组死亡概率而得到的基本数据进行推断。应用马尔可夫模型,我们计算了患有儿童癌症的幸存者的20年患病率。根据性别分层的POCCS估计结果与来自同一注册处的个体癌症记录派生的SEER*Stat估计结果进行了比较。
在2011年,POCCS预测,在之前20年被诊断为儿童癌症的荷兰每百万人口中有654名男性 [95%置信区间(95% CI):637-672] 和 539名女性 (95% CI: 523-555)。使用SEER*Stat,在2011年7月1日,每百万人口中有665名男性(95% CI: 647-683)和544名女性(95% CI: 529-560)患有儿童癌症20年患病。
使用POCCS模型和聚合癌症数据,我们对于儿童癌症幸存者有限持续期患病率的估计结果与使用需要个体癌症记录的标准方法计算的结果一致。POCCS方法为儿童癌症幸存者的后续随访和护理规划提供了相关信息。© 2023作者。由牛津大学出版社代表国际流行病学协会发表,版权所有。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep

TiffanyYSia,AnnaMaio...
Germline Pathogenic Variants and Genetic Counseling by Ancestry in Patients With Epithelial Ovarian Cancer.
GENES & DEVELOPMENT
评估上皮性卵巢癌(EOC)患者中与祖传致病性/可能致病性变异(PVs)和遗传咨询有关的血统率。纳入从2015年1月1日至2020年12月31日期间進行临床腫瘤-正常测序的病理确认的EOC患者,包括对≥76基因的基因组分析。对于新识别的PVs,患者被转介给临床遗传学服务(CGS)接受咨询。使用自述种族/族裔和Ashkenazi犹太人(AJ)渊源来定义族群。使用经过验证的算法进行计算推断遗传血统。建立了逻辑回归模型。在1,266名患者中,自述血统(AJ,17%;亚洲人,10%;黑人/非裔美国人,5.4%;西班牙裔,6.2%;非西班牙裔白人,57%;其他,0.16%;未知,4.0%)与遗传血统相关(AJ渊源,18%;混合血统,10%;非洲血统,4%;东亚人(EAS),6%;欧洲人,56%;美洲原住民,0.2%;南亚人(SAS),4%;未知,2%)。313名患者(25%)观察到了基因组PVs,其中195名患者(15%)在EOC相关基因中观察到了PVs。PV患者在诊断时年龄较轻(59岁对62岁;P < .001),且更有可能患高级浆液性卵巢癌(83%对72%;P = .009)。血统群组间的PV患病率有所差异(P < .001),AJ(39.9%)和亚洲人(26.5%)群组的患病率最高,而其他血统群组的患病率(>10%)类似。遗传血统的使用显示了类似结果,并进一步描绘了EAS/SAS群组中的高PV患病率。较年轻的年龄,高级别浆液性组织学和自述的AJ或亚洲血统与EOC相关基因的PV相关联。新识别PV的CGS咨询率在所有血统群组中较高(80%)。
无论血统如何,尤其是在EOC相关基因中,PV患病率很高,各群组间接受咨询的比率相似,强调在所有EOC患者中进行全面遗传测试的重要性。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 22

MichaelDolan,NickStJ...
High-Throughput Screening of the Saccharomyces cerevisiae Genome for 2-Amino-3-Methylimidazo [4,5-f] Quinoline Resistance Identifies Colon Cancer-Associated Genes.
GENES & DEVELOPMENT
杂环芳香胺(HAAs)是在烧烤肉类和香烟烟雾中发现的强致癌物质。然而,目前只鉴定出了少数真核细胞抗性基因。我们利用酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)来鉴定能够赋予对2-氨基-3-甲基咪唑[4,5-f]苯并喹啉(IQ)的抗性的基因。CYP1A2和NAT2可以将IQ激活成致突变的亚硝基化合物。我们对表达人类CYP1A2和NAT2基因或无人类基因的删减文库进行了暴露实验,暴露浓度为400或800 μM IQ,且实验持续五代或十代。我们使用Illumina HiSeq 2500平台对DNA条形码进行了测序,针对完全匹配的条形码进行了统计学显著性分析。在"人源化"文库的IQ抗性筛选中,我们鉴定了424个ORFs,其中包括337个已知功能基因。对于51个基因的选择性验证,我们使用了生长曲线、竞争生长或尝试蓝染色实验。在不表达人类基因的文库中,鉴定了143个对IQ自身具有抗性的ORFs。核糖体蛋白和蛋白修饰基因在原始和"人源化"文库中均被确定为IQ抗性基因,而氮代谢、DNA修复和生长控制基因也在"人源化"文库中明显。我们还鉴定了包括酪蛋白激酶2(CK2)和组蛋白伴侣蛋白质复合体(HIR)在内的蛋白质复合体。在DNA修复和检查点基因中,我们鉴定了参与后复制修复(RAD18,UBC13,REV7)、碱基切割修复(NTG1)和检查点信号传导(CHK1,PSY2)的基因。这些研究强调了核糖体蛋白基因在赋予IQ抗性中的作用,并阐明了赋予活化的IQ抗性的DNA修复途径。© 2023 作者。由牛津大学出版社代表遗传学学会发表。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Sep 22

EunjiJun,SeungwooJeo...
Medical Transformer: Universal Encoder for 3-D Brain MRI Analysis.
Disease Models & Mechanisms
由于现实世界中可用于训练数据驱动深度学习模型的三维医学数据集的注释数量有限,迁移学习在医学图像分析中引起了广泛关注。我们提出了一种新颖的迁移学习框架——医学变换器,能够将三维体积图像高效地建模为二维图像切片的序列。为了改进三维形式中的高层表示并增强空间关系,我们采用了一种多视图方法,利用三维体积的三个平面的信息,并提供了参数高效的训练。为了构建一个适用于各种任务的源模型,我们使用自监督学习(SSL)进行预训练,以蒙面编码向量预测作为代理任务,在大规模正常健康脑磁共振成像(MRI)数据集上进行。我们的预训练模型在三个下游任务上进行了评估:1)脑疾病诊断;2)脑龄预测;3)脑肿瘤分割,这些任务在脑MRI研究中被广泛研究。实验结果表明,我们的医学变换器在分类和回归任务中能够将参数数量高效地减少约92%,在分割任务中减少97%,并且在仅使用部分训练样本的情况下也能够取得良好的性能,优于最先进的迁移学习方法。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Sep

MeghanGrassel
Higher Incidence of Pyogenic Liver Abscess in an Upper Midwest Hospital System: A 5-Year Study With Emphasis on Rural Impact.
DIABETES & METABOLISM
全国性的肝脓肿发病率正在增加。目前估计的全国发病率范围从每10万住院患者中的8到20个肝脓肿。了解危险因素对于高效诊断和治疗肝脓肿至关重要。本研究旨在评估中西部地区一个农村地区与大都市地区相比,肝脓肿发病率是否更高。同时还考虑了水基础设施因素。我们对2016年1月1日至2019年12月31日之间,位于南达科他州的一家中部地区医院系统的所有以肝脓肿诊断入院的患者进行了回顾性病历审查。收集了微生物学培养和患者的人口统计数据,包括年龄、性别、故乡和种族。评估的危险因素包括腹部手术史、胆囊疾病、败血症、结肠憩室炎、癌症和糖尿病。使用泊松率检验和置信区间方程计算了肝脓肿的发病率。计算了每个危险因素的平均值。最后,使用故乡数据制作了疾病负担热图,并将其与该地区私人水井的密度进行了比较。
该医院在2016年至2019年期间共有116例成人肝脓肿确诊入院。纠正后的发病率为每年每10万住院患者95.66个肝脓肿。农村地区的人均发病率和私人水井的密度较高。
在这个单中心研究中,肝脓肿患者的发病率明显高于全国平均水平。人口统计特征,尤其是地理位置,可能在发病率中起重要作用。农村地理位置可能会影响肝脓肿的发病率,并可能是本研究中较高于预期发病率的一个解释。水基础设施(定义为该地区私人水井的发病率)可能是一个影响因素,因为大部分农村地区依赖未经处理的地下水。本研究的局限性在于对患有肝脓肿的患者真实用水来源的数据可用性。本研究的另一个局限性是缺乏多中心参与。
版权©南达科他州医学协会。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Sep 22

RanxiLiang,FeizeLi,X...
Multimodal Imaging-Guided Strategy for Developing 177Lu-Labeled Metal-Organic Framework Nanomedicine with Potential in Cancer Therapy.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
纳米金属-有机框架 (nano-MOFs) 标记的放射性核素在抗癌领域显示出巨大潜力。在这项研究中,我们提出将荧光成像 (FI) 与核成像相结合,系统评估新型纳米药物从活体癌细胞到整个机体的肿瘤抑制作用,指导高性能抗癌放射药物对胶质瘤的设计和应用。我们装饰了以铁为基础的纳米金属-有机框架载体 MIL-101(Fe)/PEG-FA,用荧光磺化青酰亮7 (Cy7) 进行标记,以研究靶向纳米载体对胶质瘤细胞的结合亲和力,并研究其在体内癌症治疗中的可能给药方式。然后,制备了铒-177(177Lu) 标记的 MIL-101(Fe)/PEG-FA,用于胶质瘤的高灵敏成像和靶向放射治疗。实验证明,所获得的 177Lu 标记的 MIL-101(Fe)/PEG-FA 可作为补充探针,纠正荧光成像给出的所制备纳米载体对癌症的结合亲和力,提供更精确的生物分布信息。此外,177Lu 标记的 MIL-101(Fe)/PEG-FA 具有出色的抗肿瘤效果,导致细胞增殖抑制、细胞内活性氧的上调、肿瘤生长抑制以及与免疫应答相关的蛋白质和细胞因子上调。本研究揭示了光学成像和核成像可以在抗癌纳米药物的设计和评估中作为多模态成像相辅相成,提供了一个有潜力的基于 MIL-101(Fe)/PEG-FA 的肿瘤内放射治疗药物。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 20

SamuelDPollock,Israe...
Scalable generation of 3D pancreatic islet organoids from human pluripotent stem cells in suspension bioreactors.
Stem Cell Research & Therapy
本文介绍了一种利用人多能干细胞在悬浮生物反应器中产生三维胰样器官的方案。我们描述了一种可扩展的技术,可以生成10,000-100,000个器官,经过4-5周进一步分化为具有葡萄糖响应的胰岛素和胰高血糖素释放的α和β细胞。我们详细说明了培养、传代和冷冻保存干细胞悬浮团块的步骤,并指定了分化所需的培养基和分化因子。最后,我们讨论了用于研究应用的功能性评估方法。有关使用和执行该方案的完整细节,请参阅Alvarez-Dominguez 等1。版权所有© 2023 The Authors. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 22

NobukoHijiya,AlexeyM...
The Long-term Efficacy and Safety of Nilotinib in Pediatric Patients With CML: a 5-Year Update of the DIALOG Study.
Stem Cell Research & Therapy
在阶段 II 的开放标签 DIALOG 研究中,验证了尼洛替尼在免疫耐受(R/I)或新诊断(ND)的幼儿期 Philadelphia 染色体阳性慢性髓系白血病慢性期(CML-CP)患者中的疗效和安全性。在这份最终分析中,呈现了治疗完成 66 个周期(每周期 28 天)的尼洛替尼(剂量为每天 230 毫克/平方米,分两次服用)或提前停药患者的长期疗效和安全性。共招募了 59 名患者,其中 58 名接受了治疗(R/I 群体为 33 名,ND 群体为 25 名;两个群体的中位治疗时间分别为 60.5 个月和 51.9 个月)。在 R/I 群体中,累计发生主要分子应答(MMR)的比率为 60.6%,没有患者出现确认的 MMR 丧失。在 ND 患者中,最佳整体 MMR 比率为 76.0%,有三名患者有确认的 MMR 丧失。通过 66 个周期,R/I 群体的累计分子应答 MR4 和 MR4.5 比率(BCR::ABL1IS≤0.01% 和≤0.0032%,分别)分别为 27.3% 和 12.1%,而 ND 群体则分别为 56.0% 和 44.0%。尼洛替尼的安全性与先前报告一致,没有治疗期间的死亡事件发生。这些长期(约 5 年)的数据支持尼洛替尼在幼儿期 Ph+ CML-CP 患者中的疗效和安全性。www.clinicaltrials.gov.uk #NCT01844765. 版权所有 © 2023 年美国血液学会。
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