研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
查看全部
GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 21
FaliangXing,YiQin,Ji...
Construction of a Novel Disulfidptosis-Related lncRNA Prognostic Signature in Pancreatic Cancer.
GENES & DEVELOPMENT
胰腺癌是一种致命的、极具侵略性的胃肠道肿瘤,预后不良且治疗选择有限。二硫化物病变是一种新定义的细胞死亡类型,对癌症可能产生影响。有关二硫化物病变与胰腺癌的关联研究非常有限。二硫化物病变相关基因的表达数据从The Cancer Genome Atlas-Pancreatic Adenocarcinoma (TCGA)中下载。通过Cox回归和最小绝对值收缩和选择算子(LASSO)分析,发展出二硫化物病变相关长链非编码RNA签名(DRLS)。评估了高风险组和低风险组之间富集功能、突变谱、免疫微环境和预测治疗效果的差异。应用共识聚类分析来鉴定与DRLS相关的亚型。在98个与二硫化物病变相关的长链非编码RNA中,筛选出了5个长链非编码RNA,构建了一个预后性DRLS。DRLS表现出较高的预测准确性,并且是胰腺癌的独立预后因子。根据从签名计算的风险分数,将样本分为高风险组和低风险组。总体而言,低风险患者预后较好,突变发生率较低,免疫细胞浸润较高,对抗肿瘤药物更敏感。DRLS在预测预后方面表现良好,并揭示了与胰腺癌生物学功能、突变状态和免疫浸润情况的密切相关性,为将来关于二硫化物病变与胰腺癌之间关系的研究提供了一些见解。© 2023年。作者们在Springer Science+Business Media, LLC的独家许可下,属于Springer Nature。
Visits: 16
GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 21
ChongPang,ZheXu,Jilo...
Identification of a TRP channel-related risk model for predicting prognosis and therapeutic effects of patients with hepatocellular carcinoma.
GENES & DEVELOPMENT
TRP通道与癌症进展有关。我们的研究旨在利用与TRP通道相关的基因建立肝细胞癌(HCC)的预后模型。我们在TCGA和ICGC数据库中使用训练组和验证组,分别计算使用Lasso-Cox回归分析基于预后基因表达水平的风险评分,并进行生存分析以比较高风险组与低风险组的总生存情况。然后,我们比较了临床病理特征并进行了生物功能分析。我们还探讨了免疫细胞浸润并比较了药物敏感性。通过生物信息学算法,我们确定了11个与TRP相关的基因并计算了风险评分。高风险组的患者表现出更差的总生存情况,以及更晚期的T分期和病理分期。风险评分与细胞周期显著相关。高风险组中ICI和RTK靶点的表达升高,并显示出对包括5-氟尿嘧啶、喜树碱、多西紫杉醇、多柔比星、吉西他滨和紫杉醇在内的化疗药物表现出更好的治疗效果。总体而言,我们通过将风险评分和必要的临床病理参数整合,构建了一个个体化的诊断模型,用于预测HCC患者的总体生存情况。我们成功建立了一个使用TRP通道相关基因预测总生存和治疗效果的高度准确的预后模型。© 2023 年 作者(们)。
Visits: 16
GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 21
BurcuFDarst,EdSaunde...
Germline Sequencing Analysis to Inform Clinical Gene Panel Testing for Aggressive Prostate Cancer.
GENES & DEVELOPMENT
建议对患有晚期前列腺癌(PCa)或有家族癌症史的男性进行生殖系基因检测。虽然目前包括在基因检测中的一些基因的证据有限,但基因检测也很可能是不完全的,缺少影响PCa风险和侵袭性疾病的基因。为了鉴定与侵袭性PCa相关的基因,进行了一个2阶段外显子测序单一病例遗传关联研究,包括来自18个国际研究的欧洲血统男性。数据分析从2021年1月到2023年3月进行。参与者包括9185名患有侵袭性PCa的男性(其中6033人死于PCa,2397人确认有转移)和8361名患有非侵袭性PCa的男性。 我们对全外显子组测序数据进行了评估,并对包括在基因检测中的29个DNA修复途径和癌症易感基因进行了重点研究。主要研究结果是侵袭性(T4类别或T3和格里森评分≥8的肿瘤,有转移的PCa或PCa死亡)与非侵袭性PCa(T1或T2类别和格里森评分≤6的肿瘤,无已知复发)以及转移性与非侵袭性PCa之间的差异。 分析纳入了17546名欧洲血统男性;侵袭性PCa患者的平均(标准差)诊断年龄为65.1(9.2)岁,非侵袭性疾病患者为63.7(8.0)岁。侵袭性或转移性PCa与已知PCa风险基因BRCA2和ATM中罕见的有害变异相关性最强(P≤1.9×10-6),其次是NBN(P=1.7×10-4)。本研究发现了与MSH2、XRCC2和MRE11A中罕见的有害变异相关的名义证据(P<0.05)。另外五个基因存在更高风险的证据(OR≥2),但侵袭性和非侵袭性PCa患者之间的携带频率差异在统计学上没有显著性:TP53、RAD51D、BARD1、GEN1和SLX4。这些11个候选基因中的有害变异存在于2.3%的非侵袭性PCa患者、5.6%的侵袭性PCa患者和7.0%的转移性PCa患者中。 本研究的结果进一步支持了DNA修复和癌症易感基因在指导PCa患者的疾病管理方面的作用,并建议将检测范围扩展到非侵袭性疾病的男性,因为携带这些基因的有害等位基因的男性很可能发展为更严重的疾病。
Visits: 15
European Journal of Physical and Rehabilitation Medicine
2023 Sep 21
Jin-JinChen,Zi-YanZh...
Nutrition-associated health levels in persons with cancer: item response modelling based on the International Classification of Functioning, Disability and Health.
European Journal of Physical and Rehabilitation Medicine
癌症患者的营养状况是其健康和福祉的重要决定因素,解决与营养相关的功能情况对于维持身体活动水平和参与日常活动至关重要。本研究旨在使用项目反应理论,针对癌症患者的营养状况,确定一种基于证据的《国际功能、残疾与健康分类》(ICF)量表,可区分和评估癌症幸存者的与营养相关的功能情况。横断面研究。南京医科大学附属苏州同济医院。本研究纳入了100名癌症患者。通过方便抽样,研究向参与者提供了一个由89个ICF项目组成的问卷调查。通过数据整理、非参数项目反应理论分析和参数项目反应理论分析,使用R软件计算了营养ICF量表的心理测评属性。研究提取了一个具有32个项目的一维量表,并构建了一个具有良好拟合度的二参数逻辑模型,其均方根误差估计(RMSEA)= 0.0759,Tucker-Lewis指数(TLI)= 0.9655,比较适合指数(CFI)= 0.9677。该模型表现出高可靠性,Cronbach's α为0.95,Guttman λ2为0.95,Molenaar Sijtsma统计量为0.96,潜在类别可靠性系数(LCRC)为0.98。此外,32个ICF项目的总得分与患者生成的主观全球评估(PG-SGA)得分(P<0.001,r=-0.77)和迷你营养评估(MNA)得分(P<0.001,r=0.76)之间存在较强的相关性,表明32个项目的量表具有很高的效度。本研究构建了一个基于证据的32项ICF营养量表和2PLM,用于评估癌症患者的营养相关健康水平,具有高效度和可靠性。基于ICF的IRT模型为区分癌症患者的营养相关健康水平提供了一种有前景的评估工具,并为选择康复干预目标提供了辅助方法。这有潜力改善癌症治疗的结果,提高癌症幸存者的生活质量。
Visits: 15
EUROPEAN JOURNAL OF PEDIATRICS
2023 Sep 21
ChristianJentzsch,Jö...
Solid pseudopapillary neoplasms of the pancreas in childhood and adolescence-an analysis of the German Registry for Rare Pediatric Tumors (STEP).
EUROPEAN JOURNAL OF PEDIATRICS
胰腺实性假乳头状瘤(SPN)是儿童胰腺肿瘤中最常见的一种疾病。然而,这些疾病很少见,每年的发病率为0.1-0.2/1,000,000,人们对其最佳治疗方法所知甚少。本分析旨在增加对儿童SPN发生和治疗策略的了解。我们分析了德国罕见儿科肿瘤登记簿(STEP)中记录的0-18岁患有SPN的儿童的诊断、治疗和结果数据。共识别出38名患者,诊断时中位年龄为14.5岁(范围:8-18岁),女性占多数(81.6%)。肿瘤最常见的部位是胰腺尾部。在组织病理学和免疫组化检查中,假乳头状、实性和囊性病变以及β-连环蛋白、孕激素受体和细胞周期蛋白D1的表达最常见。所有患者均接受了手术切除。大多数患者接受了开放性切除,主要是尾部切除术用于尾部区域的肿瘤,胰十二指肠切除术用于头部区域的肿瘤。术后主要的影响是内源性胰腺功能不全(23.7%),特别是胰头部位的SPN。在随访期间没有出现复发,尽管有两名患者进行了显微镜残留切除。儿童胰腺SPN是低度恶性肿瘤,通常治疗结果良好。然而,治疗可能导致相关的长期后遗症。为了预防复发,建议进行完全的手术切除,并尽可能保留健康的胰腺组织。为了优化治疗,跨学科专家的协作是必不可少的。这些肿瘤的分子遗传分析可能有助于改善对其发生机制的理解。 • 儿童胰腺实性假乳头状瘤(SPN)是非常少见的疾病。 • 对肿瘤发生的了解很有限,并且儿科患者的治疗和随访没有具体的指南。 • 我们对大量儿童SPN患者进行了综合评估,包括其特征、治疗和结果。 • 我们提出了儿童SPN诊断、治疗和随访的建议,这些建议是基于我们的分析和已有的经验。 © 2023. 作者。
Visits: 19
Disease Models & Mechanisms
2023 Sep 21
MarlieseAlexander,Sa...
Risk-Directed Ambulatory Thromboprophylaxis in Lung and Gastrointestinal Cancers: The TARGET-TP Randomized Clinical Trial.
Disease Models & Mechanisms
对接受全身抗癌治疗的个体进行抗血栓预防已被证明是有效的。最大化效益的潜力依赖于改进的风险导向策略,但现有风险模型在肺癌和胃肠癌人群中表现不佳。评估肺癌和胃肠癌患者进行生物标志物驱动的抗血栓预防的临床益处和安全性,并对生物标志物血栓风险评估模型进行外部验证。本开放标签、3期随机临床试验(接受抗癌治疗的门诊患者靶向抗血栓预防[TARGET-TP])由澳大利亚1个大都市和4家地区医院于2018年6月至2021年7月(6个月为初级随访期)进行。纳入年满18周岁或以上的肺癌或胃肠癌患者进行全身抗癌治疗。基于纤维蛋白原和D-二聚体水平的血栓栓塞风险评估将个体分为低风险(观察)和高风险(随机)队列。高风险患者1:1随机分组接受皮下注射40毫克速碧林,每天一次,共90天(根据持续风险延伸至180天)或无抗血栓预防(对照组)。主要结局为180天内客观确认的血栓栓塞。主要次要结果包括出血、生存和风险模型验证。在符合条件的782名成年患者中,有328名(42%)被纳入试验(年龄中位数65岁[范围30-88岁];男性176名[54%])。这些参与者中,201名(61%)患有胃肠癌,127名(39%)患有肺癌,132名(40%)有转移性疾病;200名(61%)为高风险(各组100名),128名(39%)为低风险。在高风险队列中,接受速碧林随机分组的8名个体(8%)和对照组23名个体(23%)发生血栓栓塞(风险比[HR] 0.31;95% CI,0.15-0.70;P = .005;需治疗人数为6.7)。低风险个体有10例(8%)发生血栓栓塞(高风险对照 vs 低风险:HR,3.33;95% CI,1.58-6.99;P = .002)。风险模型的敏感性为70%,特异性为61%。大出血率较低,速碧林组有1名参与者(1%),高风险对照组2名(2%),低风险组3名(2%)发生(P = .88)。6个月死亡率速碧林组为13%,高风险对照组为26%(HR,0.48;95% CI,0.24-0.93;P = .03),低风险组为7%(与高风险对照相比:HR,4.71;95% CI,2.13-10.42;P < .001)。本随机临床试验对肺癌和胃肠癌个体根据血栓风险评分进行分层,并根据风险进行血栓预防,减少了血栓栓塞发生率,需要治疗的人数合理,无安全顾虑,且降低了死亡率。低风险个体避免了不必要的干预。研究结果表明,在这个人群中,基于生物标志物的风险导向主要抗血栓预防是合适的方法。ANZCTR标识符:ACTRN12618000811202。
Visits: 15
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Sep
YuanYuan,WeipengLi,X...
[Screening and obataining of aptamers for the blood group antigen-binding adhesin (BabA) to block Helicobacter pylori (H.pylori) colonization in the stomach of mice].
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
目标 本研究旨在探索适配体特异性结合幽门螺杆菌(BabA)与血型抗原结合粘附素(H.pylori)的能力,以阻断H.pylori对宿主细胞的粘附过程。 方法 使用培养的H.pylori菌株,提取其基因组作为模板,利用设计的引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增BabA基因。获得的BabA基因经克隆并构建到原核表达质粒中,通过异丙基β-D-半乳糖苷(IPTG)诱导表达并纯化目标蛋白。对能够特异性结合BabA的单链DNA (ssDNA) 适配体进行SELEX筛选。使用酶联寡核苷酸检测法(ELONA)检测和评估候选适配体的特性。通过体外流式细胞术和小鼠感染模型的细胞水平上进行的细胞计数实验,验证ssDNA适配体对H.pylori粘附的阻断效果。同时,利用ELISA检测小鼠胃黏膜细胞匀浆中白细胞介素6(IL-6)、IL-8、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、IL-10和IL-4的水平。 结果 提取到H.pylori ATCC 43504菌株的基因组,并构建了重组质粒pET32a-BabA。诱导和纯化后,重组BabA蛋白的相对分子质量(Mr)约为39,000。通过肽段质量指纹(PMF),验证了重组蛋白的氨基酸序列与BabA蛋白一致。通过SELEX筛选出了5个候选适配体,它们可以与上述重组BabA蛋白结合。适配体A10、A30和A42识别同一位点,而A3、A16和上述三个适配体各自识别不同位点。实验结果表明,这些适配体能够显著阻断H.pylori在体外的粘附。动物模型实验显示,通过胃内注射,适配体能够阻断H.pylori在胃黏膜的寄生,并减少炎症反应。适配体治疗模型组胃黏膜匀浆中IL-4、IL-6、IL-8和TNF-α的水平低于未经治疗的模型组。 结论 适配体能够通过结合BabA蛋白来阻断H.pylori与胃黏膜上皮细胞的粘附过程,从而减少H.pylori在胃黏膜定植过程中的寄生。
Visits: 17
Cellular & Molecular Immunology
2023 Sep 21
TylerSimmons,DoronLe...
Modeling the Development of Cellular Exhaustion and Tumor-Immune Stalemate.
Cellular & Molecular Immunology
长期感染和癌症导致免疫细胞的细胞耗竭。耗竭免疫细胞通过抑制性受体的上调和效应功能的减弱而表现出来,无法完全清除由于过度暴露而导致的抗原。在癌症环境中,这导致较小但持续存在的肿瘤负担,被称为局部肿瘤-免疫僵局。近年来的研究阐明了细胞耗竭的发展和进展的关键方面,并重新审视了先前的误解。生物学出版物也提供了有关耗竭细胞功能能力的见解。为了建立细胞耗竭和对实体肿瘤的局部僵局发展的数学框架,本文提出了一个模型。对该模型的分析显示,这种僵局是稳定的,并且能够处理小的扰动。此外,模型分析还提供了未来免疫治疗努力的潜在目标的见解。© 2023. 作者,独家授权给数学生物学协会。
Visits: 15
Cellular & Molecular Immunology
2023 Sep 21
TadafumiShimizu,Taka...
Eribulin promotes proliferation of CD8+ T cells and potentiates T cell-mediated anti-tumor activity against triple-negative breast cancer cells.
Cellular & Molecular Immunology
化疗药物对三阴性乳腺癌(TNBC)细胞和免疫细胞产生免疫调节作用。依鲁必连有利于改善乳腺癌患者的免疫状态。然而,依鲁必连对免疫细胞的影响尚未得到探究。本研究旨在调查依鲁必连对免疫细胞的影响。从健康供者的外周血单个核细胞(PBMCs)和小鼠脾细胞中,使用抗CD3和抗CD28抗体进行刺激。利用流式细胞术分析依鲁必连和紫杉醇对细胞增殖和分化状态的影响。采用RNA测序评估依鲁必连和紫杉醇治疗后CD8+ T细胞基因表达的变化。通过使用TNBC细胞系(MDA-MB-231、Hs578T和MDA-MB-157),评估刺激CD3/CD28的T细胞与依鲁必连或紫杉醇联合治疗的抗肿瘤活性。依鲁必连对CD3/CD28刺激的PBMCs增殖无影响。然而,依鲁必连显著降低了T细胞中的CD4/CD8比值,表明依鲁必连促进CD8+ T细胞增殖。此外,依鲁必连显著增加了较少分化的CD45RA+、CCR7+和TCF1+亚群CD8+ T细胞的频率。RNA测序显示,依鲁必连增强了与细胞增殖和免疫应答相关的基因组的表达。此外,依鲁必连增强了刺激CD3/CD28的T细胞对TNBC细胞的抗肿瘤作用。这些结果在使用紫杉醇的实验中未观察到。依鲁必连促进了CD8+ T细胞增殖,抑制了效应T细胞分化,并利用T细胞介导的抗肿瘤效应。这些机制可能是依鲁必连改善肿瘤患者免疫状态的线索之一。© 2023作者,由Springer Science+Business Media, LLC的独家许可,属于Springer Nature的一部分。
Visits: 19
Cellular & Molecular Immunology
2023 Sep 21
XinXiong,YangZhang,Y...
Diverse functions of myeloid-derived suppressor cells in autoimmune diseases.
Cellular & Molecular Immunology
自从发现髓系源性抑制性细胞(MDSCs)在癌症和其他病理情况下对免疫反应有抑制作用后,随后的研究者寄希望于其对自身免疫疾病中免疫损伤的抑制功能。然而,最近的研究发现了MDSC在癌症和自身免疫病中免疫效应的关键区别。这些不仅包括抑制和免疫耐受,MDSCs还具有促炎效应,在自身免疫病中加剧免疫失调,同时促进T细胞增殖,诱导Th17细胞分化,释放促炎细胞因子和直接引起组织损伤。此外,MDSCs还可以与周围细胞进行互动,直接引起组织损伤或修复,有时甚至作为疾病严重程度的炎症指标。MDSC的这些多样表现部分归因于MDSC的异质性,但并非全部。不同的疾病类型、疾病状态和细胞因子谱改变了MDSC的多样表型和功能,从而导致MDSC抑制的受损或Obversion。在本综述中,我们总结了MDSC在几种自身免疫疾病中的功能,并试图阐明其作用机制。© 2023. 作者。
Visits: 15