高度转录非编码元件（HTNEs）是具有高水平转录能力的关键非编码元件，涉及到多种细胞生物学过程的特定群体。研究在异常组织中持续异常表达的HTNEs可能有助于探索它们在疾病发生和进展中的作用。乳腺癌是一种高度异质性的疾病，早期筛查和预后非常重要。在本研究中，我们开发了一个HTNE鉴定框架，系统研究乳腺癌患者中的HTNE景观，并鉴定了一万多个HTNEs。通过公共数据集验证了我们框架的稳健性和合理性。我们发现，HTNEs具有明显的染色质增强子和长链非编码RNA（lncRNA）的特征，并且明显富集于RNA结合蛋白，同时也成为miRNA的靶点。此外，HTNE相关基因显著过表达，并且与乳腺癌呈强相关。最终，我们探究了与HTNEs相关的亚型特定转录过程，并揭示了能够基于激素受体特性对乳腺癌亚型分类的HTNE标志。我们的结果强调，所鉴定的HTNEs及其相关基因在乳腺癌进展中起着关键作用，并与乳腺癌的亚型特定转录过程相关。© 2023 The Authors.

肝纤维化与异常肝功能和肝癌密切相关。准确的非侵入性肝纤维化评估对于预防疾病进展和治疗决策具有重要意义。本研究的目的是开发和验证一种用于非酒精性脂肪性肝病患者评估重要纤维化的非侵入性预测模型。2017-2018年，从NHANES数据库中提取了所有参与者的信息。从中选择了显著纤维化的符合条件患者(n=123)和非显著纤维化患者(n=898)组成原始数据集。使用最小绝对收缩和选择算子(Lasso)回归进行变量选择，并使用多变量逻辑回归分析开发预测模型。评估模型的实用性包括其区分能力、校准性和临床可用性。使用自举重采样内部验证来评估预测模型的准确性。本研究建立了一个由9个常见临床指标组成的新模型，并开发了一个在线计算器来展示该模型。与先前提出的肝纤维化评分系统相比，该模型在训练组(0.812，95%CI 0.769-0.855)和验证组(0.805，95%CI 0.762-0.847)中显示出最佳的区分能力和预测性能，具有最高的曲线下面积。特异度(0.823)、敏感度(0.699)、阳性似然比(3.949)和阴性似然比(0.366)同样出色。预测概率与显著纤维化的实际发生概率的校准图显示出卓越的一致性，表明模型校准优秀。结合决策曲线分析，该模型在0.1-0.8阈值概率范围内具有很大的益处，并且在临床显著纤维化的诊断中具有良好的应用价值。本研究提出了一种将临床指标结合起来的新型非侵入性诊断模型，为非酒精性脂肪性肝病患者的显著纤维化提供了精确、方便的个体化诊断。版权所有 © 2023 郭、沈、薛和李。

细针穿刺活检（FNAB）是甲状腺结节的良好诊断工具，然而，对于巨大结节的假阴性率仍存在争议。许多临床医生建议对直径大于4厘米的结节进行手术切除，因为这会增加恶性风险和假阴性率。本研究旨在通过我们医院的病历，检验这种方法的可行性，并调查直径大于4厘米的甲状腺结节中无可疑细胞学特征的恶性发生率。这是针对首尔世宗医院于2017年1月至2022年8月接受术前FNAB检查的453名患者的回顾性分析。在这453名患者中，有140个结节是良性的，119个结节是不确定的。在259名患者中，最终病理结果被分为良性（149个）和癌性（110个）两组，良性组中恶性发生率为38.9%，不确定组中恶性发生率为55.5%。在这些恶性病例中，研究发现在细胞学上被认为是良性和不确定的结节中，有83%是滤泡状癌和滤泡状乳头状癌变体。术前FNAB在具有直径大于4厘米且无可疑细胞学特征的甲状腺结节患者中具有很高的假阴性率和低诊断准确性，因此，诊断性手术可能是一个考虑的治疗选择。版权所有© 2023 Kang, Kim, Lee, Kim, Lee, Kang, Lee, Jeong, Nam, and Chung.

低强度脉冲超声（LIPUS）是一种非常有前景的治疗方法，在康复、骨科、牙科、泌尿学、妇科和其他多学科疾病诊断和治疗中得到了广泛应用, 在全球引起了广泛的关注。然而，目前对LIPUS领域的现状和未来发展方向的综合和系统研究还比较缺乏。因此，本研究采用文献计量学方法全面分析了过去十年来与LIPUS相关的报告，进一步专注于其在内分泌和代谢疾病中的应用进行研究。我们从Web of Science核心合集科学引文索引扩展版和社会科学引文索引中下载了2012年至2022年的LIPUS文献，并使用VOSviewer和CiteSpace等文献计量分析软件执行了分析和可视化结果。我们检索到了655篇英文LIPUS文章，发表于2012年至2022年之间。在这个领域，中国发表的文章数量最多，中国与美国之间的合作最为密切。重庆医科大学是产出最多的机构，而《ULTRASOUND IN MEDICINE AND BIOLOGY》是相关出版物最多的期刊。近年来，对LIPUS的分子机制研究不断深入，其临床应用也不断拓展。LIPUS在氧化应激、再生机制和癌症等重大疾病中的应用被认为是未来的研究方向，尤其是在内分泌和代谢领域，具有广泛的应用价值。全球对LIPUS的研究预计将继续增加，未来的研究将集中在其作用机制和临床应用上。本研究全面总结了LIPUS领域的当前发展状况和全球趋势，以及其在内分泌和代谢疾病领域的研究进展，为该领域未来的研究提供了有价值的参考。版权所有 © 2023 Chu and Niu.

在过去的十年中，高维单细胞技术已经彻底改变了基础和转化免疫学研究，并成为科学家研究免疫系统的工具箱的关键元素。然而，对这些方法产生的数据进行分析通常需要聚类算法和降维表示，这些算法计算强度大、评估和优化困难。在这里，我们提出了细胞测量学聚类优化与评估（Cyclone），这是一个集成降维、聚类、评估和聚类分辨率优化的分析流程，并提供下游可视化工具，便于对各种细胞测量学数据进行分析。我们在各种生物学背景下对Cyclone进行了基准测试和验证，包括质谱细胞测量学（CyTOF）、基于全光谱荧光的细胞测量学和多重免疫荧光（IF）。在每种情况下，Cyclone不仅能够重新得到免疫细胞的黄金标准鉴定结果，还能够无监督地识别与不同生物特征相关的淋巴细胞和单核吞噬细胞亚群。总之，Cyclone流程是一种多功能和易于使用的流程，用于对各种细胞测量学数据集进行聚类的执行、优化和评估，这将进一步推动免疫学研究并为生物发现提供支持。Copyright © 2023 Patel，Jaszczak，Im，Carey，Courau，Bunis，Samad，Avanesyan，Chew，Stenske，Jespersen，Publicover，Edwards，Naser，Rao，Lupin-Jimenez，Krummel，Cooper，Baron，Combes和Fragiadakis.

病毒相关的宫颈癌的分子多样性仍然是一个相对未开发的问题，而在特定的宫颈癌微环境形成过程中，免疫学和血管生成特征之间的相互关系尚未充分表征，尤其是对其早期临床阶段，尽管这可能揭示出肿瘤侵袭性、治疗反应性和预后差异背后的机制。在这项研究中，我们旨在识别在免疫相关特征、信号通路模式和微环境组成方面与其直接前体（上皮内）病变存在显著差异的早期宫颈癌的转录组景观。我们使用含人乳头状瘤病毒阳性宫颈上皮内瘤变（CIN）、FIGO IA1-IIB阶段的侵袭性宫颈鳞状癌以及形态正常的上皮组织样本的面板进行了Illumina平台基于RNA测序。推导的转录组文件通过信号通路激活模式、肿瘤浸润细胞种群分布和参与的基因组区域进行了生物信息学分析和比较。根据整体转录组景观的分层集群分析，组织样本分布在三个组或基因表达模式之间（其中包括大部分癌前病例的一组，以及主要包含早期侵袭性癌症病例的另外两组）。检索了每个组间成对比较中的差异表达基因，随后进行了Gene Ontology分析。与CIN组相比，对两组肿瘤样本的基因集富集分析确定了肿瘤组之间的免疫和血管生成特性的显著差异，说明了不同分子表型的发展。细胞组成分析证实了免疫和非免疫种群丰度的不同变化，并相应地显示了与这两组肿瘤相比的CIN在肿瘤微环境中免疫和间质组分的不同作用。位置基因表达分析表明，鉴定到的转录组差异与不同染色体区域关联，并在免疫调节、炎症、细胞分化和肿瘤侵袭中涉及的特定基因家族共定位。总体而言，在其最早阶段发现不同的侵袭性宫颈癌转录组模式支持了免疫应答和血管生成相关机制对肿瘤侵袭和发展的多样影响。这可能为扩大靶向抗血管生成和免疫治疗适用性并提高效率提供了新的选择。版权©2023年Kurmyshkina, Dobrynin, Kovchur和Volkova。

AKT3 在肺癌中似乎扮演着一定的角色。然而，它在呼吸机相关性肺炎中的作用尚不清楚。因此，本研究旨在调查呼吸机相关性肺炎中AKT3在巨噬细胞中的作用。AKT3的mRNA水平来自癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达数据库(GEO)，并使用仙桃学术分析工具进行数据分析。此外，在体实验探究了AKT3在呼吸机相关性肺炎(VAP)中的作用。AKT3在不同正常和肿瘤组织中表达差异明显。功能富集分析显示AKT3在肺癌中具有免疫调节功能和炎症反应。巨噬细胞的消耗保护了肺上皮细胞，并显著降低了MMP9、MMP19、FTH和FTL表达水平，并增加了GPX4表达水平，同时部分逆转了巨噬细胞的变化。机制上，巨噬细胞消耗通过调节VAP后的AKT3减轻了肺上皮细胞的铁死亡。总的来说，本研究暗示了对AKT3在肺癌中的免疫调节功能需要进一步验证。此外，巨噬细胞的消耗通过调节AKT3/GPX4途径来缓解呼吸机相关性肺损伤。版权所有 © 2023 朱、陈、谢、夏、邝、郭和宁。

New York食管癌1（NY-ESO-1）属于癌胚抗原家族（CTA）成员之一，并被鉴定为家族成员中最免疫原性的肿瘤相关抗原（TAAs）之一。由于其触发自发的体液和细胞免疫反应以及受限的表达能力，NY-ESO-1已成为癌症免疫治疗中最有前景的靶点之一。作为癌症免疫治疗重要组成部分的癌症疫苗，通过主要组织耐受性类II型（MHC-II）介导的外源性TAAs蛋白、肽和抗原表位对CD4+T细胞以及通过主要组织耐受性类I型（MHC-I）介导的外源性TAAs蛋白、肽和抗原表位对CD8+T细胞呈递，进一步增强由细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）和辅助T细胞介导的对TAAs的免疫反应。基于NY-ESO-1的癌症疫苗历经近20年的发展历程，从2003年开始进行首个临床试验。当前针对NY-ESO-1的癌症疫苗具有不同类型，包括树突状细胞（DC）疫苗、肽疫苗、蛋白质疫苗、病毒疫苗、细菌疫苗、治疗性整肿瘤细胞疫苗、DNA疫苗和mRNA疫苗，各自在开发和应用中展示出其优势和难题。本文总结了针对固体癌症治疗的NY-ESO-1靶向癌症疫苗的当前进展，旨在为未来研究提供展望。版权所有 © 2023 Zhou, Ma, Liu, Li, Qiao, Ren和Wang。

目的 此共识旨在为危重患癌症患者的急性呼吸衰竭（ARF）的诊断和治疗提供基于证据的建议。方法 我们根据PICO（人群、干预、比较和结果）原则，制定了六个关于危重患癌症患者急性呼吸衰竭（ARF）的诊断和治疗的临床问题。通过文献搜索和荟萃分析，制定了相应的建议。应用GRADE（推荐评估、发展和评估）方法，让专家组达成共识。结果 专家组强烈建议：（1）使用基因组学下一代测序（mNGS）检测可能有助于快速诊断疑似患有肺部感染的危重患癌症患者；（2）超低温体外膜氧合（ECMO）治疗不应作为危重患癌症患者急性呼吸窘迫综合征的例行救治方法，在多学科会诊后选择高度筛选患者可能获益；（3）与标准化疗相比，接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者发生肺炎的概率增加；（4）危重患癌症患者使用侵入性机械通气，估计拔管时间大于14天时，早期气管切开术可能会获益；（5）高流量鼻导氧和非侵入性通气治疗可作为危重患癌症患者的一线氧气治疗策略，并且相对较弱的建议是：（6）对于由肿瘤压迫引起的危重患癌症患者的急性呼吸衰竭，仅建议对经过多学科会诊确定对抗癌治疗可能敏感的患者进行紧急化疗作为救治方法。结论 基于现有证据的建议可以指导危重患癌症患者急性呼吸衰竭的诊断和治疗，并改善预后。

多发性骨髓瘤（MM）是一种以浆细胞异常克隆增殖为特征的造血恶性肿瘤，可能导致局灶性骨损害、肾功能衰竭、贫血和/或高钙血症。近年来，由于对疾病发病机制的更好理解、风险分层的改进以及新治疗的出现，MM的诊断和治疗有了进一步发展。新药物的应用，包括蛋白酶体抑制剂、免疫调节药物、抗CD38抗体和高剂量化疗后造血干细胞移植，显著改善了患者的预后和生活质量。本综述总结了MM的鉴别诊断和治疗进展。© 2023 Hussain et al.