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Stem Cell Research & Therapy
2023

QiJi,YongpingZhang,Y...
The influence of methotrexate-related transporter and metabolizing enzyme gene polymorphisms on peri-engraftment syndrome and graft-versus-host disease after haplo-hematopoietic stem cell transplantation in pediatric patients with malignant hematological diseases.
Stem Cell Research & Therapy
甲氨蝶呤(MTX)在同种异体造血干细胞移植(allo-HSCT)中作为预防移植物抗宿主病(GvHD)的药物已被证明能有效降低移植物与次植入综合征(Peri-ES)和急性GvHD(aGvHD)的发生率。MTX的药代动力学变化与编码药物代谢酶和转运蛋白基因的基因多态性密切相关。然而,当前的研究主要集中在白血病或自身免疫性疾病上,关于同种异体造血干细胞移植的研究报道有限。在这里,我们回顾性评估了在单个中心接受恶性肿瘤单倍型HSCT(haplo-HSCT)的57名儿科患者中,MTX相关转运蛋白和代谢酶基因多态性、临床特征和预后之间的关系。
我们发现在我们的队列中所有基因多态性都符合Hardy-Weinberg平衡。我们发现血小板恢复时间与ABCB1(1236C>T)之间存在显著相关性(p=0.042)。与SLCO1B1(1865+4846T>C)TT患者相比,SLCO1B1(1865+4846T>C)TC/CC患者的Peri-ES发病率增加(p=0.030)。根据多元Cox分析,我们发现SLCO1B1(1865+4846T>C)TT基因型是Peri-ES发病的独立保护因子(风险比(HR)=0.464,p=0.031),重新输注的单个核细胞剂量与II-IV级aGvHD显著相关(HR=2.604,p=0.039)。
总之,我们的研究结果证明宿主基因型可能调节Peri-ES的发病风险,有助于更好地理解个体差异的疗效,并促进个体化GvHD预防策略的发展。
版权所有 © 2023 Ji, Zhang, Hu, Liu, Cao, Gao, Li, Tian, Kong, Wu, Ling, Xiao, Lu, Li, Yao, Qin和Hu。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Oct 20

LinTian,HuiLi,Peiyan...
C-Myc-induced hypersialylation of small cell lung cancer facilitates pro-tumoral phenotypes of macrophages.
Stem Cell Research & Therapy
小细胞肺癌 (SCLC) 亚型中已经有免疫抑制性髓系细胞群体的记录,它们在重塑肿瘤微环境 (TME) 中发挥着关键作用。然而,在 SCLC 中单核细胞和肿瘤相关巨噬细胞 (TAMs) 的癌相关转录特征仍然不清楚。在本实验中,我们分析了单核细胞/巨噬细胞亚群的分子特征和功能,旨在抑制单核细胞招募和巨噬细胞的促肿瘤行为。我们观察到 NEUROD1 高表达的 SCLC 亚型 (SCLC-N) 表现出亚型特异的过度唾液酸化,这是由 NEUROD1 的独特靶点 c-Myc (MYC) 引起的。过度唾液酸化可以通过调节SCLC-N 中单核细胞源巨噬细胞 (MDMs) 上的免疫抑制性凝集素受体的表达,改变巨噬细胞表型和促肿瘤行为。抑制SCLC中异常唾液酸代谢途径可以显著增强巨噬细胞的吞噬作用。本研究全面概述了单核细胞和巨噬细胞的肿瘤特异性免疫特征,并揭示了肿瘤相关生物标志物作为SCLC的潜在治疗靶点。© 2023 作者。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Oct 20

XiaoleiSun,HangChen,...
Mitochondrial transplantation ameliorates doxorubicin-induced cardiac dysfunction via activating glutamine metabolism.
Stem Cell Research & Therapy
阿霉素是一种被广泛使用的有效抗癌药物。然而,阿霉素的使用也与部分患者的心脏毒性副作用有关。研究显示,线粒体损伤是阿霉素诱发心肌损伤的病理机制之一。在本研究中,我们证明线粒体移植可以通过直接提供功能性线粒体来抑制阿霉素诱导的心肌毒性。线粒体移植改善了心肌细胞的收缩功能和呼吸能力,减少了细胞凋亡和氧化应激。从多种来源分离的线粒体,包括小鼠心脏、小鼠和人类动脉血液以及人类诱导多能干细胞心肌细胞(hiPSC-CMs)衍生的线粒体,都具有类似的心脏保护作用。在机械上,线粒体移植通过激活阿霉素处理的小鼠心脏中的谷氨酰胺代谢,并阻断谷氨酰胺代谢可减弱线粒体移植的心脏保护作用。总体而言,我们的研究表明,从动脉血液中分离的线粒体可用于线粒体移植,这可能成为治疗阿霉素诱导的心脏毒性的可行的有前途的治疗选择。© 2023 作者
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Stem Cell Research & Therapy
2023

SarahMGroves,VitoQua...
Quantifying cancer cell plasticity with gene regulatory networks and single-cell dynamics.
Stem Cell Research & Therapy
癌细胞的表型可塑性可能导致肿瘤进展和获得性耐药期间的复杂细胞状态动态。高度可塑的干细胞样态可能固有耐药。此外,细胞状态对治疗的动态响应允许肿瘤规避治疗。在这两种情况下,量化可塑性对于识别高可塑性状态或阐明状态之间的转变路径至关重要。目前,量化可塑性的方法主要集中在以下两个方面:1)基于基因调控网络动力学的准势量化;或2)基于单细胞动态中的轨迹推断或细胞系追踪方法推断细胞能力。在这里,我们探讨了这两种方法及相关的计算工具。然后,我们讨论了每种方法对可塑性度量的影响以及其与癌症治疗策略的相关性。版权所有© 2023 Groves和Quaranta。
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Frontiers in Pharmacology
2023

ZhenyunYang,YizhenFu...
Comparison of hepatic arterial infusion chemotherapy with mFOLFOX vs. first-line systemic chemotherapy in patients with unresectable intrahepatic cholangiocarcinoma.
Frontiers in Pharmacology
背景:全身化疗(SC)仍然是无法手术切除内肝外胆管癌(iCCA)的唯一一线治疗方法。近期已证实肝动脉灌注化疗(HAIC)在肝细胞癌(HCC)治疗中具有疗效。因此,我们的研究旨在调查HAIC治疗无法手术切除的iCCA患者的安全性和疗效。方法:我们以回顾性的方式研究了2016年3月至2022年3月期间接受HAIC或SC治疗的146名无法手术切除的iCCA患者。比较了HAIC组和SC组的患者结果和安全性。结果:HAIC组和SC组分别有75名和71名患者。HAIC组和SC组的中位生存期分别为18.0和17.8个月(p = 0.84)。HAIC组和SC组的中位无进展生存期分别为10.8和11.4个月(p = 0.59)。然而,与SC组相比,HAIC组具有显著较长的肝内无进展生存期(IPFS)(p = 0.035)。HAIC组和SC组的中位IPFS分别为13.7和11.4个月。根据总生存期(p = 0.047)和无进展生存期(p = 0.009),HAIC组中的单发肿瘤患者似乎获益更多。此外,HAIC组的不良事件(AEs)总发生率低于SC组。结论:我们的研究揭示了HAIC是一种对无法手术切除的iCCA安全有效的治疗方案,相较于SC具有更好的肝内肿瘤控制。同时,单发肿瘤患者更有可能从HAIC中获益。版权所有 © 2023 Yang,Fu,Wu,Hu,Pan,Wang,Chen,Hu,Zhou,Chen和Zhang。
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Frontiers in Pharmacology
2023

EvaProestler,JuliaDo...
The multiple functions of miR-574-5p in the neuroblastoma tumor microenvironment.
Frontiers in Pharmacology
神经母细胞瘤是儿童中最常见的非颅内实体肿瘤,起源于发育中的交感神经系统神经嵴细胞。前列腺素E2(PGE2)被确认为促进神经母细胞瘤进展的肿瘤微环境(TME)的关键炎性介质。我们报告了微小RNA miR-574-5p与CUG结合蛋白1(CUGBP1)之间的相互作用在神经母细胞瘤细胞中诱导了微粒体前列腺素E2合酶1(mPGES-1)的表达,这有助于PGE2的生物合成。然后,PGE2在神经母细胞瘤细胞系中特异性诱导了miR-574-5p在小型细胞外囊泡(sEV)中的排序。sEV是TME中细胞间通讯的重要角色之一。我们发现sEV来源的miR-574-5p在神经母细胞瘤中具有旁分泌功能。它作为直接的Toll-like受体7/8(TLR7/8)配体,并诱导成纤维细胞中α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)的表达,从而促进了成纤维细胞的分化。这一点尤为值得注意,因为它与另一种依赖于PGE2的肿瘤类型——肺癌TME中的功能相反。在这里,sEV来源的miR-574-5p具有自分泌功能,抑制了肺癌细胞中的PGE2生物合成。我们报告了sEV表面的四跨膜蛋白组成与sEV来源的miR-574-5p功能相关。这表明囊泡不仅可以转运miR,还似乎影响它们的作用方式。版权所有©2023年Proestler,Donzelli,Nevermann,Breitwieser,Koch,Best,Fauth,Wickström,Harter,Kogner,Lavieu,Larsson和Saul。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Aug 30

YongLiu,YouchengLian...
Exploring the potential mechanisms of Yi-Yi-Fu-Zi-Bai-Jiang-San therapy on the immune-inflamed phenotype of colorectal cancer via combined network pharmacology and bioinformatics analyses.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
大肠癌(CRC)的发展和进展与其复杂的肿瘤微环境(TME)密切相关。评估免疫细胞浸润(ICI)的改变模式将有助于增加对TME浸润特征的了解。已经证明羿一附子白降散(YYFZBJS)对调节CRC的免疫微环境具有积极影响。然而,其药理靶点和分子机制尚待阐明。本研究采用网络药理学分析方法,鉴定YYFZBJS在CRC TME中的靶点。利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的CRC样本鉴定具有免疫炎性表型(IIP)的患者。通过对比YYFZBJS靶点、CRC疾病靶点和CRC微环境中差异表达基因的交集,确定共识基因。然后,利用最小绝对收缩和选择算法(LASSO)Cox分析法从共识基因中鉴定出预后签名。进一步使用Cytoscape软件构建YYFZBJS重要成分和预后基因靶点的独特草药-化合物-靶点网络图。此外,利用预后基因集进行Kyoto基因与基因组百科全书(KEGG)分析,探索预后基因在CRC IIP患者药物治疗中的分子机制。最后,利用TISCH2数据库进行单细胞分析,验证CRC TME中预后基因的表达。从480名CRC患者中鉴定出284名IIP患者。确定了35个共识基因作为YYFZBJS在CRC患者TME中的靶点。从共识基因中鉴定出了一个包含PIK3CG、C5AR1、PRF1、CAV1、HPGDS、PTGS2、SERPINE1、IDO1、TGFB1、CXCR2和MMP9的11个基因预后签名,训练集和测试集的受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUCs)值分别为0.84和0.793。在草药-化合物-靶点网络中,共有24种化合物与这11个预后基因相互作用,且在IL-17信号通路、花生四烯酸代谢和代谢通路中显著富集。预后基因的单细胞分析证实它们的异常表达与CRC TME有关。本研究有机地整合了网络药理学和生物信息学分析,从YYFZBJS的靶点中鉴定出了CRC IIP患者的预后基因。尽管这项数据挖掘工作仅限于基于免疫微环境的预后机制研究,但该方法为寻找传统中药的新治疗靶点和精确诊断肿瘤指标提供了新的视角。
版权所有©2023年Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Sep 01

DongZhang,RuiSun,Che...
Microdissection of cancer-associated fibroblast infiltration subtypes unveils the secreted SERPINE2 contributing to immunosuppressive microenvironment and immuotherapeutic resistance in gastric cancer: A large-scale study integrating bulk and single-cell transcriptome profiling.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
在免疫治疗时代,初始受益者中的亚优响应率和获得性耐药的发展在包括胃癌在内的多种恶性肿瘤中仍然存在显著挑战。考虑到肿瘤基质,尤其是癌相关成纤维细胞(CAFs)与免疫细胞和肿瘤细胞的相互作用在肿瘤的进展、肿瘤微环境的重塑和治疗反应性方面起着不可或缺的作用,对CAFs的作用以及其功能的关键介体进行深入探索可能为提高当前免疫治疗药物的有效性并进一步实现协同抗肿瘤反应提供新线索。在这里,通过规范生物标记物的共识聚类,对包含来自11个独立数据集的2148例GC患者的四个综合性大规模队列进行了虚拟显微切割,研究发现根据CAFs的丰度可将GC分为三个亚型。通过广泛的免疫基因组分析发现,CAF浸润高的肿瘤表现出不利的预后、恶性表型、较低的肿瘤免疫原性、免疫逃逸的高风险,从而导致免疫治疗的耐药性。通过大规模的单细胞转录组学分析,鉴定出一系列CAF分泌的蛋白质,其中SERPINE2在GC组织的纤维母细胞中受限且通过生物信息学计算和组织芯片分析被证实有助于促进肿瘤微环境以及形成免疫抑制性环境。此外,全癌种调查还证实了SERPINE2在包括各种胃肠恶性肿瘤中的免疫学作用,多个实际免疫治疗队列进一步证实了其对预测免疫治疗效果的意义。总之,这些发现表明CAF来源的SERPINE2是一个具有治疗意义的免疫肿瘤靶点,可进一步协同免疫治疗组合。 版权所有 ©2023 Elsevier Ltd.。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 21

ShilpiSingh,Akhilesh...
Myricetin 3-rhamnoside retards the proliferation of hormone-independent breast cancer cells by targeting hyaluronidase.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
乳腺癌是妇女致死性癌症的第二大原因,也是最常见的恶性肿瘤。由于大多数化疗药物易于复发、耐药和副作用等问题,科学家们开始转向有益的预防和治疗制剂,如天然分子。3-葡萄糖苷化的槲皮素是一种天然黄酮醇苷,已知具有多种药理活性,但有关其抗增殖能力的报道较少。本研究旨在利用细胞毒性实验、体外和体内试验方法,通过计算机辅助和分子动力学分析,调查3-葡萄糖苷化的槲皮素在乳腺癌细胞系中的抗增殖效果及其对透明质酸酶(HYAL)和鸟氨酸脱羧酶(ODC)两个乳腺癌预后标志物的调节潜力。3-葡萄糖苷化的槲皮素显著抑制MDA-MB-231细胞的生长,在SRB(IC50为88.64±7.14μM)和MTT(56.26±8.50μM)试验中显示出较低的细胞毒性。它通过诱导细胞在G0/G1期停滞来抑制细胞向S期的转变,并且抑制率为1.10倍。它与ODC(-7.90 kcal/mol)和HYAL(-9.46 kcal/mol)有强大的结合作用,并抑制了ODC(15.22±2.61μM)和HYAL(11.92±2.89μM)的活性,但在体内实验中,主要对HYAL(21.46±4.03μM)产生了显著的反应。此外,它还表现出1.38倍下调HYAL的能力,并与HYAL形成稳定的复合物。3-葡萄糖苷化的槲皮素的结合口袋与模拟过程中的口袋完全一致,表明其积极阻断了透明质酸酶。计算预测表明该物质具有安全性。这些观察结果提示,3-葡萄糖苷化的槲皮素可作为设计和合成管理非激素依赖性乳腺癌的新型安全药物的药效团。由Ramaswamy H. Sarma提供的信息。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 21

YadavSangeetaMuthyal...
Exploring the molecular interactions and binding affinity of resveratrol and calcitriol with RAGE and its intracellular proteins and kinases involved in colorectal cancer.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
结肠直肠癌(CRC)负担在年轻人群中逐渐增加,原因是饮食和生活方式模式的改变。糖基化终末产物(AGEs)是膳食化合物之一,它与蛋白质、脂质和核酸形成复杂的聚集体,扭曲它们的结构和功能。AGE通过AGE受体(RAGE)介导的信号通路触发促肿瘤作用。本研究旨在通过分子对接(MD)、分子动力学模拟(MDS)、MM-PBSA分析和体外研究,从多个水平上针对AGE-RAGE轴信号蛋白和激酶进行CAL和转-resveratrol(RES)的靶向筛选。CAL和RES的分子对接分析显示其与RAGE及其信号蛋白(如NF-kB、PI3K/AKT、ERK1/2和PKC)相比参考抑制剂具有更好的氢键、疏水性和pi-pi堆积作用。MD和MDS研究显示蛋白质-配体复合物稳定且紧凑。利用MM/PBSA分析估计蛋白质-配体复合物的结合自由能,从而评估复合物的整体相互作用自由能,并揭示活性位点内的低结合能。此外,在体外研究中,AGE前体甲基甘氧(MG)对HCT116细胞具有增殖效应,然而,CAL和RES对MG诱导的效应具有抑制作用,其IC50分别为51 nM和110 µM。因此,研究表明CAL和RES可能是AGE-RAGE信号蛋白和激酶的潜在靶点结合位点,可以与化疗药物一起开发CAL与RES作为CRC辅助治疗。由Ramaswamy H. Sarma传达。
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