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肿瘤
Frontiers in Pharmacology
2023
MeichenPan,LingxueCh...
Exploration of 2D and 3D-QSAR analysis and docking studies for novel dihydropteridone derivatives as promising therapeutic agents targeting glioblastoma.
Frontiers in Pharmacology
背景：二氢蝌蚪昆酮衍生物是一类PLK1抑制剂，具有良好的抗癌活性，并有潜力作为抗胶质母细胞瘤的化疗药物。目标：本研究旨在建立2D和3D-QSAR模型，验证二氢蝌蚪昆酮衍生物的抗癌活性，并确定设计新型治疗药物的最佳结构特征。方法：使用启发式方法（HM）构建2D线性QSAR模型，利用基因表达编程（GEP）算法开发2D非线性QSAR模型。此外，引入CoMSIA方法，研究药物结构对活性的影响。设计了200个新型抗胶质瘤二氢蝌蚪昆酮化合物，并利用化学描述符和分子场图预测其活性水平。具有最高活性的化合物经过分子对接验证其结合亲和力。结果：在分析范畴内，HM线性模型的决定系数（R2）为0.6682，伴随着交叉验证决定系数（R2 cv）为0.5669和残差平方和（S2）为0.0199。GEP非线性模型在训练集和验证集上的决定系数分别为0.79和0.76。经验建模结果强调了3D-QSAR模型的卓越性，其次是GEP非线性模型，而HM线性模型表现出亚优效力。3D模型展现出出色的拟合度，具有强大的Q2（0.628）和R2（0.928）值，辅以令人印象深刻的F值（12.194）和最小化的估计标准误差（SEE）为0.160。在2D模型中，包括六个描述符，最重要的分子描述符被确定为“C-N键的最小交换能量”（MECN）。将MECN描述符与疏水场相结合，生成了用于创新药物的建议。这导致了化合物21E.153的发现，这是一种新型二氢蝌蚪昆酮衍生物，具有出色的抗肿瘤性能和对接能力。结论：2D和3D-QSAR模型的建立，以及轮廓图和分子描述符的创新整合，为胶质母细胞瘤化疗药物的设计提供了新的概念和技术。版权所有© 2023 Pan, Cheng, Wang, Lyu, Hou和Zhang。
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Frontiers in Pharmacology
2023
PeijunLiu,WeihuaTang...
Active metabolites and potential mechanisms of Notopterygium incisum against obstructive sleep apnea Syndrome (OSAS): network analysis and experimental assessment.
Frontiers in Pharmacology
背景：K.C. Ting ex H.T. Chang-related, is an anti-inflammatory medicinal plant. Although abrnotopterol has been reported to be its primary active metabolite, the other metabolites and their mechanisms of action remain unclear. This study aims to investigate the potential mechanisms by which its active metabolites treat Obstructive Sleep Apnea Syndrome (OSAS) through network analysis and experimental assessment.
方法：Notopterygium incisum代谢物及其潜在靶点从公共数据库中提取。我们在Genecards, OMIM，PharmGkb, TTD 和 DrugBank数据库中搜索OSAS相关基因。使用Cytoscape 3.9.0构建药物-靶点-疾病网络并筛选核心基因。人支气管上皮细胞在缺氧和慢性间断性低氧（CIH）培养基中培养24小时。使用酶联免疫吸附分析（ELISA）定量检测白细胞介素-6（IL-6），肿瘤坏死因子-α（TNF-α）和前列腺素E2（PGE2）。使用RT-qPCR检测前列腺素内过氧化物合酶2（PTGS2）mRNA, 用Western blot分析鉴定PTGS2和核因子-κB（NF-κB）蛋白。利用共免疫沉淀（CoIP）和Western blot法评价HBE细胞中PTGS2的泛素化水平。
结果：从Notopterygium incisum中分离的Pterostilbene和notopterol具有治疗OSAS的潜在疗效。PTGS2和雌激素受体α（ESR1）核心基因与OSAS相关。通路富集分析集中在NF-κB、凋亡和HIF-1A通路上。对CIH的响应中，pterostilbene和notopterol降低了IL-6、TNF-α和PGE2水平。通过增加PTGS2水平激活了NF-κB通路。Pterostilbene促进了PTGS2蛋白经蛋白酶体介导的泛素化，降低了PTGS2水平，抑制了NF-κB通路。
结论：本研究揭示了Notopterygium incisum的活性代谢物和与治疗OSAS相关的核心基因，为该植物药物的后续开发和开发提供了基础。版权所有 © 2023年 刘、唐、赵、周和胡。
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Frontiers in Pharmacology
2023
LijuanLi,NanWu,Gaoji...
Heterogeneity and potential therapeutic insights for triple-negative breast cancer based on metabolic-associated molecular subtypes and genomic mutations.
Frontiers in Pharmacology
目的：由于缺乏有效的治疗手段，三阴性乳腺癌（TNBC）的预后非常差。代谢重编程是肿瘤发生、癌症诊断、预后和治疗的重要特征。对TNBC中的代谢模式进行分类对于对抗异质性和靶向治疗至关重要。方法：将来自TCGA 的115例TNBC患者合并成一个虚拟队列，并通过其他验证集进行验证，发现有差异表达的基因（DEGs）。为了识别可靠的代谢特征，我们对五个独立数据集采用相同的程序进行验证，以验证已鉴定的TNBC亚型，这些亚型在预后、代谢特征、免疫浸润、临床特征、体细胞突变和药物敏感性方面有所不同。结果：总体而言，TNBC可以分为两个代谢上有明显差异的亚型。C1 有免疫检查点基因表达高，免疫和基质评分高，对PD-1抑制剂治疗敏感。另一方面，C2代谢途径涉及到碳水化合物、脂质和氨基酸代谢有很大的变异。更重要的是，C2缺乏免疫标志物，病理分期晚，免疫浸润少，预后差。有趣的是，C2 PIK3CA、KMT2D 和 KMT2C 的突变频率较高，并且显示了 PI3K 和血管生成通路的显著激活。作为最终的结果，我们创建了一个100个基因分类器，可可靠地区分TNBC亚型，而AKR1B10则是C2亚型的潜在生物标志物。结论：总之，我们鉴定了两个具有不同代谢表型的亚型，为TNBC异质性提供了新的见解，并为治疗策略提供了理论基础。版权所有 © 2023 Li, Wu, Zhuang, Geng, Zeng, Wang, Wang, Ruan, Zheng, Liu 和 Gao。
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Frontiers in Pharmacology
2023
LiYuan-Ce,ZhangQi,Zh...
Artesunate, as an Hsp90 inhibitor, inhibits the proliferation of Burkitt's lymphoma cells by inhibiting AKT and ERK.
Frontiers in Pharmacology
引言: 青蒿素的衍生物青蒿酸具有抗疟疾作用，并且近年来也被报道具有抗肿瘤活性。然而，其抗肿瘤机制尚不明确。方法: 在本研究中，我们重点研究了青蒿酸通过靶向Hsp90来抑制肿瘤细胞增殖的作用，我们采用免疫沉淀、增殖实验、流式细胞术、免疫印迹法、肿瘤异种移植动物模型和免疫组织化学等方法进行研究。此外，为了研究青蒿酸的抗肿瘤效果，我们使用了青蒿酸包裹的PLGA-PEG纳米颗粒在裸鼠中进行实验。结果: 研究发现，青蒿酸与Hsp90的结合降低了其客体蛋白AKT、ERK、p-AKT、p-ERK和EGFR的表达，从而阻断了淋巴瘤细胞在G0/G1→S阶段的细胞周期，并诱导细胞凋亡。此外，肿瘤异种移植实验结果显示，青蒿酸降低了肿瘤组织中AKT和ERK蛋白的表达，抑制了肿瘤增殖，减小了肿瘤的大小和重量。此外，纳米颗粒封装被证明能增强青蒿酸的抗癌活性。讨论: 因此，我们证实了青蒿酸通过靶向Hsp90来抑制淋巴瘤细胞增殖，我们相信这种化合物具有作为一种新型抗肿瘤药物的开发潜力。版权 © 2023元策，琪，宏阳，彦雯，玉梅，碧娟和君林。
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Frontiers in Pharmacology
2023
ChenghaoWu,ShaoboYu,...
Metabolic-suppressed cancer-associated fibroblasts limit the immune environment and survival in colorectal cancer with liver metastasis.
Frontiers in Pharmacology
背景：结直肠癌肝转移是预后不良的主要风险因素，需要积极的干预和治疗。癌相关成纤维细胞（CAFs）在转移中起着关键作用，特别是代谢重编程方面。然而，对癌相关成纤维细胞代谢表型与免疫细胞之间关联的了解有限。本研究利用单细胞和批量转录组数据解码肝转移中与代谢相关的癌相关成纤维细胞亚型和免疫细胞的作用，开发了与结直肠癌肝转移相关的CAFs预后模型。方法：本研究使用了来自癌症基因组图谱和基因表达杂志的全面数据集，筛选出与肿瘤相关成纤维细胞代谢表型有关的特征。应用Cox回归和Lasso回归方法确定与肿瘤相关的成纤维细胞的预后基因，并基于成纤维细胞亚型基因分数构建模型。随后进行功能、免疫和临床分析。结果：该研究证明了癌相关成纤维细胞细胞的代谢异质性。发现代谢状态不同的癌相关成纤维细胞细胞与不同免疫细胞之间存在显著差异的通信。基于癌相关成纤维细胞基因签名分数的预后特征可用于确定结直肠癌肝转移患者的预后状态。高免疫活性和与肿瘤相关通路的富集在具有高癌相关成纤维细胞基因签名分数的样本中观察到。此外，癌相关成纤维细胞基因签名分数可实际指导选择更敏感的化疗药物。结论：我们的研究确定了与代谢亚型相关的癌相关成纤维细胞的预后标志。该标志在结直肠癌肝转移的精准治疗中具有良好的临床应用前景。版权所有 © 2023 武、禹、王、高、谢、张。
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CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY
2023 Sep 15
ChaoXu,WenZou,Yinhua...
Bladder-sparing treatment for muscle-invasive bladder carcinoma using immune checkpoint inhibitors.
CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY
多模式膀胱保留疗法已成为肌层浸润性膀胱癌（MIBC）患者中那些不能或不愿进行全膀胱切除术的替代方法。已经对采用免疫检查点抑制剂（ICI）的多种膀胱保留策略进行了研究。ICI为基础的膀胱保留疗法有三种常见模式，其中最研究的是ICI与化学放疗的联合应用。ICI与放疗的膀胱保留策略已在对化疗耐受性差的患者中进行了研究。ICI与化疗的联合应用也已在对新辅助治疗有临床完全缓解的患者中进行了探索。所有上述策略显示出有希望的疗效和可管理的安全性概况。但是，用于预测免疫基础膀胱保留疗法疗效的程序性死亡配体1（PD-L1）表达、肿瘤突变负荷和基因改变的价值仍然存在争议。免疫基础膀胱保留疗法仍然面临一些挑战，需要大样本随机试验来验证。版权所有 © 2023. Elsevier B.V. 发表。
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CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY
2023 Sep 15
AmalKamalAbdel-Aziz,...
FLT3 inhibitors and novel therapeutic strategies to reverse AML resistance: an updated comprehensive review.
CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY
FMS样酪氨酸激酶3(FLT3)的突变在近30%的急性髓系白血病(AML)患者中发生。尽管FLT3抑制剂最初在治疗突变型FLT3的AML患者中显示出一定的临床疗效，但许多接受治疗的患者最终会复发。本综述对FLT3靶向疗法的潜力和挑战进行了批判性讨论，并阐明了其药物相互作用以及潜在生物标志物。此外，我们重点研究了FLT3内源性串联重复(FLT3-ITD)型AML对FLT3抑制剂的耐药性的分子机制，以及逆转耐药性的新的治疗策略。值得注意的是，动态的克隆选择和演化模式对于FLT3-ITD型AML对FLT3抑制剂的耐药性起到了贡献。正在进行的临床前研究和临床试验积极致力于设计合理的“个体化”或“针对患者”的联合治疗方案，以有效地治疗FLT3突变型AML的患者。版权所有© 2023 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY
2023 Sep 15
MartinaCatalano,Luig...
Immunotherapy-Related Biomarkers: Confirmations and Uncertainties.
CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY
免疫疗法深刻改变了肿瘤学治疗，成为主要治疗策略之一。在生存结果方面取得了显著改善，但从免疫疗法中受益的患者比例仍有限。只有三分之一接受免疫检查点抑制剂（ICIs）的患者能够实现长期反应。有些患者对治疗无反应或在初次反应后复发。到目前为止，程序性死亡配体1、微卫星不稳定性和肿瘤突变负担是已验证的三种预测ICIs反应的生物标志物，但单一变量似乎仍不足以选择患者。考虑到这些药物的广泛和日益增加的使用，寻找新的ICIs反应预测生物标志物至关重要。我们总结了肿瘤学中免疫生物标志物的现状和临床应用，突出了目前已批准的生物标志物的优势和不足，描述了新兴的组织和循环生物标志物，并概述了未来的展望。版权所有 © 2023作者。由Elsevier B.V.出版。保留所有权利。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Sep 04
RJenkinSuji,SaritaSi...
A survey and taxonomy of 2.5D approaches for lung segmentation and nodule detection in CT images.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
肺癌诊断和检测的计算机辅助诊断系统能够提供无偏差、无疲劳的诊断，方差很小，从而降低死亡率和五年生存率。肺分割和肺结节检测是肺癌计算机辅助诊断系统管道中的关键步骤。关于肺分割和肺结节检测的文献主要包括处理三维数据或二维切片的技术和调查。然而，仍需添加突出2.5D技术的肺分割和肺结节检测调查。本文提供了2.5D方法的背景和讨论以填补这个空白。此外，本文还给出了2.5D方法的分类和详细描述。根据分类，将肺分割和肺结节检测的各种2.5D技术归类为这些2.5D方法，然后提出了在这个方向上可能的未来工作。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Sep 10
AbdurRehman,IsrarFat...
Unveiling the multi-target compounds of Rhazya stricta: Discovery and inhibition of novel target genes for the treatment of clear cell renal cell carcinoma.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
肾透明细胞癌（ccRCC）是一种常见的肾恶性肿瘤，迫切需要创新的治疗策略。在这种情况下，新兴研究重点探索了瑞木叶等植物的药用潜力。然而，其潜在治疗效果的复杂分子机制仍然尚不明了。我们的研究采用了整合方法，包括数据挖掘、网络药理学、组织细胞类型分析和分子建模方法，以确定R. stricta中具有潜在相关性的ccRCC治疗潜力的有效植物化学物质。首先，我们从公共数据库收集了关于R. stricta的植物化学信息。随后，我们将这些信息与由微阵列数据集（GSE16441、GSE66270和GSE76351）得出的ccRCC差异表达基因（DEGs）进行整合。我们确定了R. stricta与ccRCC靶点之间的潜在交集，从而使用Cytoscape软件构建了一个化合物-基因-通路网络。这有助于揭示R. stricta对ccRCC的多靶点药理作用。此外，组织细胞类型分析为了解肾脏潜在治疗靶点的细胞特异性提供了另一个洞察层面。通过进一步的Kaplan-Meier生存分析，我们确定了MMP9、ACE、ERBB2和HSP90AA1作为ccRCC潜在的诊断和预后生物标志物。值得注意的是，我们的研究强调了R. stricta中潜在的化合物-即quebrachamine、corynan-17-ol、stemmadenine、 strictanol、rhazinilam和rhazimolare，通过调节MMP9、ACE、ERBB2和HSP90AA1基因的活性来阻碍ccRCC的进展。此外，分子对接和动态模拟证实了这些化合物的合理结合亲和力。尽管有这些有希望的发现，我们认识到需要全面的体内和体外研究以进一步研究这些化合物的药代动力学和生物安全性。©2023年Elsevier Ltd. 版权所有。
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