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肿瘤
Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 14
ForoughShams,Bahareh...
Current progress in engineered and nano-engineered mesenchymal stem cells for cancer: From mechanisms to therapy.
Stem Cell Research & Therapy
骨髓间充质干细胞（MSCs）作为自我更新的多能性基质细胞，在癌症治疗方面被视为有前途的治疗药物。大量的研究已经证明了基于MSC的治疗的有价值特性，如低免疫原性和固有的对肿瘤的趋化性。为了增强MSC在治疗目的上的效力，利用基因工程为MSC赋予靶向传递功能是非常有益的。经过基因工程改造的MSC能够表达肿瘤抑制因子，如促凋亡、抗增殖、抗血管生成因子，成为理想的传递载体。MSC还可以携带纳米粒子药物，以增强疗效和外部调控的靶向性。此外，MSC释放的外泌体具有重要生理特性，因此它们可以促进细胞间通讯，并将载荷输送到靶向肿瘤细胞。基因改造MSC在肿瘤环境中的精确作用仍然存在争议，但临床试验的开始已经通过对一系列恶性肿瘤的MSC基因治疗的临床前研究的有前途的结果得到证实。本综述重点介绍了工程/纳米工程技术和MSC来源外泌体在肿瘤靶向治疗方面的先进技术。版权所有 © 2023 Elsevier Masson SAS 发表。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 08
MathieuNeault,Charle...
CBFA2T3-GLIS2-dependent pediatric acute megakaryoblastic leukemia is driven by GLIS2 and sensitive to navitoclax.
Stem Cell Research & Therapy
儿童急性巨核细胞白血病（AMKL）是一种与治疗反应差和高死亡率相关的侵袭性血液癌症。本文描述了CBFA2T3-GLIS2驱动的AMKL小鼠模型的发展，这些模型再现了人类疾病的表型和转录特征。我们显示在人类AMKL中发生的一个激活Ras突变增加了CBF2AT3-GLIS2驱动的AMKL的穿透性并减少了其延迟期。CBFA2T3-GLIS2和GLIS2修饰相似的转录网络。我们鉴定了GLIS2的主导致癌特性，与致癌性Ras相互作用触发AMKL。我们发现CBFA2T3-GLIS2和GLIS2都改变了一些BH3-only蛋白的表达，导致AMKL细胞对BCL2抑制剂navitoclax在体外和体内都表现出敏感性，为患有CBFA2T3-GLIS2驱动AMKL的儿科患者提供了潜在的治疗选择。
版权所有 © 2023作者。由Elsevier Inc.出版。保留所有权利。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 14
Wei-CheYen,Qiao-ZhuL...
Salmonella inhibits tumor metastasis by downregulating epithelial cell adhesion molecules through the protein kinase-B/mammalian target of rapamycin signaling pathway.
Stem Cell Research & Therapy
上皮细胞粘附分子（EpCAM）在许多癌症中高度表达，并调控上皮-间质转变，该转变对于肿瘤转移至关重要。此外，EpCAM过表达诱导肿瘤细胞发展出干细胞样表型，并促进肿瘤进展。靶向EpCAM可能是抑制肿瘤转移和进展的有前途的方法。沙门菌治疗抑制肿瘤生长，并减少肿瘤携带小结节的数目。基于这些结果，我们假设基于沙门菌的治疗可以抑制转移相关蛋白的表达。剂量依赖的沙门菌治疗通过免疫印迹显示，显著降低了EpCAM的水平，并降低了蛋白激酶B（AKT）/哺乳动物雷帕霉素靶标（mTOR）通路的磷酸化。此外，沙门菌治疗以剂量依赖的方式增加了上皮标记物的水平，并降低了间质标记物的水平。划痕愈合和Transwell实验表明，沙门菌治疗显著减少了肿瘤细胞的迁移。小鼠静脉注射预孵育与或未经沙门菌预处理的B16F10和CT26细胞，沙门菌组的肿瘤载荷小鼠存活率增加，说明具有抗转移效果。我们的研究结果表明，沙门菌通过AKT/mTOR信号转导途径下调EpCAM在抑制肿瘤转移中起到作用，并具有巨大的癌症治疗潜力。版权所有 © 2023 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY
2023 Sep 13
Yu-JinJeong,ThomasJR...
Tumor lipid metabolism: a mechanistic link between diet and cancer progression.
CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY
“抗癌饮食”对改变癌症风险和预后的潜力已经引起了病人、医生和研究人员的想象力，但是其中许多饮食建议都是基于相关性研究，将特定饮食与癌症风险的变化联系在一起。尽管引人注目，但我们对这些饮食干预对癌症进展的分子机制知之甚少。然而在这个背景下，肿瘤脂质代谢的变化正在被认为是一个关键因素。在本综述中，我们研究了肿瘤微环境（TME）中脂质代谢的当前理解，提出了饮食诱导的脂质组成变化如何调节肿瘤进展和治疗效果。通过剖析参与脂质代谢的各种细胞途径，我们强调了饮食如何调控肿瘤中饱和脂肪酸和不饱和脂肪酸物种的平衡，从而影响癌细胞和基质细胞的功能。最后，我们描述了当前癌症治疗如何与饮食相互作用，提高治疗效果。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY
2023 Sep 14
WeichangYang,WenjunW...
Delta-like ligand 3 in small cell lung cancer: potential mechanism and treatment progress.
CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY
小细胞肺癌（SCLC）是肺癌的一种病理类型，其特点是侵袭性强、恶性高和耐药性。SCLC的死亡率明显高于其他类型的肺癌，而SCLC患者的治疗选择有限。Delta样配体3（DLL3）是Notch信号通路的配体，它在调节SCLC细胞的增殖、发育和转移中起作用。许多研究表明，DLL3在SCLC细胞表面过度表达，提示DLL3是SCLC患者的潜在治疗靶点。目前正在进行一系列针对DLL3的药物试验。针对DLL3的药物Rova-T的III期临床试验未达到预期结果。然而，其他针对DLL3的药物，如AMG119、AMG757和DLL3靶向NIR-PIT，为SCLC治疗带来了新的想法。总体而言，DLL3仍然是SCLC的有价值的靶点。Copyright © 2023. Elsevier B.V.出版。
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Comput Meth Prog Bio
2023 Sep 12
DongqingSu,YuqiangXi...
Structural deep clustering network for stratification of breast cancer patients through integration of somatic mutation profiles.
Comput Meth Prog Bio
乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一，也是全球妇科恶性肿瘤死亡的主要原因之一。乳腺癌的异质性很高，这使得制定有效的治疗策略具有挑战性。越来越多的证据凸显将乳腺癌患者分为临床意义明显的亚型在预后和治疗方面起到关键作用。结构深度聚类网络是一种基于图卷积网络的聚类算法，它整合了结构信息，在各种应用中取得了最先进的性能。在该研究中，我们采用结构深度聚类网络,将2526名乳腺癌患者的体细胞突变谱整合起来，将其分为两个临床可区分的亚型。研究发现，在聚类1中的乳腺癌患者的预后要好于聚类2中的乳腺癌患者，并且两者之间的差异具有统计学显著性。免疫遗传学研究结果进一步表明，聚类1与肿瘤浸润淋巴细胞的显著浸润相关。聚类亚型可用于评估乳腺癌患者在免疫治疗和化学治疗方面的治疗效益。此外，我们的方法有效地对来自八种不同癌症类型的患者进行了分类，证明了它的通用性。我们的研究代表了使用仅有体细胞突变数据和结构深度聚类网络方法对癌症患者进行分类的一种通用方法。采用结构深度聚类网络来识别乳腺癌亚型具有很大的发展前景，并可以为更准确、个性化的治疗方法的开发提供信息。 版权所有 © 2023 Elsevier B.V.。保留所有权利。
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Comput Meth Prog Bio
2023 Sep 06
RongSun,LongWei,Xuew...
Molecular-subtype guided automatic invasive breast cancer grading using dynamic contrast-enhanced MRI.
Comput Meth Prog Bio
组织学分级和分子亚型在确定个性化或精准医学中具有重要参考价值，作为代表浸润性乳腺癌（IBC）生物行为的重要预后指标。 为了评估一个结合分子亚型（MS）信息的IBC分级的两阶段深度学习框架，使用DCE-MRI。 在第一阶段，开发了一种名为IOS2-DA的创新神经网络，其中包括一个具有池化层（DA）的稠密浮动空间金字塔池化块和具有双核心挤压特征的内核-八方块（IOS2）。 该方法侧重于IBC分级的影像表现，使用一种新颖的F1得分损失函数进行初步预测。 在第二阶段，引入了一个MS注意分支，通过Kullback-Leibler散度对IOS2-DA提取的整合深度向量进行微调。 通过集成学习进行肿瘤分级预测的三个MRI造影后系列对分类值进行分析，将MS引导信息与初步结果进行加权，经由接受者操作特征分析被定量评估。DeLong检验用于测量统计学显著性（P < 0.05）。在准确度（0.927），精确度（0.942），AUC（0.927，95％置信区间：[0.908，0.946]）和F1分数（0.930）方面，以分子亚型引导的IOS2-DA显著优于单一的IOS2-DA。梯度加权类激活图显示从IOS2-DA提取的特征表示与肿瘤区域一致。IOS2-DA阐释了其在非侵入性肿瘤分级预测中的潜力。关于MS和组织学分级之间的相关性，它在将相关临床生物标志物应用于增强IBC分级的诊断效能方面展现出显着的临床前景。因此，DCE-MRI倾向于成为对乳腺生物行为和癌症预后进行全面术前评估的可行成像方法。 版权所有 © 2023。 Elsevier B.V.出版。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 16
AlaaeldinMahmoud,Yas...
Delineation and detection of breast cancer using novel label-free fluorescence.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
乳腺癌（BC）的准确诊断在临床病理分析和确保手术边界准确以防止复发中起着关键作用。激光诱导荧光（LIF）技术对组织生物化学具有高敏感性，是一种非侵入性乳腺癌识别的潜在工具。本研究利用激发乳腺癌标本的高光谱（HS）成像数据，通过与正常组织比较改变的荧光特性来检测恶性病变。首先，我们采用了高光谱相机和宽频谱光来评估乳腺癌样本的吸收。值得注意的是，在440-460纳米波长范围内观察到了显著的吸收差异。随后，我们开发了一种专门用于乳腺癌检测的LIF系统，利用450纳米波长的低功率蓝激光源测试了十个乳腺癌样本。我们的研究结果显示，乳腺标本的荧光分布，携带了分子尺度结构信息，可作为识别乳腺肿瘤的有效标记。具体而言，561纳米的发射在肿瘤和正常组织的荧光信号强度中变化最大，可作为一种光学预测性生物标记物。为了提高乳腺癌识别，我们提出了一种结合轮廓映射和K均值聚类（K-mc，K = 8）的高光谱发射图像数据分析的先进图像分类技术。这项探索性工作展示了利用光学技术，特别是我们的LIF技术结合先进的K-mc方法，改善“体内”疾病表征的潜在途径，有助于乳腺癌的早期诊断。© 2023. BioMed Central Ltd.,属于斯普林格自然出版集团的一部分。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 16
TaoSun,ManzhiWang,We...
Revealing mechanism of Methazolamide for treatment of ankylosing spondylitis based on network pharmacology and GSEA.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
甲唑酰胺是一种碳酸酐酶（CA）抑制剂，具有令人满意的安全性。我们之前的研究已经证明甲唑酰胺在强直性脊柱炎（AS）中能提高CA1表达，并显示其治疗作用。本研究通过基因集富集分析（GSEA）和网络药理学研究，探索了CA1的致病作用以及甲唑酰胺在AS中的药理机制。十二个与CA1相关的基因集中有七个在AS组中富集。CA1在这七个基因集中是核心富集的，涉及到锌离子结合、芳香酯酶活性和一碳代谢过程。通过AS相关基因和甲唑酰胺靶基因的交集得到的候选靶基因进行功能分析表明，甲唑酰胺主要通过调节炎症途径，调控肿瘤坏死因子、IL-6和一氧化氮的产生，对AS产生治疗效应。我们选择了PTGS2、ESR1、GSK3β、JAK2、NOS2和CA1作为甲唑酰胺在AS中的治疗靶点。成功进行了分子对接和分子动力学模拟。此外，我们创新地获取了基因本体（GO）/京都基因和基因组百科全书（KEGG）分析结果与GSEA结果的交集，并发现甲唑酰胺在AS中的药理机制涉及骨矿化、血管生成、炎症和趋化因子信号通路等18个GO术语和5个KEGG术语。然而，需要通过体内/体外实验来验证这些机制。© 2023. Springer Nature Limited.
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 16
GiJeongKim,TonghyunL...
Efficient diagnosis of IDH-mutant gliomas: 1p/19qNET assesses 1p/19q codeletion status using weakly-supervised learning.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
准确鉴定胶质瘤的分子变化对其诊断和治疗至关重要。然而，荧光原位杂交（FISH）虽然可以观察到多样且异质的变化，但由于分子方法的限制，它本身具有耗时和挑战性。在这里，我们报告了一种名为1p/19qNET的先进深度学习网络的开发，该网络旨在预测1p和19q染色体的倍变值，并从整张切片图像中对异柠檬酸脱氢酶（IDH）突变的胶质瘤进行分类。我们在发现组（DS）的288例患者的下一代测序数据上对1p/19qNET进行了训练，并采用了弱监督方法和切片级别标签，以减少偏差和工作量。然后，我们在由综合的癌症基因组资源The Cancer Genome Atlas提供的385个样本的独立验证组（IVS）上进行了验证。1p/19qNET的性能优于传统的FISH，1p和19q的R2值分别达到了0.589和0.547。作为IDH突变的胶质瘤分类器，在DS和IVS中，1p/19qNET的AUC分别达到了0.930和0.837。1p/19qNET的弱监督特性提供了结果的可解释性热图。这项研究证明了深度学习在精确确定1p/19q缺失状态和将IDH突变的胶质瘤分类为星形细胞瘤或少突胶质瘤方面的成功应用。1p/19qNET与FISH的结果相当，并提供了有关空间信息的相关信息。这种方法在肿瘤分类方面具有更广泛的应用。© 2023. Nature Publishing Group UK.
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