研究动态
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Hepatology International
2023 Sep 09
MasayaSato,MakotoMor...
Development of a transformer model for predicting the prognosis of patients with hepatocellular carcinoma after radiofrequency ablation.
Hepatology International
射频消融(RFA)是一种广泛接受的微创治疗方式,适用于肝细胞肝癌(HCC)患者。准确的预后预测对于识别RFA后肿瘤进展/复发风险较高的患者至关重要。最近,在几个领域中,最新的Transformer模型显示出比现有的基于深度学习模型更好的性能。本研究旨在开发并验证一种Transformer模型,以预测接受RFA治疗的HCC患者的总体生存率。我们纳入了总共1778例首次接受RFA治疗的既往未治疗HCC患者。我们开发了一种基于Transformer的机器学习模型,用于预测接受RFA治疗的HCC患者的总体生存率,并将其预测性能与基于深度学习的模型进行了比较。通过确定Harrel’s c-index来评估模型性能,并通过分样本方法进行外部验证。Transformer模型的Harrel’s c-index为0.69,表明其在外部验证队列中具有更好的区分性能,优于深度学习模型(Harrel’s c-index为0.60)。Transformer模型能够有效将外部验证队列分为两个或三个不同的风险组(两种风险分组的p < 0.001)。该模型还能够为每位患者输出个性化的累积复发预测曲线。我们开发了一种新型的Transformer模型,用于个性化预测接受RFA治疗的HCC患者的总体生存率。目前的模型可以为接受RFA治疗的HCC患者提供个性化的生存预测模式。© 2023. The Author(s).
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HEART & LUNG
2023 Sep 07
EdithMMarom,WentaoFa...
The IASLC Thymic Epithelial Tumors Staging Project: A Re-Assessment of the ITMIG/IASLC Lymph Node Map for Thymic Epithelial Tumors for the Forthcoming 9th Edition of the TNM Classification of Malignant Tumors.
HEART & LUNG
淋巴结图谱是准确确定和记录淋巴结分类的支柱。国际胸腺恶性肿瘤兴趣小组与肿瘤、淋巴结和转移(TNM)分类第八版合作,创建了第一个胸腺上皮恶性肿瘤地图,代表了胸腺上皮恶性肿瘤的第一个官方TNM分类。该图谱基于临床经验和已发表的研究,但由于数据有限,主要是经验性的。2017年的图谱传播和在全球范围内实施了标准胸腺分期分类,提供了更一致和细致的数据。与第八版数据库相比,当前数据库中的淋巴结受累病例数量多出两倍以上,这使得可以验证第八版图谱的许多方面。本文详细介绍了国际肺癌研究学会肺腺瘤分期和预后因素委员会胸腺领域的第九版TNM用于细化胸腺图谱的过程和考虑因素。委员会评估了一个大型国际合作数据库、有关胸腺上皮肿瘤淋巴结转移的已发表解剖和临床研究,以及作为第九版TNM分类细化基础的分析结果。根据保持第九版TNM分类的N组分不变的建议,淋巴结图谱也保持不变。但是,已添加澄清内容以促进临床使用。© 2023 Elsevier Inc. 发布
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HEART & LUNG
2023 Sep 07
EnricoRuffini,JamesH...
The IASLC Thymic Epithelial Tumors Staging Project: Proposal for a Stage Classification for the Forthcoming (9th) Edition of the TNM Classification of Malignant Tumors.
HEART & LUNG
肺科恶性肿瘤TNM分期分类的第8版引入了一个适用于所有类型的胸腺上皮肿瘤(TET)的肿瘤、淋巴结、转移(TNM)系统。国际肺癌研究协会胸腺分期和预后因素委员会的胸腺领域,由多学科的国际专家组成,负责制定第9版的建议。本文概述了T、N和M分量的建议定义,以及它们如何组合成分期组。借助世界各地主要胸腺组织的贡献,建立了拥有11,347名TET患者的大型中央数据库,并对T、N、M分量和分期组进行了分析。对于完全和不完全切除肿瘤的患者,以总体生存率为结果指标,对于完全切除的患者,以复发率为结果。当患者数量足够时,分别针对胸腺瘤、胸腺癌和神经内分泌胸腺肿瘤进行分析。肿瘤大小包括在T1类中,分为T1a(≤ 5cm)和T1b(> 5cm);冠状肺膜作为T描述符被删除; 肺部或膈神经侵犯被重新分类为T2(而不是T3)。第8版的N和M分量没有提出变化的建议。分期组保持不变。TNM分类第9版的建议变化为未来这些罕见肿瘤的进一步发展奠定了基础。版权所有 © 2023. Elsevier Inc. 发表。
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HEART & LUNG
2023 Sep 09
Yi-XingYang,Huai-Pen...
Comparisons of drug-eluting balloon versus drug-eluting stent for the treatment of cancer patients presenting with acute myocardial infarction.
HEART & LUNG
癌症患者合并急性心肌梗死(AMI)的治疗仍然具有挑战性。本研究的目的是比较药物洗脱球(DEB)与药物洗脱支架(DES)在这一高危人群中的安全性和效果。在2017年1月1日至2022年1月1日期间,北京朝阳医院收治的AMI患者中进行了回顾性纳入癌症患者。主要终点为主要不良心血管事件(MACE),次要终点包括重度出血事件、心功能不全和心脏并发症。最终纳入164例癌症患者的AMI患者进行最终分析。DEB组患者在中位随访21.8个月期间MACE发生率较DES组低(22.9% vs. 37.1%,p = 0.23)。DEB组患者在重度出血事件发生率方面较DES组趋势低(6.3% vs. 18.1%,HR 2.96,95% CI [0.88, 9.92],p = 0.08)。两组在心功能不全(4.2% vs. 9.5%,p = 0.32)和心脏并发症(0.0% vs. 2.6%,p = 0.56)发生率方面没有显著差异。本研究结果表明,在AMI患者中,DEB组与DES组相比,重度出血事件发生率趋势较低,MACE发生率数字上较低。© 2023. BioMed Central Ltd.,施普林格自然出版集团的一部分。
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GYNECOLOGIC ONCOLOGY
2023 Sep 07
HyoChunLee,JaeWonJeo...
High-dose (60 Gy) intensity-modulated radiotherapy with concurrent weekly cisplatin followed by intracavitary radiation in locally advanced cervical cancer: A phase II prospective clinical trial.
GYNECOLOGIC ONCOLOGY
在子宫颈癌治疗中,采用强度调制放射治疗(IMRT)进行剂量递增是改善治疗效果的必要手段。本研究为II期前瞻性临床试验,在单个中心纳入了88例FIGO II-IVa期子宫颈癌患者。这些患者接受了高剂量(60Gy)IMRT治疗,并在治疗期间每周静脉注射顺铂,随后进行宫腔内放疗。主要终点指标为30个月的无进展生存率(目标为82%,相比于GOG 120试验的标准剂量放疗增加了20%)。次要终点指标包括肿瘤反应、毒性反应、复发、远处转移和总生存率。30个月的进展生存率为82.8%。30个月时的总生存率、局部复发率、远处转移率和腹主动脉复发率分别为93.6%、8.2%、9.2%和2.4%。88名患者中有45名(51.1%)在放疗期间MRI检查表明病情下降,并且80名(90.9%)患者在高剂量IMRT和宫腔内放疗后三个月达到临床完全缓解。相较于放疗期间病情没有下降的患者,病情下降组的30个月无复发生存率(92.9% vs. 73.1%,P=0.009)和总生存率(100% vs. 87.0%,P=0.006)显著更高。有11例患者(12.5%)出现3级或更高级别的血液毒性反应,3例患者(3.4%)出现3级或更高级别的非血液毒性反应。此外,还有14名患者出现慢性尿路(8.0%)、肠道(5.7%)毒性反应,盆腔功能不全性骨折(2.3%)或膀胱阴道瘘(2.3%)。高剂量(60Gy)IMRT联合每周顺铂治疗在局部晚期子宫颈癌中取得了良好的无进展生存率。放疗期间的肿瘤反应可以作为预后的显著预测因素。该前瞻性试验已在ClinicalTrials.gov注册编号为NCT02993653。© 2023 Elsevier Inc. 保留所有版权。
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Molecular Cancer
2023 Sep 09
ZhongjieZhao,WenboYa...
circEIF3I facilitates the recruitment of SMAD3 to early endosomes to promote TGF-β signalling pathway-mediated activation of MMPs in pancreatic cancer.
Molecular Cancer
在消化道肿瘤中,胰管腺癌(PDAC)表现出最高的死亡率趋势。此外,尽管PDAC的转移仍然是癌症相关死亡的主要原因,但其生物学机制尚不清楚。最近的证据表明,环形RNA(circRNA)在PDAC进展中起重要作用。通过生物信息学分析筛选了正常和PDAC组织中表达差异的circRNA。进行Sanger测序、RNase R和actinomycin D实验以确认circEIF3I的环状结构。进行体外和体内功能实验评估circEIF3I在PDAC中的作用。通过MS2标记的RNA亲和纯化、质谱分析、RNA免疫沉淀、RNA下拉实验、荧光原位杂交、免疫荧光和RNA-蛋白交互作用模拟和分析等方法,鉴定circEIF3I的相互作用蛋白。通过共免疫沉淀和Western blotting测定circEIF3I对SMAD3与TGFβRI或AP2A1之间相互作用的影响。微阵列数据分析显示circEIF3I在PDAC细胞中高表达,并与TNM分期和不良预后相关。体内外功能实验证实circEIF3I通过增加MMPs表达和活性促进PDAC细胞的迁移、侵袭和转移。机制研究表明,circEIF3I结合到SMAD3的MH2结构域,并通过增强SMAD3与早期内体中的TGFβRI之间的相互作用增加SMAD3的磷酸化。此外,AP2A1直接与circEIF3I结合,并促进circEIF3I结合的SMAD3招募到早期内体中的TGFβRI。最后,我们发现circEif3i在小鼠中的生物学功能与在PDAC人体中的circEIF3I相似。我们的研究揭示了circEIF3I促进胰腺癌的进展。circEIF3I是一个与SMAD3和AP2A1相互作用形成三元复合物的分子支架,促进SMAD3招募到早期内体并激活TGF-β信号转导通路。因此,circEIF3I是PDAC的潜在预后生物标志物和治疗靶点。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 09
JianfengXiang,Wangru...
Deciphering the implications of mitophagy-related signatures in clinical outcomes and microenvironment heterogeneity of clear cell renal cell carcinoma.
GENES & DEVELOPMENT
线粒体自噬在各种与癌症相关的生物过程中的作用被广泛认可,然而对于透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中线粒体自噬的全面意义仍需要进一步探索。基于包含25个线粒体自噬相关基因(MRGs)的转录组数据,我们确定了763个ccRCC样本中独特的线粒体自噬模式。随后,采用机器学习算法构建了一个与线粒体自噬相关的预测标志,命名为风险评分(RiskScore),以量化ccRCC患者的个体线粒体自噬状态。通过多光谱免疫荧光(mIF)和免疫组织化学染色(IHC),我们检测了PTEN诱导的潜在激酶1(PINK1)对ccRCC的预后和免疫微环境的影响。我们的分析首先对ccRCC中的25个MRGs的表达谱、基因组变异和相互作用进行了全面评估。随后,应用共识聚类算法将ccRCC患者分为三个具有不同预后结果、肿瘤微环境(TME)特征和潜在生物通路的类群。我们筛选出了八个关键基因(CLIC4、PTPRB、SLC16A12、ENPP5、FLRT3、HRH2、PDK4和SCD5)构建了一个与线粒体自噬相关的预测标志,该标志在ccRCC患者中具有良好的预后价值。此外,通过风险评分将患者亚群分为不同的免疫检查点(ICPs)表达水平、免疫细胞数量和免疫治疗反应。此外,我们建立了一个结合风险评分和临床特征的有力预测模型。值得注意的是,我们观察到PINK1的表达与良好的治疗反应和高级三次淋巴结构成熟阶段显著相关,这有望为增强ccRCC的抗肿瘤免疫提供新的思路。综上所述,本研究首次开发了一个与线粒体自噬相关的标志,该标志在预测ccRCC患者的临床预后、TME特征和靶向治疗以及免疫治疗反应方面具有出色的能力。值得特别注意的是,PINK1在调节ccRCC患者的治疗反应和免疫微环境方面发挥了关键作用。© 2023年作者(们),在Springer-Nature出版集团的Springer-Verlag GmbH Germany的专属许可下。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 09
SaiHan,XiaoliLiu,Shu...
New mechanisms and biomarkers of lymph node metastasis in cervical cancer: reflections from plasma proteomics.
GENES & DEVELOPMENT
淋巴结转移(LNM)和淋巴血管间隙浸润(LVSI)在宫颈癌患者中预示着不良预后,但缺乏满意的诊断这些表型的方法。本研究旨在通过数据无偏采集(DIA)蛋白组测序,寻找LNM和LVSI的新有效血浆生物标志物,并探讨LNM和LVSI的潜在机制。对20个宫颈癌患者的血浆样本进行DIA,包括7个LNM-/LVSI-(NC)、4个LNM-/LVSI+(LVSI)和9个LNM+ /LVSI+(LNM)样本,以鉴定LVSI和LNM的差异表达蛋白(DEPs)。随后,进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,对DEP进行功能注释。利用蛋白质相互作用(PPI)和加权基因共表达网络分析(WGCNA)来检测新的有效血浆生物标志物和可能的机制。在这个队列中共鉴定出79个DEPs。GO和KEGG分析显示,DEPs主要富集在补体和凝血通路、脂质和动脉硬化通路、HIF-1信号传导通路、吞噬体和自噬中。WGCNA显示,绿色模块的富集在各组之间有很大差异。确认了6个有趣的核心DEP(SPARC、HPX、VCAM1、TFRC、ERN1和APMAP)作为宫颈癌患者LVSI和LNM的潜在血浆诊断标志物。本研究开发的蛋白质标志物反映了宫颈癌LVSI和LNM的潜在血浆诊断标志物和新的可能致病机制。© 2023年。BioMed Central Ltd.,Springer Nature的一部分。
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ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY
2023 Sep 07
ChenbinCui,XinruWang...
Paneth cells protect intestinal stem cell niche to alleviate deoxynivalenol-induced intestinal injury.
ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY
脱氧雄酮醇(DON)是谷物和饲料中常见的毒素,接触DON会触发严重的小肠损伤和炎症,危害人类和牲畜的健康。DON处理导致Paneth细胞减少,然而Paneth细胞在DON诱导的肠道损伤中的作用尚不明确。我们利用二唑磺(40mg/kg)将小鼠的Paneth细胞数量维持在较低水平。结果显示,二唑磺介导的Paneth细胞长期破坏加剧了DON(2mg/kg)处理小鼠的肠道损伤、肠干细胞(ISC)丧失和菌群紊乱。令人意外的是,二唑磺和DON处理的小鼠中腺细胞和增殖细胞的数量增加。在二唑磺和DON处理后,Firmicutes/Bacteroidetes(F/B)比例降低,并观察到Dubosiella的丰度增加和Lactobacillus的丰度减少。溶菌酶(200U/天)补充对Paneth细胞功能的恢复改善了DON挑战后小鼠的肠道损伤和ISC丧失。此外,溶菌酶还促进了肠道器官样体的生长和ISC活性。综上所述,这些结果表明Paneth细胞在DON诱导的肠道损伤中具有保护作用。我们的研究为DON接触的治疗提供了一个新的靶点——Paneth细胞。版权所有 © 2023作者, Elsevier公司出版,保留所有权利。
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DRUG DISCOVERY TODAY
2023 Sep 07
AmrAAAbdEl-Aal,Faire...
Dual-action potential of cationic cryptides against infections and cancers.
DRUG DISCOVERY TODAY
隐性嵌入在他们的母蛋白中的生物活性肽的一个亚科叫作隐性肽,具备多种生物学功能。阳离子隐性肽可以作为现代药物应用于传染病和癌症领域,因为它们的作用机制不太可能受到被治疗细胞中的基因突变的影响,因此解决了这两个领域当前的未满足需求。在本综述中,我们介绍隐性肽的最新认识,使用可用的在线数据库和预测工具可持续地开采隐性肽的方法,特别关注其抗微生物和抗癌潜力,以及其在临床设置中的潜在应用。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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