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Disease Models & Mechanisms
2023 Sep 06

MajaHalgrenOlsen,Tho...
Socioeconomic position and the pre-diagnostic interval among patients diagnosed with head and neck squamous cell carcinoma - a population-based study from DAHANCA.
Disease Models & Mechanisms
诊断为头颈癌的患者中,社会经济差异对生存率有着显著影响,而诊断时的疾病分期被认为是这种关联的主要驱动因素。本全国范围的基于人群的研究调查了社会经济差异在患者诊断前间隔和疾病分期上的影响。关于患者报告的症状和疾病特异因素的信息来自于丹麦头颈癌组织(DAHANCA)数据库,这是一个全国人群基础的数据库,收录了2008年至2019年间在丹麦被诊断为头颈鳞状细胞癌的患者资料。社会经济地位(SEP)通过个体的受教育程度、收入和共同居住状况等因素来衡量,这些数据来源于行政登记。我们使用普通线性模型和95%置信区间(CI)研究了社会经济差异在症状出现至诊断间隔上的影响,同时考察了总体和亚位点以及症状和合并症评分的情况。我们采用了变点检测的方法来研究诊断前就诊的模式。我们使用Logistic回归模型来估计与晚期疾病的关联性。低、中、高社会经济地位的患者在自述症状出现到诊断的时间上相似,都为10周。尽管这段时间根据主要症状和解剖亚位点而有所差异,在这些亚组内观察不到明显的社会经济差异。与患者报告的症状出现相吻合,低社会经济地位患者就诊率在9周(95% CI [7.3; 10.7])处略有增加,而高社会经济地位患者则在7周(95% CI [4.8; 9.2])处增加,两者的置信区间有交叠。相比高社会经济地位的患者,低社会经济地位的患者患喉和口腔鳞状细胞癌的晚期风险更高。对于其他亚位点,关联性根据SEP指标和TNM版本而有所变化。症状出现到诊断的间隔和就诊模式在不同的社会经济地位群体中相似。然而,在某些亚位点上观察到了社会经济差异对于诊断时的疾病分期的影响,但并非所有亚位点都如此。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Sep 06

AshishKumar
SBS 3.1, a novel natural product small molecule regulates TNF-α-induced NF-κB activation and key signals of inflammation to promote apoptosis in lung cancer tumour microenvironment.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
慢性炎症导致肺癌患者患上许多疾病。肿瘤坏死因子α(TNF-α)作为一种多向性促炎性细胞因子,通过调控核因子κB(NF-κB)的活化,驱动炎症和癌症凋亡中的许多生理和病理信号通路。本研究通过虚拟对接ZINC天然产物库和计算模型分析,发现了抑制TNF-α诱导NF-κB激活的一种新的天然产物。分子动力学模拟显示,化合物SBS-3.1是与p50蛋白高效且稳定地结合的最佳领先化合物,靶向该蛋白上与DNA结合有关的重要氨基酸残基。MMP BSA (Binding Site Analysis)预测结果显示,该领先化合物与蛋白的结合自由能是有利的。该化合物能抑制TNF-α诱导的A-549细胞的增殖,其GI50值为30.53 μM。SBS-3.1能降低TNF-α诱导的NF-κB-65、p38和ERK1/2阳性肺癌细胞百分比,同时提高这些细胞的凋亡。总之,一种名为SBS-3.1的天然产物被鉴定为靶向p50的可靠化合物。SBS-3.1通过抑制NF-κB和炎症信号促进肺癌细胞的凋亡。进一步研究可以为治疗与肺癌细胞相关的炎症带来新的治疗策略。由Ramaswamy H. Sarma作通信。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Sep 06

JeanLemoine,Emmanuel...
Non-Relapse Mortality after CAR T-Cell therapy for Large B-Cell Lymphoma: A LYSA Study from the DESCAR-T Registry.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
CD19嵌合抗原受体(CAR)T细胞能够引发持久缓解,并有可能治愈大部分复发/难治性大B细胞淋巴瘤(LBCL)患者。然而,在CAR T细胞疗法后,部分患者可能因与淋巴瘤无关的原因而死亡。目前,我们对CAR T细胞后的非复发性死亡(NRM)了解甚少。本研究使用法国DESCAR-T登记表,分析了NRM的发生率、原因,并确定了NRM的危险因素。我们报告了957名接受标准护理治疗(SOC)axicabtagene ciloleucel(axi-cel;n=598)或tisagenlecleucel(tisacel;n=359)的患者,治疗时间为2018年7月至2022年4月,在法国27个中心进行。在中位随访12.4个月的情况下,共有48名患者(占所有患者的5.0%)发生了NRM:早期(<28天碰撞后)有9名患者(占所有患者的0.9%和总NRM的19%),晚期(≥28天碰撞后)有39名患者(占所有患者的4.1%和总NRM的81%)。总NRM的原因分布如下:56%的感染(29%的非COVID感染,27%的COVID感染),10%的细胞因子释放综合征(CRS),6%的中风,6%的脑出血,6%的第二原发恶性肿瘤,4%的免疫效应细胞相关的神经毒性(ICANS),以及10%的其他原因导致的死亡。我们报告了早期NRM和总NRM的危险因素。多变量分析显示,糖尿病和淋巴消融时升高的铁蛋白与总NRM的风险增加相关。我们的结果可以帮助医生在患者的选择和管理方面,以减少CAR T细胞疗法后的NRM。版权所有 © 2023 美国血液学会。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 04

XinyuLv,Fu-leHe,Yili...
IFNγ synergies with cold atmospheric plasma in triggering colorectal cancer cell ferroptosis via the IFNγ/IFNR2/APC/TCF4/GPX4 axis.
Stem Cell Research & Therapy
结肠癌是第二常见的相关致死癌症。肠道干细胞负责维持肠内稳态,一旦发生转化,便会成为结肠癌干细胞。阻止癌症干性代表了一种创新的结肠癌管理策略。我们使用肠道干细胞器官样体作为主要模型,对常见的炎症细胞因子进行筛选,以识别靶向癌症干性的关键调节因子。我们还通过实验研究和计算预测探索了相关细胞因子的下游信号传导机制。作为结果,我们确定了IFNγ作为关键的细胞因子,能够通过IFNγ/IFNGR2/APC/TCF4/GPX4轴抑制肠道干细胞,并提出了其通过激活GPX4依赖的铁死亡方式杀灭结肠癌干细胞的作用,并展示了其与冷等离子体具有协同抗癌效应的价值,值得进行实验验证。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 06

JathinPranavSingaraj...
Organalysis: Multifunctional Image Preprocessing and Analysis Software for Cardiac Organoid Studies.
Stem Cell Research & Therapy
鉴于近期干细胞研究领域对人类多能干细胞源器官模型的可视化需求日益增长,一个高效的批量处理应用程序是必要的,以提供预处理和图像分析服务。在本研究中,我们开发了一种名为Organalysis的高精度、多功能和易用的应用程序,以满足这些需求,提供图像处理和增强功能、器官模型面积和强度计算、分形分析、噪声去除和特征重要性计算等功能。图像处理功能包括亮度和对比度调整。面积和强度计算为每个图像计算了六个值:器官模型面积、总图像面积、图像被器官模型覆盖的百分比、器官模型的总强度、器官模型按面积计算的总强度,以及器官模型总强度与总图像面积的总和。分形分析功能计算了每个图像的分形维度值。噪声去除功能从输入图像中去除多余的标记,如气泡和其他不需要的噪声。特征重要性功能通过训练一个Lasso正则化线性回归机器学习算法,来识别对细胞分化最重要的心脏生长因子。该应用程序的批量处理功能进一步建立在现有的ImageJ服务的基础上,提供了一种更方便的处理多幅图像的方式。Organalysis的多功能和精确性共同表明其创新性,因为目前没有其他图像处理软件能够同时具备批量处理和广泛的特征分析能力。因此,Organalysis在心脏器官模型研究中提供了独特的功能,其在再生医学领域的价值不可估量。
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CRITICAL REVIEWS IN MICROBIOLOGY
2023 Sep 06

KaiXia,RenyuanGao,Li...
Transformation of colitis and colorectal cancer: a tale of gut microbiota.
CRITICAL REVIEWS IN MICROBIOLOGY
肠道炎症改变宿主生理学,促进结肠癌(CRC)的发生,如溃疡性结肠炎相关的CRC所见。肠道微生物群对癌症进展至关重要,主要是通过诱导肠道慢性炎症微环境,导致DNA损伤、染色体突变和特定代谢物产生的改变。因此,对基于微生物群的预防和治疗策略,如益生菌、益生元、微生物群代谢物和粪菌移植越来越感兴趣。本综述旨在提供有关肠道微生物群与溃疡性结肠炎相关CRC之间潜在相关性及有希望的基于微生物群的溃疡性结肠炎相关CRC治疗策略的有价值见解。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Oct

MartinBeaumont,Corin...
Disruption of the primocolonizing microbiota alters epithelial homeostasis and imprints stem cells in the colon of neonatal piglets.
Epigenetics & Chromatin
肠道微生物群在肠道上皮的产后发育中起着关键作用。然而,驱动这些效应的原始定植菌群的细菌成员尚未被完全确定,其对上皮稳态的长期影响机制尚未被充分描述。在本研究中,我们使用了新生小猪模型,在出生后的第一周使用抗生素科利司汀进行治疗,以耗尽新生儿肠道微生物群中短暂优势的革兰阴性菌。科利司汀减少了新生儿结肠微生物群中的变形菌科和梭杆菌科,降低了细菌合成脂多糖(LPS)的能力,并增加了结肠中琥珀酸的浓度。科利司汀引起的原始定植微生物群的紊乱与结肠上皮基因表达的改变相关,包括调节样受体4(TLR4)和溶菌酶(LYZ)的降低。我们在猪结肠器官培养细胞单层中获得的数据表明,这些效应不是由琥珀酸或LPS水平的变化驱动,也不是由科利司汀对上皮细胞的直接作用驱动的。原始定植微生物群的紊乱导致结肠上皮干细胞的印记,因为与对照小猪相比,在经过多次通过后,来自科利司汀处理过的小猪结肠隐窝的器官样体中TLR4和LYZ的表达仍然较低。最后,结肠器官样体中LYZ的稳定印记与其转录起始位点处H3K4me3水平无关。总的来说,我们的结果表明,原始定植肠道微生物群的紊乱改变了结肠上皮的先天免疫力,并在干细胞上留下了印记,这可能对肠道健康产生长期影响。© 2023 The Authors. The FASEB Journal published by Wiley Periodicals LLC on behalf of Federation of American Societies for Experimental Biology.
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 06

RileyMHorvath,Zabrin...
CDK8 inhibitors antagonize HIV-1 reactivation and promote provirus latency in T cells.
Epigenetics & Chromatin
潜在的HIV-1激活子代表了对感染治愈的障碍,并且依赖于宿主RNA聚合酶(Pol)II机制进行重新出现。在这里,我们发现RNA Pol II介质激酶CDK8/19的抑制剂Senexin A和BRD6989抑制了激活剂和T细胞信号激动剂诱导的HIV-1表达。发现这些抑制剂阻碍了RNA Pol II对HIV-1 LTR的招募。此外,通过shRNA或基因敲除干扰CDK8后,多种激活潜伏病毒逆转剂引起的HIV-1表达受到了影响。然而,CDK8缺乏并未完全模拟CDK8/19激酶抑制,这表明介质激酶并非功能冗余。此外,对与HIV-1感染和接受抗逆转录病毒疗法的人类外周血单核细胞(CD4+)进行Senexin A处理,抑制了PMA和ionomycin引起的T细胞刺激对病毒复制的诱导。这些观察结果表明,介质激酶CDK8和CDK19在调控HIV-1转录中起着重要作用,并且这些酶的小分子抑制剂可能有助于推动持久性潜伏状态下病毒表达的疗法的发展。意义一种HIV-1感染的治愈将需要能够迫使含有病毒基因组拷贝插入细胞染色体但被关闭或沉默的细胞的新型疗法。这些称为潜伏感染细胞,它们是目前治疗HIV/艾滋病无法治愈感染的主要原因,因为这些细胞中的病毒不受目前药物的影响。我们的结果表明,Cdk8的化学抑制剂也抑制了潜伏的HIV亲病毒表达。Cdk8是一个重要的酶,它调节基因在细胞需要对信号作出反应时的表达,并由一个在癌症中经常发生突变的基因产生。我们的观察结果表明,Cdk8抑制剂可以用于新型治疗,以防止潜伏病毒的表达,最终可能使得感染者停止抗逆转录病毒药物治疗。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 08

DomenicoIuso,IsabelG...
Nucleoside diphosphate kinases 1 and 2 regulate a protective liver response to a high-fat diet.
Epigenetics & Chromatin
从乙酰辅酶A(AcCoA)合成脂肪酸在多种疾病(包括癌症)中发生了异常调节。本文报告核苷酸二磷酸激酶1和2号(NME1/2),这些参与核苷酸平衡的家庭酶最近被发现与辅酶A结合。我们展示NME1还与AcCoA结合,并且配体识别牵涉到CoA/AcCoA 3'磷酸依赖的独特结合方式。我们报告了Nme2基因敲除小鼠在高脂饮食下的过度三酰甘油合成和肝脏脂肪变性。在肝细胞中,NME2介导HFD所导致的基因转录反应,导致脂肪酸积累的抑制和保护基因表达计划的激活,通过靶向组蛋白乙酰化实现。我们的发现将NME1/2与HFD防护性肝脏应答的表观遗传调控联系起来,并暗示其在控制组蛋白乙酰化和脂肪酸合成之间的竞争性AcCoA使用中可能发挥潜在作用。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023

Margaret-AnnTait,Dan...
Health-related quality of life in patients accessing medicinal cannabis in Australia: The QUEST initiative results of a 3-month follow-up observational study.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
澳大利亚的医师为对常规治疗无效的慢性疾病患者提供了使用草药大麻(MC)的处方。我们旨在评估大量使用药物大麻的患者的整体健康相关的生活质量(HRQL)、疼痛、疲劳、睡眠、焦虑和抑郁。我们假设所有患者报告的结果(PROs)在基线和三个月后都会有所改善。QUEST倡议自2020年11月至2021年12月之间进行,是一个涉及多个中心的大规模前瞻性研究,对象为新近使用药物大麻的患有任何慢性疾病的患者。在澳大利亚的六个州的120名医师所在医疗中心中确定了符合条件的患者。同意参与的患者完成了EuroQol Group EQ-5D-5L健康状态问卷;欧洲研究与治疗癌症质量生活问卷(QLQ-C30);疲劳和睡眠紊乱的患者报告结果测量信息系统(PROMIS)简表;抑郁焦虑应激量表(DASS-21),分别在开始治疗前、2周渐增剂量以及随后的每个月进行为期3个月的随访调研。在2762名同意参与的患者中,2327名完成了基线和至少一个随访问卷。年龄范围在18-97岁之间(平均51岁;标准差=15.4),62.8%为女性。最常进行治疗的疾病为慢性疼痛(n=1598/2327;68.7%)、失眠(n=534/2327;22.9%)、广泛性焦虑(n=508/2327;21.5%)以及混合性焦虑与抑郁(n=259/2327;11%)。整个队列中,EQ-5D-5L效用分数和QLQ-C30摘要分数显示了HRQL从基线到随访的临床意义上的改善,d=0.54(95%CI:0.47至0.59)和d = 0.64(95%CI:0.58 to.70)对应地,疲劳也有临床意义上的改善(d = 0.54; 95%CI:0.48 to 0.59)。对于慢性疼痛的患者,疼痛有临床意义上的减轻(d = 0.65; 95%CI:0.57至0.72)。对于中度至极度严重的焦虑(X2 = 383;df = 4;p <0.001)和抑郁(X2 = 395;df = 4;p <0.001)均有显著改善,而睡眠障碍则没有变化。我们观察到,患有慢性疾病的患者在前3个月使用药物大麻后,整体HRQL和疲劳都有统计学上显著且临床上有意义的改善。焦虑、抑郁和疼痛也有所改善,特别是对于具有相应健康问题的患者。研究将继续对患者进行长达12个月的随访,以确定PROs的改善是否能够长期维持。研究注册-澳大利亚新西兰临床试验注册:ACTRN12621000063819. https://www.australianclinicaltrials.gov.au/anzctr/trial/ACTRN12621000063819.版权:©2023 Tait等。本文采用知识共享署名许可协议进行开放获取,允许任何媒介以任何方式使用、分发和再生产,前提是原始作者和出处得到适当的署名。
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