研究动态
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Protein & Cell
2023 Sep 06
BudhadevBaral,Meenak...
Helicobacter pylori and Epstein-Barr virus infection in cell polarity alterations.
Protein & Cell
细胞质内细胞器的不对称分布由一组细胞极性蛋白质维持。维持极性是机体抵御病原体的重要防御机制之一,其丧失导致感染易化和癌症进展。研究表明,病毒和细菌感染可改变细胞极性。幽门螺杆菌和Epstein-Barr病毒是I类致癌物,除了胃癌和Burkitt淋巴瘤外,它们还与其他多种临床疾病的进展有关。此外,这两种病原体的共感染导致一种高度侵袭性的胃癌形式。幽门螺杆菌和EBV靶向宿主细胞的极性复合物进行致病。幽门螺杆菌相关蛋白质,如CagA、VacA OipA和尿素酶,通过改变细胞极性来破坏细胞的稳态。同样,EBV相关的基因LMP1、LMP2A、LMP2B、EBNA3C和EBNA1也导致细胞不对称。本综述总结了H. pylori和EBV感染上皮细胞中参与细胞极性形态变化的所有可能机制。我们还讨论了在H. pylori、EBV及其共感染中调节上皮细胞中PAR、SCRIB或CRB极性复合物的异常分子途径,如NF-κB、TGF-β/SMAD和β-连环蛋白。© 2023. 捷克共和国科学院微生物研究所,自然科学研究院。
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Protein & Cell
2023 Sep 06
MengGao,WeiboLiu,Ten...
Identifying Genetic Signatures Associated with Oncogene-Induced Replication Stress in Osteosarcoma and Screening for Potential Targeted Drugs.
Protein & Cell
骨肉瘤是最常见的原发性恶性骨肿瘤。由于化疗药物对肿瘤细胞的选择性和敏感性不足,加上使用大剂量药物,化疗药物常常具有全身性毒性。利用现代测序技术筛选大量肿瘤样本中的肿瘤标志物是筛选高度特异和选择性抗肿瘤药物的常用方法。本研究旨在利用最新报告的肿瘤源性癌基因诱导的复制应激(ORS)基因表达特征,识别潜在的生物标志物,并在不同的药物数据库中筛选潜在的抗骨肉瘤药物。在本研究中,我们在TARGET数据库中获得了89个与骨肉瘤相关的样本,所有样本均包括生存信息。根据六个已报告的ORS基因标记(NAT10/DDX27/ZNF48/C8ORF33/MOCS3/MPP6)的中位表达水平,我们将89个骨肉瘤基因表达数据集分为高表达组和低表达组,然后进行差异表达基因(DEG)分析。六组差异表达基因的共存基因被用作骨肉瘤的复制应激相关基因(RSGs)。然后,使用LASSO回归、Cox风险比例回归预测模型和十折交叉验证测试筛选关键的RSGs。从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中收集的GSE21257数据集用于验证预测模型。最终选定的关键RSGs用于在L1000PWD和DGIdb数据库中挖掘潜在药物。在经过预测模型的进一步验证后,我们确定了与骨肉瘤中的ORS有关的七个基因作为关键的RSGs,包括转录因子7类似2(TCF7L2),溶质载体家族27成员4(SLC27A4),前蛋白酶酶/切割酶5(PCSK5),核仁蛋白6(NOL6),螺旋螺旋螺旋螺旋结构域蛋白4(CHCHD4),真核生物翻译起始因子3亚单位B(EIF3B)和细胞色素C氧化酶1的合成(SCO1)。然后,我们在两个药物数据库中筛选了这七个关键的RSGs,并发现了六种潜在的抗骨肉瘤药物(DGIdb数据库:雷帕格列奈、他克莫司、雷帕霉素、环孢素和氢氯噻嗪;L1000PWD数据库:小分子VU-0365117-1)。七个RSGs (TCF7L2, SLC27A4, PCSK5, NOL6, CHCHD4, EIF3B, 和SCO1) 可能与骨肉瘤中的ORS基因特征相关。雷帕格列奈、他克莫司、雷帕霉素、环孢素、氢氯噻嗪和小分子VU-0365117-1是骨肉瘤的潜在治疗药物。© 2023. The Author(s), under exclusive licence to Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature.
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Protein & Cell
2023 Sep 06
ChristinCarter-Su,La...
2022 Cannon Lecture: An ode to signal transduction - how the growth hormone pathway revealed insight into height, malignancy and obesity.
Protein & Cell
沃尔特·坎农是一位备受尊敬的美国神经学家和生理学家,具有非常广泛的兴趣。以坎农及其广泛兴趣为传统,我们讨论了我们实验室在信号转导方面多方面的工作,涵盖了过去40多年。我们展示了我们对血液中生长激素(GH)如何与身体各部分的细胞进行通信以促进身体生长和调节身体新陈代谢的问题的质疑,从而不仅对身高有了认识,还对恶性肿瘤和体重的重要调节因子有了了解。亮点包括:1)GH信号传导的关键初始步骤是GH激活GH受体相关的酪氨酸激酶JAK2;2)GH激活JAK2导致一系列信号传导蛋白的激活,包括STAT转录因子;3)JAK2在多个酪氨酸上自磷酸化,调节JAK2的活性并招募信号传导蛋白到GH/GH受体/JAK2复合物中;4)活化的STAT蛋白与癌症相关;5)GH激活JAK2招募适配蛋白SH2B1到GH/GH受体/JAK2复合物中,在其中促进GH对肌动蛋白细胞骨架和运动性的调节;6)SH2B1被招募到大脑中的其他受体中,在其中增强饱腹感,很可能部分通过调节瘦素作用和调节食欲调节神经元的连接来实现。这些发现增加了我们对GH功能的理解,也为某些癌症和肥胖个体的治疗干预提供了依据,从而加强了支持基础研究的重要性,因为人们事先无法预知它可以提供什么重要的见解。
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Cancer Discovery
2023 Sep 06
JasmineTPlummer,Soph...
Challenges and Opportunities in Building a Global Representative Single-Cell and Spatial Atlas in Cancer.
Cancer Discovery
癌症健康差异具有复杂性,是一系列需要考虑的因素,必须在所有研究人员中包括我们的规划、实施和执行中予以考虑,特别是在单细胞和空间技术方面,这些技术在低收入和中等收入国家的普及上面临更大的负担。本评论旨在探讨这些技术在创建多样化、代表性的癌症图谱方面面临的障碍,并呼吁制定一项面向全球各人群包容性的战略计划。©2023美国癌症研究协会。
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Cancer Discovery
2023 Sep 06
ElizabethIHarper,Ash...
A Wrinkle in TIME: How Changes in the Aging ECM Drive the Remodeling of the Tumor Immune Microenvironment.
Cancer Discovery
癌症是与年龄相关的疾病,大多数患者在60岁后被诊断,并且大多数癌症死亡发生在这个年龄之后。肿瘤微环境随年龄而变化,进而影响癌症的进展和治疗效果。过去几十年来,微环境中个别成分的年龄相关变化受到了应有的注意,但两个或更多微环境成分之间衰老的效应却鲜为人知。在这个视角中,我们讨论了衰老的细胞外基质和衰老的免疫系统之间的关系,以及它们如何影响肿瘤微环境,以及这些多学科研究如何为新的治疗方法开辟通路。癌症是一种与年龄有关的疾病。随着人口老龄化的迅速发展,我们需要更好地了解推动肿瘤发展的与年龄相关的变化,从分泌性变化到生物物理和免疫变化。©2023美国癌症研究协会。
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Cell Death & Disease
2023
Chian-WeiChen,Chien-...
Low neutrophil-to-lymphocyte ratio predicts overall survival benefit in advanced NSCLC patients with low PD-L1 expression and receiving chemoimmunotherapy.
Cell Death & Disease
尽管包括化疗和免疫检查点抑制剂(ICIs)在内的联合治疗改善了非小细胞肺癌(NSCLC)患者的总生存率(OS),但不良事件和治疗中断的发生率更高。由于程序化死亡配体-1(PD-L1)不能作为预测性生物标志物,我们调查了中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)作为预测性生物标志物。在我们先前的研究中,我们证明了在高PD-L1表达(>50%)的患者接受化疗免疫联合治疗而不是单独免疫治疗时,低NLR可以预测生存益处。在这个当前的研究中,我们的目标是评估这种预测能力在低PD-L1表达(<50%)患者中的作用。共有142名患者入组,其中28名接受联合治疗,114名接受单独化疗。使用Kaplan-Meier法估计无进展生存(PFS)和OS,并使用log-rank检验进行比较。接受联合治疗的患者的PFS和OS明显优于接受单药治疗的患者。在低NLR亚组中,接受联合治疗的患者表现出具有临床意义的延长PFS和OS,这也得到了多变量Cox回归分析的验证。我们的研究展示了在NSCLC晚期患者中,当低PD-L1表达时,NLR作为生物标志物用于预测联合化疗和ICIs治疗的生存益处的潜力。Copyright © 2023 Chen, Lin, Tsai, Lin, Chang, Yen, Tseng, Su and Lin.
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Cell Death & Disease
2023
YiZhang,YuzhiWang,Ji...
A programmed cell death-related model based on machine learning for predicting prognosis and immunotherapy responses in patients with lung adenocarcinoma.
Cell Death & Disease
肺腺癌(LUAD)仍是最常见和致命的恶性肿瘤之一,预后不良。程序化细胞死亡(PCD)是一种在进化中保守的细胞自杀过程,调控肿瘤发生、发展和转移。然而,目前对于PCD在LUAD中的作用的综合分析还不可用。我们对LUAD中与PCD相关基因(PCDRGs)进行了多组学变异的分析。我们使用10种机器学习算法(101种组合)进行交叉验证,通过PCDRGs的表达谱合成开发和验证一种最优的细胞死亡评分(CDS)模型。患者根据其中位数CDS值被分为高和低CDS组。接下来,我们比较了两组患者的基因组学、生物功能和肿瘤微环境的差异。此外,我们评估了CDS对免疫治疗队列患者的治疗反应的预测能力。最后,对CDS中的关键基因进行了功能验证。 我们基于四个PCDRGs构建了CDS,可以有效而一致地分层LUAD患者(高CDS的患者预后不良)。我们的CDS表现优于之前发表的77个LUAD特征。结果显示高CDS的患者观察到显著的遗传变异,如突变计数、TMB和CNV。此外,我们观察到CDS与免疫细胞浸润、微卫星不稳定性、SNV新抗原的关联。低CDS患者的免疫状态更活跃。此外,CDS可以可靠地预测多个免疫治疗队列中的治疗反应。体外实验证明,LUAD细胞中高DNA损伤诱导转录因子4(DDIT4)表达介导了促肿瘤效应。 使用机器学习基于PCDRGs构建了CDS。该模型可以准确预测患者的预后和对治疗的反应。这些结果为临床管理提供了新的有前景的工具,并有助于设计LUAD患者的个体化治疗策略。 版权所有 © 2023 张、王、陈、夏和黄。
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Cell Death & Disease
2023
AntonioVelez,AndrewD...
Cryoablation and immunity in non-small cell lung cancer: a new era of cryo-immunotherapy.
Cell Death & Disease
尽管在过去的十年中,在肺癌的肿瘤反应和患者存活方面取得了显著进展,但整体免疫治疗对肺癌的疗效仅能在大约一半的患者中产生明确的反应。基于这个限制,正在研究组合策略以提高治疗反应率。冷冻消融已被提出作为一种诱导免疫细胞死亡并与免疫检查点抑制剂等全身免疫治疗产生协同效应的技术之一。冷冻消融传统上是通过穿刺引导进行,然而最近的技术进展允许通过支气管镜传递。在本文中,我们回顾了冷冻消融在非小细胞肺癌中的临床前和临床证据,并探讨其潜在抗肿瘤免疫作用。我们重点介绍了涉及该方法的正在进行的研究,并提出了未来研究的方向。© 2023 Velez, DeMaio和Sterman的版权所有。
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Cell Death & Disease
2023
MichaelIKoukourakis,...
Circulating Plasma Cell-free DNA (cfDNA) as a Predictive Biomarker for Radiotherapy: Results from a Prospective Trial in Head and Neck Cancer.
Cell Death & Disease
癌症患者的细胞游离DNA(cfDNA)浆液水平因快速癌细胞增殖和死亡而增加。因此,cfDNA可用于研究特定的肿瘤-DNA特征。此外,非特异性的cfDNA浓度可能是癌症预后的重要生物标志物。我们前瞻性地研究了cfDNA水平和动力学在47例局部晚期鳞状细胞头颈癌(SCHNC)接受确定性化疗放疗(CRT)治疗的患者队列中的预测作用。治疗完成后(治疗前/后比率;A/B比率>1),26/47例患者(55.3%)发现cfDNA水平升高。T4期局部晚期与CRT后cfDNA水平显著相关(T4期为3.3ng/μl,T1-3期为1.3ng/μl,p=0.007)。对CRT有反应(部分/完全反应)的患者治疗前cfDNA水平显著较低(平均值1.2ng/μl vs. 2.7ng/μl,p=0.03)。A/B比率>1的患者局部区域进展无进展生存率显著较差(p=0.01;风险比3.5,95%CI=1.2-9.7)。这在多变量分析中也得到证实,其中A/B比率是局部复发的独立预测变量(p=0.03,风险比3.9,95%CI=1.2-13)。CRT后cfDNA水平升高可能是将SCHNC患者立即纳入巩固化疗免疫疗法方案的早期生物标志物。 版权所有©2023,国际抗癌研究所。
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Cell Death & Disease
2023 Sep 06
AsalGolchin,Masoumeh...
Autophagy-targeted nanoparticles in breast carcinoma: A systematic review.
Cell Death & Disease
乳腺癌是一种广为人知的癌症类型,也是女性癌症死亡的主要原因。癌症治疗中一个未解决的问题是肿瘤对现有治疗方法产生的抗药性增加,这是凋亡缺陷的直接结果。寻找细胞死亡的替代方式(自噬)可能是最大限度地促进癌细胞死亡的最终解决方案。本研究的目标是调查自由纳米颗粒(非药物负载)在自噬的诱导或抑制能力,并考虑其对治疗过程的影响。当符合纳入标准的研究满足条件时,所有相关文章的全文将被仔细检查和分类。在分析中,包括对MCF-7、MDA-MB-231、MDA-MB-231-TXSA、MDA-MB-468、SUM1315和4T1细胞系进行的25篇文章进行了研究。其中20项体外研究和5项体内/体外研究应用了5种不同的自噬测试方法:吖啶橙、蛋白免疫印迹、Cyto-ID自噬检测试剂盒、共聚焦显微镜和定量聚合酶链反应。这些文章中所包含的基本形式的纳米颗粒(NPs),包括Ag、Au、Y2 O3、Se、ZnO、CuO、Al、Fe、五氧化二钒和脂质体。研究中观察到纳米颗粒与自噬相关的三种行为:诱导、抑制和无作用。筛选和呈现的数据表明,在本次系统综述中涉及的大多数自由纳米颗粒(金属性纳米颗粒)具有氧化应激途径介导的自噬诱导作用(36%)。此外,仅有四项研究提到了PI3K/Akt/mTOR和MAPK/ERK信号通路(16%)。令人印象深刻的是,31%的研究没有检查与纳米颗粒相关的自噬途径。© 2023国际细胞生物学联合会。
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