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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 06

SeungyeonRyu,So-Hyun...
Impact of media compositions and culture systems on the immunophenotypes of patient-derived breast cancer cells.
Stem Cell Research & Therapy
异质性肿瘤细胞被认为是雌激素受体阳性(ER+)癌症内分泌治疗失败的显著因素。培养患者来源的乳腺癌细胞(PDBCCs)为癌细胞的异质性提供了一种宝贵的体外和转化研究工具。本研究旨在探究不同培养基成分和培养方法对ER+ PDBCCs中BCSC相关免疫表型和基因表达的影响。本研究纳入了10例ER+乳腺癌患者,其中6例进行了新辅助化疗,4例未进行。使用胶原I和透明质酸酶的酶法分离PDBCCs。将PDBCCs作为单层培养和悬浮状态下的多细胞球体培养。分别使用涂有胶原I的培养皿和涂有聚合物X的超低附着力培养皿进行单层培养和球体培养。采用流式细胞术、免疫荧光染色、RT-PCR和RNA测序方法检测PDBCCs的免疫表型和基因组信息。在经3-4次亚培养后,超过95%的PDBCCs在单层条件下保持EpCAM高/+/成纤维细胞标记-表型。A83-01的去除导致具有较高β-半乳糖苷酶活性的细胞衰老。单层培养的PDBCCs以大多数细胞具有EpCAM+/CD49f+表型为特征。与单层培养中的全培养基相比,去除EGF会增加EpCAM+/CD49f-表型(增加13.8倍,p=0.028),而去除R-spondin会减少其表型(减少0.8倍,p=0.02)。去除A83-01会增加EpCAM+/CD24+表型(增加1.82倍,p=0.023),减少EpCAM低/-/CD44+/CD24-表型(减少0.45倍,p=0.026)。与单层培养相比,球体培养会导致EpCAM-/CD49+(增加14.6倍,p=0.006),EpCAM低/-/CD44+/CD24-表型(增加4.16倍,p=0.022)和ALDH高活性(增加9.66倍,p=0.037)的细胞亚群增加。ALDH1A和EMT相关基因被上调。通过spheroid和monolayer的RNA测序分析,鉴定出了561个差异表达基因(2倍改变,p<0.05),富集在27条KEGG信号通路中,包括调节干细胞多能性的信号通路。根据Kaplan-Meier Plotter数据库中spheroid中鉴定的上调和下调基因对复发无病生存的分析结果,发现15个上调和14个下调基因与乳腺癌患者预后不良有关。媒体成分和球体培养方法的改变会改变PDBCCs的BCSCs和EMT标记物,这意味着在体外研究PDBCCs时定义媒体成分和培养方法的重要性。©2023. BioMed Central Ltd., Springer Nature成员.
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 03

BoyuDu,RuihongYu,Xia...
The function of MSP-activated γδT cells in hepatocellular carcinoma.
Stem Cell Research & Therapy
免疫治疗策略针对γδT细胞的靶向已被认为是肝细胞癌(HCC)的一种有希望的治疗方法。迄今为止,尚未确定γδT细胞识别的特定抗原或抗原表位,限制了它们在HCC治疗领域的应用。我们先前采用一个已建立的筛选策略确定了一种被γδT细胞识别的新型HCC蛋白抗原MSP。本研究探讨了MSP激活的γδT细胞在HCC中的功能。结果表明,HCC患者外周血γδT细胞的比例和血清中的IFN-γ水平均高于健康对照组。我们还确定了γδT细胞能与MSP蛋白结合。MSP激活的γδT细胞显示具有特定的CDR3δ2序列,支持γδT细胞对MSP的识别。我们确定MSP在HCC中高度表达,HCC患者外周血中的MSP激活γδT细胞表达共刺激分子,并且MSP激活的γδT细胞能直接杀伤HCC细胞。综上所述,我们证明了新蛋白配体MSP激活了γδT细胞,并通过直接和间接机制导致了对HCC细胞的杀伤。这些发现可为HCC的临床诊断和治疗提供潜在的新靶点,并为HCC的临床治疗策略奠定基础。Copyright © 2023 Elsevier B.V. All rights reserved.
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Sep 01

DebinCheng,ZhaoZhang...
Deciphering the heterogeneity and immunosuppressive function of regulatory T cells in osteosarcoma using single-cell RNA transcriptome.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
成骨肉瘤(OS)是一种高度侵袭性且预后不良的恶性肿瘤。肿瘤微环境(TME)在OS的发生和发展中起着重要作用。调节性T细胞(Tregs)已知可促进免疫抑制、肿瘤进展、侵袭和转移。然而,Tregs在OS的TME中的作用尚不清楚。本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据鉴定了OS TME中的Tregs和其他各类细胞群集。采用基因集变异分析(GSVA)来研究OS和相邻组织中Tregs的信号通路。使用CellChat和iTalk软件包来分析细胞间通讯。此外,我们基于TARGET数据库的批量RNA-seq建立了一个基于Tregs特异基因的预后模型,并使用Gene Expression Omnibus数据集进行验证。利用pRRophetic软件包预测药物敏感性。免疫组化用于验证OS中候选基因的表达。基于以上方法,我们发现OS样本有较高的Tregs浸润。GSVA揭示了与OS中Tregs相关的氧化磷酸化、血管生成和哺乳动物雷帕霉素复合物1(mTORC1)通路显著活化。通过细胞间通讯分析,我们发现Tregs通过C-X-C模体化学因子配体(CXCL)信号与成骨细胞、内皮细胞和髓样细胞相互作用;尤其是,它们通过CXCL12/转化生长因子β1(TGFB1)强烈影响C-X-C模体化学因子受体4(CXCR4)的表达,并通过CXCL12/TGFB1与其他细胞群集相互作用,从而共同促进肿瘤生长和进展。随后,通过单变量、最小绝对收缩和选择算子回归(LASSO)和多变量分析筛选出两个Tregs特异基因(CD320和MAF),构建了一个预后模型,该模型在两个独立队列中显示出良好的预后准确性。此外,药物敏感性分析表明,高Tregs风险的OS患者对舒尼替尼、索拉非尼和阿昔替尼敏感。我们还通过免疫组化验证了CD320和MAF在OS组织中与相邻组织相比显著上调。总的来说,本研究揭示了OS TME中Tregs的异质性,为该癌症的侵袭和治疗提供了新的见解。Copyright © 2023 The Authors. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.
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JCI Insight
2023 Sep 05

BrendanLHorton,Alici...
Overcoming lung cancer immunotherapy resistance by combining non-toxic variants of IL-12 and IL-2.
JCI Insight
在癌症免疫治疗领域,经过工程改造的基于细胞因子的方法即将进入临床试验阶段,其中IL-12处于前沿。然而,对于细胞因子治疗的潜在耐药机制了解甚少。我们发现,原位移植的小鼠肺肿瘤对系统性给予的小鼠血清白蛋白(IL12-MSA)融合IL-12抗体疗法具有耐药性,原因是肿瘤反应性CD8+T细胞的IL-12R表达较低。IL2-MSA增加了肿瘤反应性CD8+T细胞对IL12-MSA的结合,同时给予IL12-MSA和IL2-MSA联合治疗,导致肺肿瘤反应性CD8+T细胞效应分化增强、肿瘤内CD4+调节性T细胞数量减少和肺肿瘤患者存活时间延长。可预见的是,治疗剂量下的IL-2和IL-12联合会引起显著的剂量限制性毒性反应。给予与IL12rb1和CD25表达阳性细胞优先结合的IL-12和IL-2类似物,可显著延长肺肿瘤小鼠的存活时间,同时消除剂量限制性毒性反应。这些发现表明,IL-12和IL-2的联合细胞因子疗法是一种合理的方法,其剂量限制性毒性可以通过工程改造的细胞因子变体来克服。
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JCI Insight
2023 Sep 05

AlyxzandriaMGaydosik...
The mycosis fungoides cutaneous microenvironment shapes dysfunctional cell trafficking, anti-tumor immunity, matrix interactions and angiogenesis.
JCI Insight
在蕈样肉芽肿病(MF)中,恶性T淋巴细胞的增殖主要限制在皮肤中,这意味着恶性细胞对其特定的皮肤肿瘤微环境(TME)具有依赖性,包括与非恶性免疫和基质细胞、细胞因子和其他免疫调节因子的相互作用。为了探索这些相互作用,我们通过单细胞RNA测序对MF皮肤肿瘤的TME进行了全面的转录组分析。我们的分析确定了MF TME中细胞类型组成、细胞功能和细胞间相互作用,这些与健康皮肤和良性皮肤病的差异明显。尽管基因表达模式在患者样本之间是共同的,但在免疫和基质细胞中也观察到高水平的转录多样性,并且这些细胞与恶性T淋巴细胞之间存在着动态的相互作用和相互调控。这种异质性与细胞运输、基质相互作用、血管生成、免疫功能和代谢等过程有关,这些过程影响着癌细胞的生长、迁移和侵袭,以及抗肿瘤免疫。通过全面描述MF肿瘤中切皮环境中免疫和基质细胞的转录组,我们已经确定了所有肿瘤共同的功能失调模式,这些模式是寻找具有治疗潜力的候选物以及个体化疾病管理的重要资源。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 05

ShiyuanZhang,XiaoYu,...
Clinicopathological characteristics of breast cancer patients with HER-2 low expression received neoadjuvant therapy.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
近年来,人类表皮生长因子受体-2(HER2)低表达的乳腺恶性肿瘤已成为研究的热点,但HER-2低表达是否代表了乳腺癌的一种特殊亚型仍不清楚。然而,这种分子类型在新辅助治疗阶段需要更有效的治疗方案。本研究纳入自2011年10月至2019年5月在哈尔滨医科大学肿瘤医院接受新辅助治疗的乳腺癌患者,为单中心回顾性研究。共纳入1053例接受术前治疗的乳腺癌患者,其中包括279例(26%)HER-2低表达患者。HER-2低表达组中50岁以下的患者比例高于其他两种分子亚型组(p=0.047,62.0% vs. 57.2%和52.5%),Ki67指数超过15%的患者的比例低于HER-2阴性和HER-2阳性患者(p<0.001,50.2% vs. 63.6%和71.5%)。大多数HER-2低表达患者为激素受体(HR)阳性(p<0.001,85.7% vs. 60.4%和36.0%),其在新辅助治疗后的病理完全缓解(pCR)率显著低于HER-2阴性和HER-2阳性患者(p<0.001,5.7% vs. 11.8%和20.5%)。亚组分析结果显示,HER-2低表达的HR阳性患者与HER-2阳性患者相比,具有较低的pCR率(p<0.001,4.6% vs. 14.6%)和客观反应率(ORR)(p=0.001,77.8% vs. 91.0%),而与HER-2阴性患者相比,在这些率上没有显著差异。HER-2低、HER-2阴性和HER-2阳性患者在至多67个月(中位随访时间)的总生存率(OS)和无病生存率(DFS)方面没有显著差异。Cox比例风险模型的结果显示Ki67指数和T分期(T3)是DFS的独立影响因素。在OS方面,Ki67指数,P53,T分期和客观反应(OR)是HER-2低表达患者OS的独立影响因素。总的来说,需要进一步的研究来确认HER-2低表达是一种特殊的乳腺癌分子亚型。HER-2低表达患者在新辅助治疗中的疗效相对较差,而新辅助治疗的疗效可以预测HER-2低表达患者的预后。由S. Karger AG, Basel出版。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 05

CuyanDemirkesen,Ayça...
Cutaneous rhabdomyosarcoma with FUS::TFCP2 fusion: A case report emphasizing early detection.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
伴有TFCP2重排的横纹肌肉瘤是一种近期被确认的恶性肿瘤,其免疫组化证据表明存在横纹肌样分化、角蛋白表达、ALK上调和临床病情恶化等特征。该肿瘤有影响颅颌骨的倾向,仅有少数报道其在骨外的肿瘤例子。本文中,我们提出了一个35岁女性患者的皮肤横纹肌肉瘤病例,其中具有FUS::TFCP2融合。值得注意的是,该肿瘤呈现出一种病理学谱系,初始时呈现为硬化性皮炎相似,但在8个月内逐渐进展为高级别恶性肿瘤。这种肿瘤的独特免疫表型突出了早期分子研究对于诊断的重要性,即使在低级别的细胞形态学出现时也是如此。早期发现可能为肿瘤变得无法切除之前提供时机。© 2023 John Wiley & Sons A/S. Published by John Wiley & Sons Ltd.
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 05

MengmengLiu,XuguangZ...
HPV prevalence and genotype distribution among 38 056 women in Weifang, China: a cross-sectional study.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
人类乳头瘤病毒(HPV)感染与宫颈癌密切相关,尤其是高风险HPV(HR-HPV)基因型的持续感染。因此,对大规模人群进行HPV感染率、年龄特定性、基因型分布以及COVID-19大流行对其影响的调查对HPV筛查和优化疫苗接种至关重要。本研究为横断面研究。我们收集了2018年1月至2022年12月威海市的38056份宫颈上皮细胞标本。根据参与者年龄将研究分为7个年龄组。我们使用一种商业试剂盒进行HPV基因型检测,该试剂盒设计用于检测23种HPV基因型。共有8998名女性感染HPV,总体阳性率为23.64%(8998/38056)。不同年龄组中单一型HPV感染占主导地位,占总感染数的71.33%。最常见的基因型是HR-HPV 16(4.33%),其次是52、58、53和68。在6个低风险HPV基因型中,低风险HPV 42显示了最高的流行率(2.19%),这是一个新的发现。不同年龄组间的流行性差异显著(p<0.01),25岁以下年龄组的感染率最高。在为期3年的COVID-19爆发期间,2020年、2021年和2022年收到的HPV样本数量分别减少了24.03%、14.79%和24.76%。在2018年至2022年期间,年患病率在21.09%至25.30%之间波动,呈下降趋势,而HR-HPV 39、56、31和LR-HPV 42的患病率却上升。本研究表明,该地区存在高HPV感染率和年龄特定性分布特征,以及COVID-19爆发对HPV患病率的影响分析,为该地区控制和预防HPV感染提供了流行病学依据。© 作者(或其雇主)2023年。根据CC BY-NC许可进行再利用。不允许商业再利用。BMJ出版。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 05

SabrinaSchütz,Lloren...
Functionally distinct cancer-associated fibroblast subpopulations establish a tumor promoting environment in squamous cell carcinoma.
Epigenetics & Chromatin
鳞状细胞皮肤癌(cSCC)由于其高发病率和转移潜力而成为一个严重的公共卫生问题。它可能由光化性角化病变(AK)或原位癌基文氏病(AD)逐渐发展而来。在这个发展过程中,恶性角质形成细胞将皮肤深层成纤维细胞激活为促肿瘤的癌相关纤维细胞(CAFs),它们的起源和形成仍然大部分是未知的。在这里,我们生成并分析了来自健康皮肤、基文氏病和鳞状细胞皮肤癌的男性供体的115,000多个单细胞转录组。我们的结果揭示了免疫调节和基质重塑的CAFs亚型,可能来源于促炎性和间充质的成纤维细胞。这些CAFs亚型在光化性角化病变中很少见,并与不同的细胞类型相互作用,建立了一个促肿瘤的微环境。这些发现是鳞状细胞皮肤癌特异的,在基底细胞癌中无法复制。我们的研究为皮肤深层CAF的潜在起源和功能提供了重要的见解,这对于特定靶向cSCC微环境将非常有益。©2023. Springer Nature Limited.
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 05

XiuchuanLucasHu,Wenf...
Aryl hydrocarbon receptor utilises cellular zinc signals to maintain the gut epithelial barrier.
Epigenetics & Chromatin
锌和植物源芳香烃受体(aryl hydrocarbon receptor, AHR)的配体是影响肠上皮屏障功能的膳食组分。在这里,我们探索锌和AHR途径是否相关。我们展示了在小鼠模型中使用AHR配体前补充膳食可以保护免受炎症性肠病的影响,但在缺乏AHR的肠上皮细胞的小鼠中无效。在摄入缺锌膳食的小鼠中,AHR激动剂治疗也失效。在人类回肠器官结构和Caco-2细胞中,AHR的激活通过转录锌导入基因增加了细胞内总锌和胞浆游离Zn2+浓度。通过锌抑制核因子kappa-轻链增强子和钙蛋白酶活性,紧密连接蛋白得到上调。我们的数据表明,由植物源膳食配体激活的AHR通过锌依赖性细胞途径至少部分改善肠道屏障功能,提示联合膳食补充AHR配体和锌可能在预防炎症性肠道疾病中具有效果。© 2023. Springer Nature Limited.
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