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CANCER RESEARCH
2023 Sep 05

JingShi,TaoJiao,Qian...
A cell surface-binding antibody atlas nominates a MUC18-directed antibody-drug conjugate for targeting melanoma.
CANCER RESEARCH
近年来,靶向治疗和免疫治疗显著改善了黑色素瘤的治疗效果。然而,对于无反应或治疗复发的黑色素瘤患者仍然需要治疗策略。为了发现适用于黑色素瘤的抗体药物偶联物(ADC)可控制的细胞表面靶点,我们利用全蛋白组规模的抗体阵列平台(PETAL)开发了黑色素瘤细胞表面结合抗体(pAbs)的图谱。通过对pAbs的靶点鉴定,我们开发了针对LGR6、TRPM1、ASAP1和MUC18等靶点的黑色素瘤细胞杀伤ADC。在各种黑色素瘤亚型的肿瘤细胞和肿瘤浸润血管中,MUC18过度表达,使其成为潜在的双子房和普遍的黑色素瘤治疗靶点。基于拓扑异构酶I抑制剂exatecan和自解脱的T基团,MUC18指向的ADC AMT-253相比微管抑制剂基础的对比物具有更高的治疗指数,并且在猴子中具有良好的药代动力学和耐受性。AMT-253通过DNA损伤和凋亡表现出MUC18特异性细胞毒性和强大的旁观者杀伤效应,在黑色素瘤细胞系和患者衍生的异种移植模型中表现出强效的抗肿瘤活性。通过小鼠MUC18特异性抗体-T1000-exatecan偶联物靶向肿瘤血管抑制了人黑色素瘤异种移植瘤的生长。AMT-253与抗血管生成剂的联合治疗在腔上黑色素瘤模型中产生了比单一药物更高的疗效。除了黑色素瘤,AMT-253在广泛表达MUC18的实体肿瘤中也具有疗效。这里展示的T基团-exatecan连接剂有效的靶点/抗体发现,可能有助于发现新的ADC,改善癌症治疗。
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CANCER RESEARCH
2023 Sep 05

InodeBruijn,RitikaKu...
Analysis and Visualization of Longitudinal Genomic and Clinical Data from the AACR Project GENIE Biopharma Collaborative in cBioPortal.
CANCER RESEARCH
国际癌症登记处提供了真实世界的基因组和临床数据,但其共同分析仍然具有挑战性。AACR GENIE项目是一个国际性的癌症登记处,收集来自19个癌症中心的数据,并通过cBioPortal for Cancer Genomics(https://genie.cbioportal.org)向公众提供逾13万名患者的数据。对于2.5万名患者,AACR GENIE生物制药合作专案团队还使用PRISSMM数据整理模型收集了额外的真实世界纵向临床数据,包括治疗和结果数据。这些案例中的数千个现在也可在cBioPortal中获取。我们显著增强了cBioPortal的功能,以支持对这一丰富的临床与基因组相关数据的可视化和分析,以及其他中心和合作专案生成的数据集。这些增强功能的例子包括:1)在患者层面可视化纵向临床和基因组数据,包括诊断、治疗和结果的时间轴,2)能够根据治疗状态选择样本,便于对特定治疗前后的分子和临床特征进行比较,以及3)基于个体治疗方案的生存分析估计。综合起来,这些功能为cBioPortal用户提供了一个交互式工具包,可研究复杂的临床与基因组数据,以生成关于特定基因组变异对癌症预后和治疗敏感性的影响的假设并进行发现。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2023 Sep 04

RuiFan,XiangwenJi,Ji...
Defining the single base importance of human mRNAs and lncRNAs.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
作为基因和其转录本的基本单位,核苷酸对基因功能和进化、以及表型和疾病产生巨大影响。为了确定一个特定基因的关键核苷酸,定量测量每个碱基对基因的重要性非常关键。然而,目前仍没有基于序列的方法来实现这一目标。在本研究中,我们提出了一种基于人类mRNA和长非编码RNA(lncRNA)序列信息计算单个碱基重要性的算法——碱基重要性计算器(BIC)。随后,我们通过应用BIC于三个不同任务来验证其效力。首先,我们揭示了BIC能够通过单核苷酸变异有效评估基因和单个碱基的致病性。此外,BIC在癌症基因组图谱的体细胞突变中的得分能够预测某些癌症的预后。最后,我们显示了BIC还能够准确预测新型冠状病毒传播性。以上结果表明,BIC是评估人类mRNA和lncRNA单个碱基重要性的有用工具。
© 2023年 作者。牛津大学出版社所有,保留所有权利。如需获得权限,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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Brain Structure & Function
2023 Sep 05

Yah-YuanWu,Ko-TingCh...
Neuropsychological impairment in primary malignant brain tumor patients with awake craniotomy: a hospital-based registration study.
Brain Structure & Function
神经可塑性是一种在面对损伤时,保持神经回路功能的能力。这也是使得脑肿瘤臭名昭著的原因之一。因此,我们评估了原发性脑肿瘤患者的特征,比较了接受左侧或右侧肿瘤觉醒开颅手术的患者之间的神经心理缺陷,并分析了右侧肿瘤患者的白质束与神经心理缺陷的关联。本研究利用长庚记忆医院2014年至2020年的登记数据集,共纳入了698例接受原发性脑肿瘤开颅手术的成年患者(其中538例接受常规开颅手术,160例接受觉醒开颅手术)。为觉醒开颅手术患者进行术前神经心理评估。觉醒开颅手术患者中,右侧肿瘤的比例较常规开颅手术患者低(33.8%和51.5%,p < 0.001)。觉醒开颅手术中,88.7%的左侧肿瘤患者和77.8%的右侧肿瘤患者存在神经心理障碍。左侧肿瘤患者在术前整体功能(36.2%和8.0%,p < 0.001)、语言领域(57.6%和22.2%,p < 0.001)和注意力(36.0%和18.5%,p = 0.02)方面表现出较差。此外,在右侧低级别胶质瘤患者中,涉及卓越纵束(SLF)I通路的患者在口头记忆(p = 0.001,奇比值=11.2,95% CI=1.8 ~ 71.4)和视觉记忆(p = 0.048,奇比值=10.5,95% CI=1.0 ~ 111)方面的缺陷风险较高。在觉醒开颅手术中,左侧大脑肿瘤患者在整体功能、语言和注意力方面的认知功能较右侧肿瘤患者较差。77%的右侧肿瘤患者存在神经心理障碍。因此,脑肿瘤患者需要进行全面的神经心理评估并接受觉醒开颅手术。
© 2023. 作者(作者)在Springer Science+Business Media, LLC的独家许可下,属于Springer Nature的一部分。
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Brain Structure & Function
2023 Sep 05

PatrickHLuckett,Mich...
Predicting survival in glioblastoma with multimodal neuroimaging and machine learning.
Brain Structure & Function
胶质母细胞瘤(GBM)是最常见和最具侵袭性的恶性神经胶质瘤,总体中位生存期不到两年。在治疗之前能够预测GBM患者的生存期将有助于改善疾病管理、临床试验入组和患者护理。GBM患者(N=133,平均年龄60.8岁,中位生存期14.1个月,57.9%为男性)是从华盛顿大学医学中心神经外科脑肿瘤服务回顾性招募的。所有患者在手术前完成结构性神经影像和静息态功能磁共振成像(RS-fMRI)。人口统计学信息、皮层厚度(CT)测量和静息态功能网络连接(FC)用于训练一个深度神经网络,以根据生存期(<1年,1-2年,>2年)对患者进行分类。基于训练模型,置换特征重要性确定了最强的生存期预测因子。模型在生存期分类上的交叉验证和留存验证准确率达到了90.6%。最强的人口统计学预测因子是诊断时年龄和性别。生存期的最强CT预测因子包括颞上沟、扣带回、基底节周围、三角旁区域和颞中部位。最强的FC特征主要涉及背侧和下部体感运动、视觉和顶顶顶角叶网络。我们证明了机器学习可以根据多模式神经影像准确地分类GBM患者的生存期,而无需任何手术或医学干预。这些结果在没有涉及症状、治疗、手术后结果或肿瘤基因组信息的情况下实现。我们的结果表明GBMs对大脑的结构和功能组织具有全球影响,并且这一影响与生存有关。© 2023。此为美国政府作品,未在美国受版权保护;可能适用外国版权保护。
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Brain Structure & Function
2023 Sep 05

ChristopherPCifarell...
Intracranial intraoperative radiotherapy (IORT): evaluation of electrocorticography and peri-operative seizure risk.
Brain Structure & Function
脑转移瘤和原发性脑肿瘤的术中放射治疗(IORT)已成为一种辅助放射治疗方法,它使得治疗可以在单次手术麻醉中完成。然而,关于IORT可能对围手术期和长期癫痫风险的影响的数据很少。本文通过回顾性分析接受肿瘤切除期间接受IORT治疗的患者的数据,包括围手术期抗癫痫药物和麻醉剂的使用。术中采用脑电图(ECoG)进行脑神经监测,记录IORT之前、中间和之后的电活动,并分析是否存在癫痫或基线变化的证据。使用Kaplan-Meier估计对手术后的癫痫发生率与总生存率进行分析。
共有24位连续接受IORT治疗的患者被纳入分析,其中18位(75%)患者诊断为脑转移瘤,而6位(25%)患者为新诊断的胶质母细胞瘤。平均和中位生存时间分别为487天和372天。术后3位患者出现临床癫痫发作,其中2位脑转移瘤患者在9个月内出现,1位胶质母细胞瘤患者在14个月后出现。IORT时间占总麻醉时间的9.5%。对5位患者(4位脑转移瘤,1位胶质母细胞瘤)进行了ECoG记录,平均记录持续时间占总麻醉时间的13%,没有发现高频振荡或癫痫活动的证据。
IORT是在术中切除脑肿瘤的情况下进行明确放射治疗的选择,而不增加围手术期和长期癫痫风险。IORT传递放射治疗期间的ECoG数据未能显示任何电生理学变化作为对电离辐射的反应。
© 2023. 本文作者通过独家许可,授权给Springer Science+Business Media, LLC,属于Springer Nature的一部分。
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Brain Structure & Function
2023 Sep 04

ChangpingJiao,CuiLiu...
Brain Protection Effects of Mild Hypothermia Combined with Distant Ischemic Postconditioning and Thrombolysis in Patients with Acute Ischemic Stroke.
Brain Structure & Function
为了评估轻度低温和远程缺血后处理(RIPC)在急性缺血性中风(AIS)患者接受溶栓治疗后的有效性和分子机制,本前瞻性研究纳入了共58例接受重组组织型纤溶酶原激活剂(rt-PA)静脉溶栓的AIS患者。参与者随机分配到实验组(rt-PA静脉溶栓+轻度低温敷帽+远程缺血性大脑保护,n=30)和对照组(rt-PA静脉溶栓+0.9%生理盐水,n=28)。远程缺血后处理在两侧上肢动脉上连续进行14天,间隔2分钟。依次进行5个缺血再灌注周期(2-2、3-3、4-4、5-5、5-0分钟)。在治疗后,评估了国家卫生研究院中风量表(NIHSS)评分、脑梗死体积、血清超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)、白细胞介素-1β、肿瘤坏死因子α、核因子κ B(NF-κB)和NOD-样受体蛋白3(NLRP3)的水平等发病机制。同样,比较了两组的90天修订Rankin量表(mRS)评分。治疗后,实验组的NIHSS评分、MDA、NF-κB和NLRP3水平明显低于对照组(p<0.05)。实验组的SOD显著高于对照组(p<0.05),实验组和对照组的NIHSS评分均在组内显著下降(p<0.05)。实验组的90天mRS评分(0-2分)明显高于对照组(73.33% vs. 53.57%,p<0.05),两组之间的安全指标没有显著差异(p>0.05)。本研究表明,轻度低温和RIPC的结合具有对脑保护的积极效果,能显著减少氧化应激和相关炎症反应的爆发。该临床试验注册号为ChiCTR2300073136。
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Brain Structure & Function
2023 Sep 05

KathleenMDecker,Alli...
New Cancer Diagnoses Before and During the COVID-19 Pandemic.
Brain Structure & Function
COVID-19大流行期间对医疗保健的干扰可能导致癌症诊断的漏诊。评估COVID-19大流行与癌症发病之间的关联至关重要,以解决公众和患者的焦虑,为恢复工作提供信息,并确定减少系统脆弱性的策略。为调查COVID-19大流行与加拿大曼尼托巴省的癌症发病率之间的关联,我们进行了一项基于人群的横断面研究设计,使用了曼尼托巴省癌症登记处和中断时间序列分析的数据。纳入了加拿大曼尼托巴省2015年1月1日至2021年12月31日期间被诊断为癌症的所有个体。根据年龄将被诊断为乳腺癌、结肠癌、直肠癌或肺癌的个体分为以下组别:年龄小于50岁、50至74岁和75岁及以上。COVID-19大流行期间。按年龄标准化的癌症发病率和在没有COVID-19的情况下与观察到(拟合)的癌症病例数间的估计累积差异。共纳入了48,378名个体。诊断时的中位数(IQR)年龄为68(59-77)岁,23,972名参与者(49.6%)为女性。2020年4月,整体癌症发病率下降了23%。乳腺癌发病率下降了46%,结肠癌发病率下降了35%,直肠癌发病率下降了47%,头颈部癌症发病率下降了50%,黑色素瘤发病率下降了65%,内分泌癌症发病率下降了33%,血液学癌症诊断上升12%,原发部位未知癌症诊断上升8%。肺癌发病率一直稳定,直到2020年12月下降了11%。脑和中枢神经系统以及泌尿系统癌症诊断从2020年4月到2021年12月持续下降,分别下降了26%和12%。未观察到与妇科癌症(1%增加),其他消化道癌症(1%减少)或胰腺癌症(7%增加)发病率的关联。截至2021年12月,曼尼托巴省估计缺口为692例(5.3%)。乳腺癌(273例,14.1%缺口)、结肠癌(133例,12.2%缺口)和肺癌(132例,7.6%缺口)的估计缺口最大。本研究发现,COVID-19大流行与大多数癌症部位的发病率最初下降,然后恢复。然而,对于一些具有较高致死率的癌症,累积缺口需要立即关注。
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Bjog-Int J Obstet Gy
2023 Sep 05

MicaelaSundell,JanBr...
Insufficient use of menopausal hormone therapy in Swedish women with early or premature menopause caused by bilateral oophorectomy: a register-based study.
Bjog-Int J Obstet Gy
调查术后双侧输卵管切除的绝经前妇女使用绝经激素疗法(MHT)的情况。回顾性注册为基础的队列研究。瑞典。使用瑞典妇产科手术质量登记(GynOp)确定了2005年至2020年接受双侧输卵管切除的无恶性肿瘤35-44岁的瑞典妇女。从GynOp的数据与从瑞典药物处方登记处提取的发放药物数据进行交叉链接。手术后一年内至少一次发放MHT的妇女比例。定义了重复治疗时段,并分析了发放时间所占据的“人时间”的比例。总共,其中1231名妇女(n = 1706)在手术后的某个时间点发放了MHT,其中1177名妇女在手术后一年内发放了MHT。这一比例从2005年的64%增加到2019年的84%(p < 0.001)。在总人群中,已经过去了4537个“治疗年”,对应于平均时间的43%。在手术后一年内发放MHT的妇女群体中,时间占比为63%。仅有69%的所有无恶性肿瘤的双侧输卵管切除妇女在手术后一年内接受了MHT,且治疗持续时间有限。有必要进一步研究这一群体发放率低的原因,以提高对当前治疗指南的依从性,改善生活质量,避免增加发病率和死亡率。© 2023 The Authors. 由John Wiley & Sons Ltd.出版的《BJOG:国际妇产科学杂志》。
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BJU INTERNATIONAL
2023 Sep 04

BenjaminMMacCurtain,...
Membranous Urethral Length and Urinary Incontinence post RARP? A Systematic Review and Meta-Analysis.
BJU INTERNATIONAL
为了提供有关术前膜状尿道长度(MUL)与术后尿失禁(UI)在接受机器人辅助根治性前列腺切除术(RARP)/机器人辅助腹腔镜前列腺切除术(RALP)的男性之间的关联的最新进展。UI在RARP / RALP术后很常见,而早期的恢复尿失禁是手术后最重要的功能结果之一。已经确定了MUL与RARP / RALP后膀胱控制恢复的相关因素。根据PRISMA指南,在Pubmed、Embase和Scopus数据库中进行了系统性回顾。纳入标准是最近五年内评估使用扩展前列腺癌指标复合物(EPIC)评估尿失禁的英文全文期刊文章。使用回顾性队列研究的关键评价技能计划(CASP)工具评估研究质量。进行随机效应荟萃分析,汇总可用研究中与MUL相关的尿失禁的比值比。使用Grading of Recommendations, Assessment, Development and Evaluations(GRADE)框架综合证据。包括970名患者的六项研究报告了MUL与12个月尿失禁之间的关联。较长的MUL与术后12个月尿失禁减少有关(汇总比值比= 0.74,CI 0.68-0.87,p<0.001)。遇到了显著的方法学和统计学异质性。MRI测量的术前MUL与接受RARP / RALP的男性术后膀胱控制显著相关。我们建议在RARP / RALP之前考虑MRI测量的MUL,以指导该人群的治疗决策。
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