肿瘤异质性在神经肿瘤领域日益被认识为治疗成功的主要障碍。胶质瘤以不同组合的遗传和表观遗传改变为特征，导致多个分子途径之间的复杂相互作用。预测疾病演变和制定个体最佳治疗方案需要复杂到足以捕捉肿瘤发生底层[表观]遗传结构的统计模型。在这里，我们将这一任务形式化为对遗传网络的层次潜在表示中不同连接模式的推断。通过评估来自12个国家、14年时间内的4023例胶质瘤患者的多机构临床、遗传和结果数据，我们应用贝叶斯生成随机块建模来揭示一个跨分子确认的胶质母细胞瘤、IDH野生型；少突胶质瘤、IDH突变和1p/19q代码缺失；以及星形细胞瘤、IDH突变的肿瘤遗传学的层次网络结构。我们的研究结果揭示了脑肿瘤遗传格局中特征之间的复杂依赖关系，并显示出生成网络模型比当前的黄金标准诊断分类具有更好的预后准确性。© 2023作者。由Brain的担保人代表牛津大学出版社发表。

前列腺特异性抗原（PSA）已广泛应用于前列腺癌（PCa）的筛查和早期诊断。然而，在4-10 ng/mL的PSA灰区，用于诊断PCa的灵敏度和特异度有限，导致了大量不必要和侵入性的前列腺生物检查，可能导致潜在的过度诊断和过度治疗。我们旨在结合基于68Ga-PSMA PET/CT的最大标准摄取值（SUVmax）和临床指标，在灰区PSA水平的男性中预测临床意义的PCa（CSPCa）。我们招募了81例疑似PCa的患者，基于血清总PSA（TPSA）水平增高（4-10 ng/mL）进行经直肠超声/磁共振成像（MRI）/PET融合引导生物检查。其中，经组织病理学证实的患者被分为CSPCa组和非CSPCa组，并且比较了PSA浓度、前列腺体积（PV）、PSA密度（PSAD）、游离PSA（FPSA）/TPSA、前列腺成像报告和数据系统第2.1版（PI-RADS v2.1）评分、68Ga-PSMA PET/CT成像评估结果和SUVmax的数据。进行多元逻辑回归分析，以确定CSPCa的独立预测因子，从而建立了基于SUVmax的预测模型，并通过分析受试者工作特征曲线（ROC曲线）和决策曲线分析来评估该模型。与非CSPCa相比，CSPCa患者的PV较小（中位数31.40 mL），FPSA/TPSA较低（中位数0.12），PSAD较大（中位数0.21 ng/mL2），并且PI-RADS评分较高（P < 0.05）。预测模型包括68Ga-PSMA PET/CT最大标准摄取值、PV和FPSA/TPSA，在所有预测因子中具有最高的AUC值（0.927），而其他单独预测因子的AUC值分别为0.585（PSA）、0.652（mpMRI）和0.850（68Ga-PSMA PET/CT）。预测模型的诊断敏感性和特异性分别为86.21%和86.54%。鉴于常规PSA测试的低诊断准确率，我们开发和验证了一种基于68Ga-PSMA PET/CT SUVmax、PV和FPSA/TPSA的新型预测模型，该模型可以更满意地预测CSPCa。本研究提供了一种在PSA灰区具有高准确性的非侵入性预测模型，从而可能更好地避免不必要的活检程序。© 2023年。国际癌症影像学学会（ICIS）。

本研究旨在开发和验证一种基于双参数磁共振成像（bpMRI）的模型，用于检测未接受活检的患者中临床意义显著的前列腺癌（csPCa）。这项回顾性研究纳入了324名接受bpMRI和MRI针对性融合活检（MRGB）和/或系统活检的患者，其中217名患者随机分配到训练组，107名患者分配到验证组。我们评估了三种基于bpMRI的评分的敏感性和特异性的诊断性能。随后，我们构建了3个模型（模型1、模型2和模型3），将bpMRI评分与临床变量结合起来，并使用受试者工作特征曲线（ROC曲线）下的面积（AUC）进行比较。我们使用DeLong检验评估了这些模型之间的差异的统计学意义。在训练组中，217名患者中有68名获得了病理学上证实的csPCa。评分1的敏感性和特异性分别为64.7%（95% CI 52.2%-75.9%）和80.5%（95% CI 73.3%-86.6%）；评分2的敏感性和特异性分别为86.8%（95% CI 76.4%-93.8%）和73.2%（95% CI 65.3%-80.1%）；评分3的敏感性和特异性分别为61.8%（95% CI 49.2%-73.3%）和80.5%（95% CI 73.3%-86.6%）。多变量回归分析显示，基于bpMRI、年龄和前列腺特异性抗原密度（PSAD）的评分是csPCa的独立预测因子。三个模型的AUC分别为0.88（95% CI 0.83-0.93）、0.90（95% CI 0.85-0.94）和0.88（95% CI 0.83-0.93）。模型2的性能显著优于模型1（P = 0.03）和模型3（P < 0.01）。所有三种评分均具有较好的诊断准确性。与年龄和PSAD结合使用时，预测能力显著改善，其中基于评分2的模型显示出最高性能。 © 2023年。国际癌症成像学会（ICIS）。

胰管腺癌（PDAC）是一种具有毁灭性的恶性肿瘤，诊断后5年生存率仅为6％，需要新型治疗方法。蛋白酶激活受体1（PAR1）在肿瘤细胞和肿瘤微环境（TME）中的多种基质细胞亚群中高度过表达，因此提供了一个适合的免疫治疗靶点。本研究采用嵌合抗原受体（CAR）策略，使用人源抗PAR1单链抗体，将其与两个共刺激性细胞内信号传导域（CD28和CD137）以及CD3ζ的内源性膜质区融合。工程化的PAR1CAR-T细胞在体外抑制了PAR1过表达和转化生长因子（TGF）-β介导的PAR1上调的肿瘤细胞，抑制率约为80％。PAR1CAR-T细胞的输注持续增强并通过80％以上的方式诱导了已建立的MIA PaCa-2癌细胞的特异性回归，此外，CAR-T细胞治疗小鼠的血清中发现了前炎细胞因子/趋化因子的增加，肿瘤中Ki67的表达减少。此外，定向消除PAR1表达的肿瘤还降低了基质金属蛋白酶1（MMP1）的水平，提示PAR1/MMP1通路的阻断构成了PDAC治疗的新选项。三代PAR1CAR-T细胞在TME中表现出抗肿瘤活性，为PDAC提供了创新的CAR-T细胞免疫治疗方法。 © 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.

结直肠腺瘤（CA），尤其是高危CA（HRCA），是一种具有高发病率和复发率的癌前病变，在全球范围内占非遗传性结直肠癌约90%的发病例数。目前，复发性CA只能通过反复侵入性息肉切除治疗，而由于缺乏可靠的CA相关药物筛选体外模型，安全且有前景的药物研发策略仍然缺失。我们建立了一个大规模的高危结直肠腺瘤器官样（HRCA-PDO）样本库，该样本库包含了从33名患者中获得的37条PDO细胞系，并进行了一系列高通量和高内容的HRCA药物筛选。我们使用非WNT3a培养基建立了一种原代培养系统，该培养基显著提高了HRCA-PDO的纯度，同时保持了其生存能力。我们还证明了HRCA-PDO复制了原发性腺瘤的组织学特征、细胞多样性、基因突变和分子特征。特别是，我们确定了LGR5、c-Myc和OLFM4等失调的干细胞基因作为腺瘤的标志，这些基因在HRCA-PDO中得到了很好的保留。基于HRCA-PDO样本库，我们应用了一个定制的139种化合物库进行了药物筛选。其中包括二甲双胍、BMS754807、泊尼帕坦和AT9283等四种药物被筛选为潜在的具有一致抑制效果的药物。作为代表，我们发现二甲双胍通过限制干细胞特性的维持，在体内外抑制了HRCA-PDO的生长。本研究建立了一种有前景的HRCA-PDO样本库，并进行了首次的高通量和高内容的HRCA药物筛选，以期为结直肠癌的预防提供启示。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.

癌症严重影响患者的生活质量。协同化疗和光热疗法（PTT）已成为一种有前景的抗癌范例，可以在达到预期的治疗效果的同时减轻副作用。然而，化疗/PTT联合治疗受到了穿透深度有限、肿瘤细胞对热的抵抗能力以及药物生物可用性低的困扰。在这里，我们开发了多功能纳米颗粒（BTP/DOX/2DG NPs），共载有近红外区域II（NIR-II）光激发给受体给受体（D-A-D）小分子、多柔比星（DOX）和2-脱氧-D-葡萄糖（2-DG），用于加强饥饿/化疗/NIR-II PTT联合治疗。我们合成了苯硼酸（PBA）修饰的水溶性D-A-D分子（BBT-TF-PBA），不仅通过给受体配位相互作用PBA-二醇键高度结合DOX和2-DG，而且还可以作为NIR-II荧光成像、NIR-II光声成像和NIR-II PTT的光活性剂。在肿瘤微环境的酸性和氧化条件下，给受体配位相互作用和PBA-二醇键分解，同时释放出DOX和2-DG从BTP/DOX/2DG NPs以实现有效的化疗和饥饿疗法。2-DG还能有效抑制热休克蛋白的表达，进一步增强NIR-II PTT和化疗效果。体外和体内实验证明了BTP/DOX/2DG NPs在化疗、NIR-II PTT和饥饿疗法中的联合作用。本文受版权保护。保留所有权利。

乳腺癌是全世界女性癌症相关死亡的第二大原因，在美国亦如此，每年造成约57.1万人死亡。早期发现乳腺癌可以提高治疗效果和治愈的可能性。尽管目前已存在乳腺癌的诊断方法，如乳房X线摄影、超声波和活体组织检查，但其中一些方法价格昂贵、不舒适、耗时，并且具有有限的敏感性，因此需要开发一种经济实惠、快速、高灵敏度的方法，例如电化学生物传感器。我们的研究重点是利用ECM1生物标志物来检测乳腺癌患者，该标志物在合成尿液中表达更高。我们的研究有两个主要目标：(i) 使用电化学阻抗谱法和酶联免疫吸附测定法测量不同ECM1蛋白浓度。通过使用电化学阻抗谱法校准ECM-1蛋白水平来建立电化学生物传感器的标准曲线。(ii) 验证电化学生物传感器的有效性。此目标涉及测试合成尿液中ECM1的未知浓度，以确保生物传感器在早期阶段检测生物标志物的效率。结果显示，合成尿液中的ECM-1检测范围为1 pg/mL 至500ng/mL。这表明通过检测患者尿液中ECM-1蛋白水平的变化，电化学生物传感器能够始终准确诊断乳腺癌的早期阶段或增加复发。我们的研究结果突出了电化学生物传感器在患者尿液中检测早期乳腺癌生物标志物(ECM-1)的效力。我们计划进一步对患者样本进行研究，并开发便携式硬件供患者使用。版权所有 © 2023。由Elsevier B.V.出版。

嘧啶是脱氧核糖核酸的遗传物质中的重要组成部分，与大量生物活性相关。基于此，通过缩合法合成了羟基-1-萘醛的嘧啶衍生的Schiff碱（1-6）。此外，通过生物信息学方法，对嘧啶衍生的Schiff碱（1-6）进行了分子对接研究，以探索其分别与DNA减旋酶II降解酶、人类造血细胞激酶、黄曲霉尿酸氧化酶和细胞周期依赖性激酶8的抗菌、抗氧化、抗真菌和抗癌特性及结合亲和力之间的相互作用。因此，计算对接分析表明，所有合成的嘧啶Schiff碱（1-6）均具有活性，并且与标准药物相比显示出更好的结合亲和力。此外，通过核磁共振、红外和元素分析对所有制备的材料进行了表征。此外，通过差示扫描量热法和热重分析测量确定了相变和热分解温度。此外，通过X射线单晶衍射技术还证实了嘧啶衍生的Schiff碱1、2、3、4和5的结构。嘧啶衍生的Schiff碱5具有显著的抗菌、抗氧化、抗真菌和抗癌活性，证实其优于标准药物的有希望的生物活性。版权所有 © 2023 Elsevier Inc. 保留所有权利。

本文拟进行中介分析，以评估一种假设的因果机制对从某一暴露因素通过中介变量最终影响结果的效应。在高通量技术时代，常常需要评估基因组或蛋白质组尺度上的大量潜在机制。与此同时，也必须解决与多重检验相关的问题。在只有少数几个基因或蛋白质参与因果关系的情况下，传统的评估中介效应的方法因无法得到这一实验背后的组合空值分布而失去统计功效。因此，功效损失在多重检验校正后会减少鉴定到的真实机制。为了公平地勾画出组合空值下的均匀分布，黄（2019年，AoAS）提出了组合检验，以为单中介分析提供了调整后的P值。我们的贡献是将该方法扩展到多中介分析，它们常见于基因组研究，并且适用于各种生物学兴趣。我们使用组合检验中的广义Berk-Jones统计量，提出了一个多元分析方法，有利于密集和多样的中介效应，一个有利于稀疏和一致效应的去相关方法，以及一个捕捉两种方法边缘的混合方法。我们的分析套件已经作为R软件包MACtest实现。通过分析癌症基因组图谱及临床蛋白质肿瘤分析联盟提供的肺腺癌数据集，我们进一步研究了受吸烟诱导的表观遗传异常调控的基因和网络。R软件包MACtest可在https://github.com/roqe/MACtest上获得。补充数据可在Bioinformatics在线提供。© 2023年作者。由Oxford University Press出版。

化疗是恶性肿瘤最常见的治疗方法。然而，化疗引起的胃肠道毒性反应（CIGT）一直是癌症患者的主要关注点，这降低了他们的生活质量，导致治疗不耐受甚至停止。尽管如此，由于该病的广泛流行和复杂性，CIGT的预防和治疗仍然具有挑战性。化疗药物直接损伤胃肠粘膜引起CIGT，包括恶心、呕吐、厌食、胃肠粘膜炎和腹泻等。CIGT的发病机制涉及多个因素，如肠道菌群失调、炎症反应和神经递质异常水平，这些因素协同促使其发生和发展。特别地，肠道菌群失调通常与异常的免疫反应相关联，导致炎性细胞因子表达增加，这是许多类型的CIGT的常见特征。化疗引起的肠道神经毒性也是CIGT的一项重要关注点。目前，现代医学是CIGT的主要治疗方法，但是作为辅助和替代疗法的传统中医药（TCM）引起了人们的兴趣，可以极大地缓解CIGT。因此，本综述旨在通过PubMed和Google Scholar数据库全面总结CIGT的发病机制和当前管理情况，并提出未来CIGT研究应重点关注肠道菌群、肠道神经毒性和有希望的TCM疗法，以促进更有效的干预措施和优化CIGT管理。版权所有 © 2023 Elsevier Inc.