肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

FennaMJansen,Nathand...

Cumulative thiopurine dosing and keratinocyte skin cancer in inflammatory bowel disease: a case-control study.

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

炎症性肠病（IBD）患者接受硫唑嘌呤治疗会增加角质细胞皮肤癌（KSC）的风险。大多数国际指南建议对接受硫唑嘌呤治疗的患者进行年度皮肤病学筛查。目前尚不清楚KSC发展与硫唑嘌呤用量之间是否存在剂量依赖性的关联。本研究旨在调查IBD患者累积硫唑嘌呤用量与KSC发展之间的关联，为IBD患者进一步皮肤癌风险分层和筛查建议个性化提供帮助。我们进行了一项单中心病例对照研究，包括具有和不具有KSC病史的IBD患者（分别为病例和对照）。主要观察指标是累积的硫唑嘌呤和硫代嘌呤剂量与KSC发展的关联。进行了单变量和多变量 logistic 回归分析，后者校正了年龄和吸烟，这是已知的KSC风险因素。我们包括了50名病例和150名对照，以白人为主。年龄和当前的硫唑嘌呤使用在单变量分析中与KSC发展显著相关。在多变量 logistic 回归分析中，入组时的年龄仍然与KSC发展显著相关。硫唑嘌呤（单独或联合）的累积剂量或使用时间对KSC风险没有影响，即使在校正年龄和吸烟后也是如此。累积的硫唑嘌呤剂量和使用时长与KSC发展没有关联。将来基于所有可用KSC风险因素的风险分层可能有助于选择最有益于皮肤病学筛查计划的个体。© 2023 Wolters Kluwer Health，Inc. 保留所有权利。

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

MingTang,AmilaSurawe...

Mono-phosphorylation at Ser4 of barrier-to-autointegration factor (Banf1) significantly reduces its DNA binding capability by inducing critical changes in its local conformation and DNA binding surface.

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

屏障自编码因子（Banf1）是一种小型DNA桥蛋白。Banf1与DNA的结合状态由其N端的磷酸化和脱磷酸化调节，这在细胞增殖中起着关键作用。Banf1可在Ser4位点磷酸化为单磷酸化的Banf1，进一步在Thr3位点磷酸化形成双磷酸化的Banf1。几十年前观察到单磷酸化的Banf1不能与DNA结合。然而，其潜在的分子和原子水平机制仍然不清楚。对这些机制的清晰理解将有助于干预细胞增殖过程，以改善全球健康。在本文中，我们使用全面和系统的分子建模和分子动力学模拟，探讨了未磷酸化的Banf1与DNA结合的详细原子基础，以及单磷酸化和双磷酸化Banf1如何削弱这些原子基础以消除其与DNA的结合能力，并进一步探索了单磷酸化和双磷酸化Banf1的DNA结合能力。这项工作详细呈现了Banf1与DNA之间残基级别的结合能、氢键和水桥，其中一些尚未报道。此外，我们揭示了单磷酸化Banf1导致其N端二级结构的变化，进而引起Banf1的DNA结合表面的显著变化，从而消除了其对DNA的结合能力。在原子级别上，我们还发现了与单磷酸化相关的相互作用的改变，导致Banf1 N端二级结构的变化。此外，我们的建模结果显示，磷酸化Banf1具有占优势的N端二级结构与DNA的结合亲和力显著降低，并且在分子动力学模拟中其绑定姿态不稳定。这些发现有助于未来研究预测Banf1突变对其与DNA结合能力的影响，并为通过引起Banf1 N端结构变化来靶向细胞增殖的治疗方法（如抗癌药物）开辟了新的途径。

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

YantingYang,ShulongW...

NIR-II photoacoustic imaging-guided synergistic cancer therapy with a tumor-targeting copper selenide-iron manganese layered double hydroxide nanocomplex.

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

本研究制备了一种新型的可降解层状双氢氧化物-铜硒化物纳米复合物，通过将铜硒化物固定在锰铁层状双氢氧化物纳米片上。在肿瘤微环境中，该纳米复合物可以特异性释放CuSe、Mn2+和Fe3+，并在1064 nm激光照射下实现NIR-II光声成像引导的协同抗癌治疗。

Epigenetics & Chromatin

MaiNhuUyenLe,RuiqiCh...

Datasets for the effects of RUNX2 silencing on transcriptomic and metabolomic profiles in SJSA-1 osteosarcoma cells.

Epigenetics & Chromatin

骨肉瘤是最常见的原发性恶性骨肿瘤，具有高转移和复发的风险。代谢重编程是骨肉瘤和其他肿瘤的一个标志性特征，与遗传和表观遗传改变相关。RUNX2是骨母细胞分化的重要转录因子，基因的异常表达有助于骨肉瘤的发展和进展。为了确定RUNX2沉默对骨肉瘤转录组和代谢组学特征的影响，我们生成了稳定表达RUNX2 shRNA的SJSA-1骨肉瘤细胞和稳定表达混乱shRNA的SJSA-1细胞，并使用Illumina NovaSeq 6000和超高效液相色谱-飞行时间质谱联用技术分析了这两种细胞类型的转录组和代谢组学特征。研究人员可以使用这些数据集来鉴定RUNX2的新靶点，并阐明RUNX2在骨肉瘤发生机制和代谢重编程中的作用和潜在机制。© 2023 The Author(s).

Epigenetics & Chromatin

SidharthSJain,MeganE...

Cell-type Deconvolution and Age Estimation Using DNA Methylation Reveals NK Cell Deficiency in the Hepatocellular Carcinoma Microenvironment.

Epigenetics & Chromatin

肝细胞癌（HCC）自2017年起已成为免疫治疗的批准指征，但预测疗效的生物标志物仍然有限。了解和描述肿瘤免疫微环境能更好地对这些肿瘤进行分类，并可能揭示预测免疫治疗效果的生物标志物。本论文中，我们应用了细胞类型解析算法和DNA甲基化芯片数据，研究了HCC肿瘤微环境的组成。利用两个公开可用的数据集，共收集了57例患者的肿瘤和正常组织样本，我们发现了免疫细胞组成方面的关键差异。我们发现与相邻正常组织相比，HCC肿瘤中NK细胞的丰度显著降低。我们还应用了DNA甲基化“时钟”，用于估计表型老化，并将这些结果与基于表达的细胞衰老测定进行比较。我们发现HCC肿瘤的衰老和表观遗传老化明显增加，而加速老化和衰老程度与NK细胞丰度显著相关。总而言之，我们发现肿瘤微环境中的NK细胞浸润显著减少，并且这种NK细胞丧失与增加的衰老和与年龄相关的表型密切相关。这些发现指出了NK细胞与衰老的肿瘤微环境之间的关键相互作用，并为HCC的发病机制以及潜在的治疗效果生物标志物提供了见解。

Epigenetics & Chromatin

SarahMZimmerman,Phyo...

Non-canonical functions of EZH2 in cancer.

Epigenetics & Chromatin

染色质修饰基因的突变在许多种癌症中经常发生。大多数机制研究关注它们的经典功能，而治疗方法则针对它们的酶活性。然而，最近的研究表明，染色质修饰因子的非经典功能在不同类型的癌症中可能同样重要且具有治疗作用。在癌症中展示这种双重作用的一个表观遗传调控因子是组蛋白甲基转移酶EZH2。EZH2是polycomb抑制复合物2（PRC2）的核心组分，对于细胞身份、分化、增殖、干细胞特性和可塑性起着至关重要的作用。尽管EZH2的调控功能和致癌活性大部分归因于其在组蛋白3上甲基化赖氨酸27（H3K27me3）的经典酶活性，即一种抑制性染色质标记，但最近的研究表明，与H3K27me3无关的非经典功能也对EZH2的致癌活性有贡献。与PRC2经典的由H3K27me3介导的抑制性活性相反，在复合物之外，EZH2可以直接与转录因子和癌基因相互作用，激活基因表达。对EZH2和其他表观遗传/染色质调控因子的这些非经典作用进行更深入的研究可能会揭示新的更有效的治疗策略。在这里，我们总结了EZH2非经典功能的主要发现以及它们与不同癌变方面的关系。Copyright © 2023 Zimmerman, Lin and Souroullas.

Epigenetics & Chromatin

AnnaBesschetnova,Wan...

Demethylation of EHMT1/GLP Protein Reprograms Its Transcriptional Activity and Promotes Prostate Cancer Progression.

Epigenetics & Chromatin

表观遗传重编程，由基因组改变和组蛋白阅读和编写蛋白质的失调介导，在推动前列腺癌进展和治疗耐药中起着关键作用。然而，前列腺癌进展中EHMT1（又称GLP）和EHMT2（又称G9A）这两种众所周知的组蛋白3赖氨酸9甲基转移酶的特定功能和调控仍然知之甚少。通过全面调查，我们发现EHMT1和EHMT2蛋白质都具备在前列腺癌细胞中激活致癌转录程序的能力。通过沉默EHMT1/2或用小分子抑制剂靶向它们的酶活性，可以显著降低前列腺癌细胞的增殖和转移能力，不论是体外还是体内。对EHMT1蛋白的翻译后修饰进行深入分析揭示了在多种前列腺癌模型中赖氨酸450和451残基的甲基化。值得注意的是，我们发现赖氨酸450可以被LSD1去甲基化。引人注目的是，同时去甲基化这两个赖氨酸残基导致EHMT1的染色质结合能力迅速而深远地扩大，使EHMT1能够重新编程前列腺癌细胞的转录网络并激活致癌信号通路。总的来说，我们的研究为EHMT蛋白在前列腺癌进展中的活性和功能提供了宝贵的分子洞察。此外，我们提出EHMT1的双赖氨酸去甲基化作为一个关键的分子开关，触发前列腺癌细胞中致癌转录重编程的诱导。这些发现凸显了以EHMT1/2及其去甲基化过程为靶点的潜在治疗策略，用于抗击前列腺癌进展和克服治疗耐药。本研究证明，EHMT1和EHMT2蛋白通过转录活化多个致癌通路推动前列腺癌的发展。机制上，通过去甲基化赖氨酸450和451残基，EHMT1的染色质结合显著扩大，这可作为在前列腺癌细胞中诱导致癌转录重编程的关键分子开关。© 2023作者；美国癌症研究协会出版。

Epigenetics & Chromatin

JiehanLi,HaolinBao,Z...

Non-Coding RNA in Cholangiocarcinoma: An Update.

Epigenetics & Chromatin

胆管细胞癌（CCA）是一种具有高恶性的常见肿瘤之一。其发病率逐年增长，潜伏并容易转移，并且大多数患者在诊断时已经处于晚期。手术是治疗CCA的必要方法，但由于早期诊断率低和CCA的高恶性，其5年生存率仍然不理想。因此，探索CCA的分子机制以寻找可靠的生物标志物和有效的治疗靶点对于改善CCA的早期诊断和生存率至关重要。非编码RNA（ncRNA）是一类无蛋白质编码能力的RNA，主要包括微小RNA（miRNA）、长链非编码RNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA）。近年来，大量证据表明，异常表达的ncRNA可以通过调节表观遗传、海绵miRNA调节靶基因表达和参与调节与癌症相关的信号通路等多种机制来调控CCA的发生和发展，为CCA的早期诊断、预后评估和治疗靶向提供了新的方法和思路。本文将回顾近年来调节CCA进展的lncRNA和circRNA的分子机制，并探讨它们在CCA中的潜在临床价值。© 2023 The Author(s). Published by IMR Press.

Epigenetics & Chromatin

FodilAzzaz,MorganeMa...

Structure of the Myelin Sheath Proteolipid Plasmolipin (PLLP) in a Ganglioside-Containing Lipid Raft.

Epigenetics & Chromatin

Plasmolipin (PLLP)是位于脂质流域中的一种膜蛋白，参与了髓鞘的形成。它还与许多病理过程有关，例如神经系统疾病、2型糖尿病和癌转移。为了更好地了解PLLP如何与流域成分（神经节苷脂和胆固醇）相互作用，我们进行了一项综合研究，结合了体外模拟和各种PLLP-神经节苷脂系统的物理化学相互作用测量。体外模拟研究包括在重建的膜环境中进行的分子动力学模拟。PLLP-神经节苷脂相互作用的测量是通过在神经节苷脂单层上进行的水—空气界面微张力测定实现的。我们已经阐明了PLLP与神经节苷脂GM1的相互作用方式，并在分子水平上对这种相互作用进行了表征。我们表明，GM1诱导了PLLP的细胞外环的结构化，并且这种相互作用通过细胞膜传播构象信号，涉及跨膜区域中的胆固醇分子。这种构象波最终传递到蛋白质的胞内结构域，与PLLP在信号转导中的作用一致。这项研究是我们团队提出的蛋白质结构的表观遗传维度的典型例证，该概念用于描述神经节苷脂对无序蛋白质基序的伴侣效应，该伴侣效应与脂质流域相结合。从生理学角度来看，这些数据揭示了神经节苷脂在髓鞘形成中的作用。从病理学角度来看，这项研究将有助于设计基于神经节苷脂-PLLP相互作用的创新治疗策略，用于治疗各种PLLP相关疾病。© 2023 The Author(s). Published by IMR Press.

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

RemyaRadhakrishnan,H...

Prevalence of Depression and Anxiety Disorders Among Cancer Patients: An Insight From a Single Institute.

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

目的本横断面观察研究旨在确定在印度泰米尔纳德邦科伯托尔市G. Kuppuswamy Naidu纪念医院治疗期间，癌症患者的焦虑和抑郁的患病率，以及焦虑和抑郁与年龄、性别、婚姻状况、教育程度、职业、经济支持、治疗时间、疾病类型和恶性程度等各种因素的相关性，使用医院焦虑和抑郁量表（HADS）。方法共纳入162名接受不同癌症治疗（化疗/手术/综合治疗）的患者，所有患者都接受了HADS评估。使用卡方检验研究了焦虑分数与年龄、部位和性别等各种因素之间的关联。结果 39名（24.1%）患者患有严重焦虑，60名（37%）患者患有边缘性焦虑，63名（38.9%）患者被确定为正常。53名（32.7%）患者患有严重抑郁，47名（29%）患者患有边缘性抑郁，62名（38.3%）患者被确定为正常。本研究发现，教育程度和职业状况是导致癌症患者焦虑和抑郁患病率增加的显著因素（p < 0.05）。本研究还发现，乳腺和胃肠癌患者的抑郁患病率较其他癌症类型高。结论本研究针对泰米尔纳德邦的癌症患者焦虑和抑郁患病率进行了贡献。虽然研究人群较小，这是本研究的局限性，但它提供了一个概述，即教育程度和职业状况对焦虑和抑郁产生重要影响，这方面的研究过去很少。为了有效管理这一问题，应让患者了解来自各慈善团体、政府政策和保险的经济支持，以便他们能够改善生活质量并更有信心地管理临床情况。这些发现呼吁在癌症护理中进行早期的精神干预，通过关注改善患者的心理稳定和服药依从性，提高患者的生活质量，从而获得癌症治疗的积极结果。版权所有© 2023，Radhakrishnan等人。