本研究旨在探讨全基因组测序（WGS）作为唯一的方法用于检测B细胞急性淋巴细胞白血病（ALL）中与临床相关的基因组异常，并旨在取代现有的诊断方法。为此，我们评估了150个bp配对末端WGS（90倍白血病/ 30倍生殖细胞系）的分析性能。选择了一组88个回顾性的B细胞ALL样本，以代表已建立的ALL亚型，以及缺乏分层标志物的ALL样本（称为B-other ALL）。无论是配对白血病/生殖细胞系（L/N）（n = 64）的分析，还是仅白血病（L-only）（n = 88）的分析，均能检测到当前ALLTogether试验方案中所需的所有类型的异常，包括非整倍体、结构变异和局部拷贝数异常。此外，与SoC的比较显示完全一致，并且使用两种方法将所有患者正确分配到正确的遗传亚型中。值得注意的是，WGS可以将39个B-other ALL样本中的35个分配到最新ALL分类中考虑的一组新出现的遗传亚型之一。我们进一步研究了高（90倍; n = 58）和低（30倍; n = 30）覆盖率对诊断产量的影响，并观察到与SoC完全一致的结果；低覆盖率能够检测到所有相关病变。对WGS结果进行对ALL中反复重排的一系列基因的过滤，有助于有效提取临床相关信息。然而，由于高度重复的D4Z4区域中嵌入了多个DUX4基因的副本，检测DUX4重排需要额外的定制分析。我们得出结论，WGS作为独立方法的诊断性能令人瞩目，并可以在B细胞ALL的诊断设置中检测到所有临床相关的基因组事件。版权所有© 2023 Rezayee, Eisfeldt, Skaftason, Öfverholm, Sayyab, Syvänen, Maqbool, Lilljebjörn, Johansson, Olsson-Arvidsson, Pietras, Staffas, Palmqvist, Fioretos, Cavelier, Fogelstrand, Nordlund, Wirta, Rosenquist和Barbany。

食管鳞状细胞癌（ESCC）是最致命的癌症之一，已成为全球性健康问题。已有研究表明，硬脂酰辅酶A脱饱和酶1（SCD1）在人类癌症中起到关键作用。然而，泛癌症分析目前仅有少量证据。本研究系统检查了SCD1在多种人类癌症中的表达模式和潜在临床结果。SCD1在多种癌症中发生失调，并作为一种诊断生物标志物，表明SCD1可能在肿瘤发生中起到作用。以ESCC为例，我们证明了SCD1在ESCC肿瘤组织中显著上调，并与ESCC患者的临床病理特征相关。此外，Kaplan-Meier分析显示，高表达的SCD1与ESCC患者的无进展生存期（PFS）和无疾病生存期（DFS）呈相关性。通过PINA数据库和Gephi软件进行了蛋白质相互作用（PPI）网络和模块分析，以确定核心靶点。同时，通过基因本体论（GO）和Kyoto基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析构建了这些核心靶点的功能注释分析。从功能上讲，SCD1在ESCC细胞中的过表达促进了细胞增殖、迁移和侵袭；相反，SCD1在ESCC细胞中的缺失功能则产生了相反的效果。生物信息学、QPCR、Western blot和荧光素酶分析表明，在ESCC细胞中，SCD1是miR-181a-5p的直接靶点。此外，在ESCC细胞中过表达miR-181a-5p减少了细胞生长、迁移和侵袭能力。相反，miR-181a-5p的抑制剂抑制了其在ESCC细胞中的表达，产生了相反的生物学效应。重要的是，在miR-181a-5p模拟转染ESCC细胞中加强SCD1可以逆转miR-181a-5p模拟预防ESCC细胞恶性表型的效果。综上所述，这些结果表明SCD1表达影响多种癌症的肿瘤进展，并且miR-181a-5p/SCD1轴可能是ESCC治疗的潜在治疗靶点。 © 2023年作者。

转化手法癌（MpBC）是乳腺癌的一种罕见且侵袭性的亚型，有关预后因素和生存预测的数据正在涌现。本研究旨在建立机器学习模型，预测MpBC患者的乳腺癌特异性生存（BCSS），利用了包括临床、病理和生物学变量在内的160名患者的数据集。使用增益比和基于相关性的方法进行深入的变量选择过程，最终得到了10个用于模型估计的变量。使用10折交叉验证评估了五个模型（带装袋的决策树；逻辑回归；多层感知机；朴素贝叶斯；和随机森林算法）。尽管没有治疗信息的限制，随机森林模型在预测BCSS方面表现出最高的性能，ROC曲线下面积为0.808。本研究强调了机器学习算法在使用临床数据集预测复杂和异质癌亚型的预后方面的潜力，并且它们对患者管理的潜力。进一步的研究可以结合更多的变量，如治疗反应和更先进的机器学习技术，有可能增强MpBC预后模型的预测能力。© 2023 作者。

基于二茂铁的纳米颗粒已引起人们对其作为活性氧（ROS）响应型抗癌药物和成像剂的纳米载体的兴趣。然而，由于其生理稳定性差，其生物医学应用仍然有限。纳米载体的PEG化改善了其稳定性和生物相容性。在本研究中，我们旨在开发具有增强稳定性和ROS响应性的新型PEG-二茂铁纳米颗粒（PFNPs），用于紫杉醇（PTX）和成像剂的传递。PEG化改善了二茂铁纳米颗粒的稳定性，抑制了其ROS响应性破坏。设计了含有不同摩尔比的丙烯酸甲基酯和聚（乙二醇）甲醚甲基丙烯酸酯的几种PEG-二茂铁聚合物以进行优化。具有最佳单体比例的ROS响应性聚合物自组装成具有增强稳定性的PFNPs。在存在ROS的情况下，8小时内，PFNPs膨胀并有效释放包装的PTX和成像剂。此外，在水溶液和生物缓冲液中储存后，其在流体动力学直径和聚分散度指数方面保持稳定。在体内肿瘤模型中，PFNPs的积累量比自由染料高15倍。装载PTX的PFNPs显示出显著的抑制肿瘤效果，将肿瘤大小减小到对应的对照组的大约18%。这些发现表明ROS响应性PFNPs作为生物相容性抗癌药物和成像剂的纳米载体，在肿瘤治疗中具有潜在的应用前景。© 2023 The Authors. Published by Elsevier Ltd.

中心体是一种细胞质内的细胞器，具有微管组织的功能，同时也被认为是细胞信号传导的中枢。中心体的一些成分对DNA损伤响应的完全激活是必需的。然而，中心体是否调节特定的DNA修复通路尚不清楚。在这里，我们展示了中心体的存在对于完全激活重组是必需的，特别是对于授权其初始步骤即所谓的DNA末端剪切的完全授权是必需的。此外，我们确定了中心体结构的亚末端附属物和特定因子CEP170作为调节重组和剪切的关键中心体成分。因此，缺乏中心体或CEP170缺失的细胞对于DNA损伤剂具有高度敏感性。此外，多种癌症类型中CEP170的低水平与特定突变标志物的突变负担增加和较好的预后相关，这表明CEP170的变化可以作为突变驱动因子，但也可以成为改善当前肿瘤治疗的靶点。© 2023 The Authors. Published under the terms of the CC BY NC ND 4.0 license.

穿越转运机制介导的纳米颗粒主动转运到实体瘤内已被认为是增强瘤聚集和穿透的一种有前景的方法，但纳米颗粒的物理化学性质对此效应尚不清楚。在本研究中，我们采用季铵盐-芘二酰亚胺(简称PDI)-染料为内核的聚赖氨酸树状分子，通过分离式生长制备了一种单分子双成像纳米点，并且内部正交连接Gd(III)-基团的大环探针，用于依赖于表面化学特性的肿瘤入侵的荧光成像和磁共振成像(MRI)。MRI和荧光成像结果显示，醋酸酯化（G6-Ac）和寡乙二醇（G6-OEG）表面的六代纳米点具有类似的高肿瘤积累但不同的肿瘤内分布。细胞摄取和转运实验证明，G6-Ac纳米点具有较低的溶酶体困捕率（61% vs. 83%）和较高的外排比率（47% vs. 29%）与G6-OEG相比。因此，G6-Ac更有可能通过细胞转运方式进行细胞间转运，并能够到达远离血管的肿瘤区域，而G6-OEG主要通过增强渗透和滞留（EPR）效应基于被动转运进入肿瘤，而不能传递到远处的肿瘤区域。本研究表明，通过调控表面化学，可以提高纳米颗粒的肿瘤入侵能力。

高级胶质瘤（HGG）与转移瘤之间的鉴别在常规放射学实践中仍然具有挑战性。我们比较了基于自然语言处理（NLP）的深度学习模型，以帮助放射科医生进行基于放射学报告中的数据的比较。本回顾性研究包括了来自两个不同机构的2010年至2022年之间的185份MRI报告。共有117份报告用于训练，21份作为验证集，其余报告用作测试集。我们进行了不同深度学习模型在HGG和转移瘤分类方面的性能比较。具体而言，我们使用了卷积神经网络（CNN）、双向长短期记忆（BiLSTM）模型、BiLSTM和CNN的混合版本以及放射学特定的双向编码器表示来自Transformers（RadBERT）模型。 对于MRI报告的分类，CNN网络在所有测试中提供了最佳结果，显示出87.32％的宏平均精确度、87.45％的敏感性和87.23％的F1得分。此外，我们的NLP算法检测到了关键词，如肿瘤、颞叶等，以对放射学报告进行正面分类，归为HGG或转移瘤组。 基于CNN的深度学习模型使放射科医生能够根据MRI报告区分HGG和转移瘤，具有高精度值。这种方法应被视为诊断这些中枢神经系统病变的附加工具。 我们的NLP模型的使用使放射科医生能够根据MRI报告区分高级胶质瘤和转移瘤的患者，并可以作为传统基于图像的方法的附加工具，用于这一具有挑战性的任务。 - 在常规放射学实践中，高级胶质瘤和转移瘤之间的鉴别依然存在挑战。 - 基于自然语言处理（NLP）的深度学习模型可以帮助放射科医生根据放射学报告中的数据进行鉴别。 - 我们开发和测试了一个基于MRI报告的自然语言处理模型，用于区分高级胶质瘤和转移瘤，表现出较高的精确度。© 2023作者，独家授权给欧洲放射学会。

肺腺癌（LUAD）的发展和抗肿瘤治疗疗效中，微生物组发挥着作用。肿瘤中的异常糖酵解可能促进乳酸产生，改变肿瘤微环境，影响微生物组、癌细胞和免疫细胞。我们旨在构建肿瘤内微生物组评分以预测LUAD患者的预后，并全面调查糖酵解和乳酸特征与LUAD免疫细胞浸润的关联。肺癌基因组图谱（TCGA-LUAD）微生物组数据从cBioPortal下载并进行分析，以研究其与总生存率的关联，创建一个预后评分模型。基因集富集分析（GSEA）用于查找每组涉及的主要机制。然后，我们调查了基于19个与肿瘤微环境（TME）表型和免疫疗法结果相关的基因的LUAD患者的糖酵解和乳酸模式。我们开发了一个糖酵解-乳酸风险评分和特征签名，以准确预测TME表型、预后和免疫疗法反应。通过单变量Cox回归分析，鉴定出了具有预后价值的38个属的丰度，并从TCGA-LUAD-微生物组数据集中开发了一个肺驻留微生物评分（LMS）。高LMS组中富集了糖酵解特征途径，并生成了三种不同的糖酵解-乳酸模式。Cluster1中的患者显示了不利的预后，并且可能对免疫疗法不敏感。构建了糖酵解-乳酸评分以准确预测预后，并在外部队列中进行了验证。开发了基因签名，此签名在单细胞水平上尤其在肿瘤组织中的上皮细胞中升高。最后，我们发现糖酵解-乳酸签名水平与组织学亚型的恶性程度一致。我们的研究证明了一个18微生物组预后评分和一个19基因的糖酵解-乳酸签名，用于预测LUAD患者的预后。我们的LMS、糖酵解-乳酸评分和糖酵解-乳酸签名在LUAD患者的精准治疗中具有潜在作用。版权所有©2023邓、陈、罗、阙和陈。

丙酸杆菌可引起促炎因子（如环氧酶-2，前列腺素E2，白细胞介素-1β和肿瘤坏死因子-α）的上调，增加活性氧（ROS）水平和钙离子内流。这导致抗菌肽LL-37水平升高，皮肤发炎，出现红肿、瘙痒等症状。五味子果油（SCO）含有各种抗氧化和抗炎成分的木脂素活性成分。本研究通过超临界CO2流体萃取得到SCO，利用丙酸杆菌诱导的HaCaT细胞模型研究了SCO的抗炎作用。建立并验证了基于反相高压液相色谱-二极管阵列检测器的方法，用于同时检测五种木脂素成分。通过ELISA试剂盒和免疫印迹法测定了促炎因子和LL-37的水平，并通过流式细胞术检测Ca2+和ROS水平。实验结果显示，schisanol A、schisanol B、schisanin A、schisanin B和schisanin C的含量分别为33.89 ± 0.24、14.89 ± 0.45、8.92 ± 0.02、29.14 ± 0.67和4.74 ± 0.09 mg/g。研究表明，SCO可以通过抑制COX-2/PGE2和NF-κB信号通路来缓解皮肤炎症。此外，SCO能抑制ROS产生，显著阻断Ca2+内流，缓解细胞损伤，调节抗菌肽LL-37的含量。总之，我们的研究阐明了SCO在细胞模型中的抗炎活性，并为其作为皮肤护理原料的应用提供了科学依据。© 2023 The Author(s). Published by IMR Press.

植物提取物合成银纳米颗粒（Ag NPs）等方法由于其环保的特点成为一种有前途的方法。本研究旨在研究藤黄果果实化学成分在Ag NPs的生物合成中的应用，评估其抗菌、抗氧化和抗癌性质，以及生物合成Ag NPs对结晶紫（CV）三苯甲烷染料的光催化能力。通过紫外可见光谱（UV-Vis）、X射线衍射（XRD）、傅里叶变换红外光谱（FTIR）、扫描电子显微镜（SEM）、Zeta电位分析和透射电子显微镜（TEM）对通过绿色途径合成的Ag NPs的物理特性进行了表征。使用合成的Ag NPs在紫外光下，通过分析579 nm处的吸收峰来确定CV的染料降解效率。使用稀释法研究了Ag NPs对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、热带白念珠菌和白念珠菌的抗菌效果。使用DPPH和MTT试验评估了合成的Ag NPs的抗氧化和抗癌性质。紫外分析显示，合成的Ag NPs峰位于442 nm。FTIR、XRD、Zeta电位、SEM和TEM分析的数据证实了纳米颗粒的形成。SEM和TEM分析确定了球形纳米颗粒的存在，平均尺寸分别为29.12 nm和24.18 nm。在320分钟后，CV的染料降解效率最高达到90.08％，并且没有银离子渗出，证实了Ag NPs的光催化活性。采用Allium cepa根生长抑制试验、Vigna radiata的毒性分析以及盐水虾致死试验评估了处理的生物效能。结果表明，相对于物理/化学合成的Ag NPs来说，绿色Ag NPs具有环境友好的特点。合成的Ag NPs可以有效用于生物医学和光催化应用。 © 2023 作者发表。IMR Press出版。