研究动态
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GYNECOLOGIC ONCOLOGY
2023 Aug 29
PriyankaNarayan,Muha...
Partner and localizer of BRCA2 (PALB2) pathogenic variants and ovarian cancer: A systematic review and meta-analysis.
GYNECOLOGIC ONCOLOGY
约有20%的卵巢癌是由潜在的生殖细胞致病变体引起的。虽然多个基因的致病变体在遗传性卵巢癌的发展中已得到充分证实(例如BRCA1/2、RAD51C、RAD51D、BRIP1、错配修复基因),但伴侣与定位蛋白2(PALB2)的作用仍不确定。本研究旨在利用荟萃分析评估PALB2生殖细胞致病变体与卵巢癌的关联关系。 我们进行了系统评价和荟萃分析。我们搜索了主要的电子数据库,以找到评估卵巢癌患者多基因面板检测的研究。符合条件的试验经过荟萃分析。 共有55项研究符合纳入标准,包括48,194名患有卵巢癌的人,并提供了关于PALB2生殖细胞致病变体状态的信息。在患有卵巢癌并可获得PALB2测序数据的人群中,0.4% [95% CI 0.3-0.4]携带PALB2基因的生殖细胞致病变体。经过生殖细胞检测的20,474名卵巢癌人群相对于123,883名对照个体,携带PALB2致病变体的合并比值比(OR)为2.48 [95% CI 1.57-3.90]。 我们的荟萃分析显示,在患有卵巢癌的人群中,携带PALB2基因生殖细胞致病变体的合并比值比(OR)相对于一般人群为2.48 [95% CI 1.57-3.90]。值得注意的是,有必要进行前瞻性研究评估PALB2生殖细胞致病变体在卵巢癌发展中的作用。 Copyright © 2023. Elsevier公司出版。
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GUT
2023 Aug 31
JanaJarosova,LeaZari...
Endoluminal radiofrequency ablation in patients with malignant biliary obstruction: a randomised trial.
GUT
内腔射频消融术(RFA)被推广为胆管癌(CCA)和胰腺导管腺癌(PDAC)患者的姑息治疗方法,以改善胆汁引流并最终延长生存期。然而,目前没有关于该技术的高水平证据。在这项随机对照研究中,我们比较了内腔RFA联合支架与单独支架(对照组)在恶性胆道梗阻患者中的应用;首选金属支架。主要观察指标是总生存期,次要观察指标包括支架通畅性、生活质量和不良事件。在优势设计中,假定RFA的生存期为对照组(n=280)的两倍,即6.4个月。在中位年龄为71±9岁的161名受试者中进行随机分组,招募结束后进行了无效中期分析。85名患者患有CCA(73例肝门型,12例远端型),76例患有胰腺癌。在两个亚组中均未观察到存活差异:对于CCA患者,RFA组的中位生存期为10.5个月(95% 可信区间6.7至18.3),对照组为10.6个月(95% 可信区间9.0至24.8),p=0.58)。在胰腺癌亚组中,RFA组的中位生存期为6.4个月(95% 可信区间4.3至9.7),对照组为7.7个月(95% 可信区间5.6至11.3),p=0.73)。在RFA组中未观察到支架通畅性的好处(CCA组12个月时为40%,对照组为36%;PDAC组为66%和65%)。两种治疗对生活质量均没有改变,并且在两个组之间是可比较的。两组患者均出现了七例不良事件。内腔RFA和支架联合应用在延长恶性胆道梗阻患者的生存期或改善支架通畅性方面并不优于单独支架。NCT03166436.© 作者(或其雇主)2023。未经商业再利用。请参阅权利和许可。由BMJ发表。
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Journal of Translational Medicine
2023 Aug 31
PeiyaoWang,SophieSun...
New insights into the biology and development of lung cancer in never smokers-implications for early detection and treatment.
Journal of Translational Medicine
肺癌是全球癌症死亡的首要原因。尽管非吸烟者仅占所有病例的10%至25%,但从病因学和生物学角度来看,非吸烟者肺癌(LCNS)相对缺乏详细描述。在大规模患者队列上应用多组学技术显著推进了对LCNS肿瘤生物学的当前理解。通过从临床角度综合多组学研究在LCNS上的发现,我们可以直接将有关肿瘤生物学的知识转化为对患者护理的影响。本综述主要关注肺腺癌的非吸烟者,并详细说明驱动基因突变的优势,特别是在东亚患者中的优势,以及LCNS中常见和重要的种系变异的频率。全面探讨了LCNS肿瘤中出现的突变模式,突出了APOBEC签名的高丰度。此外,本综述认识到LCNS肿瘤中存在的免疫谱,并提出如何将其转化为治疗选择。多组学研究在LCNS肿瘤生物学方面的反复和新颖见解具有广泛的临床意义。如户外空气污染、二手烟和潜在饮食等风险因素在不同程度上在LCNS中留下了基因组印记,虽然这些风险因素并没有涵盖所有LCNS病例,但可以用来对风险进行分层。种系变异同样对LCNS的相当比例有贡献,这要求详细记录非吸烟者肺癌的家族史,并且在未来的早期检测中开展有关致病变异的测试具有价值。分子驱动亚型和特定的共突变和突变特征在LCNS中具有预后价值,并可以指导治疗选择。无已知驱动基因突变的LCNS肿瘤倾向于具有干细胞样状态,贡献于此状态的基因可能成为潜在的治疗靶点。总的来说,多组学研究的综合发现对LCNS领域的临床管理和未来的研究方向具有广泛的影响。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 29
SinaNikbin,GitaFarda...
Aerobic exercise training reduces deep-frying oil-induced apoptosis of hippocampal tissue by reducing oxidative stress in male rats.
GENES & DEVELOPMENT
炸油富含大量自由基,食用通过这种方法制备的食物会导致由氧化应激引起的神经组织损伤。由于中等强度的有氧运动训练能够减少氧化应激,本研究旨在调查有氧运动对炸油喂养大鼠海马组织中氧化应激、凋亡和神经生成标志物的影响。将18只雄性Wistar大鼠(200-280g)随机分为对照组(正常饮食),炸油对照组(喂养炸油)和炸油有氧运动组(炸油-运动)(每组6只)。连续四周,每周五天,给予2ml的炸油灌胃。有氧运动包括在跑步机上跑步,连续四周,每周五次,每次40分钟。通过PCR方法检测B细胞淋巴瘤2(BCL-2)基因、与Bcl-2相关的X蛋白(BAX)基因、Caspase-3(Casp-3)基因和Caspase-9(Casp-9)基因的表达。采用ELISA方法计算超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)活性、丙二醛(MDA)和脑源性神经营养因子(BDNF)水平。还通过免疫组织化学和TUNEL染色评估大鼠脑组织中Cannabinoid受体类型1(CB1)、Cannabinoid受体类型2(CB2)、胶质纤维酸性蛋白(GFAP)、神经核(NeuN)和DNA断裂的蛋白表达。结果发现,炸油喂养导致BAX、Casp-3、Casp-9基因表达和DNA断裂的显著增加(p≤0.05),同时降低了BDNF浓度和SOD活性(p≤0.05)。有氧运动显著降低了BAX、Casp-3、Casp-9、MDA、CB1、GFAP和DNA断裂(p≤0.05)。综上所述,有氧运动可以减少炸油喂养对海马组织的有害影响。版权所有 © 2023 Elsevier B.V. 发布。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 31
GraceAvecilla,Pieter...
Copy number variation alters local and global mutational tolerance.
GENES & DEVELOPMENT
复制数变异(CNVs) 是基因组序列的重复和缺失,既有助于进化适应,也可能造成有害效应和疾病。尽管对于个别基因或整个染色体(即异染)的扩增效应进行了广泛研究,但对于不同大小和结构的CNVs的遗传和功能效应了解甚少。在这里,我们研究了在谷氨酸限制的连续培养中通过实验进化获得特异结构和拷贝数的Saccharomyces cerevisiae(酵母)菌株的CNVs。尽管在选择环境中有益,但与富含培养基的祖先比较,CNVs会导致适应度降低。我们使用转座子突变来研究CNV菌株中的突变耐受性和全基因组遗传相互作用。我们发现CNVs增加了突变靶位大小,在扩增的必需基因中提供了更高的突变耐受性,并导致与非连锁基因的新型遗传相互作用。我们验证了不同CNVs和BMH1之间的新型遗传相互作用是多个菌株共有的。我们还分析了全局基因表达,并发现转录剂量补偿对大部分被CNVs扩增的基因没有影响,尽管约12%的扩增基因发生了基因特异性的转录剂量补偿。此外,我们发现CNV菌株没有显示先前描述的异染的转录表征。我们的研究揭示了CNVs如何修改局部和全局的突变耐受性,这对基因组进化和与CNVs相关的疾病,比如癌症,具有重要意义。© 2023 Avecilla et al.; Published by Cold Spring Harbor Laboratory Press.
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GASTROENTEROLOGY
2023 Aug 29
KentaroSugano,Steven...
Gastric Intestinal Metaplasia: Real Culprit or Innocent Bystander as a Precancerous Condition for Gastric Cancer?
GASTROENTEROLOGY
胃肠化生(GIM)是指胃粘膜转变为肠道表型,可以发生在胃的所有部位,包括贲门、室部和幽门粘膜。自从早期描述GIM以来,其与分化型(肠型)胃癌的关联已被广泛关注。许多流行病学研究已确认GIM与胃癌发展之间有显著关联。幽门螺杆菌(H. pylori),作为胃癌的主要病因,在GIM的易感性中起到最重要的作用。虽然GIM在胃癌发生逐步进展模型(所谓的“Correa级联”)中的作用最近引起了质疑,但我们回顾了强有力支持这个长期模型的科学证据,并提出了一个基于Correa级联的新进展模型。根除H. pylori是全球预防胃癌最重要的方法,但对于已形成的GIM来说,根除的效果有限,甚至可以忽略。因此,对于存在大范围胃体GIM的患者来说,内镜监测GIM可能是必要的。近期集成人工智能的图像增强内镜技术的进展,将有助于识别GIM和肿瘤性病变,这将对预防策略产生重要影响。版权所有 © 2023 AGA Institute. 由Elsevier Inc.发表。保留所有权利。
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ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY
2023 Aug 29
DiWu,LianshengWang,Z...
Comprehensive assessment of detoxification mechanisms of hydrolysis fish peptides in largemouth bass (Micropterus salmoides) under copper exposure: Tracing from bioaccumulation, oxidative stress, lipid deposition to metabolomics.
ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY
作为一种重金属, 铜在水中对水生生物具有毒性, 会引起氧化应激和脂肪沉积。然而, 目前尚无有效的饮食策略来预防铜暴露造成的损害。本研究通过对铜暴露的大口黑鲈(Micropterus salmoides)在鱼肽水解(HFP)预处理后对其铜累积、抗氧化酶、脂肪合成酶、脂质代谢相关基因表达水平和代谢途径进行综合评估。结果表明,添加1%(P < 0.05)、3%(P < 0.01)和5%(P < 0.05)的HFP显著降低了大口黑鲈中的铜累积。鱼肽水解物补充显著降低了总抗氧化能力(P < 0.01)和过氧化氢酶(P < 0.01)的活性,以及还原型谷胱甘肽(P < 0.01)和丙二醛(P < 0.05)的含量。添加3%(P < 0.05)和5% HFP(P < 0.05)的鱼中脂肪酸合酶浓度显著降低。同样,饲喂3%(P < 0.05)和5%(P < 0.01)HFP的鱼显著降低了葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的浓度。血清代谢组学分析显示,添加1%、3%和5% HFP的鱼获得了85、144和207个差异代谢物。差异代谢物主要是脂质和类脂类分子, 与脂质代谢途径相关。添加3% HFP(P < 0.01)和5% HFP(P < 0.001)的鱼中脂肪酸合酶(P < 0.01)、类固醇调节元件结合蛋白-1c(P < 0.05)、肝X受体(P < 0.001)、过氧化物酶体增殖活化γ(P < 0.01)、载脂蛋白B(P < 0.001)和脂肪酸结合蛋白1的表达水平(P < 0.01)显著下调, 肉碱棕榈酰转移酶1α(P < 0.01)、激素敏感组织脂解酶(P < 0.001)和载脂蛋白A 1(P < 0.05)的表达水平显著上调。此外, 添加3% HFP(P < 0.01)和5% HFP(P < 0.001)的鱼中B细胞淋巴瘤-2基因的表达水平也显著上调, 并呈剂量依赖效应。综上所述, 本研究证实了HFP补充与大口黑鲈铜暴露引起的氧化应激、酶活性和相关代谢途径以及细胞凋亡密切相关, 总体上缓解了铜暴露引起的脂肪沉积的现象。版权所有 © 2023. 由Elsevier Inc.发表。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 31
WenshanZhai,YiYang,K...
Impact of visceral obesity on infectious complications after resection for colorectal cancer: a retrospective cohort study.
Disease Models & Mechanisms
目的是探索通过术前腹部计算机断层扫描(CT)测量的内脏肥胖(VO)对结直肠癌(CRC)患者术后感染并发症的影响,并建立预测模型。研究纳入了2015年1月至2021年1月间接受结直肠癌切除的患者。所有患者在术前测量了体重指数(BMI)和内脏脂肪面积(VFA)。根据BMI和VO分类,比较了不同组之间的感染并发症。采用单变量和多变量 logistic 回归分析 VO 是否是术后感染并发症的独立危险因素。根据回归分析结果,采用了六种机器学习方法建立预测模型并进行内部验证。通过 SHAPley Additive exPlanations(SHAP)值解释了效果最好的模型。约有520名患者中大约有64.81%患有 VO。VO 与术后感染并发症(P<0.001)、冠心病(P=0.004)、脑梗死(P=0.001)、高血压(P<0.001)、糖尿病(P<0.001)和脂肪肝(P<0.001)显著相关。VO 患者的切口感染率(P=0.048)、腹腔或盆腔感染率(P=0.006)和肺炎率(P=0.008)明显增加。与低 BMI 组相比,高 BMI 与高血压(P=0.007)、脂肪肝(P<0.001)以及术后感染率增加(P=0.003)显著相关。回归分析结果显示 VO(OR=2.01,95% CI 1.17~3.48,P=0.012)、手术时间≥4小时(OR=2.52,95% CI 1.60~3.97,P<0.001)、吸烟(OR=2.04,95% CI 1.16~3.59,P=0.014)、造口(OR=1.65,95% CI 1.04~2.61,P=0.033)和慢性阻塞性肺疾病(COPD)(OR=2.23,95% CI 1.09~4.57,P=0.029)是独立危险因素。轻梯度提升机(LGBM)模型显示出最大的受试者工作特征曲线下面积(AUC)(0.74,95% CI 0.68~0.81)。本研究表明,在评估肠癌患者肥胖对代谢合并症和术后感染并发症的影响时,VO 优于BMI。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 31
LeiGWang,AntonioRMon...
Nerve Visualization Using Phenoxazine-Based Near-Infrared Fluorophores to Guide Prostatectomy.
Disease Models & Mechanisms
荧光引导手术 (FGS) 通过近红外 (NIR) 荧光染料的组织和疾病特异性对比,有望通过改变手术医学。临床开放和腹腔镜 FGS 视觉系统几乎完全在 NIR 波长下操作。然而,与临床可用的成像系统兼容的组织特异性 NIR 对比剂缺乏,因此在前列腺切除术中持续存在神经组织识别的挑战。在这里,我们展示了结合类似药物的分子设计概念和荧光染料化学,使得生产出一系列 NIR 苯鍛基荧光染料,用于术中神经特异性成像。候选物能在犬和猪模型中使用临床广泛应用于微创前列腺切除术的达芬奇手术系统,准确描述前列腺神经和髂丛。这些结果表明,通过分子工程在 NIR 神经结合荧光染料中的可行性,可以便利地集成到现有手术工作流程中,为前列腺癌患者减少神经损伤的发生铺平了道路。本文受版权保护,版权所有。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 29
GirishBathla,DurjoyD...
AI-based Classification of Three Common Malignant Tumors in Neuro-oncology: A Multi-Institutional Comparison of Machine Learning and Deep Learning Methods.
Disease Models & Mechanisms
为了确定在基于人工智能的胶质母细胞瘤 (GBM)、颅内转移性疾病 (IMD) 和原发性中枢神经系统淋巴瘤 (PCNSL) 的三类分类中,机器学习 (ML) 或深度学习 (DL) 管线的性能更好。回顾性分析包括用于训练的502例病例 (208例GBM,67例PCNSL和227例IMD),并在86例病例上进行外部验证 (27:27:32)。多参数核磁共振成像 (T1加权、T2加权、FLAIR、DWI和T1-CE) 经过共注册、重采样、去噪和强度标准化处理,然后进行半自动三维增强肿瘤 (ET) 和肿瘤周围区域 (PTR) 的分割。使用多个ML管线和基于序列特定掩模的三维卷积神经网络 (3D-CNN) 以及掩模的组合来评估模型性能。所有管线在内部数据上进行了5折嵌套交叉验证的训练和评估,然后使用多类曲线下面积 (AUC) 在外部验证上进行了评估。两个ML模型在测试集上达到了类似的性能,一个使用T2-ET和T2-PTR掩模 (AUC: 0.885, 95% CI: [0.816, 0.935]),另一个使用T1-CE-ET和FLAIR-PTR掩模 (AUC: 0.878, CI: [0.804, 0.930])。最佳性能的DL模型在外部数据上使用了T1-CE-ET和T2-PTR掩模,取得了AUC为0.854 (CI [0.774, 0.914]),其次是使用T1-CE-ET、ADC-ET和FLAIR-PTR掩模的模型 (AUC: 0.851, CI [0.772, 0.909])。ML和DL派生的管线都取得了类似的性能。四个最佳模型中的三个都使用了T1-CE掩模。此外,这四个模型中都有一些来自PTR的掩模,要么是T2WI,要么是FLAIR。版权 © 2023. 由Elsevier Masson SAS出版。
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