表观遗传机制对于在哺乳动物中建立和保护细胞身份至关重要。它们动态调控基因、可移动元件和高阶染色质结构的表达。因此，这些染色质标记对于哺乳动物的发育至关重要，而其改变通常会导致疾病，如癌症。在分化和发育过程中，二项式启动子尤其重要。在这里，我们使用遗传筛选来鉴定新的二项式抑制基因调控剂。我们发现BEND3是数百个二项式启动子的调控剂，其中它一部分是抑制的，一部分是激活的。我们展示了BEND3被招募到存在于许多二项式启动子中的含CpG的共识位点。除了对其结合的启动子有直接影响外，失去BEND3会导致全基因组范围内DNA甲基化的增加，在通常由TET酶保护的区域尤为显著。Bend3突变细胞中DNA羟甲基化减少，可能是由于基因表达改变导致α-酮戊二酸产生减少，从而降低了TET酶的活性。我们的结果澄清了一个重要染色质调控因子BEND3的直接和间接作用，并且更广泛地揭示了二项式启动子的调控机制。© 2023作者。由牛津大学出版社代表核酸研究发表。

当组织和器官正在生长发育的阶段，它们对环境影响非常敏感，但目前尚不清楚这段时间内的暴露如何导致表观基因组的改变，增加了子宫肌瘤等激素相关疾病的风险。通过RNA-seq、ChIP-seq、RRBS、功能增强/减弱分析和荧光素酶活性分析，在培养中和Eker大鼠模型中对母细胞干细胞（MMSCs）进行了发育重编程的研究，该细胞被认为是子宫肌瘤的可能起源。当暴露于内分泌干扰化学物质（EDC）二乙基雌酚时，发现MMSCs经历了其雌激素响应转录组的重编程。在MMSCs中，重编程的基因称为雌激素响应基因（ERGs），并通过混合祖细胞白血病蛋白-1（MLL1）和DNA低甲基化机制被激活。此外，我们观察到，在EDC发育暴露后，经常遭受自然类固醇物质暴露的Eker大鼠的MMSCs中，ERGs的表达显著升高，从而增强了雌激素的活性。我们的研究确定了MLL1/DNA低甲基化介导的MMSC重编程的表观遗传机制。EDC的暴露通过表观遗传方式靶向MMSCs，导致一部分ERGs的表达持久性改变，给ERGs打上激素印记，使其呈现出“过度雌激素”表型，并增加了激素依赖性子宫肌瘤的风险。© 2023. 作者。

促红细胞生成素（EPO）被认为在红细胞生成中具有功能，然而其对肝纤维化的潜在抗纤维化效果尚不清楚。本研究检测了EPO是否会影响硫代乙酰胺（TAA）引起的肝纤维化，重点关注Toll样受体4（TLR4）级联和磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/Akt通路作为可能的途径。雄性Wistar大鼠随机分为四组，包括：阴性对照组、TAA组（腹腔注射；每周三次，TAA 100 mg/kg，连续2周）和EPO处理组（150 和 300 IU/kg，腹腔注射），在TAA注射后连续2周。EPO剂量依赖性地减轻了肝纤维化，表现为血清丙氨酸转氨酶和天冬氨酸转氨酶活性降低，白蛋白水平增加。EPO抑制了组织中肿瘤坏死因子-α、白细胞介素-1β、转化生长因子-β1和TLR4的水平增加，提高了PI3K和p-PI3K的水平。EPO的抗氧化性质通过恢复肝谷胱甘肽和超氧化物歧化酶，防止肝马来醛的积累而得到证明。此外，EPO增加了PI3K和Akt的蛋白表达，降低了TLR4的蛋白表达。免疫组化结果显示，EPO处理改变了组织组织学，下调了丝裂原活化蛋白激酶蛋白的表达。总之，研究表明EPO可以通过上调PI3K/Akt信号级联和下调TLR4下游轴来预防TAA引起的肝纤维化。

骨肉瘤（OS）是最常见的原发性恶性骨肿瘤，常见于儿童和青少年。目前，骨肉瘤的最常用治疗方法是手术联合化疗，但治疗效果通常不尽如人意。高转移率和治疗后复发率是骨肉瘤治疗中的主要挑战。这突显了对骨肉瘤病因机制的深入研究和更有效的治疗方法的发展的需要。先前的研究已经证明了骨微环境和信号通路调控在骨肉瘤发生和发展中的重要作用。在本综述中，我们讨论了与骨肉瘤发展机制相关的现有证据，并确定了骨肉瘤的治疗靶点。我们还总结了骨肉瘤的可用治疗方法，并确定了未来治疗研究的优先方向。版权所有 © 2023 中国医学会，由Wolters Kluwer, Inc.根据CC-BY-NC-ND许可证创作和制作。

早期发现食管鳞状细胞癌（ESCC）可以大大改善患者的预后。异常的细胞外游离DNA（cfDNA）甲基化特征是检测ESCC的一种有前途的工具。然而，基于细胞外DNA甲基化的可用标志物仍然不足。本研究旨在确定ESCC特异性的cfDNA甲基化标志物，并评估其在早期检测ESCC中的诊断性能。我们对24例ESCC组织及其正常邻近组织进行了全基因组亚硫酸盐测序（WGBS）。基于WGBS数据，我们确定了21,469,837个合格的CpG位点。通过整合多个甲基化数据集，我们确定了几个有前途的ESCC特异性细胞外DNA甲基化标志物。最后，我们基于甲基化的KCNA3和OTOP2开发了一个双标志物组合板，并在我们的训练和验证队列中评估其性能。基于KCNA3和OTOP2构建的ESCC诊断模型在训练队列中具有0.91的AUC值（95％CI：0.85-0.95），并具有84.91％的最佳敏感性和94.32％的最佳特异性。在独立的验证队列中，AUC为0.88（95％CI：0.83-0.92），敏感性为81.5％，特异性为92.9％。对于I-II期ESCC，模型的敏感性为78.4％，略低于III-IV期ESCC模型的敏感性（85.7％）。基于cfDNA的双目标板显示出了优异的ESCC检测性能，并可能成为筛查ESCC的替代策略。 版权所有 © 2023 中华医学会，Wolters Kluwer, Inc. 根据CC-BY-NC-ND许可协议制作。

多种分子机制促进结直肠癌（CRC）的发展，其中染色体不稳定性（CIN）起着重要作用。CRC受到多个重要基因突变的影响，包括APC、TP53、KRAS、PIK3CA、BRAF和SMYD4。该疾病的三个分子亚型是CIN、MSI-H和CIMP（CpG岛表型）。p53功能失调和异常的Wnt信号传导是CRC癌变的共同特点。尽管传统治疗取得了进展，但转移性CRC由于毒性和耐药性而难以治疗。纳米技术对癌症的治疗诊断联合疗法（Theranostics）具有重要意义，因为它能够实现更有针对性、个体化护理，并减少副作用。利用功能化纳米颗粒实现了MRI引导的基因治疗、磁性热疗、化疗、免疫疗法以及光热/光动力疗法，从而彻底改变了癌症的治疗方式。使用纳米颗粒上的配体或肽段的主动靶向改善了药物传递到癌细胞的效果。药物肽共轭物、壳聚糖纳米颗粒、金纳米颗粒、碳纳米管、介孔二氧化硅基纳米颗粒、银纳米颗粒、混合脂质聚合物纳米颗粒、氧化铁纳米颗粒和量子点等纳米结构可能实现对CRC的靶向药物传递和增强治疗效果。纳米药物目前正在临床试验中评估用于结直肠癌的治疗，有望提供更有效和个体化的治疗方案。本文考察了CRC的当前纳米医学专利，包括Delta-Fly、Merrimack和Pfenning, Meaning & Partner等的工作。从未来纳米医学研究和发展的角度来看，配体生产、颗粒大小和清除是重要因素。最后，纳米医学用于靶向药物治疗和诊断的众多纳米结构表明了改善CRC治疗前景的乐观前景。本综述还强调了现有结肠癌治疗的纳米医学研究和发展的成功之处。© 2023。本文作者授予Springer-Verlag GmbH Germany独家许可使用，隶属于Springer Nature。

大肠杆菌是一种杆状生物体，由复杂的双膜结构组成。了解电场驱动的离子传输通过两个膜以及其诱导的通透性改变的演化在生物医学工程、基因传递和抗菌剂传递等领域具有重要应用。然而，在考虑到所有离子类型的情况下，关于革兰氏阴性菌的研究还很少。为弥补这一知识空白，我们开发了一个确定性和随机的布朗动力学模型，以在三维空间中模拟大肠杆菌细胞质膜中形成的孔道中离子的运动。从数值模型中估计了Ca2+、Mg2+、Na+、K+和Cl-离子在孔道区域内的扩散系数、迁移率和传输时间。通过在古斯塔夫·鲁西研究所进行的实验证实了孔道的电导率计算结果。从模拟中发现，在脉冲期间，主要的离子摄取驱动力是外加电场。这项研究的结果对于理解电渗透过程中的离子运输提供了更好的理解，有助于设计最大限度增加离子通量的电脉冲，主要用于癌症治疗应用。© 2023. 作者(们)在生物医学工程学会拥有独家许可权。

我们先前报道了长链非编码RNA（lncRNA）RPLP0P2在结直肠癌（CRC）进展中的参与，然而它在CRC中的分子机制仍不清楚。在本研究中，我们观察到RPLP0P2在CRC组织和细胞系中上调表达。细胞活力通过MTT和克隆形成实验测定。迁移和侵袭能力通过伤口愈合、透过法和免疫荧光实验监测。结果显示RPLP0P2下调抑制了CRC细胞的细胞活力、迁移和侵袭能力，伴随着PCNA、N-钙黏蛋白和Vimentin表达下调以及E-钙黏蛋白表达上调。我们通过DIANA在线数据库确定miR-129-5p是RPLP0P2的下游靶点。事实上，RPLP0P2与miR-129-5p共定位，作为miR-129-5p的海绵。miR-129-5p抑制几乎消除了RPLP0P2抑制在CRC细胞中诱导的抗肿瘤效应。在CRC细胞中，酞锌和BTB结构域包含20（ZBTB20）被确定为miR-129-5p的一个潜在下游靶点。ZBTB20过表达在CRC细胞中预防了miR-129-5p模拟器介导的抗肿瘤效应。通过肿瘤异种移植实验来监测RPLP0P2在肿瘤生长中的作用。值得注意的是，在携带肿瘤的小鼠中，RPLP0P2沉默抑制了肿瘤生长，随之miR-129-5p表达增加，ZBTB20表达下降。我们的结果表明lncRNA RPLP0P2作为一个促进CRC细胞增殖和侵袭的癌基因，通过调节miR-129-5p/ZBTB20轴，因此可能作为CRC介入治疗的候选靶点。© 2023. 作者，独家许可Springer Science+Business Media, LLC，Springer Nature的一部分。

DNA甲基化的改变被誉为恶性疾病诊断、预后和预测价值的有希望的靶点。本研究基于表观遗传改变和免疫细胞浸润分析，研究了葡萄膜黑色素瘤（UM）中CD3D甲基化的机制。对TCGA数据库中的UM患者的转录组数据、450K甲基化数据和临床信息进行了生物信息学分析。通过计算UM样本的基质得分和免疫得分来评估基质和免疫细胞浸润。将UM样本分为高和低基质得分以及免疫得分的组别，然后进行差异和富集分析。通过蛋白质相互作用网络构建和相关分析来识别与预后相关的核心基因。生物信息学分析结果通过UM细胞实验得到了验证。基质得分和免疫得分与UM患者的预后显著相关。CD3D、IRF1、CCL3和FN1被识别为受甲基化驱动的核心基因，影响UM患者的预后。CD3D表达与其甲基化呈最高相关性，并与UM发展的四个关键免疫细胞密切相关。UM细胞中CD3D表达低甲基化，且富集表达，而CD3D的沉默抑制了体外UM细胞的增殖、迁移和侵袭。总之，本研究鉴定了UM中CD3D启动子的低甲基化，与UM的免疫细胞浸润相关。© 2023美国实验生物学联合会。

三分之一的III期结直肠癌患者将经历肿瘤复发。目前尚不确定III期结直肠癌患者在术后化疗期间和之后进行体力活动是否能改善肿瘤复发后的整体生存。本前瞻性队列研究嵌入在一项多中心随机试验中，研究对象为最初诊断为III期结直肠癌并经历肿瘤复发的患者（N=399）。测量了肿瘤复发前的术后体力活动。通过代谢当量任务每周能量消耗量（MET-h/week）来量化体力活动。主要终点为肿瘤复发后的总体生存。多变量灵活参数化生存模型估计了相对效应和绝对效应，并进行了双侧假设检验。 与每周<3.0 MET-h的体力活动相比（相当于每周<1.0小时的快走），每周≥18.0 MET-h的体力活动（相当于每周6小时的快走）的患者在肿瘤复发后的整体生存时间上有33%的相对改善（危害比0.67，95% CI 0.42-0.96）。肿瘤复发后3年的总体生存率为61.3%（95% CI 51.8%-69.2%），每周<3.0 MET-h的体力活动组与72.2%（95% CI 63.1%-79.6%）的≥18 MET-h的体力活动组相比有10.9个百分点的风险差异（95% CI 1.2-20.8个百分点）。 术后更高的体力活动与最初诊断为III期结直肠癌的患者肿瘤复发后的整体生存改善有关。这些数据对那些尽管进行了最佳术后药物治疗但仍然面临较高肿瘤复发风险的患者可能具有相关性。 ©2023美国癌症学会。