研究动态
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 31
GuixingZhang,Huiting...
Osimertinib resistance prognostic gene signature: STRIP2 is associated with immune infiltration and tumor progression in lung adenocarcinoma.
GENES & DEVELOPMENT
尽管奥西美替尼的使用能显著提高具有表皮生长因子受体突变的肺腺癌(LUAD)患者的生存时间,然而药物抗性最终会限制大多数患者的生存益处。本研究旨在基于与奥西美替尼抗性相关的基因开发一种新的预后预测标识。从Gene Expression Omnibus数据集和The Cancer Genome Atlas数据集中筛选与奥西美替尼抗性相关的差异表达基因(DEGs)。使用多变量Cox回归建立预后标识,然后开发一种预测LUAD患者生存概率的评分卡。我们使用ROC曲线和DCA曲线评估其临床预测准确性和净益。此外,选择与预后显著相关的差异表达基因进行免疫渗透分析和药物敏感性分析,并通过体外实验验证其在肺腺癌发展中的作用。我们的评估结果表明,新的评分卡的临床预测准确性和净益值高于TN评分卡。进一步分析显示,STRIP2表达低的患者具有更高的免疫应答水平,可能更有可能从免疫检查点抑制剂和常规抗肿瘤药物中获益。这可以帮助为奥西美替尼抗性的LUAD患者选择更精准和适当的治疗。此外,体外实验显示STRIP2促进了LUAD细胞的增殖、迁移和侵袭。这进一步证明了该基因标识对预后预测的重要性。我们基于与奥西美替尼抗性相关的DEGs开发了一个可靠的预后模型,并筛选了可以预测LUAD患者免疫应答的生物标志物,这可能有助于在奥西美替尼抗性后选择治疗方案。© 2023. The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature.
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 31
ChenWei,YichaoMa,Fei...
Machine learning and single-cell sequencing reveal the potential regulatory factors of mitochondrial autophagy in the progression of gastric cancer.
GENES & DEVELOPMENT
线粒体自噬作为一种重要的调节机制,以清除受损线粒体和维持内外环境平衡为目标,在癌症的发展和治疗中起着关键作用(Onishi EMBO J 40(3): e104705, 2021)。本研究旨在通过RNA测序(RNA-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq),全面分析线粒体自噬相关基因在胃癌(GC)发展中的作用。GSE26942、GSE54129、GSE66229、GSE183904等数据集通过GEO数据库获取到。分别采用支持向量机递归特征消除(SVM-RVF)算法和随机森林算法,获得与胃癌相关的线粒体自噬相关基因。之后,构建模型并分析炎症因子、免疫评分和免疫细胞浸润。此外,根据13个GC样本中28,836个细胞的scRNA-seq数据,利用scRNA-seq分析鉴定出18个细胞簇和7个细胞类型。通过细胞通讯分析验证相关基因的表达水平和信号通路。最后,通过SCENIC分析细胞的调控网络。通过机器学习算法,鉴定出MAP1LC3B、PGAW5、PINK1、TOMM40和UBC作为关键基因。在肿瘤环境中,CXCL12-CXCR4、LGALS9-CD44、LGALS9-CD45以及MIF (CD74 + CD44) 通路可能在具有较高T细胞和单核细胞评分的内皮细胞中发挥重要作用。在GC细胞簇中,识别出CEBPB、ETS1、GATA2、MATB、SPl1和XBP1作为具有特定调控表达的候选转录因子。本研究结果为研究GC中线粒体自噬的机制、诊断和治疗提供了启示。© 2023. 作者(们)在Springer-Verlag GmbH Germany的独家许可下,属于Springer Nature。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 30
YingChan,WeimingXu,Y...
Association of TP53 rs1042522 G > C, MDM2 rs2279744 T > G, and miR-34b/c rs4938723 T > C polymorphisms with aneuploidy pregnancy susceptibility.
GENES & DEVELOPMENT
非整倍体妊娠是一种严重的先天缺陷,其病因不明的情况下导致约50%的自发性流产。到目前为止,只有少数涉及非整倍体妊娠风险因素的流行病学研究,且样本规模较小。TP53、MDM2和miR-34b/c基因与非整倍体肿瘤发生有关,但其多态性在非整倍体妊娠易感性方面的功能需要进一步阐明。为了阐明TP53 rs1042522 G > C、MDM2 rs2279744 309 T > G和miR-34b/c rs4938723 T > C等特定多态性与非整倍体妊娠的关联。在回顾性病例对照研究中,于中国云南省昆明市第一人民医院于2018年1月至2022年4月招募了330名非整倍体妊娠妇女和813名正常妊娠对照。使用快照法对TP53 rs1042522 G > C(Arg72Pro)、MDM2 rs2279744 309 T > G和miR-34b/c rs4938723 T > C这三个功能性多态性进行基因分型。在病例和对照妊娠妇女之间,三种基因型变异的频率分布没有差异,并且与Hardy-Weinberg平衡相似。然而,在年轻亚组(35岁以下),等位基因和隐性模型存在显著差异(p = 0.01)。在高龄亚组(35岁及以上),MDM2 rs2279744 T > G的G等位基因在病例中的频率明显高于对照组(p = 0.045),而miR-34b/c rs4938723 T > C在显性模型下的差异也显著(p = 0.03),但在其他模型和年轻组和老年组中未观察到显著差异(p > 0.05,分别)。这些结果表明个体多态性与非整倍体妊娠无关,但结合年龄,它们可能作为非整倍体妊娠的危险因素。TP53 rs1042522 G > C、MDM2 rs2279744 T > G和miR-34b/c rs4938723 T > C多态性与母亲年龄的组合可能与非整倍体妊娠易感性有关。这些发现可能有助于深入了解非整倍体妊娠的遗传病因。© 2023. BioMed Central Ltd., Springer Nature的一部分。
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Gastric Cancer
2023 Aug 30
Tae-HwanKim,Jin-Hyuk...
Thromboembolic events in patients who received adjuvant chemotherapy for gastric cancer: a single-center retrospective study.
Gastric Cancer
恶性肿瘤患者在接受化疗过程中可能发生血栓栓塞事件(TEE),这是一个严重的不良事件,可导致严重的病症和死亡。有报道称,接受姑息化疗的胃癌(GC)患者TEE的发生率为5-27%。然而,很少有报告涉及GC辅助化疗(AC)时出现的TEE。本研究对在2013年1月至2020年6月期间,在一家单一中心接受了根治性切除手术后开始使用卡培他滨/奥沙利铂(167例)或S-1(444例)进行AC的611例GC患者(II期:309例,III期:302例)进行了回顾性分析。在AC过程中或AC完成后的1年内调查了TEE的发生率,并分析了影响TEE发生的因素。共有20名患者(3.3%)被确认出现TEE,其中几乎所有的患者都在S-1组(19例)中发生TEE。最常见的TEE类型是脑梗死和肺血栓栓塞(各有5例)。虽然高龄(≥ 70岁,p<0.0001)、S-1治疗(p=0.021)和高血压(p=0.017)在单变量分析中被确定为TEE的显著危险因素,但只有高龄在多变量分析中与TEE的发生存在显著相关性(奥德斯比:3.07;95%置信区间1.11-8.48;p=0.031)。与之前的报告相比,在接受AC的GC患者中TEE的发生率较低。然而,正在接受AC治疗的年老的GC患者需要更加仔细地监测可能发生的TEE,考虑其相对较高的发生率。© 2023. 作者经独家许可授权给国际胃癌协会和日本胃癌协会。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 28
FahimEbrahimi,Hannes...
Familial Coaggregation of MASLD with Hepatocellular Carcinoma and Adverse Liver Outcomes: Nationwide Multigeneration Cohort Study.
Disease Models & Mechanisms
代谢功能障碍相关的脂肪肝疾病(MASLD; 以前被称为NAFLD)是全球肝细胞癌(HCC)最快增长的原因。然而,MASLD患者的家庭成员是否也有较高发展肝细胞癌的风险尚不清楚。本研究涉及所有瑞典成人中经活检证实的MASLD(1969-2017)的直系亲属和匹配的一般人口对照群体,利用瑞典多代人登记表,我们确定了38,018例MASLD一级亲属(父母、兄弟姐妹、子女)和9,381例MASLD配偶,以及197,303例对照群体一级亲属和47,572例对照群体配偶。我们使用Cox比例风险模型计算了HCC、肝硬化、脱水性肝病或肝移植、肝相关死亡、非肝癌性死亡的调整风险比(aHR)。在中位随访时间17.6年内,MASLD一级亲属的主要结果HCC的发病率高于对照一级亲属(13 vs. 8/100,000PY; aHR=1.80, 95%CI=1.36-2.37)。与MASLD患者肝纤维化/肝硬化的亲属的HCC风险进一步增加(aHR=2.14, 95%CI=1.07-4.27; PHeterogeneity=0.03)。MASLD一级亲属的重大不良肝脏结果(73 vs. 51/100,000PY; aHR=1.52, 95%CI=1.36-1.69)和肝相关死亡率(20 vs. 11/100,000PY; aHR=2.14, 95%CI=1.67-2.74)也较高。当成为MASLD患者的一级亲属时,任何伴有慢性肝病的个体都会加速肝病的进展(aHR=1.47, 95%CI=1.29-1.67)。MASLD配偶在重大不良肝脏结果(86 vs. 74/100,000PY; aHR=1.23, 95%CI=1.01-1.51)和肝相关死亡(25 vs. 19/100,000PY; aHR=1.93, 95%CI=1.15-3.23)方面的风险更高,但HCC风险不高(aHR=1.43, 95%CI=0.87-2.35)。在经活检证实的MASLD患者家庭中存在明显的不良肝脏相关结果群集,以及HCC、进行性肝病和肝相关死亡的相对风险升高,但绝对风险较低。代谢功能障碍相关的脂肪肝疾病(MASLD; 据称非酒精性脂肪性肝炎; NAFLD)在有高遗传易感性和共享环境危险因素的家族中聚集,但MASLD患者的家庭成员发展肝细胞癌(HCC)和其他重大肝脏相关结果的风险在很大程度上是未知的。本研究涉及与活检证实的MASLD个体的家庭成员(直系亲属和配偶)以及配对的一般人口对照者,发现了一级亲属中微增的HCC风险,并对所有活检证实的MASLD个体的家庭成员发展肝硬化和肝相关死亡的风险也稍微增加。本研究结果提供了大规模的证据,可用于制定临床实践指南,以对高风险肝脏疾病和死亡的个体进行早期识别的建议。版权所有© 2023 作者。由Elsevier B.V.出版。保留所有权利。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Aug 30
MuradRMamedov,ShaneV...
CRISPR screens decode cancer cell pathways that trigger γδ T cell detection.
DIABETES & METABOLISM
γδ T细胞是强效的抗癌效应细胞,具有广泛靶向肿瘤的潜力,并且不依赖患者特异性新抗原或人类白细胞抗原背景。γδ T细胞能够感知在转化细胞中普遍存在的保守细胞应激信号,然而目前对有应激靶细胞的靶向机制尚未充分揭示。Vγ9Vδ2 T细胞是人类γδ T细胞中最丰富的亚群,能够识别含有丰富由肿瘤细胞产生的磷酸抗原激活的细胞表面蛋白复合物的蛋白2A1 (BTN2A1)和BTN3A1 (参考文献6-8)。本文中,我们结合基因组范围的CRISPR筛选,在靶癌细胞中鉴定了调控γδ T细胞杀伤作用和BTN3A细胞表面表达的通路。筛选结果显示了BTN3A在细胞表面的丰度受到多层次调控,并通过转录、翻译后修饰和膜转运等途径激活γδ T细胞。此外,对癌细胞进行不同的遗传干扰和破坏代谢通路的抑制剂的研究发现,特别是ATP生成过程的干扰,能够改变BTN3A水平。在代谢危机期间,BTN3A和BTN2A1的诱导依赖于AMP激活蛋白激酶 (AMPK)。最后,我们发现小分子激活AMPK在细胞系模型和患者源性肿瘤器官样体内可增加BTN2A1-BTN3A复合物的表达,并提高Vγ9Vδ2 T细胞受体介导的杀伤作用。这种AMPK依赖的代谢应激诱导的配体上调机制加深了我们对γδ T细胞应激监视的认识,并提出了增强γδ T细胞抗癌活性的新途径。© 2023. 作者(们),独家许可给 Springer Nature Limited。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 28
,JustineRSmith,AlixF...
Presentation, Diagnostic Testing and Initial Treatment of Vitreoretinal Lymphoma.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
玻璃体视网膜淋巴瘤是一种具有较高致死率的恶性肿瘤。罹患率较低,缺乏指导治疗的医学证据。本研究描述了最近被诊断和治疗的患者队列的临床展现、诊断测试和首次治疗方法。临床登记的观察性研究。诊断为玻璃体视网膜淋巴瘤的48名女性及32名男性患者(年龄为32至91岁,中位数为64岁)。国际眼科医生网络通过电子平台报告了2020年1月1日至2022年12月31日期间患有玻璃体视网膜淋巴瘤的患者的临床特征和管理情况。首次就诊时的视觉力(LogMAR);诊断依据;首次治疗。玻璃体视网膜淋巴瘤在65%的患者(N=52)的首次就诊时是双眼成病,78%的患者(N=62)首次出现淋巴瘤部位。在首诊时有127只眼出现淋巴瘤,其中玻璃体受累89%(N=113),且是唯一受累眼组织的40%(N=51);视网膜受累46%(N=58),且是唯一受累眼组织的9%(N=11)。最差视力眼的中位数LogMAR为0.50。80%的患者(N=64)通过眼部标本诊断出淋巴瘤,通常是玻璃体(N=57,占64患者的89%),20%的患者(N=16)通过其他临床信息诊断。92%的患者(64名中的59名)进行了细胞学研究,其中最常见的是细胞学检查。21名患者(64名中的33%)进行了肿瘤基因分析,13名患者(64名中的20%)进行了细胞因子测定。76位患者(95%)在诊断后的6个月内开始接受治疗,包括眼部(48%,76名中的38名)、眼部外(21%,76名中的17名)和眼部外加眼部联合(26%,76名中的21名)治疗方法。玻璃体内甲氨蝶呤是最常见的眼部治疗方法(83只眼中的87只,占95%)。通过收集自2020年以来诊断为玻璃体视网膜淋巴瘤的80名患者的数据,我们表明视力障碍普遍存在,并且常见的治疗方法包括通过细胞学测试进行诊断和使用玻璃体内化疗进行治疗。版权所有 © 2023 Elsevier Inc.
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 28
IkukoShibasaki,Naoyu...
Utility of growth differentiation factor-15 as a predictor of cardiovascular surgery outcomes: Current research and future directions.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
在面对心血管疾病(CVDs)日益严峻和人口老龄化的世界中,心脏手术前精确的风险评估至关重要。尽管日本SCORE,胸外科医生学会评分和EuroSCORE II等传统的风险计算器已经被证明有效,但它们可能无法完全捕捉到当代风险,特别是由脆弱和肌萎缩等新出现的因素引起的风险。这些计算器通常关注地区和民族特异性,并且严重依赖基于年龄和潜在疾病的评估。生长分化因子-15(GDF-15)是一种应激反应的细胞因子,已被确定为肌萎缩的潜在生物标志物,并且是未来心脏风险评估的工具。手术前血浆GDF-15水平与接受心脏手术的患者的术前、术中和术后因素以及短期和长期死亡率有关。增加的血浆GDF-15水平具有预测意义,与手术中使用体外循环、出血量、术后急性肾损伤和重症监护病房停留时间有关。值得注意的是,将术前GDF-15水平纳入风险分层模型可以提高其预测价值,尤其是与脑钠肽N末端前体相比,后者不会导致重分类。因此,本研究审查了心脏手术传统风险评估和新生物标志物GDF-15的作用。本研究承认患者预后与升高的GDF-15水平之间的关系不仅限于心血管疾病或心脏手术,还可能与糖尿病和癌症等各种疾病有关。此外,GDF-15的正常范围尚未明确定义。鉴于GDF-15在改善心血管手术的患者护理和预后方面的潜力,未来的研究应探索GDF-15作为术后结果的生物标志物和靶向治疗干预的潜力。版权所有 © 2023. Elsevier Ltd.出版。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 28
JieZhang,Zhi-WeiYe,P...
Microsomal Glutathione Transferase 1 Controls Metastasis and Therapeutic Response in Melanoma.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
尽管最近对恶性黑素瘤进行的靶向治疗和免疫治疗令人鼓舞,但大多数患者会产生耐药性,说明有必要确定其他药物靶点以改善疗效。最近,人们开始关注调节氧化还原平衡的途径,特别是保护细胞免受铁死亡的脂质过氧化途径。在这里,我们发现微粒体谷胱甘肽S转移酶1(MGST1),一种非硒依赖性谷胱甘肽过氧化物酶,在恶性黑素瘤和耐药性黑素瘤中高度表达,并作为转移能力和治疗敏感性的特定决定因子。小鼠和人黑素瘤中MGST1的缺失增强了细胞氧化应激,减弱了糖酵解、氧化磷酸化和戊糖磷酸途径。gp100激活的pmel-1 T细胞杀死了更多的Mgst1 KD而不是对照黑素瘤细胞,而KD细胞对细胞毒性抗癌药和铁死细胞死亡更敏感。与对照组相比,携带Mgst1 KD B16肿瘤的小鼠中有更多的CD8+ T细胞浸润,抑制性受体表达减少,细胞因子反应增强,肺转移大幅减少,生存期延长。靶向MGST1可以改变氧化还原平衡,限制黑素瘤的转移,增强化疗和免疫治疗的治疗指数。版权所有 © 2023. 由Elsevier Ltd. 发布。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug
Gee-HyunKim,JaeHyuck...
Elevated interleukin-10 levels in patients with ocular toxoplasmosis.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
在老年患者中,眼睛弓形虫病是最常见的葡萄膜炎症病因之一,需要与眼球淋巴瘤进行鉴别诊断,后者是老年人常见的葡萄膜炎症病理学。高水平的白细胞介素(IL)-10和IL-10/IL-6比值大于1(>1.0)是诊断眼球淋巴瘤的有帮助的参数。本研究中,我们使用房水样本检测出4例具有高水平IL-10和IL-10/IL-6比值大于1的眼睛弓形虫病患者。我们的结果表明,眼睛弓形虫病可能与房水中细胞因子水平增加有关。
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