研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Aug 30
QianFeng,ZhihaoHuang...
Combining bulk and single-cell RNA-sequencing data to develop an NK cell-related prognostic signature for hepatocellular carcinoma based on an integrated machine learning framework.
Cellular & Molecular Immunology
分子靶向治疗和免疫治疗的应用显著延长了肝细胞癌(HCC)患者的生存时间。然而,HCC的多药耐药性和高分子异质性仍然限制了临床效益的进一步改善。肿瘤浸润的自然杀伤(NK)细胞功能障碍与HCC进展和HCC患者的生存效益密切相关。因此,建立了与NK细胞相关的预后标志来预测HCC患者的预后和免疫治疗反应。NK细胞标记物是从GSE162616数据集中获取的单细胞RNA测序数据中选择的。采用一共77个算法的共识机器学习框架,用于在TCGA-LIHC数据集、GSE14520数据集、GSE76427数据集和ICGC-LIRI-JP数据集中建立基因签名。此外,使用GSE91061数据集和PRJEB23709数据集对ICI反应的预测效力进行了外部验证。在77个算法中排名最高的C索引下,通过LASSO和CoxBoost算法的组合建立了一个由11个基因组成的签名,将患者分为高风险组和低风险组。预后标志显示了较好的整体生存率预测性能,预测准确性适中到高,并且是TCGA、GEO和ICGC队列中HCC患者预后的独立危险因素。与高风险组相比,低风险患者显示出更高的IPS-PD1阻断剂、IPS-CTLA4阻断剂、常见免疫检查点表达,但更低的TIDE评分,这表明低风险患者可能更容易受益于ICI治疗。此外,一个真实世界的队列PRJEB23709也显示出低风险组对免疫治疗的反应更好。总的来说,本研究基于NK细胞相关基因建立了一个基因签名,为HCC患者的预后和免疫治疗反应评估提供了一个新平台。 © 2023 BioMed Central Ltd., Springer Nature的一部分。
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CELL DEATH AND DIFFERENTIATION
2023 Aug 30
JunyaNing,XiukunHou,...
METTL3 inhibition induced by M2 macrophage-derived extracellular vesicles drives anti-PD-1 therapy resistance via M6A-CD70-mediated immune suppression in thyroid cancer.
CELL DEATH AND DIFFERENTIATION
对于难治的晚期乳头状甲状腺癌(PTC)和间变甲状腺癌(ATC)来说,标准疗法的治疗选择有限。虽然抗PD-1治疗具有可控的安全性,并在少数晚期PTC和难治ATC患者中有效,但大部分患者要么不响应,要么对抗PD-1治疗产生抵抗。N6-甲基腺苷(m6A)修饰是肿瘤微环境(TME)复杂度的关键决定因素,但目前尚不清楚肿瘤细胞中m6A修饰是否以及如何塑造PTC和ATC的免疫景观。本研究通过对PTC和ATC组织进行批量和单细胞RNA测序分析,发现低METTL3表达不仅与免疫检查点阻断(ICB)治疗的差反应相关,而且与免疫抑制性调节T细胞和终末耗竭T细胞中增加的TNF家族相关配体-受体相互作用有关。此外,在PTC和ATC细胞中过表达METTL3可以增强抗PD-1治疗在外周血单个核细胞人源化NCG(huPBMC-NCG)小鼠模型中的疗效。机制上,M2巨噬细胞衍生的细胞外囊泡(M2 EVs)通过miR-21-5p抑制PTC和ATC细胞中的METTL3表达。METTL3的下调促进了CD70 mRNA的去甲基化,阻止了YTHDF2介导的转录物降解。CD70 mRNA的稳定和随后CD70蛋白水平的上调增加了免疫抑制性调节T细胞和终末耗竭T细胞的丰度,从而导致对抗PD-1治疗的抵抗。此外,使用高亲和力的单克隆抗体cusatuzumab阻断CD70能够逆转由M2 EVs诱导的抗PD-1治疗耐药性。最后,我们证明METTL3表达与PTC和ATC组织中的CD70表达以及M2巨噬细胞和调节T细胞浸润呈负相关。我们的研究结果为开发晚期PTC和ATC的新治疗方法提供了新的见解。 © 2023. 作者(们),在ADMC Associazione Differenziamento e Morte Cellulare的专属许可下。
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CANCER LETTERS
2023 Aug 28
Fang-FangZhuo,LingLi...
Lycorine promotes IDH1 acetylation to induce mitochondrial dynamics imbalance in colorectal cancer cells.
CANCER LETTERS
异柠檬酸脱氢酶(IDH)1和2作为能量代谢中的关键酶,在多种实体瘤尤其是结直肠癌(CRC)的生存和药物耐药性中发挥重要作用。然而,其潜在的分子机制仍然不清楚。在本研究中,我们使用无偏的热蛋白质组学分析(TPP)策略,将IDH1确定为天然衍生的抗CRC小分子利科力的关键细胞靶点。我们发现,利科力直接靶向IDH1的独特C端结构域,破坏了IDH1与去乙酰化酶sirtuin 1(SIRT1)的相互作用,从而显著促进了IDH1的乙酰化修饰。然后,利科力明显地诱导了CRC细胞的氧化应激,导致线粒体膜损伤,并进一步促进线粒体分裂。特异性敲低IDH1或SIRT1明显加剧了利科力介导的CRC细胞氧化应激和线粒体碎裂。此外,利科力与SIRT抑制剂烟酰胺(NAM)的联合治疗在CRC细胞中展示了协同的治疗效果。总之,我们的结果揭示了IDH1可能作为治疗CRC的有前途的靶点,通过药理学方式驱动氧化应激依赖的线粒体动力学失衡。版权所有 © 2023. Elsevier B.V. 发表。
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Microbial Cell Factories
2023 Aug 30
OlgaMarchut-Mikołajc...
Endophytic bacteria isolated from Urtica dioica L.- preliminary screening for enzyme and polyphenols production.
Microbial Cell Factories
内生菌,尤其是从草本植物中分离出来的内生菌,可能充当多种生物活性的次生代谢物的储库。一些内生菌表现出与它们的植物寄主相同的生物活性化合物的产生能力,使它们成为这些物质更可持续的工业供应。大麻草(Urtica dioica L.)是一种广泛用于草药中的共生植物,因其含有多种生物活性化学品,如多酚类物质,它们具有抗炎、抗氧化和抗癌等能力。本研究旨在从大麻草中分离内生细菌,以获取其生物活性化合物。通过生化和分子方法(16S rRNA)鉴定了内生分离物,并对其酶、表面活性物质和多酚类物质的产生进行了研究。每个分离的细菌菌株都能产生表面活性物质和多酚类物质。然而,其中三株鉴定为两株蜡样芽孢杆菌 (Bacillus cereus) 和一株草枯膏芽孢杆菌 (Bacillus mycoides) 的内生菌菌株具有最大的表面活性物质和多酚类物质产生能力。培养液中衍生的提取物显示了1.633 mol l-1 (9.691 mg l-1) 的多酚类化合物浓度。因此,本研究表明,从大麻草中分离得到的内生蜡样芽孢杆菌和草枯膏芽孢杆菌可能是表面活性物质和多酚类物质的潜在来源。然而,需要进一步研究以了解该过程的机制,并实现内生细菌高效产生多酚类物质。 © 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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Experimental Hematology & Oncology
2023 Aug 28
JingjingLi,CamilleMa...
Chronic inflammation can transform the fate of normal and mutant haematopoietic stem cells.
Experimental Hematology & Oncology
慢性炎症虽然隐匿,但会使机体处于持续警觉状态,并与多种疾病,包括癌症和心血管疾病相关。它会促使造血细胞产生和释放促炎细胞因子,该细胞因子会激活造血干细胞(HSCs)中的特定信号通路,引起增殖、分化和迁移变化。当HSCs需要产生特定的血球以排除病原病毒等入侵物时,这种响应是必不可少的,但突变HSCs可以利用这些促炎信号来加速血液病或恶性肿瘤的发展。了解这一复杂过程对监测和控制患者疾病进展至关重要。在2023年冬季国际实验血液学学会(ISEH)网络研讨会中,Eric Pietras博士(美国科罗拉多州安舒茨医学校区)和Katherine Y. King博士(美国贝勒医学院)就这一主题进行了演讲,本综述文章对其进行了概述。版权所有 © 2023 Elsevier Inc.
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Experimental Hematology & Oncology
2023 Aug 30
FranziskaBriest,Dani...
Frequent ZNF217 mutations lead to transcriptional deregulation of interferon signal transduction via altered chromatin accessibility in B cell lymphoma.
Experimental Hematology & Oncology
最近的全外显子研究发现,原发性纵隔B细胞淋巴瘤(PMBCL)及相关疾病中的表观遗传修饰因子ZNF217存在频繁的体细胞突变。由于ZNF217变异的功能后果尚不清楚,我们全面评估了它们对PMBCL的影响。靶向测序鉴定出影响157例PMBCL患者中33%的ZNF217的遗传损伤。随后的基因表达谱(n=120)揭示了ZNF217异常的PMBCL病例中细胞因子和干扰素信号转导的改变。体外实验发现ZNF217缺失导致染色质可及性的变化,干扰对关键与淋巴瘤相关的转录因子的结合位点的影响。这导致了干扰素响应和炎症相关基因的异常表达,细胞行为的改变和异常分化。质谱分析显示,ZNF217作为包含LSD1、CoREST和HDAC的组蛋白修饰复合物的一部分发挥作用,并干扰H3K4甲基化和H3K27乙酰化。总之,我们的数据表明ZNF217具有非催化活性,可以指导组蛋白修饰复合物的功能,并控制B细胞分化相关的染色质结构模式。© 2023. 作者。
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Brain Structure & Function
2023 Aug 30
WenxiaoJia,XiaoyangZ...
Prognostic value of cranial radiotherapy and optimal timing stratified by lung-molGPA for NSCLC patients with brain metastases.
Brain Structure & Function
更新的肺癌分子标志物分级预后评估(lung-molGPA)指数为诊断为晚期非小细胞肺癌(NSCLC)并有脑转移(BM)的患者提供更准确的生存预测。鉴于对于有BM的NSCLC患者,颅脑放疗(CRT)的价值仍有争议,本回顾性研究旨在评估CRT和最佳时机在初次BM的NSCLC患者中的价值,并根据lung-molGPA指数进行分层。本研究筛选了我中心2012年2月至2018年7月期间初次BM的NSCLC患者。使用Kaplan-Meier生存分析评估了CRT和最佳时机的预后价值,并将患者分为lung-molGPA0-2组和lung-molGPA2.5-4组。前期CRT的定义为在初次诊断后3个月内接受CRT且无BM进展,其他CRT被归类为延迟CRT。研究共纳入了288名患者,其中156名患者接受了CRT。中位随访时间为47个月。在整个队列中,中位无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)分别为9.2和17.0个月。在lung-molGPA2.5-4组中,CRT可以为初次BM的NSCLC患者带来明显的整体生存益处(HR:0.48,95% CI:0.34-0.68,P < 0.0001),而前期CRT相较于延迟CRT可以进一步扩大这种生存益处(HR:0.49,95% CI:0.27-0.89,P = 0.0026)。但在lung-molGPA0-2组患者中未观察到这种现象。前期CRT可以为这些具有lung-molGPA2.5-4指数的患者带来明显的总生存期益处,但对于具有lung-molGPA0-2指数的患者则不然。©2023。作者(及)独家授权给斯普林格科学+商业媒体有限公司,斯普林格自然出版集团的一部分。
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Brain Structure & Function
2023 Aug 30
YongpingHao,TingTang...
Prognostic analysis of stereotactic radiosurgery for brain metastases: a single-center retrospective study.
Brain Structure & Function
脑转移瘤(BM)是许多癌症发展过程中常见的事件,也是患者死亡的主要原因之一。立体定向放射外科手术(SRS)是一种有效的BM治疗方法。目前对SRS治疗后各种临床因素对局部控制(LC)和总生存期(OS)的预后影响仍不清楚。本研究的目的是回顾性地分析接受SRS治疗的患者的颅内进展无瘤生存期(iPFS)和OS,并探讨不同临床特征与患者预后之间的关系。我们收集了2018年至2021年期间在我们中心被诊断为BM并接受SRS治疗的患者的临床信息。使用R软件进行单因素和多因素Cox回归分析以及iPFS和OS的KM分析,以研究临床特征的预后效果。共有183名在我们中心接受SRS治疗的患者被纳入队列。所有患者的中位iPFS为8.87个月(95% CI 6.9-10.6),中位OS为16.5个月(95% CI 12.9-20.7)。BM数量≥5(HR 1.965 [95% CI 1.381-2.796],p < 0.001,经FDR校正后p值<0.001)被发现是iPFS和OS较短的强预测指标。亚组分析显示,颅内累积肿瘤体积(CITV)≥2.14 cm³和数量≥5的患者iPFS(P < 0.001)和OS(P = 0.007)最短,相对于其他亚组。对于有5个以上BM的患者,SRS加全脑放疗(WBRT)可以实现更好的局部控制,相对于仅SRS组(P = 0.0357)。外周血炎症指标与BM患者的预后在单因素Cox分析中相关,但在多因素Cox分析中不相关。BM数量是BM患者的独立预后因子。CITV较大且BM数量较多的亚组预后最差。对于有5个以上BM的患者,SRS和WBRT的组合可以提高局部控制,但不能延长OS。© 2023年。意大利医学放射学学会。
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Brain Structure & Function
2023 Aug 30
RabiaTütüncüToker,Il...
MRI findings in children with migraine or tension-type headache.
Brain Structure & Function
儿童偏头痛和紧张型头痛是常见的原发性头痛。儿童存在发展为继发性头痛的风险。本研究旨在评估患有偏头痛或紧张型头痛的儿童的磁共振成像(MRI)结果。该研究招募了在小儿神经科门诊进行定期门诊访视至少两年,并在最近一年进行神经影像学检查的患有偏头痛或紧张型头痛的儿童。
共研究了280位患者(187位女性患者)的数据。其中,91位(61位女性患者)被诊断为偏头痛,189位(126位女性患者)被诊断为紧张型头痛。患者的年龄为13.1±3.4岁。一个患有紧张型头痛且伴有视乳头水肿的儿童被发现有脑肿瘤。偶发的MRI结果在偏头痛和紧张型头痛中分别为7.7%和12.7%。该研究中的MRI结果包括蛛网膜囊肿(14例)、垂体腺瘤(6例)、巨大后脑池(6例)、松果囊肿(3例)、非特异性星形胶质病变(2例)和肿瘤(1例)。蛛网膜囊肿是与儿童偏头痛或紧张型头痛最常见的偶发性MRI结果。儿童可能会出现罕见且危及生命的继发性头痛。作为神经系统检查的补充,眼底检查对于要求进行MRI可能很有用。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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Brain Structure & Function
2023 Aug 30
KritikaTyagi,PrachiR...
Neurological manifestations of SARS-CoV-2: complexity, mechanism and associated disorders.
Brain Structure & Function
冠状病毒,如严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、中东呼吸综合征(MERS)和严重急性呼吸综合征冠状病毒2型 (SARS-CoV-2),与包括严重呼吸系统疾病在内的危重疾病相关。SARS-CoV-2是致命的COVID-19疾病的病因,已成为全球大流行。SARS-CoV-2可以通过嗅觉叶进入人体,并与血管紧张素转化酶2 (ACE2)受体相互作用,进一步促进细胞结合和进入细胞。报告显示病毒能够通过血脑屏障 (BBB)并进入中枢神经系统 (CNS),导致多种疾病。SARS-CoV-2的细胞侵入在很大程度上依赖于TMPRSS2和cathepsin L的活化S蛋白。TMPRSS2可在呼吸道、胃肠道和泌尿生殖道上皮的细胞表面上发现,而cathepsin-L是内体的一部分。本综述的目的是提供有关SARS-CoV-2感染如何影响脑功能的信息。此外,还将讨论与SARS-CoV-2感染有关的CNS疾病,包括缺血性中风、脑静脉血栓形成、格林-巴利综合征、多发性硬化症、脑膜炎和脑炎。详细介绍了COVID患者发展脑血管问题的许多可能机制和途径。有报告称,SARS-CoV-2病毒能够穿透血脑屏障 (BBB)进入中枢神经系统 (CNS),并可能引起多种疾病。COVID-19患者经历各种神经系统并发症,包括睡眠障碍、病毒性脑炎、头痛、味觉异常和认知障碍。已有报告称在COVID-19患者的脑脊液 (CSF)中发现了SARS-CoV-2的存在。卫生专家还报告其在皮层神经元和人类脑器官样结构中的存在。病毒渗透到大脑的可能机制主要有神经性、直接渗透和细胞因子风暴途径。嗅觉叶也可能是SARS-CoV-2进入大脑的主要途径。SARS-CoV-2会导致神经系统并发症,如脑血管病变、运动障碍和认知能力下降。COVID-19感染可能导致脑血管症状和疾病,如中风和血栓形成。该病毒可以影响神经系统,破坏认知功能并引起神经系统疾病。为了应对流行病,迅速改用目前使用的药物并开发新的治疗方法至关重要。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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