研究动态
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 29
XinweiHe,XiaoqiangSu...
Multicellular network-informed survival model for identification of drug targets of gliomas.
GENES & DEVELOPMENT
越来越多的证据表明,肿瘤细胞(TCs)与肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)之间的通讯在促进低级别胶质瘤(LGG)的进展方面起到重要作用。因此,对TAM-TC相互作用进行建模并探究其对LGG患者预后的影响变得至关重要。本文提出了一种转化性研究流程,构建了多细胞相互作用基因网络(MIGN),用于鉴定可药物靶点以开发新的治疗策略。首先,我们使用临床前试验中胶质瘤小鼠的RNA-seq数据,选择与免疫治疗相关的特征基因(IFGs)用于TAMs和TCs。将这些IFGs转化为人类基因组后,分别构建了TAM-和TC-相关网络,使用524例人类LGG的训练集。随后,在每个网络内进行聚类分析,并采用一致性度量K指数,将基因聚类与患者生存率相关联。MIGN是通过将与TAM-和TC-关联网络中的生存高度相关的聚类组合而成。然后,我们开发了一种基于MIGN的生存模型,以识别由配体、受体和中心基因组成的预后标志。我们利用一个独立的包含172个人类LGG样本的队列来验证标志的预测准确性。在验证集中,与1年、3年和5年生存率相关的时间依赖ROC曲线下面积分别为0.881、0.867和0.839。此外,还对标志基因进行了文献调查,并评估了针对LGG患者的靶向药物的潜在临床反应,进一步凸显了MIGN标志的潜在实用性,以开发新的免疫疗法,延长LGG患者的生存期。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 29
JingfangLv,WenbinLi,...
Identification of MKI67, TPR and TCHH Mutations as Prognostic Biomarkers for Patients with Defective Mismatch Repair Colon Cancer Stage II/III.
GENES & DEVELOPMENT
第二、第三阶段的疾病是结直肠癌最常见的形式,约占70%的病例。此外,约15%-20%的第二、第三阶段的患者存在缺陷错配修复或微卫星不稳定性高的结直肠癌。然而,尚未找到与该疾病相关的重要预后生物标志物。本研究旨在发现缺陷错配修复/微卫星不稳定性高结直肠癌第二、第三阶段患者的预后标志物。采用回顾性研究设计。该研究在中国医学科学院肿瘤医院这一高量级结直肠中心进行。研究对象为在2015年7月至2018年11月期间在中国医学科学院肿瘤医院接受根治性手术的第二、第三阶段缺陷错配修复/微卫星不稳定性高结直肠癌患者。主要的结局指标是不同突变基因对无进展生存的影响。回顾性的缺陷错配修复/微卫星不稳定性高队列和癌症基因组图谱-微卫星不稳定性高队列分别涉及32名和45名患者。缺陷错配修复/微卫星不稳定性高患者中,MKI67、TPR和TCHH的突变频率较微卫星稳定患者更高。MKI67、TPR、TCHH和基因组合与预后显著相关。生物标志物-突变型结直肠癌组相比野生型组有更高的复发或死亡风险。此外,生物标志物-突变型肿瘤在DNA损伤修复途径和肿瘤突变负荷方面的突变更多。本研究受到其回顾性性质的限制。MKI67、TPR和TCHH可能作为缺陷错配修复/微卫星不稳定性高结直肠癌第二、第三阶段的潜在诊断和预后生物标志物。Copyright © The ASCRS 2023.
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 23
LauraJMcCormick,Stev...
Cervical cancer screening positivity among women living with HIV in CDC-PEPFAR programs 2018-2022.
Disease Models & Mechanisms
美国总统抗击艾滋病紧急计划(PEPFAR)旨在通过在世界高负担地区提供高质量的筛查服务来解决妇女艾滋病病毒感染者(WLHIV)患宫颈癌的较高风险问题。我们分析了自2018年4月至2022年3月期间,在撒哈拉以南非洲地区的13个国家的CDC支持下的PEPFAR监测、评估和报告数据,针对年龄在15岁以上的WLHIV进行了宫颈癌筛查服务(主要是视觉检查,对于癌前病变提供烧灼或切除治疗)。我们计算了按年龄、国家和临床就诊类型(首次生涯筛查或例行复查)的阳性率。我们拟合了负二项式随机系数模型以估算阳性测试的概率,并确定阳性率的任何时间趋势。在280万次完成的癌症筛查中,5.4%的筛查结果显示有癌前病变,0.8%的筛查结果显示有可能是浸润性宫颈癌(综合为6.1%)。这些阳性率在研究期间,在进行宫颈癌筛查的初次筛查妇女以及前往抗逆转录病毒治疗(ART)诊所进行例行复查的妇女中有所下降。这些阳性率低于已发表文献的预期。需要进一步研究来确定这些较低的率是否归因于这些人群中高水平的持续ART使用,而系统的计划监测和质量保证活动对确保WLHIV能够获得最高质量的预防服务至关重要。版权所有©2023 Wolters Kluwer Health, Inc. 保留所有权利。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Sep 01
AllisonNavarrete-Wel...
Campylobacter Infection-Associated Acute Pancreatitis in a Renal Transplant Recipient.
DIABETES & METABOLISM
免疫低下个体(癌症、糖尿病、感染艾滋病毒/艾滋病的患者以及器官移植受者)和孕妇比普通人更容易发生复杂的食源性疾病。我们目前尚未发现免疫低下宿主中与Campylobacter肠炎相关的急性胰腺炎的报道。在此,我们描述了一个肾移植受者中出现的与Campylobacter感染相关的胰腺炎例子。该案例强调了对免疫低下患者进行食品安全教育的必要性,强调了医疗保健提供者在鼓励遵守食品安全准则方面的作用,以及强调了对免疫低下患者群体需要保持广泛的传染病鉴别诊断,即使对于不常见的与传染性病因相关的情况也是如此。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 29
EfrenAReyes,DavidCas...
Epithelial TNF controls cell differentiation and CFTR activity to maintain intestinal mucin homeostasis.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
胃肠道依赖于粘膜的生成、成熟和传递来保护免受病原体的侵害,并润滑上皮内膜。尽管对调控粘膜生成和运动的分子和细胞机制的理解正在增加,但对贡献于粘膜调控的上游上皮信号仍不清楚。本文报道了由上皮产生的炎症细胞因子肿瘤坏死因子(TNF)通过调控细胞分化和囊性纤维囊膜导电调节因子(CFTR)活性,对粘膜稳态的贡献。我们使用遗传学小鼠模型和进行抗-TNF治疗的炎症性肠病(IBD)患者的非炎症样本来评估TNF体内干扰的效果。我们发现抑制上皮TNF促进分泌前体细胞向黏液产生的顶泡细胞分化。此外,肠道器官样体中的TNF处理和CFTR抑制表明,TNF通过CFTR促进离子转运和腔内流动。缺乏TNF导致肠道传输时间变慢,我们认为这是由于粘液积聚增加和腔内流体泵送减少所致。这些发现指出成年肠道中存在TNF-CFTR信号轴,并将上皮来源的TNF识别为粘膜稳态的上游调控因子。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 29
HojeongShin,Seounghu...
Enhanced Local Delivery of Engineered IL-2 mRNA by Porous Silica Nanoparticles to Promote Effective Antitumor Immunity.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
局部表达免疫调节分子可以刺激肿瘤周围微环境中的免疫反应,同时避免与全身给药相关联的毒性。在本研究中,我们开发了一种基于聚乙烯亚胺修饰多孔二氧化硅纳米粒子(PPSN)的载体平台,用于载运细胞因子mRNA进行局部免疫治疗。我们的载体平台在局部mRNA翻译方面显著比FDA批准的脂质纳米颗粒更有效。我们观察到在任何器官中没有靶向外显子翻译的迹象,也没有系统毒性的证据。将细胞因子mRNA负载的PPSN进行肿瘤内注射,可在肿瘤内部产生高水平的蛋白表达,并刺激免疫原性肿瘤细胞死亡。此外,将细胞因子mRNA与免疫检查点抑制剂联合使用,可增强多种小鼠肿瘤模型中的抗癌反应,并实现对远处转移性肿瘤的抑制。我们的结果表明,PPSN介导的mRNA负载具有潜力成为肿瘤免疫治疗中特异、有效和安全的mRNA疗法平台。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 05
MingxingLei,HansI-Ch...
The mechano-chemical circuit drives skin organoid self-organization.
Stem Cell Research & Therapy
器官样体中的干细胞通过未知的机制自组织成组织模式。在此,我们利用皮肤样体来分析这一过程。细胞行为视频显示,从具有形态发生能力的多个球状单位(CMU)向平面皮肤的形态转化特点是在平静之前出现两次突然的细胞运动增加事件。自组织过程受到由分子传感器、调节物和执行物组成的造形模块的控制。逐渐增加的真皮硬度提供了初始的驱动力(驱动器),激活表皮囊的Yap1(传感器)。表皮囊中的Notch信号(调节物1)调节了Yap1激活的阈值。激活的Yap1在基底细胞中诱导了Wnt和MMPs(表皮执行物),促进细胞流动,使表皮细胞从CMU中突出出来。真皮细胞表达的Rock(真皮执行物)在两个CMU之间生成了一个坚硬的力桥,并通过激活Laminin和β1整合素加速组织混合。因此,这个自组织合并过程由一个机械-化学回路控制。超越皮肤,器官样体中的自组织可能使用类似的机械-化学回路结构。
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JCI Insight
2023 Aug 29
NikitaBhalerao,AsmiC...
ST6GAL1 sialyltransferase promotes acinar to ductal metaplasia and pancreatic cancer progression.
JCI Insight
异常糖基化在胰腺导管腺癌(PDAC)中的作用仍然是一个未充分研究的领域。在本研究中,我们发现ST6GAL1唾液酸转移酶在早期PDAC患者中上调,并在晚期疾病中进一步增加,该酶将α2,6连接的唾液酸添加到N-糖基化蛋白质中。通过使用人类PDAC细胞进行肿瘤异种移植实验,我们阐明了ST6GAL1的肿瘤促进功能。此外,我们开发了具有转基因ST6GAL1在胰腺表达的遗传工程小鼠模型,并发现与仅表达KRASG12D的小鼠相比,具有ST6GAL1和KRASG12D双重表达的小鼠的PDAC进展明显加速。由于ST6GAL1赋予了祖细胞样特性,我们研究了ST6GAL1在腺泡向导管样肉芽肿(ADM)中的作用,这个过程通过重编程腺泡细胞为导管样祖细胞而促进新生物。我们使用多种模型验证了ST6GAL1促进ADM的作用,包括266-6细胞系、GEM衍生的器官样体和组织以及炎症诱导ADM的体内模型。EGFR是ADM的一个关键驱动因子,而ST6GAL1介导的唾液酸化被认为可以激活EGFR。重要的是,具有转基因ST6GAL1表达的小鼠的腺泡细胞和器官样体中EGFR的激活明显增加。这些综合结果突出了涉及胰腺新生物早期阶段的依赖于糖基化的机制。
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JCI Insight
2023 Aug 29
ZoltánPethő,Karolina...
Acid-base homeostasis orchestrated by NHE1 defines pancreatic stellate cell phenotype in pancreatic cancer.
JCI Insight
胰腺导管腺癌(PDAC)在具有独特pH环境的器官中发展,其中结缔组织在每餐后酸化。我们假设在PDAC进展过程中干扰这种pH环境会触发胰腺星状细胞(PSCs)和癌相关成纤维细胞(CAFs)引发PDAC纤维化。我们揭示碱性环境pH足以诱导PSC分化为肌成纤维样表型。然后,在机械上解析这一发现,重点研究钠/氢交换体NHE1的参与。通过使用cariporide抑制NHE1扰乱细胞pH稳态,部分改变了肌成纤维细胞样PSC表型。为了展示这一发现在体内的相关性,我们针对小鼠PDAC(KPfC)靶向NHE1。确实,当小鼠同时接受NHE1抑制剂cariporide和吉西他滨治疗时,肿瘤纤维化减轻。此外,肿瘤免疫浸润从富含粒细胞转变为更多的淋巴细胞。综上所述,我们的研究提供了关于胰腺pH环境如何通过调节PSC分化来塑造胰腺癌的机制证据。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug 29
KangLi,JieChen,Caihu...
The CTBP2-PCIF1 complex regulates m6Am modification of mRNA in head and neck squamous cell carcinoma.
Epigenetics & Chromatin
PCIF1能够介导mRNA中N6,2'-O-二甲基腺苷(m6Am)的甲基化。然而,PCIF1与潜在辅因子之间的详细相互作用以及其病理意义仍然不清楚。在这里,我们证明了PCIF1介导的mRNA帽子m6Am修饰促进了头颈鳞状细胞癌(HNSCC)的体外和体内进展。CTBP2被确定为PCIF1的辅因子,用于催化mRNA上的m6Am沉积。CLIP-seq数据证明CTBP2与PCIF1结合到相似的mRNA上。然后,我们利用了m6Am-seq方法以单碱基分辨率分析mRNA上的m6Am位点,并发现TET2 mRNA,一个众所周知的抑癌基因,是PCIF1-CTBP2复合物的主要靶底物。机制上,CTBP2的缺失减少了PCIF1在TET2 mRNA上的占有率,PCIF1-CTBP2复合物负调节了TET2 mRNA的翻译。总之,我们的研究证明了表观转录组调节因子PCIF1-CTBP2复合物的致癌功能,突出了m6Am修饰在肿瘤进展中的重要性。
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