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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2023 Aug 29

TianjiaoZhang,Liangy...
DeepICSH: a complex deep learning framework for identifying cell-specific silencers and their strength from the human genome.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
沉默子是位于基因组上、抑制基因表达的非编码DNA序列片段。特定细胞中沉默子的变异与基因表达和癌症发展密切相关。仅仅依靠DNA序列信息进行沉默子识别的计算方法未能考虑到沉默子的细胞特异性,因此准确性降低。尽管已发现数种与基因组上沉默子相关的转录因子和表观遗传修饰,但仍未找到明确的生物学信号或其组合来完全表征沉默子,这增加了选择合适的生物学信号进行其识别的挑战。因此,我们提出了一种复杂的深度学习框架DeepICSH,该框架基于多个生物数据源。具体而言,DeepICSH利用深度卷积神经网络自动捕捉与沉默子强相关的生物学信号组合,这些信号组合来自多样的生物学信号。此外,注意机制的运用有助于得分和可视化这些信号组合,而跳跃连接的使用则有助于融合多层次序列特征和信号组合,从而实现了对特定细胞内沉默子的准确识别。在HepG2和K562细胞系数据集上进行了广泛实验,结果显示DeepICSH在沉默子识别方面优于最先进的方法。值得注意的是,我们首次提出了使用多组学数据进行分类强弱沉默子的深度学习框架,并取得了良好的性能。总之,DeepICSH 在复杂疾病中的沉默子研究和分析方面具有巨大潜力。源代码可在https://github.com/lyli1013/DeepICSH上获取。© 作者(们) 2023。由牛津大学出版社出版。版权所有。欲获取授权,请发送电子邮件至: journals.permissions@oup.com。
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Brain Structure & Function
2023 Aug 29

MeropiMari,Chrysanth...
Lipid content evaluation of Drosophila tumour associated haemocytes through Third Harmonic Generation measurements.
Brain Structure & Function
非线性显微镜是一种强大的成像工具,可用于检查各种生物样品的结构特性和亚细胞过程。第三次谐波产生(THG)的能力包括无标记成像,分辨率为衍射极限,并具有几乎无光毒性的三维可视化效果。在本研究中,我们利用THG记录和量化果蝇血细胞对正常或肿瘤性神经细胞的脂质含量,并与其外形或状态进行相关。我们发现成年血细胞在遇到正常细胞之前和之后的脂质积累是相似的。相反,在成年血细胞与癌细胞相互作用之前,脂质指数较低,但在其参与吞噬作用时增加, exhaust 后再次减少。血细胞在遇到肿瘤细胞时脂质积累的动态变化可能是评估肿瘤相关血细胞吞噬能力或活化状态的有用工具。本文受版权保护。保留所有权利。
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Brain Structure & Function
2023 Aug 29

LiminPan,HaibaoPeng,...
Cascade Catalytic Nanoparticles Selectively Alkalize Cancerous Lysosomes to Suppress Cancer Progression And Metastasis.
Brain Structure & Function
溶酶体在调节各种癌症的发展和转移中起着关键作用。目前迫切需要溶酶体碱化剂,可以选择性和安全地改变癌症溶酶体的pH值,抑制其功能。在这里,我们报道了一种有效、选择性和安全的溶酶体碱化剂,可以抑制自噬并抑制小鼠肿瘤的生长。我们的溶酶体碱化剂由Fex Oy核心和CeO2-z卫星组成,核心在癌症溶酶体内的过量H+和H2 O2存在下产生羟基自由基(•OH),卫星则捕获并将•OH转化为羟离子(OH-)。碱化的溶酶体显示了受损的酶活性和自噬,导致癌细胞的凋亡。我们展示了我们的碱化剂在小鼠体内有效抑制了局部和全身肿瘤的生长和转移。我们的工作表明,纳米颗粒的固有特性可以用来构建既选择性又安全的有效溶酶体碱化剂。本文受版权保护,保留所有权利。
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2023 Jul 10

XiaopengHu,ChunmeiJi...
Human dendritic cell subsets in the glioblastoma-associated microenvironment.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
胶质母细胞瘤(GBM)是最具侵袭性的胶质瘤类型(四级)。细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)的存在与GBM患者的疗效改善相关,并且人们认为树突状细胞通过激活CTLs可能对GBM的生长控制起到关键作用。树突状细胞是专业的抗原呈递细胞(APC),协调先天性和适应性的抗GBM免疫反应。树突状细胞可以根据环境暴露分化为浆细胞样树突状细胞(pDC)、常规型树突状细胞1(cDC1)、常规型树突状细胞2(cDC2)和单核细胞源性树突状细胞(moDC)。不同亚群的树突状细胞在抗原呈递和T细胞激活方面具有不同的功能能力,以产生抗肿瘤反应。本综述主要关注近期研究对人类树突状细胞亚群的表型和功能特征以及它们在GBM相关微环境中的抗肿瘤免疫和免疫耐受角色的描述。本综述还针对最新文献,重点介绍了树突状细胞亚群之间的相互作用对GBM特异性免疫反应所起到的重要作用。由于树突状细胞可能是治疗干预的首要靶点,因此总结树突状细胞亚群与GBM相关免疫耐受性及其治疗潜力的相关性是值得的。版权所有 © 2023。由Elsevier B.V出版。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2023 Aug 27

QiongLuo,XinYeJi,Lia...
Shikonin prevents mice from heat stroke-induced death via suppressing a trigger IL-17A on the inflammatory and oxidative pathways.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
高温中暑(HS)是最致命的疾病。由于HS的病因复杂,临床治疗缺乏有效的药物。赤芍(SK)是紫草的主要活性成分,我们通过体内和体外病理和生化方法评估了其在高温中暑模型(温度:(41 ± 0.5) ℃,相对湿度:(60 ± 5) %)上的作用。在10mg/kg剂量下,SK延缓了核心体温上升速度,延长了小鼠的存活时间,并显著改善了器官损伤和凝血功能。SK显著降低了血清HS生物标志物白介素-1β(IL-1β)、白介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)的水平,这有助于模型中肝脏和肺脏的保护。通过RNA测序和网络分析,发现有三个通路与IL-17通路存在密切联系。WB和IHC结果表明,SK组中的核因子-κB(NF-κB)p65表达下调(P < 0.05)。核因子样2类似因子2(NFE2L2/Nrf2)和热休克蛋白70(HSP70)的表达上调(P < 0.05)。在HS模型中,附加重组IL-17A蛋白增加了肝脏和肺组织中NF-κB p65的表达水平,附加腹腔注射IL-17A抗体与SK协同抑制组织炎症反应和保护HS效果显著。总之,我们证明SK通过降低IL-17A的产生和抑制其表达,具有在HS模型中发挥抗炎和抗氧化作用的有效化合物。版权所有 © 2023 The Authors. 由Elsevier Masson SAS出版。保留所有权利。
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PHYSICAL THERAPY & REHABILITATION JOURNAL
2023 Aug 29

MartinGalligan
Exploring the prevalence, characteristics and nursing assessment of neuropathic pain.
PHYSICAL THERAPY & REHABILITATION JOURNAL
神经病理性疼痛是由神经损伤引起的。它影响到普通人群中的许多人,但在某些群体中,如那些接受特定程序或全身抗癌治疗的人以及患有糖尿病、病毒感染或中枢神经系统疾病的人群中,其患病率更高。无论原因如何,神经病理性疼痛都会对人们的生活质量产生重要的不良影响,因此护士需要能够进行包含身体、情绪、社交和精神方面的整体疼痛评估。本文探讨了神经病理性疼痛的患病率、特点和护理评估,旨在提高护士对这种类型的疼痛所影响人群的意识、实践和护理水平。 © 2023 RCN Publishing Company Ltd. 保留所有权利。未经出版商事先许可,不得以任何方式全部或部分复制、传输或记录。
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PHYSICAL THERAPY & REHABILITATION JOURNAL
2023 Aug 01

EngyAbdelRhmanKhamis...
Effectiveness of Aromatherapy in Early Palliative Care for Oncology Patients: Blind Controlled Study.
PHYSICAL THERAPY & REHABILITATION JOURNAL
姑息治疗是对所有年龄段患有严重与健康相关的苦恼的人进行积极而全面的治疗,特别是对那些临近生命终结的人。对于患有严重苦恼的无法通过专业干预来缓解并影响身体、社会、精神和情绪功能的癌症患者,需提供姑息治疗。芳香疗法作为一种补充和替代医学的方法,提供了一种简单、低风险和经济可行的姑息治疗方式。本研究的目标是评估按摩疗法、芳香按摩疗法以及按摩结合芳香吸入疗法对接受姑息治疗的癌症患者的比较效果。共有100名参与者按照随机分组分为四组。第一组作为对照组接受标准医院护理,第二组接受仅按摩(使用无味的杏仁基础油),第三组接受薰衣草油按摩,第四组接受结合(吸入和按摩)的芳香疗法。两周后使用鹿特丹症状考查表(RSCL)以检测参与者对护理的看法。根据RSCL,综合芳香疗法效果最佳。就报告的身体症状、心理症状和活动而言,对照组和每个实验组的分数之间存在统计学差异。然而,总体生活质量评分显示对照组和仅接受按摩组之间无显著差异(t = 0.529, p = 0.60)。当与芳香吸入疗法结合时,按摩对于接受早期姑息治疗的癌症患者的身体症状、心理症状、活动以及整体生活质量都有积极影响。建议护士和其他医疗保健提供者支持提供按摩疗法的项目,以减少癌症患者报告的身体症状、心理问题和活动受限。
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PHYSICAL THERAPY & REHABILITATION JOURNAL
2023 Aug 01

Ming-ChehOu,DennisOu...
The Causal Relationship of Anti-Cancer Effect with Physical Activity Evinced by the Consistent Anti-Cancer Effect of the Ou MC Decrescendo Phenomenon.
PHYSICAL THERAPY & REHABILITATION JOURNAL
医学文献中尚未牢固建立起身体活动与癌症预防之间的因果关系。欧蔓丞减退现象治疗(OuDPt)是一种自我管理的方案,通过将对侧手放置在或靠近身体受影响区域,产生一个疼痛或炎症减退区。OuDPt已被证实能够诱导多种癌症类型的肿瘤反退,包括子宫、卵巢和胰腺癌,并在子宫内膜癌中出现细胞凋亡和鳞状上皮化生。OuDPt的抗癌效应与治疗频率、持续时间、强度以及肿瘤的敏感性和易感性等因素有关,这与抗生素与细菌感染之间的动态关系相似。鉴于OuDPt可自行管理且易于操作,且具有一致的抗癌效果,此疗法可能有潜在用于癌症预防。对于OuDPt在癌症预防中的应用进行进一步研究是值得的。
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Epidemiology and Health
2023 Aug 23

KeumJiJung,JiWooBaek...
Genetically determined alcohol consumption and cancer risk in Korea.
Epidemiology and Health
本研究的目的是确定基因决定的饮酒量与重大癌症发生之间的因果关系。本研究使用的数据来自于韩国癌症预防研究-II,选择了129324名参与者,他们在2004年至2013年间参观了18个健康检查中心。癌症发生率数据截至2020年,来源于国家癌症中心。使用PLINK 2.0进行了一项基因组关联研究(GWAS),并根据性别、年龄、芯片类型和主成分进行了调整。从GWAS中,计算了用于饮酒量的遗传风险评分,并估计了基因决定的饮酒量(GDAC)。将GDAC分为五个分位组,并显示了与直肠癌和肝癌的显著因果关系,但与其他癌症无关。对于肝癌而言,在乙肝表面抗原(HBsAg)阴性群体中显示了一定的关联,并在年龄超过60岁的HBsAg阴性群体中发现了特别强的关联,与GDAC Q1组相比,Q4组的风险增加了2.35倍(95% CI,1.05-5.23),Q5组则增加了2.40倍(95% CI,1.22-7.01)。本研究结果为证明所饮酒的数量与HBsAg阴性的患者患直肠癌和肝癌之间具有因果关系提供了证据。应继续进行其他癌症类型的长期跟踪研究。
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Burns & Trauma
2023 Aug 28

SudhirManickavel,Yol...
Metformin Reduces Tumor Growth in a Murine Flank Schwannoma Model.
Burns & Trauma
二甲双胍和阿司匹林可降低前庭神经鞘瘤(VS)的生长。已有报道表明,服用二甲双胍的VS患者与肿瘤体积的减少有关。动物实验也表明,阿司匹林可减缓VS的生长。我们在50只无胸腺裸鼠体内培养和植入大鼠神经鞘瘤细胞株。将肿瘤培养至5毫米,然后每天注射低剂量或高剂量的二甲双胍、阿司匹林或生理盐水。直到经过14天或老鼠出现溃疡、行走困难或死亡等症状为止,我们测量了肿瘤的大小。控制组和治疗组之间的初始肿瘤大小没有显著差异(p = 0.73)。在低剂量组(但不是高剂量组),二甲双胍(p = 0.04)和阿司匹林(p = 0.02)的第7天体积与安慰剂组相比有显着差异。盐水组的平均肿瘤生长速率为126.6 ± 65.6 mm3/天,而低剂量二甲双胍组为73.7 ± 29.5 mm3/天(p = 0.03),低剂量阿司匹林组为68.7 ± 34.8 mm3/天(p = 0.016)。低剂量二甲双胍组和低剂量阿司匹林组的肿瘤大小(p = 0.59)和生长速率(p = 0.75)之间无显着差异。低剂量组在14天后停止治疗,继续监测结果显示,阿司匹林(p = 0.006)和二甲双胍(p = 0.048)未治疗肿瘤生长显著增加。二甲双胍治疗可将VS的生长显著降低至与阿司匹林相似的水平。此外,当停用二甲双胍和阿司匹林治疗时,肿瘤生长显著增加。版权所有 © 2023年,《听力学与神经学》。
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