研究动态
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Eur J Nucl Med Mol I
2023 Aug 19
BingxinGu,MingyuanMe...
Multi-task deep learning-based radiomic nomogram for prognostic prediction in locoregionally advanced nasopharyngeal carcinoma.
Eur J Nucl Med Mol I
预后预测对于指导局部区域进展性鼻咽癌(LA-NPC)患者的个体化治疗至关重要。最近,多任务深度学习在各种癌症中进行了联合预后预测和肿瘤分割的探索,取得了令人满意的表现。本研究旨在评估多任务深度学习在LA-NPC患者预后预测中的临床价值。 从两家医疗中心获得的886例LA-NPC患者被纳入研究,包括临床数据、[18F]FDG PET/CT图像和进展无病生存期(PFS)的随访数据。我们采用了深度多任务生存模型(DeepMTS)来同时进行预后预测(DeepMTS得分)和FDG-PET/CT图像的肿瘤分割。利用DeepMTS生成的分割掩膜提取手工制作的放射学特征,这些特征也被用于预后预测(AutoRadio得分)。最后,我们通过整合DeepMTS得分、AutoRadio得分和临床数据,开发了基于多任务深度学习的放射学(MTDLR)标度表。采用Harrell的一致性指数(C-index)和独立于时间的受试者工作特征曲线(ROC)分析来评估所提出的MTDLR标度表的判别能力。为了进行患者分层,采用Kaplan-Meier方法计算高危和低危患者的PFS率,并与观察到的PFS概率进行比较。 我们的MTDLR标度表在训练、内部验证和外部验证队列中分别达到了0.818(95%置信区间(CI):0.785-0.851)、0.752(95% CI:0.638-0.865)和0.717(95% CI:0.641-0.793)的C-index和0.859(95% CI:0.822-0.895)、0.769(95% CI:0.642-0.896)和0.730(95% CI:0.634-0.826)的曲线下面积(AUC),这显示出与传统放射学标度表相比具有显著的改进。我们的标度表还将患者分为显著不同的高危和低危组。 我们的研究表明,MTDLR标度表可以在LA-NPC患者中进行可靠准确的预后预测,并实现更好的患者分层,这有助于个性化治疗规划。
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ENVIRONMENTAL RESEARCH
2023 Aug 16
ClaudioEduardoAzeved...
Trophic dynamics of methylmercury and trace elements in a remote Amazonian Lake.
ENVIRONMENTAL RESEARCH
污染物营养动力学信息对公共健康至关重要,因为摄入受污染的食物可能导致有害效应。本研究在巴西亚马逊的普鲁兹尼奥湖进行,该湖是一处偏远水体,河岸人口从中获得了重要的动物蛋白质摄入。对来自92个个体的样本进行了分析,包括13个物种和四个营养性类群(食肉的、食浮游生物的、杂食性的和食鱼类的鱼),以确定微量元素(Fe、Cr、Mn、Ni、Zn、Ca、Sr、Cd、Sn、Tl和Pb)和甲基汞浓度。这些个体的样本在之前的调查中已经进行了稳定同位素(SI)测量(δ13C和δ15N),并且SI数据已与本研究生成的数据进行统计处理,以评估污染物营养动力学。甲基汞是唯一具有生物富集性的分析物,总鱼类和常驻鱼类的TMF值分别为4.65和4.55。微量元素在营养级上要么稀释,要么与营养水平无关,这与科学文献中的发现相吻合。镍在营养链中的行为与必需元素类似,这有助于讨论这种金属对鱼类的必需性。考虑到非癌症风险评估,计算得出的目标危害系数(THQ)值对于所有分析个体的甲基汞都高于1.0,只有一个个体的镍高于1.0。其他分析物的THQ值均低于1.0。版权所有 © 2023. Elsevier Inc. 发布。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 18
SolaHan,TedJSohn,Boo...
Predicting unplanned readmission due to cardiovascular disease in hospitalized patients with cancer: a machine learning approach.
Disease Models & Mechanisms
癌症患者的心血管疾病(CVD)可能会影响非预期的再入院风险,据报道,这些再入院费用高昂,与更糟糕的死亡率和预后相关。我们旨在展示使用机器学习技术在2017-2018年全国再入院数据库中预测因CVD而导致住院癌症患者180天内非预期再入院风险的可行性。我们包括了住院的癌症患者,结果是出院后180天内由于任何CVD而发生的非预期再入院。CVD包括房颤、冠心病、心力衰竭、中风、周围动脉疾病、心脏肥大和心肌病。我们实施了决策树(DT)、随机森林、极端梯度提升(XGBoost)和AdaBoost。准确率、精确率、召回率、F2分数和接收者操作特性曲线(AUC)用于评估模型的性能。在358,629名住院癌症患者中,5.86% (n = 21,021)经历了由任何CVD引起的非预期再入院。三种集成算法的性能优于决策树,其中XGBoost的性能最佳。我们发现住院时间、年龄和癌症手术是癌症患者心血管疾病相关的非预期住院的重要预测因素。机器学习模型可以预测住院癌症患者因CVD而引起的非预期再入院的风险。© 2023年 Springer Nature Limited.
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 19
SheetalGarg,Bhagyash...
Comparison of machine learning algorithms for the classification of spinal cord tumor.
Disease Models & Mechanisms
脊髓肿瘤被认定为一种由许多不同亚型组成的异质性疾病。癌症类型的早期诊断和预后已成为癌症研究中的必要条件,因为它能够促进随后的临床患者管理。将癌症患者分类为良性或恶性的重要性已经引领了生物医学和生物信息学领域的许多研究团队去研究机器学习(ML)方法的应用。因此,这些技术已被用于模拟癌症病情的进展和治疗。此外,ML工具能够从复杂数据集中检测关键特征,显示了它们的重要性。各种技术,如逻辑回归、支持向量机(SVM)、决策树(DT)和随机森林(RF)分类器,已经广泛应用于癌症研究中,用于开发预测模型,从而实现有效和准确的决策。尽管明显使用ML方法可以提高我们对癌症进展的理解,但这些方法被应用于日常临床实践中需要适当的验证。在本研究中,我们讨论了一种基于多种监督性ML技术的预测模型。© 2023作者(们),在独家许可下授予爱尔兰皇家医学学院使用。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 18
MaliheSafari,HabibEs...
Estimation of treatment effect in presence of noncompliance and competing risks: a simulation study.
Disease Models & Mechanisms
随机对照试验通常用于评估生存研究中的治疗效果,其中患者被随机分配到标准治疗组或实验治疗组。随着疾病进展,被随机分配到标准治疗组的患者可以转换到实验治疗。在随机对照试验中,治疗转换是指患者从随机治疗转换为其他治疗的情况。通常情况下,转换是从对照组到实验治疗。在这种情况下,治疗效果的估计需要使用方便的幼稚方法,如意向治疗法、按计划分析法,或者使用更先进的方法,如保序结构失效时间模型。到目前为止,以往的模拟研究只有一种可能的结果,但在特定的肿瘤学中,存在多种潜在结果,这些结果被称为竞争风险。以前的研究在确定不服从情况下治疗效果时未考虑这一方面。本研究旨在在存在竞争风险的情况下扩展保序结构失效时间方法,使用二维G估计方法。保序结构失效时间方法被扩展用于两个事件,即感兴趣事件和竞争事件。为此,基于特定原因风险的方法应用了保序结构失效时间方法,其结果与模拟研究中使用的幼稚方法进行了比较。研究结果显示,提出的方法与其他方法相比表现良好。 © 2023. Springer Nature Limited.
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 19
HongYingGuo,XiangNan...
Increased expression of autophagy-related gene 5 indicates poor prognosis in patients with Hepatocellular carcinoma.
Disease Models & Mechanisms
作为自噬机制的关键组分,自噬相关基因5(ATG5)对于自噬体形成至关重要。自噬参与了各种恶性肿瘤的转化和进展,但ATG5在肝细胞癌(HCC)中的作用尚待阐明。本研究评估了89对肝肿瘤和癌旁正常组织中ATG5的表达情况,并评估了ATG5表达与临床病理特征或预后的相关性。此外,还分别对年轻患者组和老年患者组进行了临床特殊分析,并探讨了评估总生存和无病生存的示意图。我们的研究表明,在肿瘤标本中,ATG5水平高于癌旁正常组织。升高的ATG5水平与血清α-胎蛋白(AFP)呈正相关。此外,ATG5水平较高的病例的无病生存(DFS)和总生存(OS)较低。多变量分析显示,ATG5的过表达预测了较差的OS和DFS。进一步的分析显示,在年轻患者和单发肿瘤数量亚组中,ATG5水平较高的病例的OS和DFS较差。示意图模型表明,标识图预测和实际情况具有一致性。综上所述,这些发现揭示了ATG5促进HCC的进展,使其成为肝细胞癌的潜在生物标志物和治疗靶点。本文受版权保护,版权所有。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Aug 19
NeilPatel,DanielCoba...
The 5-Factor Modified Frailty Index is Associated With Increased Risk of Reoperations and Adjacent Level Disease Following Single-Level Transforaminal Lumbar Interbody Fusion.
DIABETES & METABOLISM
回顾性队列研究。评估5因子改良版脆弱指数(mFI-5)评分与单节段椎间孔成形术(TLIF)后不良临床和影像学结果的预测能力。我们选取了2012年至2021年之间接受单节段开放或微创TLIF的年龄超过50岁、随访时间至少为1年的所有患者。排除变形、外伤、急诊和肿瘤病例以及进行修复手术的患者。使用包括需用药物治疗的高血压、慢性阻塞性肺疾病、糖尿病、充血性心力衰竭和部分或完全依赖功能状态在内的5个因子计算每位患者的mFI-5评分。进行单变量和多因素的 logistic 回归分析,以评估mFI-5评分对 住院再入院、再手术和术后并发症的影响。我们纳入了156名患者,并根据其脆弱程度进行分组:非脆弱组(mFI=0,n=67)、轻度脆弱组(mFI=1,n=59)和重度脆弱组(mFI≥2,n=30)。多因素分析发现高度脆弱(mFI≥2)是再手术(OR:16.9,CI:2.7-106.9,P=0.003)和相关再入院(OR=16.5,CI:2.6-102.7,P=0.003)的独立预测因子,与非脆弱组相比。mFI-5评分≥2还能预测任何并发症(OR=4.5,CI:1.4-14.3,P=0.01)和邻近节段疾病(ASD)(OR=12.5,CI:1.2-134.0,P=0.037)。高度脆弱与年长成人进行单节段TLIF的相关再入院、再手术、任何并发症和ASD具有预测性。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 18
XiaoranZheng,MinGao,...
Ceftazidime-assisted synthesis of ultrasmall chitosan nanoparticles for biofilm penetration and eradication of Pseudomonas aeruginosa.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
绿脓杆菌感染对免疫受损个体,特别是囊性纤维化患者,构成了严重威胁,因为该菌可形成细菌生物膜。本研究中,我们设计了能够有效穿透生物膜并根除绿脓杆菌的自组装壳聚糖头孢他啶纳米颗粒(CSCE)。通过离子交联合成了CSCE纳米颗粒,将带负电荷的头孢他啶与带正电荷的壳聚糖结合,形成了直径约为40 nm的均匀纳米颗粒,具有高度分散性和良好生物相容性。显著的是,这些纳米颗粒对绿脓杆菌的生长具有明显的抑制作用,降低了吲哚蓝的产生,减少了生物膜的形成,最大抑制率达到了22.44%。此外,体内实验表明,给予CSCE纳米颗粒治疗的腹腔绿脓杆菌感染小鼠生存率提高,伴随着炎症因子白细胞介素-6 (125.79±18.63 pg/mL)、白细胞介素-17 (125.67±5.94 pg/mL)和肿瘤坏死因子-α (135.4±11.77 pg/mL)水平的降低。至关重要的是,在腹腔注射绿脓杆菌感染后,接受CSCE纳米颗粒治疗的小鼠血液中无菌。总的来说,我们的研究结果强调了这些合成纳米颗粒作为抗绿脓杆菌感染剂的潜力。© 2023. Springer Nature Limited.
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 19
AngibelleLizmarRodrí...
Chimeric antigen receptor T cells: immunotherapy for the treatment of leukemia, lymphoma and myeloma.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
在免疫疗法中,利用基因改造的T细胞表达嵌合抗原受体(CAR)来治疗癌症。自体淋巴细胞从患者身体中提取出来,进行基因改造以获得CAR-T细胞,然后再引入患者体内来攻击癌细胞。该疗法在CD19阳性白血病和淋巴瘤领域取得了成功,已获批用于非何杰金淋巴瘤、急性淋巴细胞性白血病和多发性骨髓瘤的治疗。CAR是一种将抗体特异性与T细胞细胞毒性相结合的蛋白质。与该疗法相关的最常见的毒副反应通过临床前测试无法预测,包括细胞因子释放综合征、神经毒性和细胞减少症。这些毒副反应通常是可逆的。该领域面临的主要挑战之一是昂贵的经济成本,因此寻找降低成本的方法必须是首要任务。此外,其他需要克服的挑战包括不是所有患者都能获得该产品以及开始治疗的等待时间过长的情况。本综述的目的是介绍CAR-T细胞的结构发展、迄今为止获批的治疗方案、相关毒副反应以及它们作为免疫疗法的优点和局限性。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 18
LouiseRichardson,Sco...
Context-dependent TGFβ family signalling in cell fate regulation.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
转化生长因子-β (TGFβ) 家族是一大类进化保守的细胞因子,其信号调控不同细胞环境下不同生命阶段的细胞命运决策。本文讨论了早期胚胎中的新发现,揭示了与我们对形态因子解释的初始理解相反,鲁棒的细胞命运指定可以由噪声组合的信号输入和广泛范围的信号水平产生。我们将这些证据与有关TGFβ家族信号在幼年和成年期间维持和稳态组织中的作用的新发现进行了比较,涵盖了骨骼、造血和免疫系统。通过这些比较,我们发现与鲁棒的发育系统相反,TGFβ家族信号的相对微小扰动在生命后期会产生有害效应,导致异常的细胞命运指定和疾病,例如癌症或先天性疾病。最后,我们重点介绍了针对信号功能失调的新策略,并讨论了如何从生物学的不同领域中获取知识以促进疾病中异常TGFβ家族信号的治疗方法的发展。© 2023. Springer Nature Limited.
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