1. Deguelin（DGN）, 一种从多种植物中提取的维生素A类似物，对多种类型的肿瘤细胞表现出强大的抗癌活性。然而，关于DGN对红细胞（RBCs）的毒性还缺乏证据。考虑到癌症患者普遍存在化疗相关的贫血问题，这一点非常重要。 2. RBCs在37℃下被暴露于1-100μM的DGN中，持续24小时。使用光度计测量了溶血和相关标志物，同时使用流式细胞术通过Annexin-V-FITC结合和光散射特性检测磷脂酰丝氨酸外露。此外，使用Fluo4/AM和H2DCFDA分别定量细胞质中的Ca2+和活性氧化物。除此之外，还测试了DGN对特定信号传导抑制剂、维生素C和ATP的影响。 3. DGN导致Annexin-V阳性细胞数量显著增加，伴随细胞萎缩，但没有出现Ca2+升高或氧化应激。DGN还引发了剂量依赖的溶血反应，通过防止KCl离子流失和存在蔗糖、D4476和ATP的情况下得到改善。在全血中，DGN显著增加了网织红细胞计数、血小板分布宽度和大细胞计数。 4. DGN通过Casein激酶1α和ATP耗竭触发RBC的过早红细胞溶解作用和溶血作用，并且对网织红细胞和血小板具有特异毒性。

CDC42控制肠上皮细胞(IEC)干细胞(IESC)分裂。CDC42引发肠道炎症或肿瘤的机制尚不清楚。我们使用炎症性肠病(IBD)、结直肠癌、衰老和IESC损伤模型，确定了在炎症和肿瘤中失去肠道CDC42的情况。收集肠道标本以确定IBD或结直肠癌中CDC42的水平。将Cdc42 floxed小鼠与Villin-Cre、Villin-CreERT2和/或Lgr5-eGFP-IRES-CreERT2，或Bmi1-CreERT2小鼠进行交叉，生成缺失Cdc42的小鼠。辐射、结肠炎、衰老和肠道器官oid用于评估病理性炎症、IESC/祖细胞再生能力和IEC修复的CDC42。我们的研究发现结直肠癌中CDC42的增加与较低的生存率相关；相比之下，在受炎症影响的IBD结肠中发现CDC42水平较低。结肠Cdc42耗竭显著降低了Lgr5+ IESCs，增加了祖细胞的增生，并诱导黏膜炎症，从而导致囊肿发生。结肠Cdc42耗竭明显增强了辐射或化学诱导的结肠炎。Cdc42的耗竭或抑制减少了结肠Lgr5+ IESC的再生。总之，Cdc42的耗竭降低了IESC的再生和IEC的修复，导致黏膜炎症延长。Cdc42的单基因耗竭引发病理性黏膜炎症，可能在衰老背景下导致肠道肿瘤。© 2023 The Authors. Publishing services by Elsevier B.V. on behalf of KeAi Communications Co., Ltd.

结构变异（SVs）是基因组重排的一种形式，可以采取许多不同的形式，如拷贝数改变、倒位和易位。在细胞发育和衰老过程中，体细胞SVs在基因组中积累，可能产生中性、有害或病理效应。体细胞SVs的产生是癌症发展和进展的关键突变过程。尽管它们的重要性，检测体细胞SVs具有挑战性，使其比体细胞单核苷酸变异研究得少。在本综述中，我们总结了基于全基因组测序（WGS）的方法在组织和单细胞水平上检测体细胞SVs的最新进展，并讨论了它们的优点和局限性。首先，我们描述了用于使用bulk WGS数据调用体细胞SV的先进计算算法，并比较了在存在或不存在匹配正常对照时体细胞SV检测器的性能。然后，我们讨论了用于分析体细胞SVs的尖端单细胞技术的独特特征。突出了bulk和单细胞方法的优缺点，并讨论了它们对于拷贝中性SV的敏感性、对于功能推断的有用性以及实验和计算成本。最后，我们展示了将体细胞SV与其功能读数（如来自单细胞转录组和表观基因组分析的读数）链接的计算方法，并讨论了这些方法在健康和疾病中的前景。© The Author(s) 2023. Published by Oxford University Press.

脑肿瘤治疗缺乏有效的化疗药物是一个严重尚未满足的医疗需求。这部分归因于通过血脑屏障（BBB）和肿瘤细胞屏障的不足递送，两者均具有能限制许多潜在有效药物运输的活性外排转运体，适用于原发性和转移性脑肿瘤。该综述简要总结了正常BBB的组分和功能，以及与药物穿透脑部有关的BBB的改变和对药物递送的影响。根据化合物的分布限制，BBB的有限渗透性和随后的药物递送到肿瘤细胞可受到活性外排转运体的显著影响，这些部分将从某些详细方面进行讨论。鉴于这些复杂性，有必要量化活性（非结合）药物在脑部的分布范围，以对比各种化合物，并为对抗脑肿瘤的潜力提供信息。在这方面，脑血浆非结合分配系数（Kp,uu）是一种指标，其目前的使用情况进行了讨论。然而，活性药物递送的程度并不是有效治疗的唯一决定因素。除了Kp,uu之外，药物的效力也是在药物发现和开发过程中应考虑的重要参数。换句话说，要回答“多少才够？”的问题，必须考虑能够递送多少以及需要递送多少。©2023. Springer Science+Business Media, LLC独家许可，Springer Nature的一部分。

雌激素在许多生理过程中发挥作用，包括控制脑细胞的生长和分化。2-甲氧基雌二醇（2-ME2）是一种17β-雌二醇（E2）代谢物，据观察其具有抗癌作用，无论在体内或体外都有表现。2-ME2影响所有活跃分裂的细胞，包括神经元。本研究旨在确定2-ME2在特定组织培养模型和临床环境中是否是一种具有潜在抗癌保护作用或神经退行性作用的药物。在本研究中，通过神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞系的帕金森病（PD）体外模型，确定了2-ME2的活性。所得结果表明，2-ME2产生亚硝基氧化应激反应，并控制热休克蛋白（HSP），导致DNA链断裂和凋亡。从一方面来看，它可能影响强烈分裂的细胞，预防癌症的发展；然而，这种活性在中枢神经系统内可能促进帕金森病等神经退行性疾病的发生。因此，还研究了2-ME2的神经毒性活性在PD体外模型中的转化价值。采用LC-MS/MS技术评估了PD患者血液中的雌激素及其衍生物，即羟基和甲氧基雌激素，使用停流法评估了过氧化氢（H2O2）水平。与对照组相比，患者血液中的甲氧基雌激素和H2O2水平增加，而羟基雌激素同时减少。根据上述结果，我们认为测定甲氧基雌激素和H2O2的血浆水平可能是一种新的PD生物标志物。所述研究是挂号专利申请 "利用过氧化氢和17β-雌二醇及其代谢物在神经退行性疾病诊断中的应用" ，编号P.441360。©2023作者。

T2-FLAIR不匹配征象被认为是高度提示IDH突变星形胶质瘤的成像发现。本研究旨在确定T2-FLAIR不匹配征象与低级别胶质瘤中11C-甲硫氨酸摄取的相关性。我们在这项研究中纳入了78例经组织病理学证实的低级别胶质瘤（乙级：31例，丙级：47例）。78位患者在组织学诊断前进行了11C-甲硫氨酸正电子发射断层扫描（MET-PET）和磁共振（MR）成像扫描。通过将肿瘤最大标准摄取值（SUV）除以正常脑组织的平均SUV，计算了11C-甲硫氨酸摄取的肿瘤/正常比值（T/N）。通过三名独立评价者对MR成像扫描进行了T2-FLAIR不匹配征象的评估。我们比较了具有不同低级别胶质瘤分子类型的患者的分子状态、T2-FLAIR不匹配征象和11C-甲硫氨酸摄取情况。这78例低级别胶质瘤被分为三个分子组：A组（IDH突变和1p/19q非共删除，n = 22），O组（IDH突变和1p/19q共删除，n = 20）和W组（IDH野生型，n = 36）。T2-FLAIR不匹配征象在16例（20.5%）中被发现，其中分别有8例（36.4%）、0例（0%）、8例（22.2%）属于分子组A、O和W。具有T2-FLAIR不匹配征象的肿瘤的中位数MET-PET的T/N比值为1.50，明显低于没有T2-FLAIR不匹配征象的肿瘤（1.83，p < 0.001，Mann-Whitney U检验）。在A组和W组（排除O组）中，具有T2-FLAIR不匹配征象的肿瘤中，MET-PET的中位数T/N比值为1.50，明显低于没有T2-FLAIR不匹配征象的肿瘤（1.81，p = 0.002，Mann-Whitney U检验）。T2-FLAIR不匹配征象与低级别胶质瘤中11C-甲硫氨酸摄取量较低相关。© 2023. 该作者/作者，专有许可给Springer Science+Business Media, LLC，隶属于Springer Nature。

中枢神经系统(CNS)穿透整体治疗显著促进了黑色素瘤脑转移患者的护理。然而，需要改善对这些病变的分子景观和微环境的理解，以优化患者选择和推进治疗方法。评估黑色素瘤脑转移的整体和单细胞基因组特征与临床结局和治疗反应的关联。这项队列研究分析了来自一家位于加利福尼亚州旧金山的美国全国综合癌症网络肿瘤中心的连续94例黑色素瘤脑转移患者的整体DNA测序和单核RNA测序数据，这些患者经过组织病理学确诊为黑色素瘤脑转移，并在2009年1月1日至2022年12月31日期间接受了单一手术切除。 采用临床实验室改进修正法认证的靶向测序分析肿瘤切除标本，重点关注BRAF V600E变异。对于CNS治疗原始患者进行手术切除的冷冻病理标本，采用商业单核RNA测序方法。主要结局为总生存期(OS)。次要结局包括CNS无进展生存期(PFS)，以及减少T细胞和巨噬细胞群体的微环境组成和免疫治疗反应。 为了将分子状态与临床结果进行相关性分析，对94例连续患者(中位年龄64岁[范围24-82岁]；70名男性[74%])进行了Kaplan-Meier生存分析，其中包括目标BRAF变异检测，结果显示BRAF变异型肿瘤的颅内中位PFS较差(BRAF变异型：3.6个月[四分位数范围0.1-30.6个月]；BRAF野生型：11.0个月[四分位数范围0.8-81.5个月]；P<0.001)，并且OS较差(BRAF变异型：9.8个月[四分位数范围2.5-69.4个月]；BRAF野生型：23.2个月[四分位数范围1.1-102.5个月]；P=0.005；log-rank检验)。多变量Cox比例风险回归分析表明，BRAF V600E状态是独立变量，与PFS (风险比[HR]，2.65；95%可信区间，1.54-4.57；P<0.001）和OS (HR，1.96；95% CI，1.08-3.55；P=0.03）显著相关。在接受靶向DNA测序的45位患有切除黑色素瘤脑转移的患者中，分子分类重复了癌症基因组图谱组(NRAS变异型、BRAF变异型、NF1变异型和三重野生型)，脑转移队列中没有亚型富集。在分子水平上，发现BRAF V600E变异损伤具有明显降低的肿瘤突变负荷。此外，初次接受治疗的BRAF V600E变异(n=3)脑转移与BRAF野生型(n=3)脑转移的单核RNA测序结果显示在BRAF野生型肿瘤中免疫细胞群体增加(均值[标准差]，11%[4.1%] vs 3%[1.6%] CD45阳性细胞；P=0.04)。根据BRAF状态对术后免疫治疗反应进行生存分析结果显示，BRAF野生型病变与检查点抑制治疗的反应相关(OS中位数：应用免疫治疗，未定义；不使用免疫治疗，13.0个月[范围1.1-61.7个月]；P=0.001；log-rank检验)，而BRAF变异型病变(OS中位数：应用免疫治疗，9.8个月[范围2.9-39.8个月]；不使用免疫治疗，9.5个月[范围2.5-67.2个月]；P=0.81；log-rank检验)。 这项对切除黑色素瘤脑转移患者的分子分析发现，BRAF V600E变异是与较差临床结果、不同的微环境组成和免疫治疗受益相关的重要转化生物标志物。因此，患有BRAF V600E变异的黑色素瘤脑转移患者可能受益于其他穿透中枢神经系统的全身方案。

大多数sRCC研究集中在晚期或转移性疾病上，有限的研究分析了局部非转移性病人的结局。本研究评估了局部sRCC和4级RCC（非sRCC）病人的肾脏切除术后结局和癌症特异性生存（CSS）的预测因素。在1988年6月至2019年3月期间，共564例局部RCC患者接受了部分或根治性肾脏切除术，其中有204例sRCC和360例WHO/ISUP 4级非sRCC。比较了两组间各个阶段的CSS。使用III期ASSURE临床试验数据进行CSS结果的外部验证。采用曼-惠特尼U检验、卡方检验比较结果，并采用Kaplan-Meier方法评估CSS、总生存和无复发生存。采用Cox比例风险回归评估与RCC死亡相关的临床病理特征。中位随访时间为31.5个月。sRCC和4级非sRCC两组的中位总生存和CSS分别为45个月和102个月，49个月和152个月，p<0.001。在每个阶段，sRCC的CSS较4级非sRCC更差。值得注意的是，pT1期的sRCC的CSS比pT3级的4级非sRCC更差。CSS的负面预测因素包括肉瘤样特点、非透明细胞组织学、阳性切缘、较高阶段（pT3/pT4）和最小侵袭性手术（MIS）的使用。ASSURE外部验证显示sRCC患者的CSS较差（HR 1.63（95% CI [1.12-2.36]），p=0.01），但MIS手术并没有导致更差的结果（HR 1.39（95% CI [0.75-2.56]），p=0.30）。局部sRCC与4级非sRCC相比，在每个阶段的CSS较差。生存的负面预测因素包括阳性切缘、更高的病理分期、MIS的使用和非ccRCC组织学。sRCC是一种侵袭性变异，即使在低阶段也需要密切监测，并可能纳入辅助治疗试验中。本文章受版权保护，保留所有权利。

体外器官模拟解决了伴随体内实验的准确性、伦理和成本挑战。器官样体和芯片上的器官已被开发用于模拟器官的体外实时生物学和生理学特征。许多研究已经使用这些系统评估器官对外界刺激的体外实时反应。特别是，在药物研发中，可以最有效地利用芯片上的器官预测器官对药物的反应。此外，多器官芯片系统有助于更接近体内环境的表示。在本综述中，我们讨论了生物传感技术，在芯片上模拟的器官反应的体内实时测量作为读数的工具，包括多器官模型。值得注意的是，通过进一步推进芯片的开发以及评估技术，将建立一个集成自动多感知的人体芯片系统。© 2023 IOP Publishing Ltd.

宏噬作用/噬作用是一种高度保守的分解过程，用于清除功能障碍的细胞成分和侵入性病原体。噬作用功能障碍导致癌症、神经退行性和炎症性疾病等疾病的发生。了解噬作用在健康和疾病中的调控是近几十年来的研究重点。我们以前提供了一个噬作用研究的综合数据库，即噬作用调控网络（ARN）。在过去的七年中，这个资源已经被数千名用户使用。在这里，我们介绍一个新的升级版资源，噬作用网络（AutophagyNet）。它建立在之前的数据库基础上，但包含了主要的改进，以解决用户反馈和由于组学数据可用性的进展而产生的新需求。噬作用网络包含了更新的交互关系整合，并整合了超过280,000个经过实验证实的核心噬作用蛋白与它们的蛋白质、转录和转录后调控因子以及它们的潜在上游通路连接之间的相互作用。噬作用网络提供了关于每个核心蛋白的注释，包括它们在不同类型的噬作用（线粒体噬作用、异噬作用等）中的作用；在噬作用的不同阶段（启动、扩展、终止等）中的作用；以及其在亚细胞和组织特异性定位方面的作用。这些注释可以用于过滤数据集，并提供符合用户需求的可定制下载选项。该资源以各种文件格式（如CSV、BioPAX和PSI-MI）提供，并且可以直接在Cytoscape中分析和可视化数据。通过将噬作用网络与组织或细胞类型特异性（多）组学数据集（如转录组或蛋白质组数据）相结合，可以分析宏噬作用的多层调控。该资源可以在http://autophagynet.org上公开访问。