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Journal of Translational Medicine
2023 Aug 16

RuijiaoChen,Xiaopeng...
Integrated multi-omics analyses reveal Jorunnamycin A as a novel suppressor for muscle-invasive bladder cancer by targeting FASN and TOP1.
Journal of Translational Medicine
膀胱癌是一种高发的泌尿生殖系统恶性肿瘤,其中浸润性膀胱癌(MIBC)是一种具有高死亡率的恶性肿瘤。由于现有药物存在毒性高、疗效差和副作用多等缺陷,迫切需要开发低毒性、高效性的新药物用于MIBC的治疗。已发现天然海洋化合物Jorunnamycin A(JorA)具有高效的抗癌作用,但其在膀胱癌上的抗癌功能和机制尚未研究。为了考察JorA对MIBC的抗癌作用,进行了细胞计数试剂盒8、EdU染色和克隆形成分析。此外,还使用异种移植小鼠模型验证了其体内的抗癌效果。为了研究JorA的药理机制,进行了高通量定量蛋白组学、转录组学、RT-qPCR、Western blotting、免疫荧光染色、流式细胞术、拉下实验和分子对接。JorA抑制了MIBC细胞的增殖,T24和UM-UC-3的IC50分别为0.054和0.084μM。JorA诱导的显著变化的蛋白质富集在“与癌症相关的途径”和“EGFR相关的信号通路”中,主要表现为抑制细胞增殖和促进细胞凋亡。具体而言,JorA抑制了DNA合成速率,诱导了磷脂酰丝氨酸转位,并抑制了细胞迁移。此外,还发现脂肪酸合酶(FASN)和拓扑异构酶1(TOP1)是JorA的相互作用蛋白质。通过DockThor软件获得了JorA结合到FASN和TOP1的3D对接结构(结合亲和力分别为-8.153和-7.264 kcal/mol)。发现海洋化合物JorA具有特异性的对MIBC的抑制作用,并首次揭示了其潜在的药理机制。这一发现对于开发新型高效低毒性的膀胱癌治疗药物具有重要意义。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 16

XiangZhou,RanXu,Tong...
Immunogenic cell death-based prognostic model for predicting the response to immunotherapy and common therapy in lung adenocarcinoma.
GENES & DEVELOPMENT
肺腺癌(LUAD)是呼吸系统的恶性肿瘤。目前治疗方法的疗效差异很大,个体化治疗显而易见。因此,寻找预测治疗预后的生物标志物,并为制定治疗方案提供参考和指导是迫切的。在过去几十年中,癌症免疫治疗取得了明显的进展,并在LUAD上产生了显著的效果。免疫原性细胞死亡(ICD)可以重塑肿瘤的免疫微环境,有助于免疫治疗。因此,探索ICD生物标志物以构建预后模型可能有助于个体化治疗。我们使用肺腺癌(LUAD)数据集鉴定与ICD相关的差异表达基因(DEGs)。然后,将这些DEGs聚类并分成亚组。我们还在不同维度上进行了方差分析。此外,通过LASSO Cox回归分析建立并验证了预后模型。该模型的风险评分用于通过生存分析评估预后差异。我们还预测了不同治疗方法的治疗预后。将LUAD样本分为两个亚组。ICD高亚组与免疫热表型相关,对免疫治疗更敏感。预后模型是基于六个与ICD相关的DEG构建的。我们发现高风险评分患者对免疫治疗的反应更好。ICD预后模型被验证为评估个体LUAD患者ICD亚型的独立因素,可能有助于更有效的治疗。© 2023年 Springer Nature Limited。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 16

LeiLi,HainanBao,Yawe...
Preliminary Study of Whole-Genome Bisulfite Sequencing and Transcriptome Sequencing in VHL Disease-Associated ccRCC.
GENES & DEVELOPMENT
Von Hippel-Lindau(VHL)病是一种常染色体显性遗传肿瘤综合征,发病率约为1/36,000。与VHL病相关的透明细胞肾细胞癌(ccRCC)是最常见的先天性肾细胞癌。尽管近年来治疗肾细胞癌的进展提高了患有VHL病的患者的长期预后,但肾癌仍然是这些患者的主要死亡原因。因此,寻找VHL病相关的ccRCC的诊断和治疗新靶点仍然至关重要。
在本研究中,我们收集了北京大学第一医院泌尿外科诊断和手术治疗的25名VHL病相关ccRCC患者的配对肿瘤组织和正常样本。经过筛选,我们对23对组织进行了全基因组亚硫酸酯测序(WGBS)和6对组织进行了RNA-seq。并且我们还将VHL病相关的ccRCC转录组数据与来自The Cancer Genome Atlas(TCGA)公共数据库的散发性ccRCC转录组数据进行了比较
结果:我们发现VHL病相关ccRCC肿瘤组织的甲基化水平显著低于正常组织。与正常组织相比,肿瘤组织在3p缺失和5q、7q增益的拷贝数方面存在差异。我们整合了RNA-seq和WGBS数据,揭示了与VHL病相关ccRCC相关的甲基化候选基因;我们的结果显示了124个过甲基化和下调基因,以及245个低甲基化和上调基因。通过将VHL病相关ccRCC转录组数据与TCGA公共数据库中的散发性ccRCC转录组数据进行比较,我们发现差异基因富集的主要通路在两者之间有所不同。
我们的研究绘制了VHL综合征下透明细胞肾细胞癌肿瘤和正常组织的拷贝数变异、甲基化和mRNA水平变化的多组学图谱,为透明细胞肾细胞癌机制研究、生物标志物筛选和治疗靶点发现提供了坚实基础。 © 2023. 作者, 排他性授权给 Springer Nature Switzerland AG。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 16

YuZhang,TianyiZhang,...
Lactate dehydrogenase D serves as a novel biomarker for prognosis and immune infiltration in lung adenocarcinoma.
GENES & DEVELOPMENT
肺癌被报道为男性和女性全球范围内的主要死因。越来越多的证据突出了乳酸脱氢酶D(LDHD)在不同类型的癌症中的重要性,尽管其在肺腺癌(LUAD)中的作用尚未充分探索。在本研究中,我们旨在调查和确定LDHD与LUAD之间的关系。样本的收集是根据癌症基因组图谱(TCGA)数据集和基因表达数据库(GEO)进行的。为了确定LDHD功能的各个方面,我们分析了不同的表达基因(DEGs)、功能富集和蛋白质相互作用(PPI)网络。使用Kaplan-Meier方法、Cox回归分析和诺莫图共同确定了LDHD的预测值。采用Estimate和ssGSEA评估了免疫浸润分析。免疫疗法反应的预测基于TIDE和IPS。通过免疫组织化学、Western blot和qPCR方法验证了LUAD中LDHD的表达水平。还进行了划痕愈合和透过培养皿示踪试验,以说明LUAD细胞系中的侵袭特征。结果显示,在LUAD患者中,LDHD普遍下调,低LDHD组的整体生存(OS)、疾病特异生存(DSS)和进展无病生存(PFI)相对下降。通过KEGG分析观察到富集的途径包括丙酮酸代谢、中心碳代谢和氧化磷酸化。还注意到LDHD的表达与免疫细胞浸润和典型检查点呈负相关。高LDHD组对免疫疗法的反应显著,尤其在CTLA4+/PD1-疗法中。体外研究表明,LDHD的过表达抑制了肿瘤的迁移和侵袭。总之,我们的研究揭示了LDHD可能是预后和免疫浸润的有效预测因子,可能为免疫疗法提供更好的选择。© 2023. 由 Springer Nature 旗下的 BioMed Central Ltd. 提供。
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ENVIRONMENTAL RESEARCH
2023 Aug 14

BHJaswanthGowda,Moha...
The cubosome-based nanoplatforms in cancer therapy: Seeking new paradigms for cancer theranostics.
ENVIRONMENTAL RESEARCH
液晶胶束是自组装、非层状的介观纳米结构材料,作为药物载体引起了广泛的关注。其中一种液晶胶束亚型为立方胶束,其拥有三维结构,呈现出双连续的立方液晶图案。这些图案是通过不饱和单甘酯(如单油酸甘油酯或植物三醇等亲水脂类)的自组织形成,并在之后使用聚氧乙烯-聚氧丙烯醇(PO和EO的共聚物)来稳定。由于双连续结构和基于聚合物的稳定性,立方胶束已被证明具有较比脂质体更高的疏水药物包封效率,并表现出较高的稳定性。在过去的十年中,立方胶束因其在癌症治疗和成像中有效地递送治疗和造影剂并产生最小副作用的能力而受到了广泛的关注,成为一种安全有效的方法。基于这些优势,本综述详细阐述了液晶胶束的一般性质、组成和制备技术,同时解释了其药物装载和释放机制。此外,该综述还就液晶胶束在各种癌症治疗和成像中的应用进行了详细讨论,并列举了与立方胶束为基础的药物递送系统相关的专利。版权所有 © 2023. Elsevier Inc. 出版
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ENVIRONMENTAL RESEARCH
2023 Aug 14

YiqiCai,JiahuanRen,J...
Novel affibody molecules as potential agents in molecular imaging for MAGE-A3-positive tumor diagnosis.
ENVIRONMENTAL RESEARCH
癌胚抗原蛋白Melanoma antigen A3(MAGE-A3)在多种恶性肿瘤形式中高度表达。已经确认亲和体分子,一种新型的小型(约6.5 kDa)靶向蛋白家族,可作为分子成像和靶向肿瘤治疗的有用工具。本研究评估了亲和体分子作为MAGE-A3阳性肿瘤体内分子成像检测的新型药物的疗效。在这项研究中,经过三个循环的噬菌体展示文库筛选,分离出了两种新的亲和体分子(ZMAGE-A3:172和ZMAGE-A3:770),它们能够与MAGE-A3结合。这些分子然后在细菌中表达和纯化。使用Western blotting、免疫组织化学、间接免疫荧光、表面等离子共振和近红外光成像对具有高亲和力和特异性的亲和体分子进行评估并检测裸鼠肿瘤。所选的ZMAGE-A3亲和体分子可以在活细胞中与MAGE-A3蛋白精确结合,并在分子水平上显示高亲和力结合MAGE-A3蛋白。此外,DyLight755标记的ZMAGE-A3:172或ZMAGE-A3:770在MAGE-A3阳性肿瘤中的积累可在注射后30分钟即可达到,并在48小时后消失。我们的发现支持这两种MAGE-A3蛋白结合的亲和体分子作为分子成像药物的潜力。
版权所有 © 2023 Elsevier Inc. 发布
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 02

KarolinaOlbrich,Zuza...
Vibrational spectroscopy methods for investigation of the animal models of glioblastoma multiforme.
Disease Models & Mechanisms
胶质母细胞瘤(GBM)是成年人中最常见且具有毁灭性的原发性脑肿瘤。这是一种高度致命的疾病,只有25%的患者能存活超过1年,仅有5%的患者能存活超过起病后的5年时间。为了寻找更有效的治疗方法,需要了解肿瘤发生过程的机制。对受肿瘤生长影响的组织的生化异常进行分析可能为解决这个问题提供新的线索。因此,在本研究中,我们应用傅立叶变换红外光谱(FTIR)和拉曼显微光谱技术评估大鼠脑组织中生物分子分布和结构的变化,这些变化是由胶质母细胞瘤发展所导致的。同时,我们还利用同步辐射X射线荧光显微镜确定神经组织中出现的元素异常。为了达到研究的预定目标,我们使用了GBM动物模型。我们将胶质瘤细胞以不同侵袭程度进行颅内植入。对于光谱学研究,我们使用取自癌细胞植入区域的脑片进行实验。所获得的结果揭示了脂质和含酮基化合物含量的下降,蛋白质的组成和结构变化以及肿瘤区域低原子序数元素分布的异常等。Copyright © 2023 Elsevier B.V. All rights reserved.
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Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 16

AndrewALin,HanfeiShe...
Modeling and optimization of parallelized immunomagnetic nanopore sorting for surface marker specific isolation of extracellular vesicles from complex media.
Disease Models & Mechanisms
基于表面标记物表达的特异亚群胞外囊泡(EVs)的分离面临着重大挑战,因为其纳米级尺寸(< 800 nm),其异质性表面标记物表达和临床标本中存在的大量背景 EVs(血液中每毫升存在1010-1012 EVs)。
使用径迹刻蚀磁性纳米孔(TENPO)芯片的高度并行纳米磁性分离已实现高通量、抗堵塞的精确免疫特异分选。然而,目前还没有对控制通量、目标 EVs 回收和丢弃背景 EVs 能力的折衷设计参数进行系统研究。我们结合有限元模拟和TENPO芯片的实验表征来阐明从血液中分离 EV 亚群的设计规则。我们通过选择孔径、串联膜片数量和流速,在不牺牲目标 EVs 回收的情况下,将装置背景降低>10倍,展示了该方法的实用性。我们将TENPO分离的 EVs 与 EV 分离的黄金标准方法进行比较,并通过针对肺癌、胰腺癌和肝癌等多种疾病模型的 EVs 亚群进行展示,证明了其广泛应用和模块化的实用性。© 2023. Springer Nature Limited.
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 14

AlicjaBurek-Michalsk...
Biologic therapy in psoriasis and eye.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
银屑病是一种全身性炎症性疾病,主要表现为皮肤病变,但炎症也可能影响关节和眼睛。很多与银屑病相关的合并症已经被描述出来,包括代谢综合征和冠状动脉斑块。银屑病的发病机制是多方面的。遗传和免疫因素在激发炎症过程中起到了一定作用。遗传易感性与HLA-C*06:02风险等位基因和细胞因子(如肿瘤坏死因子阿尔法、白细胞介素17、白细胞介素20、白细胞介素23和干扰素阿尔法)引起的炎性反应有关。除了常规治疗如局部类固醇和免疫抑制剂外,生物制剂在银屑病、银屑病性关节炎和合并的葡萄膜炎的治疗中被广泛使用。在大多数情况下,生物制剂对葡萄膜炎具有益处,但在某些情况下,其中一些药物可能会导致严重的副作用,威胁到视力。
版权所有 © 2023 Elsevier Inc. 发表。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 14

Yeun-PoChiang,Zhiqia...
Sphingomyelin synthase-related protein SMSr is a phosphatidylethanolamine phospholipase C protein that promotes nonalcoholic fatty liver disease.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
鞘磷脂酰乙醇胺磷脂酶C(PE-PLC)相关的鞘磷脂合酶(SMSr)是一种在哺乳动物中广泛存在的保守分子。然而,其生物学功能仍不清楚。我们之前观察到SMS1缺陷介导的葡萄糖鞘脂醇积累引发非酒精性脂肪肝病(NAFLD),包括非酒精性脂肪性肝炎(NASH)和肝纤维化。在本研究中,首先我们评估了高脂肪饮食/果糖诱导的Smsr基因敲除(KO)和WT小鼠的NAFLD。其次,我们评估了SMSr缺陷是否能够逆转SMS1缺陷引发的NAFLD,使用Sms1/Sms2双缺陷以及Sms1/Sms2/Smsr三重缺陷小鼠模型。我们发现SMSr/PE-PLC缺陷减轻了高脂肪饮食/果糖诱导的脂肪肝和NASH,并减轻了葡萄糖鞘脂醇积累引发的NASH、纤维化和肿瘤形成。此外,我们发现SMSr/PE-PLC缺陷降低了许多炎症细胞因子和纤维化相关因子的表达,并且体外或体内的PE补充模拟了SMSr/PE-PLC缺陷的情况。此外,我们证明了SMSr/PE-PLC缺陷或PE补充有效阻止了膜结合的β-连环蛋白转移到细胞核,从而阻止了与肿瘤相关的基因表达。最后,我们观察到NASH患者肝脏中SMSr蛋白水平较高,血浆PE水平较低且血浆PE /磷脂酰胆碱(PC)比值较低,并且人类血浆PE水平与TNF-α和TGFβ1水平呈负相关。总之,SMSr/PE-PLC缺陷引起PE积累,可以减轻脂肪肝、NASH和纤维化。这些结果表明,SMSr/PE-PLC抑制剂治疗可能缓解NAFLD。版权所有 © 2023 作者,由Elsevier公司出版。保留所有权利。
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