研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Journal of Ovarian Research
2023 Aug 11
DanyiLiu,GuorongLyu,...
Can the ultrasound microcystic pattern accurately predict borderline ovarian tumors?
Journal of Ovarian Research
本研究旨在探讨超声微囊性模式(MCP)是否能够准确预测卵巢边缘性肿瘤(BOT)。本研究选择符合入选标准的393名患者进行回顾性收集。通过多元无序Logistic回归分析,获得能够较好鉴别不同病理类型BOT的指标。最后,分析超声MCP与病理特征之间的相关性。(1)393个卵巢肿瘤中,55个存在MCP,其中包括34例BOT(34/68,50.0%)、16例恶性肿瘤(16/88,18.2%)和5例良性肿瘤(5/237,2.1%)。 (2)单因素筛查显示BOT、良性卵巢肿瘤和恶性卵巢肿瘤之间在患者年龄、CA-125水平、腹水、>10个囊腔、实性组分、血流和MCP方面存在显著差异(P < 0.05)。 (3)多元无序Logistic回归分析显示,血流、>10个囊腔和MCP是鉴别BOT的显著因素(P < 0.05)。 (4)具有MCP的卵巢肿瘤的病理学表现为“气泡”状或“叉形”状松散组织结构。MCP可在不同病理类型的卵巢肿瘤中观察到,并可作为区分BOT、良性肿瘤和恶性肿瘤的新的超声标记。MCP可能是由无回声囊液填充松散组织缝隙而产生的。© 2023. BioMed Central Ltd.,Springer Nature的一部分。
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Frontiers in Microbiology
2023
GuangLiu,TongLi,Xiao...
An independent evaluation in a CRC patient cohort of microbiome 16S rRNA sequence analysis methods: OTU clustering, DADA2, and Deblur.
Frontiers in Microbiology
16S rRNA是微生物的通用基因,通常被用作通过下一代测序(NGS)技术获取微生物群落数据的靶基因。传统上,利用16S rRNA根据97%的阈值将序列聚类成操作分类单元(OTUs),并绕过了减少测序错误的方法,这可能导致错误的分类单元。已经发表了几种去噪声算法来解决这个问题,例如DADA2和Deblur,它们可以通过生成引物序列变体(ASVs)在单核苷酸分辨率上纠正测序错误。随着高分辨率ASVs比OTUs越来越受欢迎,并且通常在特定研究中只选择一种分析方法,在OTU聚类和去噪声流程之间需要进行全面比较。本研究通过使用来自结直肠癌(CRC)筛查队列的358个临床粪便样本生成的16S rRNA扩增测序数据,全面比较了三种最广泛使用的16S rRNA方法(两种去噪声算法,DADA2和Deblur,以及从头开始的OTU聚类)。我们的研究结果表明,所有方法导致的分类学特征相似(在PERMNAOVA中P >0.05,在Mantel检验中P <0.001),尽管ASVs/OTUs的数量和α多样性指数差异很大。尽管识别的与疾病相关的标志物存在显著差异,但与疾病相关的分析表明,所有方法都可以得出类似的结论。Fusobacterium、Streptococcus、Peptostreptococcus、Parvimonas、Gemella和Haemophilus被三种方法都鉴定为CRC组富集,而Roseburia、Faecalibacterium、Butyricicoccus和Blautia则被三种方法鉴定为健康组富集。此外,使用基于这些不同方法的数据的机器学习算法生成的疾病诊断模型都具有良好的诊断效率(AUC:0.87-0.89),其中基于DADA2的模型产生了最高的AUC(在训练集和测试集中分别为0.8944和0.8907)。然而,模型之间的性能没有明显差异(P >0.05)。总之,本研究证明DADA2、Deblur和从头开始的OTU聚类在分类单元分配中具有类似的能力,并且在CRC队列情况下可以得出类似的结论。版权所有©2023 刘,李,朱,张,王。
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Frontiers in Microbiology
2023
YouyouLi,MeifangXiao...
Identification of two novel papillomaviruses in belugas.
Frontiers in Microbiology
人乳头瘤病毒(PVs)可导致人类、哺乳动物和非哺乳动物的皮肤和粘膜组织增生,并是宫颈癌和生殖系统癌症的重要危险因素。利用新一代测序(NGS),我们在青岛和大连极地海洋公园采集的白鲸(Delphinapterus leucas)拭子中鉴定了两株新的乳头瘤病毒菌株,分别命名为PV-HMU-1和PV-HMU-2。我们扩增了这两株病毒的完整基因组,并对十只白鲸和一只虚伪虎头鲸(Pseudorca crassidens)的晚期基因(L1)进行了筛查,以确定感染率。在青岛,两只样本中的50%白鲸感染了PV-HMU-1,虚伪虎头鲸呈阴性。在大连,八只样本中的71%白鲸感染了PV-HMU-2。在其L1基因中,PV-HMU-1和PV-HMU-2与乳头瘤病毒科其他成员的氨基酸序列相似性分别为64.99%和68.12%。通过组合氨基酸序列的系统发生分析显示,PV-HMU-1和PV-HMU-2与其他已知海豚乳头瘤病毒聚类在一起,但形成独立的分支。白鲸携带的乳头瘤病毒被认定为Firstpapillomavirinae下的新物种。这两株新的乳头瘤病毒的发现丰富了我们对乳头瘤病毒的遗传多样性及其对白鲸群体的影响的认识。 © 2023 Li, Xiao, Zhang, Li, Bai, Su, Peng, Wang, Hu, Song, Li, Tang, Lu, Yin, Zhang and Du.
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Frontiers in Microbiology
2023
Huan-HuanChen,Qi-Jun...
Gut microbiome and serum short-chain fatty acids are associated with responses to chemo- or targeted therapies in Chinese patients with lung cancer.
Frontiers in Microbiology
肺癌(LC)接受治疗的患者肠道微生物和短链脂肪酸(SCFA)之间的关联以及治疗反应尚不清楚。我们前瞻性收集了LC患者的粪便和血清样本,根据是否表现持久临床效益分为反应者和非反应者。通过使用16S核糖体DNA测序分析了肠道微生物的组成。使用气相色谱法检测了血清中SCFA的浓度。我们对异丁酸处理的A549细胞进行了细胞增殖、迁移、侵袭、细胞周期和凋亡实验。通过反转录定量PCR、蛋白质免疫印迹、免疫细胞化学和免疫荧光染色实验,研究了相关基因或蛋白质的表达。非反应者的肠道菌群α多样性较高,但β多样性较低,与反应者相比。与低α多样性的患者相比,高α多样性的患者的无进展生存期显着缩短。此外,这两组之间还观察到了β多样性。具体来说,反应者中寄生沙特雷拉菌、梭菌科和普雷沃特拉_7的丰度更高,而非反应者中的肠杆菌属和Christensenellaceae_R-7组的丰度更高。血清SCFA(尤其是乙酸和异丁酸)水平在反应者中趋高。异丁酸通过诱导细胞凋亡和G1/S细胞周期阻滞抑制了A549细胞的增殖、迁移和侵袭,同时上调了GPR41、GPR43和GPR5C的表达,下调了PAR1的表达,并增强了组蛋白乙酰转移酶的活性。我们揭示了肠道菌群和SCFA对LC患者治疗反应的影响,以及异丁酸的抗肿瘤作用,表明它们有潜在的作为治疗靶点的用途。版权所有 © 2023 Chen,Wu,Zhang和Zhao。
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ARCHIVES OF DISEASE IN CHILDHOOD
2023 Aug 08
JoseAntonioAlonso-Ca...
Role of urine culture in paediatric patients with cancer with fever and neutropenia: a prospective observational study.
ARCHIVES OF DISEASE IN CHILDHOOD
为了评估癌症患儿伴发嗜中性粒细胞减少热症的例行尿液检查的必要性,我们进行了一项前瞻性观察研究。该研究在2019年11月至2021年10月期间在两家医院进行,共招募了205名患者。主要观察指标为尿培养(UC)的阳性结果。尿路感染(UTI)定义为具有尿液征象/症状和阳性尿培养的情况,可以有或没有脓尿。我们提供了数据的描述性分析。我们对具备排尿能力的儿科癌症患者进行了前瞻性研究。数据采用描述性统计学进行分析。我们以阳性尿培养为“金标准”,计算了尿液分析的诊断性能。在205名患者中,有7例患者出现了阳性尿培养(3.4%;95% CI 1.4%至6.9%),其中2例出现了尿路症状。UTI的患病率为1.0%(95% CI 0.1%至3.5%)。与没有症状或病史的患者相比(95% CI 0.1%至3.9%),伴有尿路症状和/或尿路疾病病史的患者中阳性尿培养的患病率为23.8%(95% CI 8.2%至47.2%)(p<0.001)。尿液分析的敏感性、特异性、阴性预测值和曲线下面积分别为16.7%(95% CI 3.0%至56.4%)、98.4%(95% CI 95.3%至99.4%)、97.3%(95% CI 93.9%至98.9%)和0.65(95% CI 0.51至0.79)。在这些患者中,UTI并不常见。只有在伴有尿路征象/症状的儿童和无症状但有尿路疾病病史或无法确定病史的患者才需要进行尿液分析。在收集尿液时,无论尿液分析的结果如何,都应该要求进行尿培养。© 作者(或其雇主)2023。不得进行商业再利用。有关版权和权限,请查看BMJ出版的相关内容。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2023 Aug 10
YuqingRen,RuizhiWang...
Multifaceted role of redox pattern in the tumor immune microenvironment regarding autophagy and apoptosis.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
可逆的氧化-还原稳态机制作为一种特异的信号转导系统发挥作用,引发相关的生理反应。氧化还原稳态的紊乱可能会产生负面后果,包括潜在的癌症发展和进展,这与一系列氧化还原过程密切相关,如调节活性氧化物(ROS)水平和种类,改变抗氧化能力,以及ROS对下游细胞命运和免疫力的差异性影响。肿瘤微环境(TME)在免疫力和调控性细胞死亡之间展示复杂的相互作用,尤其是自噬和凋亡,这在很大程度上受ROS的调控。本研究旨在探讨多源ROS如何影响TME中的凋亡、自噬和抗肿瘤免疫应答的机制,以及这三个过程之间的相互交流。鉴于ROS在控制细胞命运和免疫力方面的复杂作用,我们还将进一步研究传统癌症治疗与ROS之间的关系。值得注意的是,我们将讨论一些与ROS相关的潜在治疗选择以供将来的研究进一步探讨。© 2023年。BioMed Central有限公司,Springer Nature的一部分。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2023 Aug 11
NanigopalBera,Souvik...
Ultrafast Dynamics of the Medicinal Pigment Curcumin inside the Imidazolium Surface Active Ionic Liquid Containing Giant Vesicles and White Light Generation via Triple-FRET Technique.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
天然存在的黄色多酚类药用色素姜黄素在激发态下表现出超快动力学。这些超快动力学受系统环境的刚性影响很大。本研究揭示了姜黄素在咪唑表面活性离子液体(SAIL)1-十六烷基-3-甲基咪唑盐酸盐([C16mim]Cl)胶束内、巨大囊泡内引入山梨醇单酯(Span 20和Span 80)后的超快激发态分子内氢原子转移(ESIHT)(与抗氧化机制有关)和溶剂化动力学。有趣的是,含有Span 20的短碳链形成较小、不那么刚性的囊泡,而含有Span 80的长碳链在与[C16mim]Cl组装后形成较大、更刚性的巨大囊泡。ESIHT和溶剂化动力学在刚性囊泡中的Span 80中较慢,而在较不刚性的Span 20中较快。最后,我们建立了一个三组分荧光共振能量传递(Triple-FRET)系统,在胶束和巨大囊泡中产生白光(WL)。在特定浓度的这些染料与特定自组装体系中的组合下,由于三组分FRET现象,WL产生。其中,疏水性染料1,6-二苯基-1,3,5-己三烯(DPH)作为给体,亲水性抗癌药物盐酸多柔比星(DOX)作为受体,并伴随中间给体姜黄素。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2023
XiaonanLi,DonghuiCao...
Anticancer therapeutic effect of ginsenosides through mediating reactive oxygen species.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
癌细胞中反应性氧化物(ROS)产生和ROS调节通路的失控导致反应性氧化物的异常积累,对癌症进展具有双刃作用,既支持转化/增殖和促进肿瘤发生,又引起细胞死亡。癌细胞可以通过调节反应性氧化物的水平来容忍其存在,使其能够激活促癌信号通路,而不通过调节抗氧化防御系统诱导细胞死亡。因此,靶向反应性氧化物是癌症治疗的有希望方法。人参皂苷及其衍生物和相关的药物载体,通过调节氧化应激介导的细胞和分子靶点,调节多条信号通路,诱导凋亡;调节细胞周期阻滞和自噬、侵袭和转移;增强不同癌症类型的耐药细胞对化疗药物的敏感性,取决于反应性氧化物的类型、水平和来源,以及癌症的类型和阶段。我们的综述聚焦于反应性氧化物的促癌和抗癌效应,并总结了靶向反应性氧化物带来抗癌效应的各种人参皂苷的机制和最新进展,为进一步设计抗癌研究或进行更多临床前和临床研究提供了新思路。 © 2023 Li, Cao, Sun and Wang.
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2023
YaserJafari-Khataylo...
Effects of adenosine N1-Oxide and pioglitazone on inflammatory and antioxidant state in sepsis caused by experimental cecal puncture in rat.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
脓毒血症是一种由全身性炎症反应综合征引起的急性疾病,其源于感染。治疗脓毒血症严重症状的药物很少。因此,考虑不同的治疗选择非常重要。在本次研究中,我们研究了腹腔结扎和穿孔术(Cecal Ligation and Perforation,CLP)后给予腺苷N1-氧化物(Adenosine N1-oxide,ANO)和吡格列酮(Pioglitazone)对大鼠的影响。我们将它们随机分为四组(n = 10):A组为对照组,接受生理盐水;B组为CLP手术对照组;C组接受ANO;D组接受Pioglitazone。我们测量了血清中白细胞介素(Interleukin,IL)-6、IL-1β、肿瘤坏死因子-α(Tumor Necrosis Factor Alpha,TNF-α)、一氧化氮(Nitric Oxide,NO),并测量了肝脏和脾脏匀浆液中超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)、过氧化氢酶(Catalase,CAT)、丙二醛(Malondialdehyde,MDA)和髓过氧化物酶(Myeloperoxidase,MPO)的含量。我们还调查了脾脏和肝脏中抗氧化酶的含量,最后检测了细胞存活率和大鼠的存活情况。我们还测量了血清中一氧化氮的含量和所有组的大鼠的存活情况。结果表明,这两种药物能够降低大鼠血清中的IL-1β、IL-6、TNF-α和NO,降低肝脏和脾脏匀浆液中的MDA和MPO,然而在接受ANO和吡格列酮的大鼠中,肝脏和脾脏匀浆液中的SOD和CAT显著增加,与CLP组的大鼠相比。接受ANO和吡格列酮的大鼠的细胞存活率和存活情况也显著改善。腺苷N1-氧化物显示出更强和更有效的效果。© 2023 Urmia University. 版权所有。
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ANTIVIRAL RESEARCH
2023 Aug 05
ChloéBorde,Alexandre...
Shikonin, an inhibitor of inflammasomes, inhibits Epstein-Barr virus reactivation.
ANTIVIRAL RESEARCH
爱普斯坦-巴尔病毒(EBV)是一种高度普遍的人类疱疹病毒,在成年人群体中95%以上的人终生携带。EBV通常建立一个无症状的终身感染,但也与主要影响B淋巴细胞和上皮细胞的恶性肿瘤有关。该病毒在潜伏期和溶解期之间交替发生,两者都有助于肿瘤进程的启动。目前,只有少量针对溶解期的抗病毒分子,其中大多数针对病毒复制。最近的研究提供了证据,表明EBV利用NLRP3炎症小体的组分进入其周期的生产期,以对各种刺激的激活做出反应。在本研究中,我们证明了舒克宁(shikonin),一种低毒性的天然分子,已知可抑制炎症小体,可以有效抑制EBV的重激活。与红花素(apigenin)和OLT 1177两种其他NLRP3炎症小体抑制剂获得了类似的结果。本文表明,舒克宁抑制了重激活引起的NLRP3的转录,从而抑制了炎症小体的激活和EBV的溶解期诱导。版权所有©2023。由Elsevier B.V.出版。
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