研究动态
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Brain Structure & Function
2023 Aug 07
SeWonLee,BryanWerner...
Characteristics, outcomes, and its associated factors among patients hospitalized with mild traumatic brain injuries.
Brain Structure & Function
调查轻度创伤性脑损伤(mTBI)患者的特征和住院结果。使用疾病分类国际编码(ICD)和文件记录的格拉斯哥昏迷评分(GCS)为13至15之间的1,940名mTBI患者,从2017年至2019年在7家社区医院中进行了识别。采用逐步Logistic回归分析,以确定与住院死亡和回家出院相关的人口统计学和临床特征。中位年龄为69岁,66.6%与入院时的跌倒相关。颅内血肿是最常见的脑损伤灶,而且在跌倒组中更为常见。年龄增长、男性性别、硬脑膜外出血、偏瘫、截瘫、肾脏疾病、癌症、院内感染、贫血和直接血管扩张剂的使用与住院死亡的增加几率相关。年龄增长、获得医疗保险的医疗保障、脑水肿、初始GCS较低、住院时间、急性心肌梗死的合并症、维生素B1和阿片类药物的使用与出院至家庭的可能性降低相关。认识住院mTBI患者的特征以及其与住院死亡和非回家出院的增加之间的关联,对改善这一脆弱人群的护理非常有用。版权所有 © 2023 Wolters Kluwer Health, Inc. 保留所有权利。
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2023 Aug 07
Xi-QianWang,Nian-Nia...
Single-cell RNA sequencing reveals tumor heterogeneity within salivary gland pleomorphic adenoma: A preliminary study.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
唾液腺多形性腺瘤是一种常见的唾液腺肿瘤,其组织学多样性显著。先前的研究已经证实基因重排和与细胞骨架重塑相关的肌上皮细胞在唾液腺多形性腺瘤的肿瘤发生中的参与。细胞骨架重塑对上皮间质转化(EMT)是肿瘤进展的关键过程所必需的。然而,关于肿瘤细胞和唾液腺多形性腺瘤中细胞骨架重塑的异质性尚未深入研究。 我们对来自两个唾液腺多形性腺瘤供体的27,810个细胞进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析。利用生物信息学工具评估了差异表达基因,细胞轨迹和细胞间通讯。免疫组织化学和双免疫荧光染色用于证明唾液腺多形性腺瘤组织中FOXC1和MYLK的表达。 我们的分析揭示了唾液腺多形性腺瘤肿瘤细胞中的五个不同亚型,表明病灶内部的异质性水平较高。与间质细胞密切相互作用的肿瘤细胞亚型3中高度富集了与细胞骨架重塑相关的基因。我们发现,肿瘤性FOXC1的表达与唾液腺多形性腺瘤的肿瘤细胞中MYLK的表达密切相关。 富含与细胞骨架重塑相关基因的肿瘤细胞在唾液腺多形性腺瘤的发展中发挥着关键作用,而FOXC1可能部分调控了这一过程。 © 2023 John Wiley & Sons A/S. 由John Wiley & Sons Ltd.发表。
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BIOINFORMATICS
2023 Aug 07
JaceWebster,HaXDang,...
PACT: A pipeline for analysis of circulating tumor DNA.
BIOINFORMATICS
目前,检测循环肿瘤DNA(ctDNA)中的基因组改变已广泛应用于癌症进展和治疗反应的临床监测。虽然针对小突变的分析方法已相对成熟,但检测ctDNA中的结构变异(SVs)的策略仍相对有限。此外,由于缺乏统一的工具来调用这些不同类别变异的能力,可靠地识别小规模突变、拷贝数改变和SVs在ctDNA中的存在仍具有挑战性。我们开发了一种统一的ctDNA分析流水线(PACT),能够准确检测SVs,并在模拟、细胞系和临床数据中表现出色, consistently,超过了类似工具的性能。我们提供了PACT的通用工作流程语言流水线版本,可以通过常见的工作流程管理系统在高性能计算环境中运行。PACT可以免费获得,网址为https://github.com/ChrisMaherLab/PACT.补充数据可在Bioinformatics在线获取。© 作者(们)2023. 版权归属于牛津大学出版社。
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ANNALS OF INTERNAL MEDICINE
2023 Aug 08
IlanaBRichman,Jessic...
Estimating Breast Cancer Overdiagnosis After Screening Mammography Among Older Women in the United States.
ANNALS OF INTERNAL MEDICINE
过度诊断被越来越多地认识到是乳腺癌筛查的一种危害,尤其是对于年长妇女而言。本研究旨在通过年龄评估乳腺癌筛查对年长妇女的过度诊断情况。采用回顾性队列研究方法,将继续在下一个间隔期内接受筛查的年长妇女与不接受筛查的妇女进行乳腺癌累积发病率比较。分析采用竞争风险模型,以年龄分层。数据来源于按次收费的医疗保险索赔资料与SEER(监测、流行病学和终点)计划进行关联。对象为最近接受筛查的70岁及以上的妇女。对乳腺癌的诊断结果及随访期内的乳腺癌死亡结果进行研究,随访期为15年。研究共包括54635名妇女。70至74岁的妇女中,筛查妇女的乳腺癌调整后累积发病率为每100名筛查妇女6.1例(95% CI 5.7至6.4),与未接受筛查妇女的每100名发病率4.2例(CI 3.5至5.0)相比。据估计,接受筛查的妇女中约有31%的乳腺癌可能是过度诊断的。对于75至84岁的妇女,筛查妇女的累积发病率为每100名筛查妇女4.9例(CI 4.6至5.2),与未接受筛查妇女的每100名发病率2.6例(CI 2.2至3.0)相比,其中约有47%的病例可能是过度诊断的。对于85岁及以上的妇女,筛查妇女的累积发病率为每100名筛查妇女2.8例(CI 2.3至3.4),未接受筛查的妇女为每100名发病率1.3例(CI 0.9至1.9),过度诊断率高达54%。我们未观察到与筛查相关的乳腺癌特异性死亡显著减少。本研究仅旨在评估过度诊断的情况,限制了我们对筛查的所有益处与危害作出结论的能力。筛查妇女之间在乳腺癌风险和竞争性死亡方面的未测量差异可能会对结果造成混淆。结果对模型规范和筛查乳腺X线检查定义敏感。继续进行乳腺癌筛查与乳腺癌发病率增加相关,这表明年长妇女在筛查后被诊断为乳腺癌的过度诊断可能很常见。过度诊断的危害是否可以与益处相抵消,以及对谁而言更为重要,是一个重要的问题。 国家癌症研究所。
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Physical and Engineering Sciences in Medicine
2023 Aug 07
YunhaoCui,HidetakaAr...
Deep learning model fusion improves lung tumor segmentation accuracy across variable training-to-test dataset ratios.
Physical and Engineering Sciences in Medicine
本研究旨在调查深度学习(DL)融合模型在低训练-测试比(TTR)数据集中对肺癌立体定向放射治疗(SBRT)计划三维计算机断层扫描(CT)影像中粗大肿瘤体积(GTVs)的鲁棒性。共纳入192例进行SBRT的肺癌患者(实体肿瘤118例,部分实体肿瘤53例,玻璃影21例)。根据计划CT影像中GTV中心的位置,裁剪出GTV的感兴趣区域。使用3D U-Net、V-Net和Dense V-Net训练三个DL模型来分割GTV区域。采用逻辑与、逻辑或和两个或三个DL模型输出的投票构建了九个融合模型。TTR定义为训练数据集中的病例数与测试数据集中的病例数之比。评估了12个模型的Dice相似系数(DSC)和Hausdorff距离(HD),TTR分别为1.00(训练数据:验证数据:测试数据=40:20:40)、0.791(35:20:45)、0.531(31:10:59)、0.291(20:10:70)和0.116(10:5:85)。投票融合模型在所有TTR中的DSC最高,为0.829至0.798;而其他模型在TTR为1.00时的DSC为0.818至0.804,在TTR为0.116时的DSC为0.788至0.742,HD为5.40 ± 3.00至6.07 ± 3.26毫米,优于任何单个DL模型。研究结果表明,提出的投票融合模型是一种对低TTR数据集分割肺癌SBRT计划CT影像中GTV的鲁棒方法。© 2023。澳大利亚物理科学与医学工程学院。
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Environmental Technology & Innovation
2023 Aug 07
Szu-ChunYang,Wu-WeiL...
Losses of lifetime employment duration and productivity for patients with different subtypes and stages of lung cancer.
Environmental Technology & Innovation
尚未调查不同亚型和肺癌分期对致残率和病死率的生产力影响。本研究对不同亚型和肺癌分期的患者的终身就业期限和生产力损失进行了量化。我们识别了在2011年至2019年间,年龄在50-64岁之间被诊断为全国肺癌患者。根据月度就业人口比例和工资来加权月度生存概率,以估计终身就业期限和生产力。我们将患者的终身就业期限和生产力与年龄、性别、日历年匹配的一般人口进行比较,计算终身就业期限和生产力的损失,然后根据台湾非吸烟者肺癌筛查试验(TALENT)首轮筛查的病理学和分期转变对终身就业期限和生产力的节约进行计算。肺癌患者的生存时间和就业期限较短,与参考组相比。非腺癌肺癌患者的终身就业期限和生产力损失较腺癌患者更大。将非吸烟患者的估算应用于基于TALENT的病理学和分期转变的100名肺癌患者,终身就业期限和生产力的节约分别为132.2(95%预测区间:116.2-147.4)年和3353(95%预测区间:2914-3802)千美元。早期诊断肺癌将节约就业期限和终身生产力的损失。未来肺癌筛查的成本效益评估可以考虑纳入这些社会影响。 © 2023. 作者。
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Immunity & Ageing
2023 Aug 07
KarmeleValencia,Luis...
Estrogen receptor and immune checkpoint inhibitors: new partners in lung cancer?
Immunity & Ageing
关于非小细胞肺癌(NSCLC)患者免疫治疗反应受性别影响的研究尚未得出明确结论。本期文章报道了一个关键结果,表明影响治疗反应的因素并非性别,而是NSCLC中17-β-雌二醇/ERα/PDL1信号传导环路的存在。这一有趣的发现为开展新的治疗选项打开了大门。
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Immunity & Ageing
2023 Aug 07
ChenjieQiu,HuiliWu,W...
Characterization of stem cell subtypes and prognostic signature in hepatocellular carcinoma.
Immunity & Ageing
肿瘤干细胞(CSCs)与肝细胞癌(HCC)患者的肿瘤侵袭性和预后不良有关。我们整合两个外部HCC队列,根据未监督聚类和26个干细胞基因集开发了干细胞亚型。在亚型间,我们研究了预后、临床特征、已认知的HCC亚型、代谢特征、免疫相关特征、体细胞突变和药物敏感性的差异。我们创建了预后特征,并用多个队列进行验证,并将其用于评估免疫治疗和经导管动脉化疗栓塞(TACE)治疗的疗效。我们基于特征和临床特征开发了预后表。我们进一步研究了KIF20A在HCC中的功能,并通过蛋白质免疫印迹证实了KIF20A具有调控HCC细胞干性的潜力。低干细胞模式、良好预后、阳性临床特征、特定分子亚型、低转移特征和丰富的代谢和免疫方面与簇1相关,而簇2则相反。化疗和免疫治疗在簇1中更有效。簇1与CTNNB1和ALB突变更为密切相关。另外,高风险组的预后、免疫治疗和TACE治疗反应均较差。预后表可以预测HCC患者的生存概率。我们发现KIF20A在HCC中过表达,并与HepG2细胞系的干性相关联。我们确定了HCC患者中两个具有不同预后、代谢和免疫特征的干细胞亚群。我们还创建了基于7个基因的预后特征和预后表来估计生存概率。我们首次检查了KIF20A在HCC干性中的功能。© 2023. 本文作者(根据Springer Nature的独家许可)属于Springer-Verlag GmbH Germany的一部分。
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Immunity & Ageing
2023 Aug 07
YanruChen,JingjiaLi,...
DNAJB4 suppresses breast cancer progression and promotes tumor immunity by regulating the Hippo signaling pathway.
Immunity & Ageing
乳腺癌是全球最常见的癌症。DNAJB4表达水平降低与乳腺癌患者预后不良密切相关。然而,DNAJB4调节乳腺癌进展的分子机制尚不清楚。本研究验证了DNAJB4在人类乳腺癌组织、正常人类乳腺组织和乳腺癌细胞系中的表达情况。利用CCK-8、形成菌落和伤口愈合实验评估了DNAJB4过表达对MCF-7细胞系增殖和迁移的生物学影响。采用生物信息学分析鉴定了DNAJB4在乳腺癌中的相关通路。通过Western印迹法定量检测上皮-间质转化(EMT)相关生物标志物和Hippo通路组分。利用荧光素酶和Western印迹实验证明哪种miRNA调节DNAJB4。此外,使用异种移植模型评估了DNAJB4对体内肿瘤生长的影响。结果显示,DNAJB4在人类乳腺癌组织和乳腺癌细胞系中表达水平较低并与预后不良相关。DNAJB4过表达通过激活Hippo通路显著抑制了体外细胞增殖和迁移。双荧光素酶实验显示hsa-miR-183-5p靶向DNAJB4。此外,miR-183-5p能够逆转DNAJB4的效果。另外,DNAJB4表达与免疫浸润水平强烈相关。值得注意的是,DNAJB4过表达通过Hippo通路显著增强了4T1瘤中CD4+和CD8+ T细胞的水平,并降低PD-L1水平,减缓了4T1细胞皮下异种移植瘤小鼠模型中的肿瘤生长。本研究证明了DNAJB4过表达通过调控Hippo通路和肿瘤免疫抑制环境抑制了乳腺癌的恶性生物学行为。© 2023. Springer Science+Business Media, LLC.
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Immunity & Ageing
2023 Aug 07
JosefRüschoff,Hans-U...
[Testing deficient mismatch repair and microsatellite instability : A focused update. German version].
Immunity & Ageing
检测错配修复缺陷(dMMR)和高级别微卫星不稳定(MSI-H)已成为结直肠癌(CRC)常规诊断工作的重要组成部分。虽然MSI最初被认为是癌症遗传易感性(Lynch综合征,LS)的可能指标,但如今重点在于预测对免疫检查点抑制剂(ICI)的治疗反应。在初诊中可以使用对应的建议和测试算法(参见:Rüschoff等人,2021)。考虑到ICI治疗在非CRC中,如子宫内膜癌、小肠癌、胃癌和胆道癌等方面所扮演的角色不断扩大,本文对dMMR/MSI测试进行了更新的评述。重点在于评估免疫组化染色的挑战和PCR-based程序的价值,考虑到扩大的ICI适应症范围。提供了面向日常诊断决策的实践导向流程图,考虑了MMR-IHC和MSI-PCR结果间不一致的频率和类型的新数据,以及下一代测序在澄清这些不一致性中的可能作用。强调了系统质量保证措施的重要性(例如QuIP MSI门户网站和多中心熟练性测试),包括定期继续培训和教育。© 2023. 作者。
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