研究动态
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Frontiers in Immunology
2023
LingYang,XueyuanYu,M...
A comprehensive analysis of biomarkers associated with synovitis and chondrocyte apoptosis in osteoarthritis.
Frontiers in Immunology
骨关节炎(OA)是一种慢性疾病,其发病率和致残率较高,其分子机制尚不清楚。本研究旨在通过生物信息学分析,确定与滑膜炎和软骨细胞凋亡相关的OA标记物。我们从Gene Expression Omnibus数据库中选择了五个基因表达谱。我们将GEO与GeneCards数据库结合起来,并进行了基因本体论和Kyoto基因和基因组百科全书的分析。然后,我们使用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)算法来确定特征基因,并建立了预测风险评分。我们使用统一流形近似和投影(UMAP)方法来识别OA患者的亚型,而CytoHubba算法和GOSemSim R包用于筛选出核心基因。接下来,使用单样本基因集富集分析和CIBERSORTx进行免疫评估。选取了56个与OA相关的差异型基因,并通过LASSO算法确定了10个特征基因。通过UMAP将OA样本分为簇1和簇2的亚型,聚类结果表明这些簇之间的特征基因有显著差异。MYOC、CYP4B1、P2RY14、ADIPOQ、PLIN1、MFAP5和LYVE1在簇2中高表达,ANKHLRC15、CEMIP、GPR88、CSN1S1、TAC1和SPP1则在簇1中高表达。蛋白质相互作用网络分析显示MMP9、COL1A和IGF1为高节点,而差异基因影响了IL-17途径和肿瘤坏死因子途径。GOSemSim R包显示ADIPOQ、COL1A和SPP1与31个核心基因的功能密切相关。此外,还确定了mmp9和Fos与多个转录因子存在相互作用关系,ssGSEA和CIBERSORTx算法揭示了两个OA亚型之间免疫浸润的显著差异。最后,进行了一项qPCR实验,探索大鼠软骨和滑膜组织中的重要基因;qPCR结果显示COL1A和IL-17A在OA大鼠的滑膜组织和软骨组织中均高表达,与预测结果一致。未来,可能会找到用于同时缓解OA两种表型的常见治疗靶点。 版权所有 © 2023 阳、余、刘和曹。
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Frontiers in Immunology
2023
MarcelWacker,JensBau...
Immunoprecipitation methods impact the peptide repertoire in immunopeptidomics.
Frontiers in Immunology
基于质谱的免疫肽组学是唯一无偏见的方法,能够鉴定自然显示的HLA配体,这是表征新型肿瘤抗原以进行免疫治疗的必要前提。近年来,基于设备和方法的改进已经增加了免疫肽组学的灵敏度和通量。然而,配体分离、质谱分析和后续数据处理方面的发展可能会对免疫肽组学数据的质量和数量产生显著影响。本研究中,我们使用细胞系以及原发性实体肿瘤和血液肿瘤样本,比较了两种已建立的免疫沉淀方法(基于柱和基于96孔板)在肽产量、光谱质量、疏水性、滞留时间和免疫原性方面的组成。尽管我们发现了相当的肽产量,但柱法和专有方法之间存在较大比例的独占肽,其疏水性显著较高,这可能对免疫原性肿瘤抗原的鉴定产生潜在影响。我们表明,柱制备在亲水洗涤步骤中不会损失亲水性肽。相反,在96孔板制备过程中,额外的50%乙腈洗脱可部分恢复失去的疏水性肽,这表明减少了对柱法的偏倚,但并未完全均衡。总之,本研究展示了不同的免疫沉淀方法及其改进如何影响免疫肽组分析的肽库,从而影响潜在肿瘤相关抗原的鉴定。版权所有 © 2023 Wacker, Bauer, Wessling, Dubbelaar, Nelde, Rammensee和Walz。
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Molecular Therapy-Nucleic Acids
2023 Sep 12
ShashiBala,YuanZhuan...
Therapeutic inhibition of miR-155 attenuates liver fibrosis via STAT3 signaling.
Molecular Therapy-Nucleic Acids
大多数慢性肝病会进展为肝纤维化,若不加治疗会导致肝硬化和肝细胞癌。微小RNA(miRNA)靶向治疗已成为治疗疾病的吸引人的方法之一。本研究中,我们调查了miR-155抑制在胆总管结扎(BDL)小鼠肝纤维化模型中的治疗效果,并评估了miR-155在慢性肝纤维化中的作用,使用miR-155缺失(miR-155敲除)小鼠。我们发现在肝硬化患者和BDL-和CCl4诱导的小鼠肝纤维化模型中,肝脏miR-155表达增加。miR-155敲除小鼠CCl4施用或BDL后肝纤维化显著减少。为了评估miR-155抑制的治疗潜力,我们在体内接种了rAAV8-anti-miR-155 tough decoy,明显减轻了BDL中肝损伤和纤维化。与对照小鼠相比,anti-miR-155治疗小鼠的BDL诱导的转化生长因子β(TGF-β)、p-SMAD2 / 3和p-STAT3蛋白水平减弱。miR-155缺失小鼠的肝星状细胞表现为活化和基质标记物表达的减弱。体外实验中,miR-155过度表达和沉默功能的研究表明,miR-155部分通过STAT3信号途径调节星状细胞的活化。我们的研究表明miR-155是肝纤维化的关键调节因子,可能成为减轻纤维化进展的潜在治疗靶点。© 2023 The Authors.
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Molecular Therapy-Nucleic Acids
2023 Sep 12
XianyanlingYi,JinLi,...
Construction of PANoptosis signature: Novel target discovery for prostate cancer immunotherapy.
Molecular Therapy-Nucleic Acids
我们从MSigDB数据库中识别了涵盖火焰死亡、凋亡和坏死的PANoptosis通路基因集。我们分析了前列腺腺癌(PRAD)中PANoptosis通路的扰动和相互作用,包括基因突变、转录、甲基化和临床特征。通过构建一个PANoptosis标志,我们准确预测了PRAD患者的预后和免疫治疗反应。我们进一步探索了标志的分子特征和免疫学作用,将患者分为高和低评分组。值得注意的是,高评分组与更好的生存结果和免疫治疗反应,以及PANoptosis和HALLMARK通路中更高的突变频率和富集分数相关。PANoptosis标志还增强了整体抗肿瘤免疫力,促进了免疫细胞浸润,上调了免疫检查点调节因子,并揭示了PRAD的冷瘤特征。我们还根据PANoptosis标志确定了潜在的药物靶点。这些发现为PRAD患者的新预后标志和治疗靶点的确定铺平了道路。© 2023作者。
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Molecular Therapy-Nucleic Acids
2023 Sep 12
TaeWonKim,HaeinJi,Na...
Two antisense RNAs-AFAP1-AS1 and MLK7-AS1-promote colorectal cancer progression by sponging miR-149-5p and miR-485-5p.
Molecular Therapy-Nucleic Acids
结直肠癌(CRC)是癌症相关死亡的主要原因之一。反义RNA(asRNA)与癌症的恶性变化密切相关。本研究旨在揭示asRNA在控制CRC恶性变化中的作用机制。对RNA测序数据的分析表明,AFAP1-AS1和MLK7-AS1在CRC患者和细胞系中上调表达。高水平的这两种asRNA与CRC患者的预后不良有关。体外和体内实验表明,抑制这两种asRNA可以降低CRC细胞的增殖和转移能力。机制学上,AFAP1-AS1和MLK7-AS1通过作为ceRNA降低了miR-149-5p和miR-485-5p的水平。通过引入miRNA模拟子,miRNA的过表达直接与SHMT2和IGFBP5的mRNA的3' UTR结合,抑制它们的表达。抑制这两种asRNA可以降低SHMT2和IGFBP5的表达,而miRNA抑制剂对这两种miRNA的抑制可以逆转该效应。通过使用载荷有小干扰RNA的纳米粒子对asRNA进行体内药理靶向,结果显示抑制asRNA可以显著减少肿瘤的生长和转移。我们的研究结果表明,AFAP1-AS1和MLK7-AS1通过吸附抑制性miRNA miR-149-5p和miR-485-5p来促进CRC的发展,从而上调SHMT2和IGFBP5的表达。© 2023 作者
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Frontiers in Molecular Neuroscience
2023
KiranJMcloughlin,Afn...
Purification of retinal ganglion cells using low-pressure flow cytometry.
Frontiers in Molecular Neuroscience
大量纯化的视网膜神经节细胞(RGCs)作为体外研究的工具,在研究神经再生和治疗青光眼的治疗方法的发展方面具有重要价值。传统上,RGCs是从早期出生的大鼠和小鼠中分离得到的,最近也从人体体外培养的视网膜器官样体中,利用一种基于Thy-1表达的两步免疫粘附技术进行分离。然而,这种技术限制了可以分离RGCs的时间段,错过了最早出生的RGCs,这是轴突生长最活跃的阶段,同时,在视网膜退行性疾病模型中使用有限,因为受伤后Thy-1会下调。尽管荧光相关细胞分选(FACS)结合新的光遗传标记的RGCs可以克服这个限制,但传统FACS分选器的使用仅限于基因组学和蛋白质组学研究,因为RGCs在分选后几乎没有存活。在这里,我们描述了一种新的RGC分离方法,利用了联合免疫粘附-荧光相关细胞分选(IP-FACS)协议,在使用低压FACS分离这些细胞之前,通过免疫粘附法来减少巨噬细胞和光感受器。我们证明,通过IP-FACS分离得到的RGCs与相同年龄通过免疫粘附法分离得到的RGCs相比,其抗体染色和qRT-PCR测定的纯度、活存率、神经突起生长和钙释放反应到谷氨酸的电生理性能具有类似性。最后,我们证明了在Thy-1表达之前可从早期胚胎小鼠中分离得到RGCs的能力,使用Brn3b-eGFP的光遗传标记细胞。该方法提供了一种用于研究早期发育的RGCs、RGC亚型研究和RGC细胞移植研究的新方法。版权所有 © 2023 Mcloughlin,Aladdad,Payne,Boda,Nieto-Gomez和Kador。
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Arthritis & Rheumatology
2023 Jul
ElmerRDeCampsMartine...
Seronegative Rheumatoid Arthritis Secondary to Immune Checkpoint Inhibitor in a Renal Cell Carcinoma Patient Encountered in a Rural Community-Based Rheumatology Clinic: A Case Report.
Arthritis & Rheumatology
免疫检查点抑制剂(Immune checkpoint inhibitors,ICIs)是一类广泛使用的癌症免疫疗法。自2000年代引入以来,这些药物已经改善了癌症的治疗效果。尼伐替尔回诺(Nivolumab)是一种ICIs,可用于尚未接受过治疗的肾细胞癌。免疫相关不良事件(immune-related adverse events,irAEs)是与过度活化的免疫系统相关的免疫疗法不良事件的一种类型。我们报告了一例69岁的白种人男性,患有Ⅳ期肾细胞癌,他开始服用尼伐替尔回诺后的五个月内出现早晨关节僵硬至少三小时,关节肿胀、热感和红斑等症状,被肿瘤学家转诊至乡村社区风湿病门诊。患者被诊断为免疫相关的ICIs继发阴性风湿性关节炎,并需要较高剂量的强的松(每天最高40毫克)联合甲氨蝶呤以达到缓解效果。随着ICIs的广泛应用,乡村社区的风湿学免疫相关不良事件可能会增加。临床医生在照顾癌症患者时需要意识到ICIs的不良反应。版权所有 © 2023,De Camps Martinez等。
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Immunity & Ageing
2023 Aug 07
MengXu,HaidongZha,Ji...
"Ice & Fire" Supramolecular Cell-Conjugation Drug Delivery Platform for Deep Tumor Ablation and Boosted Anti-Tumor Immunity.
Immunity & Ageing
目前的临床治疗中,癌症复发和转移是两个主要的挑战。在此,我们合成了一种新型的基于双酮吡咯吡咯 (DCN) 的光热试剂,具有独特的 J-聚集诱导红移效应,在安全功率下(0.33 W/cm2 )实现了高效的肿瘤热消融。同时,近红外吸收的 DCN 和亲水性聚合物中共载入了亚硝基乙酰青霉胺 (SNAP),以实现热诱导的大量释放一氧化氮(NO),NO 可以形成氧化剂过氧亚硝酸根(ONOO-),活化基质金属蛋白酶(MMPs),从而降解紧密的肿瘤细胞外基质(ECM),改善消融深度和免疫细胞的浸润。通过一种简便的超分子组装方法,DCN/SNAP 纳米颗粒锚定在液氮冷冻的癌细胞(LNF)上,在仅经过一次治疗后实现了增强的抗肿瘤免疫反应,并有效抑制了远处肿瘤和肺转移。2D/3D 细胞实验和双侧肿瘤模型验证了这种超分子细胞结合平台的安全性和有效性,证实了热消融-气体渗透-抗原呈递治疗模式具有良好的抗癌前景。本文受版权保护,版权所有。
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Bone & Joint Journal
2023 Aug
KouFujisawa,ShimpeiM...
Vascularized Fibular Grafts for Failed Liquid Nitrogen-treated Autografts in the Humerus: Report of Two Cases.
Bone & Joint Journal
随着化疗和手术技术的进步,以及腿肢保肢和生物重建(包括自体骨移植)的方式,已成为治疗肢体原发性恶性骨肿瘤的首选方法。尽管涉及到对患有肿瘤的骨骼进行回收的自体移植有易于获得和解剖匹配等优点,但骨折是常见的主要并发症。然而据我们所知,迄今尚未报道过难治性自体移植失败的保肢方法。本报告描述了用游离血管化腓骨移植来挽救治疗失败的先前重建方法。我们描述了两例患有原发性恶性骨肿瘤的患者(其中一位是4岁的女孩,另一位是30岁的男子)。在这两种情况下,液氮处理过的自体移植物被用于重建肱骨。这些患者发生了无法保守或内固定治疗的自体移植物骨折。游离血管化腓骨移植物被作为双筒入状骨移植物(长度分别为7.2和8.2厘米)和单支外形骨移植物(长度为16厘米)植入。肱动脉、肱静脉和桡静脉被用作受体血管。在分别经过29个月和15个月的随访后,腓骨移植物与肱骨之间实现了骨愈合。总而言之,游离血管化腓骨移植物可用于挽救难治性自体移植物骨折。版权所有2023年作者。 由 Wolters Kluwer Health 公司代表美国整形外科医师协会发布。
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Bone & Joint Journal
2023
HiepHoangPhan,CongTh...
Secondary Mediastinal Bleeding Caused by Parathyroid Adenocarcinoma: A Case Report.
Bone & Joint Journal
甲状旁腺肿瘤的临床表现主要与高血钙(如肾结石、骨和肌肉疼痛)相关。然而,由于甲状旁腺瘤出血引起的颈部自发性出血是罕见的临床表现,其症状包括颈部疼痛性肿胀和瘀伤,伴随吞咽困难和呼吸困难。 我们报告了一例71岁女性患者的病例,患者出现急性颈部肿胀和大量出血,从颈部蔓延至腹部和两侧。患者的检查结果显示甲状旁腺激素水平升高和高血钙。颈部超声显示颈部两叶有甲状腺结节和右侧钻入性甲状腺肿。计算机断层扫描图像显示血肿从颈部右侧蔓延至纵隔。患者出现呼吸困难和血流动力学不稳定,需要进行紧急手术。术前的诊断是颈部出血,可能的原因是甲状腺结节破裂。然而,手术中确定出血源为位于上纵隔之下深处的右侧甲状旁腺肿瘤。患者的肿瘤组织病理学结果为甲状旁腺腺癌。根据我们的经验,当没有创伤史或手术史时,应将源自甲状旁腺肿瘤的出血列为急性颈部出血的原因。术后病理组织学分析对于检测甲状旁腺腺癌非常重要。©2023作者。
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