研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 07
MoyanZhang,YichengLi...
COL3A1-positive endothelial cells influence LUAD prognosis and regulate LUAD carcinogenesis by NCL-PI3K-AKT axis.
GENES & DEVELOPMENT
作为生物和医学领域的科学家,您精通英语和简体中文。将以下文章翻译成准确且符合学术论文语言模式的简体中文,保持原句结构: 肺腺癌(LUAD)作为最常见的肺癌类型,对公共卫生构成了重大威胁。肿瘤的异质性在癌症发生中起着关键作用,这可以通过下一代测序(NGS)来大致解读。我们获取并筛选了16个LUAD样本的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,并将内皮细胞(ECs)分为三个类群。我们通过伪时序分析来探索EC分化的起源。我们使用CellChat分析来检测EC与恶性细胞之间的潜在通信,使用基因调控网络分析来确定转录因子活性的变化。我们在大量转录组水平上探究了特定EC类群的预后及其对肿瘤微环境(TME)的影响。我们进行了5-乙炔基-2'-脱氧尿嘧啶(EdU)和Ki-67染色,以研究LUAD细胞系的增殖表型。利用针对PI3K-AKT蛋白质磷酸化的Western blotting确定NCL的下游通路。COL3A1阳性的ECs表现出与恶性细胞最高的相互作用,表明它们对于驱动LUAD的癌变具有重要作用。我们确定了血管内皮生长因子(VEGF)信号通路作为主要信号通路,介导恶性细胞的信号转导。COL3A1阳性ECs的TME相关基因表达显著更高。COL3A1阳性ECs表现出独特的代谢和免疫特征,以及高度活化的代谢信号通路和炎症反应。重要的是,COL3A1阳性ECs分数低的LUAD患者显示出较差的预后结果和更高的转移风险。通过筛选,我们确定了介入上皮细胞和癌细胞间相互作用的关键靶基因NCL。流式细胞术显示NCL的减少促进了A549和NCI-H1299的凋亡。Western blotting显示NCL的减少降低了AKT和PI3K的磷酸化水平,从而确定了NCL的下游通路。COL3A1阳性ECs对LUAD的发展和免疫微环境的形成具有重要作用。此外,我们还确定了一个在内皮细胞和癌细胞间相互作用中发挥作用的关键靶基因NCL。NCL还通过PI3K-AKT信号通路影响LUAD的凋亡和增殖。© 2023 John Wiley & Sons Ltd.
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 07
ZemingMa,HaiboHan,Zh...
Machine learning-based establishment and validation of age-related patterns for predicting prognosis in non-small cell lung cancer within the context of the tumor microenvironment.
GENES & DEVELOPMENT
肺癌 (LC) 是全球癌症相关死亡的主要原因,非小细胞肺癌 (NSCLC) 占到80%以上。关于年龄对 NSCLC 临床结果的影响仍然不明确,尤其是免疫反应方面。在本研究中,我们使用人类衰老基因组资源中与人类衰老相关的 307 个基因,探讨了年龄对 NSCLC 的影响。我们鉴定出 53 个与 NSCLC 患者总生存显著相关的衰老相关基因,其中包括临床验证的基因 BUB1B。此外,我们开发了一个与年龄相关的富集分数,根据患者的衰老亚型对其进行分类,并评估它们在 LC 中的预后和治疗反应价值。我们的分析得到了两个与衰老相关的亚型,其在肿瘤微环境中具有独特的特征,表明对免疫治疗的不同反应。基于转录组文件的一致性聚类提供了关于衰老对 NSCLC 的影响的见解,并突出了个体化治疗方法在衰老亚型上的潜力。我们的发现为 NSCLC 患者个体化治疗方法提供了新的靶点和理论支持,揭示了年龄对癌症结果的潜在影响。© 2023 国际生物化学与分子生物学联合会。
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EXPERT OPINION ON THERAPEUTIC PATENTS
2023 Aug 06
ClaudiuTSupuran
Targeting carbonic anhydrases for the management of hypoxic metastatic tumors.
EXPERT OPINION ON THERAPEUTIC PATENTS
多种金属酶碳酸酐酶(CA, EC 4.2.1.1)的异构体与肿瘤发生密切相关。由于缺氧肿瘤而导致的HIF激活级联反应使CA IX和XII过度表达,参与PH调节、代谢和转移形成。其他异构体(CA I,II,III,IV)在一些肿瘤中也有报道。一些CA异构体是疾病进展或治疗反应的生物标志物。该文讨论了用于肿瘤/转移治疗的靶向这些酶的抑制剂、抗体和其他方法。磺胺类和香豆素类被视为最常研究的抑制剂类别,但也有人研究了含有羧酸盐、硒和碲的抑制剂。报道了CA抑制剂与其他抗肿瘤药物的混合药物用于多靶点治疗。用选择性、靶向抑制剂靶向实体或血液肿瘤中的CA是一种经过验证的方法,在过去几年已经得到了巩固。大量新的临床前数据和多个抗体和小分子抑制剂的临床试验正在进行中,与大量有效的新化合物/方法相结合,可能在这一治疗领域取得突破。通过从2018年到2023年在PubMed、ScienceDirect、Espacenet和PatentGuru搜索科学和专利文献。
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ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY
2023 Aug 04
GuanqingJiang,XuSong...
Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) in ambient air of Guangzhou city: Exposure levels, health effects and cytotoxicity.
ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY
大气中PM2.5中的多环芳香烃(PAHs)对人类健康构成潜在严重威胁。本研究从2016年到2019年,分析了广州市环境空气中16种优先管控的细微PM(PM2.5)结合PAHs的分布特征。四种具有最高年平均浓度的高分子量PAHs为苯并[ghi]芘(BghiP; 0.757 ng/m3)、吲哚并[1,2,3-cd]芘(IcdP; 0.627 ng/m3)、苯并[b]芴(BbF, 0.519 ng/m3)和3,4-苯并[α]芘(BaP; 0.426 ng/m3)。BghiP、IcdP、BbF和BaP浓度的增加与呼吸系统疾病门诊人次的增加相关,表明接触这些PAHs可能导致居民急性呼吸系统损伤。将人支气管上皮细胞系BEAS-2B细胞体外急性暴露于BghiP,IcdP,BbF和BaP会导致急性炎症,DNA损伤和细胞凋亡。进一步的生物信息学分析表明,核受体亚家族1组D成员1(NR1D1)可能是介导BghiP毒性效应的关键靶基因。总之,我们的结果表明,以BghiP为代表的其他PAHs可以损害呼吸系统并诱发肺癌。本研究为本地环境中PAHs污染所带来的潜在健康风险提供了有价值的证据。本文版权©2023作者。由Elsevier Inc.出版,保留所有权利。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Sep
YagoJuste-Lanas,Silv...
Fluid flow to mimic organ function in 3D in vitro models.
Disease Models & Mechanisms
文献中可以找到许多不同的策略来模拟离体器官生理学、组织功能和疾病,然而,大多数这些模型缺乏体内存在的生理流体动力学。在这里,我们强调液体流动对组织稳态的重要性,特别是对管腔、其他腔腔结构和间质的影响,以指出当前三维离体模型中灌流的必要性。重要的是,对不同的实验液体流动设置的优点和局限进行了讨论。最后,我们着重探讨了流体流动模型在最新的生物工程最前沿平台(如器官样和器官芯片)中的应用,作为最复杂和最生理学的临床前平台的当前挑战和未来重点。© 2023 作者。
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DIABETES-METABOLISM RESEARCH AND REVIEWS
2023 Aug 07
FanxiuXiong,QichenDa...
Diabetes and incidence of breast cancer and its molecular subtypes: A systematic review and meta-analysis.
DIABETES-METABOLISM RESEARCH AND REVIEWS
由于共享危险因素、代谢功能障碍和使用抗糖尿病药物,已经提出糖尿病(DM)与乳腺癌(BCa)风险呈正相关。我们进行了一项系统综述和荟萃分析,以评估DM与BCa风险之间的关联。我们在2021年12月10日之前,在PubMed、Embase和Web of Science上搜索了对DM和BCa之间的关联进行评估的队列研究和病例对照研究。两位评审者独立筛选研究进行纳入、摘录文章数据并评价研究质量。采用随机效应模型估计总体风险比(RR)和95%置信区间(CI)。在初始搜索中确定的8396篇文章中,共有70个独立研究包含在荟萃分析中。DM与BCa的总体风险增加有关(RR = 1.20,95% CI:1.11-1.29)。24项病例对照研究呈现更强的关联(RR = 1.26,95% CI:1.13-1.40)比46项队列研究(RR = 1.15,95% CI:1.05-1.27)。根据更年期状态报告风险的研究发现,绝经后妇女患BCa的风险升高(RR = 1.12,95% CI:1.07-1.17)。而绝经前妇女DM与BCa风险之间没有关联(RR = 0.95,95% CI:0.85-1.05)。此外,DM与雌激素受体(ER)阳性(RR = 1.09,95% CI:1.00-1.20)、ER阴性(RR = 1.16,95% CI:1.04-1.30)和三阴性BCa(RR = 1.41,95% CI:1.01-1.96)之间存在显著增加的风险。人皮肤生长因子受体2阳性BCa的关联估计结果也呈阳性(RR = 1.21,95% CI:0.52-2.82),但置信区间较宽,穿越了零点。我们的荟萃分析确认了DM与BCa风险之间的温和正相关。此外,我们的结果表明,DM与BCa之间的关联可能受更年期状态的调节,并且DM可能与由受体状态定义的BCa亚型不同相关。有必要进行进一步的研究以探究这些关联的机制和DM对BCa受体表达的任何影响。© 2023 The Authors. Diabetes/Metabolism Research and Reviews由John Wiley&Sons Ltd出版。
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DIABETES & METABOLISM
2023
BrendaGarcía-Hernánd...
Txnip expression promotes JNK-mediated neuronal death in response to reactive oxygen species.
DIABETES & METABOLISM
TXNIP是一种对氧化条件敏感的蛋白质,其表达与癌症、糖尿病、缺血和神经退行性疾病等死亡进程相关。因此,许多研究提出TXNIP作为多种疾病的治疗靶点。小脑颗粒神经元暴露于丹参酮或低钾条件下会导致凋亡死亡。这两种条件都会产生早期的活性氧(ROS)生成,从而引起ASK1途径和凋亡机制的激活。在这些模型中,已经显示出ROS介导的TXNIP蛋白增加。在这里,我们评估了在神经元死亡期间调节Txnip表达的分子机制,以及蛋白质在这两种凋亡条件引起的细胞死亡进程中的作用。在培养的小脑颗粒神经元中,我们观察到低钾和丹参酮引起ROS的早期增加与Txnip mRNA的增加相关。当我们评估基因的启动子时,发现JASPAR报道的FOXO1/3转录因子结合位点靠近转录起始位点(TSS)。然后,我们通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)验证了FOXO3在低钾处理1小时后与Txnip启动子的相互作用。我们还通过低钾和丹参酮处理检测到FOXO3核定位。最后,通过在神经母细胞瘤MSN细胞系中使用shRNA,我们发现Txnip的下调减少了丹参酮刺激引起的神经元死亡。综上所述,这些结果表明ROS通过Akt抑制介导的FOXO3转录因子的激活促进Txnip的表达。我们还证明了TXNIP对神经元死亡进程的必要性。Copyright © 2023 García-Hernández and Morán.
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Jul 27
EmilyJIllingworth,Al...
Transcriptomic Effects of Low-Dose Inorganic Arsenic Exposure on Murine Bone Marrow-Derived Macrophages.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
无论是组织驻留巨噬细胞还是从骨髓中招募并转化为组织驻留细胞的单核细胞,它们在调节体内稳态以及发炎性疾病的病理过程中起着关键作用。砷(iAs)是全球最常见的饮用水污染物之一,也是一个重大的公共卫生问题。巨噬细胞在多种疾病中的参与与iAs的暴露有关,包括心血管疾病、癌症以及感染性疾病的风险增加。因此,了解iAs暴露对巨噬细胞的影响,有助于更好地理解砷引起的免疫毒性的全面范围,并为特定暴露人群中iAs诱导疾病的治疗靶点设计提供帮助。在本研究中,我们分析了经低剂量iAs暴露的雄性和雌性小鼠骨髓来源的巨噬细胞(BMDMs)在M0、M1或M2刺激下的转录组。我们通过性别和刺激依赖的方式确定了iAs调节的差异表达基因,并使用生物信息学工具预测了蛋白质相互作用、转录调控网络以及相关的生物过程。总体而言,我们的数据表明,M1刺激的巨噬细胞,尤其是雌性来源的BMDMs,对iAs的暴露最敏感。值得注意的是,我们观察到了主要的促炎转录因子(如IRF8)及其下游靶基因的显著下调,以及参与模式识别和抗原呈递的蛋白质编码基因(如TLR7、TLR8和H2-D1)的显著下调,这可能提供了关于砷在干扰免疫对感染性疾病应答中作用的因果洞察。我们还观察到了参与协调促炎反应的关键过程的基因的显著下调,包括白细胞迁移、分化以及细胞因子和趋化因子的生成和响应。最后,我们发现,对于被iAs暴露的雌性刺激组,有24个X连锁基因的表达失调,而在iAs暴露的雄性刺激组中只有3个。这些发现阐明了性别差异在与iAs相关的免疫相关疾病风险中的潜在机制。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023
XiaoyingZhang,Xingch...
Immune dysregulation and potential targeted therapy in myelodysplastic syndrome.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
骨髓增生异常综合征(MDS)是一组异质的克隆性血液疾病,存在向急性髓系白血病(AML)转化的高风险。鉴定MDS中关键的遗传改变有助于我们对发病机制和演变的理解。近年来,发现MDS造血微环境中存在先天免疫和适应性免疫信号的活化,伴有异常的细胞因子分泌。同时明确了免疫调节失衡在MDS的发生和进展中起重要作用,尤其是破坏骨髓微环境,包括造血和基质组分。本综述的目的是探讨免疫细胞、免疫微环境和细胞因子在MDS发病机制中的作用。对这些变异机制的洞察可能有助于开发新的有效治疗手段以防止疾病进展。© 作者(们),2023年。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Aug 06
NaderHejrati,Raymond...
How can clinical safety and efficacy concerns in stem cell therapy for spinal cord injury be overcome?
Stem Cell Research & Therapy
脊髓损伤(SCI)可能导致严重的神经功能障碍。尽管科学和医学取得了进展,但在SCI领域仍缺乏临床有效的再生治疗方法,包括干细胞治疗。本文讨论与安全有效使用干细胞治疗SCI相关的转化难题,重点关注间充质干细胞(MSCs)、神经干细胞(NSCs)、施万细胞(SCs)、嗅神经鞘细胞(OECs)、寡突胶质细胞前体细胞(OPCs)、胚胎干细胞(ESCs)和诱导多能干细胞(iPSCs)。我们讨论了通过以下途径增强细胞为基础治疗策略的疗效:i)解决患者异质性和提高患者选择的方法;ii)选择细胞类型、细胞来源、细胞发育阶段和输送技术;iii)提高移植物的整合性和减轻免疫介导的移植物排斥;iv)确保细胞的可获得性。此外,我们还回顾了优化治疗结果的策略,包括康复的组合使用,并讨论了如何减轻与干细胞为基础治疗策略相关的肿瘤形成的潜在风险,以及如何增强细胞的存活率。基础科学研究将推动干细胞为基础治疗SCI的转化进展。遗传学、血清学和影像学生物标志物可能实现个体化的细胞治疗。此外,将需要组合策略来增强移植物的存活、迁移和功能整合,以实现精准干预。
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