肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

Epigenetics & Chromatin

YueWu,AnLi,CanChen,Z...

Biological function and research progress of N6-methyladenosine binding protein heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2B1 in human cancers.

Epigenetics & Chromatin

N6-甲基腺嘌呤（m6A）是mRNA和lncRNA中最常见的内部修饰。它对RNA功能施加可逆调控，影响各种疾病中的RNA处理和代谢，尤其是肿瘤。m6A结合蛋白hnRNPA2B1广泛研究，并作为异质核糖核蛋白（hnRNP）蛋白家族的一员。它经常发生失调，在多种类型的肿瘤中具有重要意义。 hnRNPA2B1通过识别m6A位点进行可变剪接，维持RNA稳定性以及调节翻译和转运，对肿瘤发展、代谢以及免疫微环境的调节在各个方面起到至关重要的作用。在本综述中，我们总结了hnRNPA2B1的功能角色和潜在的分子机制的最新研究。此外，我们讨论了其作为肿瘤治疗靶点的潜力。版权所有©2023年吴某某、李某某、陈某某、方某某、陈某某和郑某某。

Epigenetics & Chromatin

Zong-QiangHan,Li-NaW...

Application of G-quadruplex targets in gastrointestinal cancers: Advancements, challenges and prospects.

Epigenetics & Chromatin

基因组不稳定性和炎症是支持癌症发展和进展的两个关键特征。G-四链结构是导致基因组不稳定性和炎症的关键因素。过去，人们认为G-四链结构仅仅是能够阻碍致癌基因转录的障碍物。发现一种针对G-四链结构的配体具有抗癌活性，使得G-四链结构成为潜在的抗癌靶点。然而，进一步的研究揭示出G-四链结构广泛分布于人类基因组中，并具有多种功能，如调节DNA复制、DNA修复、转录、翻译、表观遗传学和炎症应答等。G-四链结构在转录和翻译中具有双重调控作用。在本综述中，我们重点关注G-四链结构作为胃肠癌治疗的新靶点。我们总结了G-四链结构在胃肠癌中的应用基础，包括它们的分布位点、结构特征和生理功能。我们描述了食管癌、胰腺癌、肝细胞癌、胃癌、结直肠癌和胃肠道间质瘤治疗的当前情况，以及相关的挑战。最后，我们回顾了G-四链结构靶点的前景临床应用，并为胃肠癌的靶向治疗策略提供参考。© 2023作者授权，由百世灯出版集团有限公司出版。保留所有权利。

Epigenetics & Chromatin

FanSun,PengrongYan,Y...

NanoPDLIM2 enhanced efficacy of PD-1 blockade and chemotherapy in mouse lung cancers.

Epigenetics & Chromatin

免疫检查点抑制剂（ICIs）及其与其他治疗方法（如化疗）的联合治疗，在大多数癌症患者中都存在失败的情况。我们此前发现，PDZ-LIM结构域含蛋白2（PDLIM2）是一种真正的肿瘤抑制因子，在肺癌中被抑制以驱动癌症及其化疗和免疫治疗的耐药性，为肺癌治疗的改进提供了新的靶点。通过使用人类临床样本和数据，我们研究了PDLIM2在肺癌中的遗传和表观遗传变化。通过使用一个忠实再现难治性人类肺癌的内源性小鼠肺癌模型以及临床可行的纳米递送系统，我们研究了以纳米颗粒（nanoPDLIM2）封装的PDLIM2表达质粒的全身给药方式的治疗有效性、作用机制和安全性，以及其与PD-1抗体和化疗药物的联合应用。PDLIM2在人类肺癌中的抑制涉及基因删除和启动子甲基化。纳米PDLIM2显示出低毒性、高肿瘤特异性、抗肿瘤活性，并显著改善了抗PD-1和化疗药物的疗效，在60%的小鼠中实现了完全的肿瘤缓解，剩余小鼠中肿瘤显著减小，通过此三种疗法的联合应用。在机制上，纳米PDLIM2增加了肿瘤细胞的重要组织相容性复合物I类（MHC-I）的表达，抑制了多药耐药1（MDR1）的诱导，以及细胞核中的Rela和stat 3以及存活基因（Bcl-xl和cyclin D1）；同时，它也增强了淋巴细胞对肿瘤的浸润和激活，使寒冷的肿瘤变热，对ICIs敏感，并使其对化疗药物变得脆弱。这些研究建立了一种基于PDLIM2的组合疗法，可在肺癌和可能的其他冷瘤中显著提高疗效，并具有临床应用价值。

Epigenetics & Chromatin

TiyunWu,HaitongHou,A...

BRD4 directs mitotic cell division by inhibiting DNA damage.

Epigenetics & Chromatin

BRD4结合乙酰化组蛋白以调控转录和驱动癌细胞增殖。然而，BRD4在正常细胞生长中的作用仍有待阐明。在本研究中，我们使用具有条件性Brd4基因敲除模式的小鼠胚胎成纤维细胞来探究这个问题。我们发现Brd4敲除细胞的生长速度比野生型细胞慢：它们无法完成复制，无法达到有丝分裂，并且在所有细胞周期阶段都出现广泛的DNA损伤。BRD4在450多个细胞周期基因的表达中起到了重要作用，包括编码核心组蛋白和中心体/着丝粒蛋白的基因，这些基因对基因组复制和染色体分离至关重要。此外，我们还表明，多个控制R环形结构形成和DNA损伤响应的基因需要BRD4来进行表达。最后，BRD4在控制R环形结构、DNA损伤响应和细胞周期进程的基因上有持续的作用。我们认为，BRD4通过表观遗传地标记这些基因，并充当正常细胞生长的主要调控因子。

Epigenetics & Chromatin

GanxunLi,DongyiWan,J...

IMOPAC: A web server for interactive multiomics and pharmacological analyses of patient-derived cancer cell lines.

Epigenetics & Chromatin

多个大型合作项目，包括NCI-60、GDSC和DepMap已经建立了大规模的多维肿瘤基因组和药理学分析数据，为数据挖掘和进一步了解内在治疗反应机制提供了新的机会。然而，对于实验生物学家，尤其是没有生物信息学背景的人来说，整合、探索和分析这些庞大的药物基因组数据愈加具有挑战性。为了弥补这一空白，我们引入了一个交互式、易于使用的基于网络的工具IMOPAC，它提供了基于这三个公共数据库的快速可视化和可定制功能，能够将细胞系的药物基因组数据转化为易于理解的遗传、表观遗传、转录、蛋白质、代谢和药理学事件。用户友好的查询界面以及定制化的数据存储使得用户能够互动地研究和可视化基因和通路中的多组学变化，并将这些变化与不同癌症类型的细胞系中的药物反应联系起来。我们门户网站中的分析包括全癌症表达、药物-组学/通路相关性、癌症亚型、组学-组学（顺着/反着调节）相关性、融合查询分析和药物反应预测分析。通过简单点击IMOPAC进行的全面多组学和药物基因组分析将显著地有益于肿瘤精准医学，有助于发现潜在的生物学机制，并促进了临床行动性生物标志物的药物基因组挖掘，从而不仅对基础研究人员，而且对临床从业者都具有重要意义。IMOPAC可以免费访问http://www.hbpding.com/IMOPAC.©2023 Research Network of Computational and Structural Biotechnology, Elsevier B.V.出版。

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

SankhaBhattacharya,B...

Therapeutic Potential of Methotrexate-Loaded Superparamagnetic Iron Oxide Nanoparticles Coated with Poly(lactic-co-glycolic acid) and Polyethylene Glycol against Breast Cancer: Development, Characterization, and Comprehensive In Vitro Investigation.

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

为了评估其作为治疗乳腺癌候选药物的潜力，利用超临界液体技术开发了甲氨蝶呤（MTX）的新型超顺磁性氧化铁纳米颗粒（SPIONs），并采用Box-Behnken设计进行优化。聚（乳酸-缩乙二醇酸）-聚乙二醇400包被的MTX-SPIONs具有500 nm的聚集尺寸和46.8 ± 3.9%的封装效率。傅里叶变换红外光谱分析揭示了主要带的移位，因为分子间氢键，而差示扫描量热法分析揭示了MTX熔化放热峰的缺失，表明完全封装了氧化铁纳米颗粒。Zeta电位结果显示为4.98 mV，而体外释放研究显示在12小时后有35.1 ± 2.78% 的可观释放。使用流式细胞术评估了对照组、MTX和MTX-SPIONs的细胞凋亡，其中MTX-SPIONs的细胞凋亡显著高于对照组和MTX。此外，MTX-SPIONs抑制了细胞分裂和内容物组织，并显着增加了处于G1和G2期的细胞比例，相对于对照组。与单独应用MTX相比，MTX-SPIONs对MCF-7细胞系表现出了持久的抗癌效果，表明SPION传递的化疗药物可能增加细胞毒性。药物稳定性良好，封装药物流失量低，证明基于超临界液体技术的方法是生成药物-聚合物磁性复合纳米颗粒用于癌症治疗的一种有前途的途径。©2023年作者授权，由美国化学学会出版。

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

HuiChen,QingqingDing...

PTEN in triple-negative breast carcinoma: protein expression and genomic alteration in pretreatment and posttreatment specimens.

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

近年来，针对磷酸肌醇3-激酶通路在乳腺癌治疗方面取得了新的进展。磷酸酸化肽酶和张力同源物（PTEN）是该通路的关键组成部分。为了了解三阴性乳腺癌（TNBC）患者疾病过程中PTEN表达的变化，并探讨下一代测序（NGS）中的PTEN拷贝数变异（CNV）是否可以作为免疫组化学（IHC）识别PTEN丢失的替代方法，本研究比较了参与TNBC临床试验的96名患者新辅助化疗前后的乳腺和淋巴结残留肿瘤的PTEN IHC表达，并进行了PTEN蛋白表达与PTEN CNV的相关分析。在严格的PTEN IHC评分截断值下，96名患者（n=96）预治疗和治疗后原发肿瘤的PTEN表达不一致比例为5%，而治疗后原发肿瘤和淋巴结转移的不一致比例为9%（n=33）。更宽松的截断值产生了类似的不一致率。我们观察到7%的患者中存在PTEN丢失的肿瘤内异质性。在预治疗肿瘤中，全外显子测序（n=72）显示PTEN阳性肿瘤的拷贝数显著高于IHC PTEN丢失肿瘤（p<0.0001）。然而，IHC诊断为PTEN阳性和PTEN丢失的肿瘤在拷贝数上有重叠：60个PTEN阳性样本中有14个显示拷贝数降低，与PTEN丢失肿瘤的范围相当。在TNBC患者中，通过IHC测试不同标本可能会产生不同的PTEN结果，因此，在临床试验中选择测试一个还是多个标本的决定应根据患者纳入标准进行定义。虽然我们未找到一个明确的截断值来区分PTEN阳性肿瘤和PTEN丢失肿瘤的CNV差异，但更高的PTEN拷贝数可能表明PTEN阳性，而较低的PTEN拷贝数则需要通过IHC进行进一步的检测以评估PTEN丢失。 NCT02276443. © 作者，2023年。

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

BrendaDesyRomadhon,H...

Volvulus Due to Mesenteric Cysts in Infants and Children; A Case Report.

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

肠系膜囊肿被定义为位于肠系膜中的良性腹腔肿瘤。这是一种罕见的疾病，在儿童中的发病率为1：20000。最常见的位置是小肠系膜。大多数患有肠系膜囊肿的患者没有症状，并且出现的症状如胃痛、腹部增大和腹痛是非特异性的。很少数的病例可能会出现急性腹部疼痛。本文描述了两例由肠系膜囊肿引起的肠扭转病例，一个是婴儿, 一个是儿童。婴儿和儿童之间的临床表现和组织病理学有所不同。婴儿表现为急性腹部疼痛，而儿童则没有出现急性腹部疼痛。我们在儿童中发现了乳糜样囊肿，而婴儿则出现了肠源性囊肿。在婴儿中发现了肠系膜囊肿引起的肠扭转。婴儿和儿童之间的肠系膜囊肿比较可以有助于特别是在婴儿中诊断肠系膜囊肿。 © 2022《中东消化疾病杂志》

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

DuoliZhang,TaoZou,Qi...

Transcriptomic characterization revealed that METTL7A inhibits melanoma progression via the p53 signaling pathway and immunomodulatory pathway.

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

METTL7A 是一个编码蛋白的基因，预计与甲基化相关，并且其表达紊乱与多种疾病相关。然而，鲜有研究探讨 METTL7A 与肿瘤恶性表型以及参与潜在机制之间的关系。我们通过计算机辅助分析和分子生物学技术相结合的方法进行研究，以探索 METTL7A 在癌症进展中的生物学功能。在 TCGA 数据库中提取基因表达和临床信息以探索 METTL7A 的表达变异和预后价值。在体外，进行了 CCK8、转漏、创伤愈合和集落形成实验，以探索 METTL7A 在癌细胞中的生物学功能。进行基因集富集分析 (GSEA) 以探索 METTL7A 参与的信号通路，并通过免疫印迹验证。总之，METTL7A 在大多数癌组织中下调，其低表达与更短的总生存期相关。在黑色素瘤中，METTL7A 的下调与较差的临床分期、较低水平的 TIL 渗入、较高的化疗药物 IC50 水平和较差的免疫治疗结果相关。qPCR 结果证实了 METTL7A 在黑色素瘤细胞中下调的情况。细胞功能实验证明 METTL7A 敲低促进了黑色素瘤细胞的增殖、侵袭、迁移和克隆形成。机制研究表明 METTL7A 通过 p53 信号通路抑制肿瘤发生能力。同时，METTL7A 也是一个潜在的免疫调节因子。©2023 Zhang et al.

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

WenhaoXu,HaomingLi,Y...

Elucidating the clinical and immunological value of m6A regulator-mediated methylation modification patterns in adrenocortical carcinoma.

CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

N6-甲基腺苷甲基化（m6A）是一种常见的表观遗传改变类型，会显著影响肿瘤患者的预后。然而，在肾上腺皮质癌（ACC）中，m6A调控剂如何影响肿瘤微环境（TME）细胞浸润以及如何影响ACC患者的预后尚不清楚。本研究评估了112例ACC患者的m6A改变模式，并探究了其与免疫浸润细胞特征之间的关联。我们采用非监督聚类方法对ACC患者的m6A改变模式进行分类，采用主成分分析（PCA）技术创建m6A评分，评估特定恶性肿瘤中的改变模式。我们发现ACC患者存在两种独立的m6A改变模式，TME细胞浸润特征与肿瘤免疫炎症和免疫贫血表型一致。m6A评分也作为ACC患者的独立预测因子。通过m6A改变模式可以预测染色体体细胞数变异（CNV）和患者的预后。此外，m6A评分高的ACC患者具有更好的总生存率（OS）和免疫检查点阻断治疗更高的效率。我们的研究证明了m6A改变对ACC患者免疫治疗的重要性。个体m6A改变模式分析可能有助于ACC患者预后预测和免疫治疗选择。© 2023 Xu等。